MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI5

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022043	CG	3	6	275386	275391	0 %	0 %	50 %	50 %	530320736
5502	NC_022043	CGA	2	6	275418	275423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320736
5503	NC_022043	ACC	2	6	275428	275433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320736
5504	NC_022043	TTG	2	6	275471	275476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530320736
5505	NC_022043	GAA	2	6	275620	275625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530320736
5506	NC_022043	TCAT	2	8	275639	275646	25 %	50 %	0 %	25 %	530320736
5507	NC_022043	GCC	2	6	276135	276140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320737
5508	NC_022043	GCGG	2	8	276156	276163	0 %	0 %	75 %	25 %	530320737
5509	NC_022043	ACA	2	6	276208	276213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320737
5510	NC_022043	ACG	3	9	276240	276248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320737
5511	NC_022043	TGCCG	2	10	276279	276288	0 %	20 %	40 %	40 %	530320737
5512	NC_022043	CAA	2	6	276314	276319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530320737
5513	NC_022043	CAC	2	6	276536	276541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320737
5514	NC_022043	GCG	2	6	276561	276566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320737
5515	NC_022043	GC	3	6	276640	276645	0 %	0 %	50 %	50 %	530320737
5516	NC_022043	CGT	2	6	276731	276736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320737
5517	NC_022043	ATC	2	6	276747	276752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320737
5518	NC_022043	TCG	2	6	276775	276780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320737
5519	NC_022043	CGA	2	6	276872	276877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320737
5520	NC_022043	CGC	2	6	277099	277104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320737
5521	NC_022043	GGCG	2	8	277280	277287	0 %	0 %	75 %	25 %	530320738
5522	NC_022043	CTT	2	6	277317	277322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320738
5523	NC_022043	GCG	2	6	277347	277352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320738
5524	NC_022043	TCG	2	6	277449	277454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320738
5525	NC_022043	TCG	2	6	277513	277518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320738
5526	NC_022043	TGC	2	6	277669	277674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320738
5527	NC_022043	GC	3	6	277711	277716	0 %	0 %	50 %	50 %	530320738
5528	NC_022043	TCA	2	6	277717	277722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320738
5529	NC_022043	CGG	2	6	277769	277774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320738
5530	NC_022043	CTG	2	6	277851	277856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320738
5531	NC_022043	GCATCG	2	12	277900	277911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530320738
5532	NC_022043	GGC	2	6	277944	277949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320738
5533	NC_022043	TGA	2	6	277978	277983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320738
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5535	NC_022043	TCGA	2	8	278034	278041	25 %	25 %	25 %	25 %	530320738
5536	NC_022043	CGC	2	6	278091	278096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320738
5537	NC_022043	CGT	2	6	278135	278140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320738
5538	NC_022043	AT	3	6	278162	278167	50 %	50 %	0 %	0 %	530320738
5539	NC_022043	ATCT	2	8	278289	278296	25 %	50 %	0 %	25 %	530320738
5540	NC_022043	CCG	2	6	278339	278344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320738
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5542	NC_022043	TGA	2	6	278544	278549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320739
5543	NC_022043	GAT	2	6	278599	278604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320739
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5553	NC_022043	CTG	2	6	278942	278947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320739
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5555	NC_022043	TGC	2	6	279069	279074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320739
5556	NC_022043	GCC	2	6	279140	279145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320739
5557	NC_022043	CG	4	8	279175	279182	0 %	0 %	50 %	50 %	530320739
5558	NC_022043	GCC	2	6	279194	279199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320739
5559	NC_022043	TCG	2	6	279279	279284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320739
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5562	NC_022043	GCA	2	6	279441	279446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320739
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5564	NC_022043	CCG	2	6	279463	279468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320739
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5574	NC_022043	CTCG	2	8	279993	280000	0 %	25 %	25 %	50 %	530320740
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5588	NC_022043	CGC	3	9	280882	280890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320741
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5599	NC_022043	GCGA	2	8	281485	281492	25 %	0 %	50 %	25 %	530320742
5600	NC_022043	GC	3	6	281519	281524	0 %	0 %	50 %	50 %	530320742
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5607	NC_022043	GC	3	6	281825	281830	0 %	0 %	50 %	50 %	530320742
