MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI4

Total Repeats: 9153

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_022049	GCC	2	6	340405	340410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322039
7502	NC_022049	GAC	2	6	340417	340422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322039
7503	NC_022049	CGC	2	6	340426	340431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322039
7504	NC_022049	GTC	2	6	340490	340495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322039
7505	NC_022049	CGC	2	6	340561	340566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322039
7506	NC_022049	CGC	2	6	340603	340608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322039
7507	NC_022049	CCCGC	2	10	340611	340620	0 %	0 %	20 %	80 %	530322039
7508	NC_022049	CGC	2	6	340792	340797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322039
7509	NC_022049	GCG	2	6	340835	340840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322039
7510	NC_022049	TCGA	2	8	341092	341099	25 %	25 %	25 %	25 %	530322040
7511	NC_022049	GAA	2	6	341105	341110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530322040
7512	NC_022049	CG	3	6	341113	341118	0 %	0 %	50 %	50 %	530322040
7513	NC_022049	GCC	2	6	341141	341146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322040
7514	NC_022049	GCC	3	9	341201	341209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322040
7515	NC_022049	GAC	2	6	341215	341220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322040
7516	NC_022049	GGC	2	6	341317	341322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322040
7517	NC_022049	GAG	2	6	341333	341338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530322040
7518	NC_022049	GCG	2	6	341351	341356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322040
7519	NC_022049	GC	3	6	341359	341364	0 %	0 %	50 %	50 %	530322040
7520	NC_022049	AGC	2	6	341400	341405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322040
7521	NC_022049	GAT	2	6	341413	341418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322040
7522	NC_022049	CGC	2	6	341425	341430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322040
7523	NC_022049	GCAA	2	8	341465	341472	50 %	0 %	25 %	25 %	530322040
7524	NC_022049	GCT	2	6	341509	341514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322040
7525	NC_022049	CG	3	6	341515	341520	0 %	0 %	50 %	50 %	530322040
7526	NC_022049	GCC	3	9	341566	341574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322040
7527	NC_022049	CT	3	6	341585	341590	0 %	50 %	0 %	50 %	530322040
7528	NC_022049	CGC	2	6	341611	341616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322040
7529	NC_022049	GAT	2	6	341617	341622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322040
7530	NC_022049	GC	4	8	341625	341632	0 %	0 %	50 %	50 %	530322040
7531	NC_022049	GCCAGC	2	12	341645	341656	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	530322040
7532	NC_022049	GC	3	6	341655	341660	0 %	0 %	50 %	50 %	530322040
7533	NC_022049	CGG	2	6	341682	341687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322040
7534	NC_022049	CG	3	6	341693	341698	0 %	0 %	50 %	50 %	530322040
7535	NC_022049	GAAGCC	2	12	341702	341713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322040
7536	NC_022049	CCG	2	6	342625	342630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322041
7537	NC_022049	GC	3	6	342634	342639	0 %	0 %	50 %	50 %	530322041
7538	NC_022049	GC	3	6	342650	342655	0 %	0 %	50 %	50 %	530322041
7539	NC_022049	TCA	2	6	342657	342662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322041
7540	NC_022049	CAAG	2	8	342687	342694	50 %	0 %	25 %	25 %	530322041
7541	NC_022049	GCG	2	6	342744	342749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322041
7542	NC_022049	CTG	2	6	342890	342895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322041
7543	NC_022049	TGA	2	6	342933	342938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322041
7544	NC_022049	CG	3	6	342949	342954	0 %	0 %	50 %	50 %	530322041
7545	NC_022049	CGC	2	6	343113	343118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322042
7546	NC_022049	CGA	2	6	343183	343188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322042
7547	NC_022049	GGC	2	6	343189	343194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322042
7548	NC_022049	ATC	2	6	343196	343201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322042
7549	NC_022049	CTTT	2	8	343263	343270	0 %	75 %	0 %	25 %	530322042
7550	NC_022049	CCGAC	2	10	343388	343397	20 %	0 %	20 %	60 %	530322042
7551	NC_022049	GCG	2	6	343503	343508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322042
7552	NC_022049	CCG	2	6	343546	343551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322042
7553	NC_022049	GAC	2	6	343728	343733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322043
7554	NC_022049	CGG	2	6	343742	343747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322043
7555	NC_022049	ACGC	2	8	343748	343755	25 %	0 %	25 %	50 %	530322043
7556	NC_022049	CGG	2	6	343811	343816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322043
7557	NC_022049	TGA	2	6	343822	343827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322043
7558	NC_022049	CGC	2	6	343841	343846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322043
7559	NC_022049	CG	4	8	343868	343875	0 %	0 %	50 %	50 %	530322043
7560	NC_022049	CCA	2	6	343885	343890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530322043
