MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI5

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022043	AGA	2	6	173826	173831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320646
3502	NC_022043	GCG	3	9	173881	173889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320646
3503	NC_022043	GC	3	6	174030	174035	0 %	0 %	50 %	50 %	530320646
3504	NC_022043	GA	3	6	174051	174056	50 %	0 %	50 %	0 %	530320646
3505	NC_022043	CG	3	6	174085	174090	0 %	0 %	50 %	50 %	530320646
3506	NC_022043	GTG	2	6	174136	174141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320646
3507	NC_022043	CTT	2	6	174171	174176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320646
3508	NC_022043	GA	3	6	174186	174191	50 %	0 %	50 %	0 %	530320646
3509	NC_022043	GC	3	6	174215	174220	0 %	0 %	50 %	50 %	530320646
3510	NC_022043	AGC	2	6	174242	174247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320646
3511	NC_022043	CTC	2	6	174265	174270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530320646
3512	NC_022043	CG	4	8	174282	174289	0 %	0 %	50 %	50 %	530320646
3513	NC_022043	GGC	2	6	174298	174303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320646
3514	NC_022043	ATC	2	6	174416	174421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320646
3515	NC_022043	GCG	2	6	174430	174435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320646
3516	NC_022043	AAAT	2	8	174452	174459	75 %	25 %	0 %	0 %	530320646
3517	NC_022043	ATC	2	6	174508	174513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320646
3518	NC_022043	GC	3	6	174554	174559	0 %	0 %	50 %	50 %	530320646
3519	NC_022043	GCCC	2	8	174624	174631	0 %	0 %	25 %	75 %	530320646
3520	NC_022043	GC	3	6	174649	174654	0 %	0 %	50 %	50 %	530320646
3521	NC_022043	CCG	3	9	174693	174701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320646
3522	NC_022043	GCG	2	6	174755	174760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320646
3523	NC_022043	GGC	3	9	175502	175510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320647
3524	NC_022043	ACC	2	6	175543	175548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320647
3525	NC_022043	GAT	2	6	175560	175565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320647
3526	NC_022043	CTG	2	6	175590	175595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320647
3527	NC_022043	CGCGC	2	10	175659	175668	0 %	0 %	40 %	60 %	530320647
3528	NC_022043	ACA	2	6	175700	175705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320647
3529	NC_022043	CG	4	8	175738	175745	0 %	0 %	50 %	50 %	530320647
3530	NC_022043	GCCCC	2	10	175754	175763	0 %	0 %	20 %	80 %	530320647
3531	NC_022043	GC	3	6	175891	175896	0 %	0 %	50 %	50 %	530320647
3532	NC_022043	GAT	2	6	175902	175907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320647
3533	NC_022043	CGC	2	6	175928	175933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320647
3534	NC_022043	CGC	2	6	175956	175961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320647
3535	NC_022043	GAT	2	6	175968	175973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320647
3536	NC_022043	GC	3	6	175992	175997	0 %	0 %	50 %	50 %	530320647
3537	NC_022043	GTG	2	6	176094	176099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320647
3538	NC_022043	TTG	2	6	176107	176112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530320647
3539	NC_022043	CTGGG	2	10	176142	176151	0 %	20 %	60 %	20 %	530320647
3540	NC_022043	GAA	3	9	176214	176222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320647
3541	NC_022043	CGC	2	6	176242	176247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320647
3542	NC_022043	CGA	2	6	176283	176288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320647
3543	NC_022043	CAG	2	6	176433	176438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320647
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3545	NC_022043	TGCCC	2	10	176468	176477	0 %	20 %	20 %	60 %	530320647
3546	NC_022043	CGC	2	6	176508	176513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320647
3547	NC_022043	GGT	2	6	176544	176549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320647
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3551	NC_022043	GCG	2	6	176727	176732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320647
3552	NC_022043	GC	3	6	176747	176752	0 %	0 %	50 %	50 %	530320647
3553	NC_022043	GC	4	8	176781	176788	0 %	0 %	50 %	50 %	530320648
3554	NC_022043	CGCGC	2	10	176808	176817	0 %	0 %	40 %	60 %	530320648
3555	NC_022043	CGATGA	2	12	176830	176841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530320648
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3558	NC_022043	CAT	2	6	176878	176883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320648
3559	NC_022043	GCC	2	6	176930	176935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320648
3560	NC_022043	CGA	2	6	176941	176946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320648
3561	NC_022043	GCCA	2	8	177033	177040	25 %	0 %	25 %	50 %	530320648
3562	NC_022043	AAC	2	6	177120	177125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320648
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3564	NC_022043	GGCGAT	2	12	177152	177163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	530320648
3565	NC_022043	GATCAG	2	12	177197	177208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530320648
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3569	NC_022043	CGG	2	6	177349	177354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320648
3570	NC_022043	CAA	2	6	177436	177441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320648
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3573	NC_022043	CCGGCG	2	12	177569	177580	0 %	0 %	50 %	50 %	530320648
3574	NC_022043	GGA	2	6	177604	177609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530320648
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3580	NC_022043	ACG	2	6	177878	177883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320649
3581	NC_022043	CGA	2	6	177921	177926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320649