5608	NC_022043	CG	3	6	281869	281874	0 %	0 %	50 %	50 %	530320742
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5621	NC_022043	CTT	2	6	282370	282375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320742
5622	NC_022043	GAT	2	6	282412	282417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320742
5623	NC_022043	ACCA	2	8	282461	282468	50 %	0 %	0 %	50 %	530320742
5624	NC_022043	ATGGC	2	10	282480	282489	20 %	20 %	40 %	20 %	530320742
5625	NC_022043	GC	3	6	282494	282499	0 %	0 %	50 %	50 %	530320742
5626	NC_022043	TGA	2	6	282522	282527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320742
5627	NC_022043	GCTG	2	8	282535	282542	0 %	25 %	50 %	25 %	530320742
5628	NC_022043	GCTG	2	8	282576	282583	0 %	25 %	50 %	25 %	530320742
5629	NC_022043	CCG	2	6	282630	282635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320742
5630	NC_022043	GCG	2	6	282668	282673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320742
5631	NC_022043	GCC	2	6	282689	282694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320742
5632	NC_022043	ACG	2	6	282717	282722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530320742
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5634	NC_022043	CGC	2	6	282898	282903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320743
5635	NC_022043	TGGTC	2	10	282943	282952	0 %	40 %	40 %	20 %	530320743
5636	NC_022043	GC	3	6	282953	282958	0 %	0 %	50 %	50 %	530320743
5637	NC_022043	GCC	2	6	282962	282967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320743
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5640	NC_022043	TCT	2	6	283138	283143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320743
5641	NC_022043	GCT	2	6	283147	283152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320743
5642	NC_022043	CTGCCC	2	12	283199	283210	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	530320743
5643	NC_022043	CGC	2	6	283329	283334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320743
5644	NC_022043	TGA	2	6	283344	283349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320743
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5646	NC_022043	TCG	2	6	283413	283418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320743
5647	NC_022043	GCT	2	6	283435	283440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320743
5648	NC_022043	TCA	2	6	283461	283466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320743
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5650	NC_022043	GCG	2	6	283554	283559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530320743
5651	NC_022043	TGAT	2	8	283584	283591	25 %	50 %	25 %	0 %	530320743
5652	NC_022043	GCC	3	9	283667	283675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320743
5653	NC_022043	TGCC	2	8	283714	283721	0 %	25 %	25 %	50 %	530320743
5654	NC_022043	CCG	3	9	283747	283755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320743
5655	NC_022043	GCC	2	6	283781	283786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320743
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5657	NC_022043	CGC	2	6	284000	284005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530320744
5658	NC_022043	TTC	2	6	284046	284051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320744
5659	NC_022043	GC	3	6	284137	284142	0 %	0 %	50 %	50 %	530320744
5660	NC_022043	GTC	2	6	284193	284198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320744
5661	NC_022043	CCA	2	6	284219	284224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530320744
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5669	NC_022043	ATC	2	6	284499	284504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320744
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5671	NC_022043	GC	4	8	284589	284596	0 %	0 %	50 %	50 %	530320744
5672	NC_022043	TCA	2	6	284626	284631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530320744
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5674	NC_022043	CTCGCC	2	12	284757	284768	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	530320745
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5680	NC_022043	TTC	2	6	285154	285159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530320745
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5682	NC_022043	TGA	2	6	285176	285181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530320745
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5693	NC_022043	A	6	6	286169	286174	100 %	0 %	0 %	0 %	530320745
5694	NC_022043	CCCGC	2	10	286205	286214	0 %	0 %	20 %	80 %	530320745
5695	NC_022043	CCT	2	6	286268	286273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530320745
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5699	NC_022043	TCG	2	6	286690	286695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320745
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5729	NC_022043	CGGT	2	8	288570	288577	0 %	25 %	50 %	25 %	530320745
5730	NC_022043	GC	3	6	288971	288976	0 %	0 %	50 %	50 %	530320746
5731	NC_022043	TC	3	6	288996	289001	0 %	50 %	0 %	50 %	530320746
5732	NC_022043	CTG	2	6	289006	289011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320746
5733	NC_022043	GC	4	8	289068	289075	0 %	0 %	50 %	50 %	530320746
5734	NC_022043	CGT	2	6	289108	289113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530320746
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5743	NC_022043	CCTTG	2	10	289413	289422	0 %	40 %	20 %	40 %	530320746
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.