7561	NC_022049	GATCCA	2	12	343982	343993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	530322043
7562	NC_022049	CG	3	6	344014	344019	0 %	0 %	50 %	50 %	530322043
7563	NC_022049	GAT	2	6	344025	344030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322043
7564	NC_022049	TCG	2	6	344062	344067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322043
7565	NC_022049	GGCGC	3	15	344082	344096	0 %	0 %	60 %	40 %	530322043
7566	NC_022049	ATCC	2	8	344097	344104	25 %	25 %	0 %	50 %	530322043
7567	NC_022049	GCA	2	6	344106	344111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322043
7568	NC_022049	GC	3	6	344194	344199	0 %	0 %	50 %	50 %	530322044
7569	NC_022049	GCC	2	6	344203	344208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322044
7570	NC_022049	AG	3	6	344283	344288	50 %	0 %	50 %	0 %	530322044
7571	NC_022049	GAT	2	6	344426	344431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322044
7572	NC_022049	GCC	2	6	344485	344490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322044
7573	NC_022049	GC	4	8	344566	344573	0 %	0 %	50 %	50 %	530322044
7574	NC_022049	GGCA	2	8	344579	344586	25 %	0 %	50 %	25 %	530322044
7575	NC_022049	CCGC	2	8	344609	344616	0 %	0 %	25 %	75 %	530322044
7576	NC_022049	GCA	2	6	344629	344634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322044
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7579	NC_022049	GC	4	8	344704	344711	0 %	0 %	50 %	50 %	530322044
7580	NC_022049	GCG	2	6	344734	344739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322044
7581	NC_022049	CGCGT	2	10	344762	344771	0 %	20 %	40 %	40 %	530322044
7582	NC_022049	GCG	3	9	344809	344817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322044
7583	NC_022049	GCG	2	6	344824	344829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322044
7584	NC_022049	CGC	2	6	344880	344885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322044
7585	NC_022049	TCAT	2	8	344948	344955	25 %	50 %	0 %	25 %	530322044
7586	NC_022049	C	6	6	344956	344961	0 %	0 %	0 %	100 %	530322045
7587	NC_022049	CAG	2	6	345008	345013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322045
7588	NC_022049	GCA	2	6	345031	345036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322045
7589	NC_022049	CG	3	6	345048	345053	0 %	0 %	50 %	50 %	530322045
7590	NC_022049	CGA	2	6	345106	345111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322045
7591	NC_022049	CCG	2	6	345136	345141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322045
7592	NC_022049	CCG	2	6	345166	345171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322045
7593	NC_022049	CAC	2	6	345323	345328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530322045
7594	NC_022049	CG	5	10	345339	345348	0 %	0 %	50 %	50 %	530322045
7595	NC_022049	CGC	2	6	345394	345399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322045
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7598	NC_022049	CCG	2	6	345526	345531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322045
7599	NC_022049	GCC	2	6	345555	345560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322045
7600	NC_022049	GCAG	2	8	345562	345569	25 %	0 %	50 %	25 %	530322045
7601	NC_022049	TCA	2	6	345598	345603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322045
7602	NC_022049	GGC	4	12	345789	345800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322046
7603	NC_022049	CG	3	6	345837	345842	0 %	0 %	50 %	50 %	530322046
7604	NC_022049	GCG	2	6	345849	345854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322046
7605	NC_022049	GACC	2	8	345926	345933	25 %	0 %	25 %	50 %	530322046
7606	NC_022049	GCC	2	6	346031	346036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322046
7607	NC_022049	GC	3	6	346044	346049	0 %	0 %	50 %	50 %	530322046
7608	NC_022049	GCG	2	6	346075	346080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322046
7609	NC_022049	GCC	3	9	346129	346137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322046
7610	NC_022049	CAT	2	6	346323	346328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322046
7611	NC_022049	CG	4	8	346349	346356	0 %	0 %	50 %	50 %	530322046
7612	NC_022049	C	6	6	346360	346365	0 %	0 %	0 %	100 %	530322046
7613	NC_022049	CGC	2	6	346391	346396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322046
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7621	NC_022049	CCG	2	6	347413	347418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322047
7622	NC_022049	CG	3	6	347417	347422	0 %	0 %	50 %	50 %	530322047
7623	NC_022049	TCG	2	6	347457	347462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322047
7624	NC_022049	GTC	2	6	347469	347474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322047
7625	NC_022049	TTGCG	2	10	347497	347506	0 %	40 %	40 %	20 %	530322047
7626	NC_022049	AAC	2	6	347534	347539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530322047
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7629	NC_022049	CGA	2	6	347614	347619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322047
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7632	NC_022049	CCG	2	6	347844	347849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322047
7633	NC_022049	ATC	2	6	347867	347872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322047
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7636	NC_022049	TGTC	2	8	348127	348134	0 %	50 %	25 %	25 %	530322047
7637	NC_022049	CTG	2	6	348135	348140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322047