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3584	NC_022043	GAT	2	6	178054	178059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320649
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3589	NC_022043	GGT	2	6	178261	178266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530320649
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3591	NC_022043	AGAT	2	8	178322	178329	50 %	25 %	25 %	0 %	530320649
3592	NC_022043	AAG	2	6	178351	178356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320649
3593	NC_022043	GCC	2	6	178372	178377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320649
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3601	NC_022043	CG	4	8	178811	178818	0 %	0 %	50 %	50 %	530320650
3602	NC_022043	GCG	3	9	178816	178824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320650
3603	NC_022043	CAG	2	6	178830	178835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320650
3604	NC_022043	CG	3	6	178900	178905	0 %	0 %	50 %	50 %	530320650
3605	NC_022043	CGAG	2	8	179000	179007	25 %	0 %	50 %	25 %	530320650
3606	NC_022043	TCG	2	6	179017	179022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320650
3607	NC_022043	GAT	2	6	179028	179033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320650
3608	NC_022043	GCT	3	9	179072	179080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320650
3609	NC_022043	CGC	2	6	179109	179114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320650
3610	NC_022043	AATGGC	2	12	179142	179153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530320650
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3612	NC_022043	CGG	2	6	179206	179211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320650
3613	NC_022043	GCA	2	6	179225	179230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320650
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3619	NC_022043	AG	3	6	179517	179522	50 %	0 %	50 %	0 %	530320650
3620	NC_022043	CGG	2	6	179670	179675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320651
3621	NC_022043	GCC	2	6	179742	179747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320651
3622	NC_022043	CTG	2	6	179756	179761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320651
3623	NC_022043	CTC	2	6	179801	179806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530320651
3624	NC_022043	AAT	2	6	179830	179835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530320651
3625	NC_022043	TCA	2	6	179859	179864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320651
3626	NC_022043	AAT	2	6	179887	179892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530320651
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3631	NC_022043	CGT	2	6	180050	180055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320651
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3635	NC_022043	ATCG	2	8	180233	180240	25 %	25 %	25 %	25 %	530320651
3636	NC_022043	CGG	2	6	180248	180253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320651
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3641	NC_022043	TCA	2	6	180352	180357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320651
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3645	NC_022043	CGT	2	6	180720	180725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320652
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3648	NC_022043	GCG	2	6	180937	180942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320652
3649	NC_022043	TAT	2	6	181012	181017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530320652
3650	NC_022043	CG	3	6	181028	181033	0 %	0 %	50 %	50 %	530320652
3651	NC_022043	GCG	2	6	181053	181058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320652
3652	NC_022043	TCG	2	6	181073	181078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320652
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3662	NC_022043	CG	3	6	181312	181317	0 %	0 %	50 %	50 %	530320652
3663	NC_022043	ATG	2	6	181393	181398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320652
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3665	NC_022043	GCC	2	6	181540	181545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320652
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3678	NC_022043	GCC	2	6	182109	182114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320653
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3733	NC_022043	GGCG	3	12	184721	184732	0 %	0 %	75 %	25 %	530320657
3734	NC_022043	TGC	2	6	184735	184740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320657
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3741	NC_022043	CG	3	6	184965	184970	0 %	0 %	50 %	50 %	530320657
3742	NC_022043	TGC	2	6	185002	185007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320657
3743	NC_022043	CGC	2	6	185012	185017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320657
3744	NC_022043	GCG	2	6	185050	185055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320657
3745	NC_022043	GCG	2	6	185059	185064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320657
3746	NC_022043	GGC	2	6	185114	185119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320657
3747	NC_022043	GGC	2	6	185144	185149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320657
3748	NC_022043	CTGC	2	8	185157	185164	0 %	25 %	25 %	50 %	530320657
3749	NC_022043	GC	3	6	185166	185171	0 %	0 %	50 %	50 %	530320657
3750	NC_022043	CG	3	6	185177	185182	0 %	0 %	50 %	50 %	530320657
3751	NC_022043	CGT	2	6	185195	185200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320657
3752	NC_022043	GAT	2	6	185231	185236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320657
3753	NC_022043	CCG	2	6	185248	185253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320657
3754	NC_022043	CGG	2	6	185308	185313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320657
3755	NC_022043	GGC	2	6	185396	185401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320657
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3757	NC_022043	GCAC	2	8	185454	185461	25 %	0 %	25 %	50 %	530320658
3758	NC_022043	CG	3	6	185489	185494	0 %	0 %	50 %	50 %	530320658
3759	NC_022043	GC	3	6	185500	185505	0 %	0 %	50 %	50 %	530320658
3760	NC_022043	GC	3	6	185533	185538	0 %	0 %	50 %	50 %	530320658
3761	NC_022043	ATC	2	6	185577	185582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320658
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3763	NC_022043	CTG	2	6	185727	185732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320658
3764	NC_022043	TCG	2	6	185755	185760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320658
3765	NC_022043	CGGG	2	8	185761	185768	0 %	0 %	75 %	25 %	530320658
3766	NC_022043	CTG	2	6	185796	185801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320658
3767	NC_022043	GC	3	6	185808	185813	0 %	0 %	50 %	50 %	530320658
3768	NC_022043	GGTCA	2	10	185835	185844	20 %	20 %	40 %	20 %	530320658
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3770	NC_022043	GAC	2	6	185955	185960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320658
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3772	NC_022043	TGA	2	6	186074	186079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320658
3773	NC_022043	CGG	2	6	186137	186142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320658
3774	NC_022043	CGG	2	6	186151	186156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320658
3775	NC_022043	CTC	2	6	186161	186166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530320658
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3778	NC_022043	GCG	2	6	186221	186226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320658
3779	NC_022043	GC	3	6	186243	186248	0 %	0 %	50 %	50 %	530320658
3780	NC_022043	ACA	2	6	186333	186338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320658
3781	NC_022043	CGT	2	6	186386	186391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320658
3782	NC_022043	CGG	2	6	186446	186451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320658
3783	NC_022043	GC	3	6	186487	186492	0 %	0 %	50 %	50 %	530320658
3784	NC_022043	GCT	2	6	186506	186511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320658
3785	NC_022043	TCGCT	2	10	186547	186556	0 %	40 %	20 %	40 %	530320658
3786	NC_022043	CGG	3	9	186563	186571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320658
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3802	NC_022043	GC	4	8	187361	187368	0 %	0 %	50 %	50 %	530320659
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3820	NC_022043	GGCGC	2	10	187981	187990	0 %	0 %	60 %	40 %	530320660
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3832	NC_022043	TGA	2	6	188434	188439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320660
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3840	NC_022043	GTCA	2	8	188771	188778	25 %	25 %	25 %	25 %	530320660
3841	NC_022043	CATT	2	8	188984	188991	25 %	50 %	0 %	25 %	530320661
3842	NC_022043	TGA	2	6	189046	189051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320661
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3845	NC_022043	GCCGC	2	10	189226	189235	0 %	0 %	40 %	60 %	530320661
3846	NC_022043	GC	3	6	189269	189274	0 %	0 %	50 %	50 %	530320661
3847	NC_022043	CGAC	3	12	189329	189340	25 %	0 %	25 %	50 %	530320661
3848	NC_022043	CGA	2	6	189374	189379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320661
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3851	NC_022043	ATG	2	6	189649	189654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320661
3852	NC_022043	GCG	2	6	189704	189709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320661
3853	NC_022043	CGA	2	6	189919	189924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320662
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3856	NC_022043	CG	3	6	190151	190156	0 %	0 %	50 %	50 %	530320662
3857	NC_022043	GCG	2	6	190174	190179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320662
3858	NC_022043	GAT	2	6	190181	190186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320662
3859	NC_022043	GCTGGT	2	12	190202	190213	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	530320662
3860	NC_022043	TCTCG	2	10	190235	190244	0 %	40 %	20 %	40 %	530320662
3861	NC_022043	CGG	2	6	190301	190306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320662
3862	NC_022043	TCA	2	6	190309	190314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320662
3863	NC_022043	C	6	6	190407	190412	0 %	0 %	0 %	100 %	530320662
3864	NC_022043	CGC	2	6	190423	190428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320662
3865	NC_022043	GACC	2	8	190431	190438	25 %	0 %	25 %	50 %	530320662
3866	NC_022043	CGC	2	6	190460	190465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320662
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3986	NC_022043	GCG	2	6	195938	195943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320664
3987	NC_022043	CGG	2	6	196009	196014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320664
3988	NC_022043	GCGTC	2	10	196084	196093	0 %	20 %	40 %	40 %	530320664
3989	NC_022043	CG	3	6	196153	196158	0 %	0 %	50 %	50 %	530320664
3990	NC_022043	CAG	3	9	196193	196201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320664
3991	NC_022043	ACG	2	6	196237	196242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320664
3992	NC_022043	CCAG	2	8	196312	196319	25 %	0 %	25 %	50 %	530320664
3993	NC_022043	GCG	2	6	196363	196368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320664
3994	NC_022043	TTC	2	6	196379	196384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320664
3995	NC_022043	GC	3	6	196399	196404	0 %	0 %	50 %	50 %	530320664
3996	NC_022043	A	6	6	196530	196535	100 %	0 %	0 %	0 %	530320664
3997	NC_022043	GGC	2	6	196557	196562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320664
3998	NC_022043	GCA	2	6	196597	196602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320664
3999	NC_022043	CG	3	6	196657	196662	0 %	0 %	50 %	50 %	530320664
4000	NC_022043	CTT	2	6	196741	196746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320664

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