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7644	NC_022049	CTG	2	6	349405	349410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322048
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7646	NC_022049	CGT	2	6	349578	349583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322048
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7650	NC_022049	CGT	2	6	349677	349682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322048
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7662	NC_022049	TGT	2	6	351080	351085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530322115
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7671	NC_022049	CCG	2	6	351815	351820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322116
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7678	NC_022049	CG	3	6	352488	352493	0 %	0 %	50 %	50 %	530322049
7679	NC_022049	GCA	2	6	352497	352502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322049
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7683	NC_022049	CGC	2	6	352623	352628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322049
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7685	NC_022049	TAATG	2	10	352713	352722	40 %	40 %	20 %	0 %	530322049
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7689	NC_022049	CG	3	6	352810	352815	0 %	0 %	50 %	50 %	530322049
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7695	NC_022049	CGAG	2	8	353211	353218	25 %	0 %	50 %	25 %	530322049
7696	NC_022049	GATGAC	2	12	353311	353322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530322050
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7701	NC_022049	CTG	2	6	353489	353494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322050
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7708	NC_022049	TGA	2	6	353637	353642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322050
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7713	NC_022049	TCT	2	6	353775	353780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530322050
7714	NC_022049	CGA	2	6	353803	353808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322050
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7721	NC_022049	TTGCA	2	10	354748	354757	20 %	40 %	20 %	20 %	530322051
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7728	NC_022049	CCGC	2	8	355004	355011	0 %	0 %	25 %	75 %	530322051
7729	NC_022049	CAG	2	6	355043	355048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530322051
7730	NC_022049	GCAG	2	8	355051	355058	25 %	0 %	50 %	25 %	530322051
7731	NC_022049	ATCC	2	8	355382	355389	25 %	25 %	0 %	50 %	530322052
7732	NC_022049	TTG	2	6	355411	355416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530322052
7733	NC_022049	CGT	2	6	355559	355564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322052
7734	NC_022049	TGT	2	6	355580	355585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530322052
7735	NC_022049	ATT	2	6	355685	355690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530322052
7736	NC_022049	GCCTG	2	10	355694	355703	0 %	20 %	40 %	40 %	530322052
7737	NC_022049	CGG	2	6	355735	355740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322052
7738	NC_022049	A	7	7	356268	356274	100 %	0 %	0 %	0 %	530322053
7739	NC_022049	CCG	2	6	356286	356291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530322053
7740	NC_022049	AAC	2	6	356429	356434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530322053
7741	NC_022049	CAC	2	6	356479	356484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530322053
7742	NC_022049	TGG	2	6	356490	356495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530322053
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7744	NC_022049	AC	3	6	356550	356555	50 %	0 %	0 %	50 %	530322053
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7868	NC_022049	CTA	2	6	362945	362950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322059
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7972	NC_022049	C	6	6	371131	371136	0 %	0 %	0 %	100 %	530322066
7973	NC_022049	CGAG	2	8	371231	371238	25 %	0 %	50 %	25 %	530322066
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7978	NC_022049	GCG	2	6	371650	371655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530322066
7979	NC_022049	CGT	2	6	371687	371692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322066
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7984	NC_022049	GAT	2	6	372476	372481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530322067
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7988	NC_022049	AGA	2	6	372684	372689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530322067
7989	NC_022049	TTTG	2	8	372737	372744	0 %	75 %	25 %	0 %	530322067
7990	NC_022049	GAA	2	6	372745	372750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530322067
7991	NC_022049	TCA	2	6	372939	372944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530322067
7992	NC_022049	GCCA	2	8	372974	372981	25 %	0 %	25 %	50 %	530322067
7993	NC_022049	GAGCC	2	10	374333	374342	20 %	0 %	40 %	40 %	530322068
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7998	NC_022049	TCG	2	6	374571	374576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530322068
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8000	NC_022049	GC	3	6	374601	374606	0 %	0 %	50 %	50 %	530322068

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