MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas protegens CHA0

Total Repeats: 138838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021237	GCA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
2	NC_021237	TGA	2	6	142	147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677486
3	NC_021237	CTGC	2	8	149	156	0 %	25 %	25 %	50 %	501677486
4	NC_021237	TCCG	2	8	177	184	0 %	25 %	25 %	50 %	501677486
5	NC_021237	CGA	2	6	205	210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
6	NC_021237	GCT	2	6	283	288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
7	NC_021237	ACGGCA	2	12	297	308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
8	NC_021237	TCCTT	2	10	318	327	0 %	60 %	0 %	40 %	501677486
9	NC_021237	GCA	2	6	336	341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
10	NC_021237	CGC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677486
11	NC_021237	GCCGCT	2	12	383	394	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	501677486
12	NC_021237	AGC	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
13	NC_021237	TGC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
14	NC_021237	GCT	3	9	434	442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
15	NC_021237	GCC	2	6	485	490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677486
16	NC_021237	GAA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677486
17	NC_021237	GGCG	2	8	547	554	0 %	0 %	75 %	25 %	501677486
18	NC_021237	GCA	2	6	562	567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
19	NC_021237	GC	3	6	609	614	0 %	0 %	50 %	50 %	501677486
20	NC_021237	TCG	2	6	660	665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
21	NC_021237	GGC	2	6	752	757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677486
22	NC_021237	ACC	2	6	798	803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677486
23	NC_021237	AGA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677486
24	NC_021237	GCT	2	6	931	936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
25	NC_021237	TTC	2	6	953	958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677486
26	NC_021237	CTC	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501677486
27	NC_021237	GGC	2	6	1016	1021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677486
28	NC_021237	CAG	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677486
29	NC_021237	TGA	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677486
30	NC_021237	ATG	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677486
31	NC_021237	TTC	2	6	1205	1210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677486
32	NC_021237	CTG	2	6	1334	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
33	NC_021237	TAC	2	6	1394	1399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677486
34	NC_021237	CTG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
35	NC_021237	GCG	2	6	1429	1434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677486
36	NC_021237	GCCC	2	8	1448	1455	0 %	0 %	25 %	75 %	501677486
37	NC_021237	ACCA	2	8	1490	1497	50 %	0 %	0 %	50 %	501677486
38	NC_021237	CGG	2	6	1525	1530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677486
39	NC_021237	ACCAC	2	10	1536	1545	40 %	0 %	0 %	60 %	501677486
40	NC_021237	CTG	2	6	1619	1624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677486
41	NC_021237	TGA	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677486
42	NC_021237	CGT	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677487
43	NC_021237	CGC	2	6	1747	1752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677487
44	NC_021237	TGC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677487
45	NC_021237	GGTC	2	8	1839	1846	0 %	25 %	50 %	25 %	501677487
46	NC_021237	AGCC	2	8	1862	1869	25 %	0 %	25 %	50 %	501677487
47	NC_021237	CG	3	6	1893	1898	0 %	0 %	50 %	50 %	501677487
48	NC_021237	CGA	2	6	1956	1961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677487
49	NC_021237	TGG	2	6	1970	1975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677487
50	NC_021237	GAA	2	6	2038	2043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677487
51	NC_021237	GCC	2	6	2087	2092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677487
52	NC_021237	CAG	2	6	2122	2127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677487
53	NC_021237	CTA	2	6	2136	2141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677487
54	NC_021237	TGC	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677487
55	NC_021237	CCG	2	6	2168	2173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677487
56	NC_021237	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677487
57	NC_021237	CCA	2	6	2253	2258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677487
58	NC_021237	GC	3	6	2293	2298	0 %	0 %	50 %	50 %	501677487
59	NC_021237	CAC	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677487
60	NC_021237	CCA	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677487
61	NC_021237	TTCACC	2	12	2371	2382	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	501677487
62	NC_021237	TGG	2	6	2390	2395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677487
63	NC_021237	TGC	2	6	2423	2428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677487
64	NC_021237	CAA	2	6	2565	2570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677487
65	NC_021237	GAA	2	6	2581	2586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677487
66	NC_021237	GAA	3	9	2590	2598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677487
67	NC_021237	CGG	2	6	2616	2621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677487
68	NC_021237	CTG	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677487
69	NC_021237	TGA	2	6	2672	2677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677487
70	NC_021237	CAG	2	6	2715	2720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677487
71	NC_021237	ACG	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677487
72	NC_021237	TCCCCC	2	12	2862	2873	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	501677488
73	NC_021237	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677488
74	NC_021237	CTG	2	6	2973	2978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677488
75	NC_021237	AGC	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677488
76	NC_021237	GGC	2	6	3039	3044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677488
77	NC_021237	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677488
78	NC_021237	GCG	2	6	3120	3125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677488
79	NC_021237	CTG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677488
80	NC_021237	CGC	2	6	3320	3325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677488
81	NC_021237	CCG	2	6	3383	3388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677488
82	NC_021237	GGCC	2	8	3554	3561	0 %	0 %	50 %	50 %	501677488
83	NC_021237	CGC	2	6	3602	3607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677488
84	NC_021237	CAG	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677488
85	NC_021237	TGG	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677488
86	NC_021237	CGC	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677488
87	NC_021237	TGG	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677488
88	NC_021237	AGC	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677488
89	NC_021237	CCG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677488
90	NC_021237	TTG	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501677488
91	NC_021237	ATT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501677488
92	NC_021237	GAA	2	6	3919	3924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677489
93	NC_021237	TACG	2	8	3927	3934	25 %	25 %	25 %	25 %	501677489
94	NC_021237	CAC	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677489
95	NC_021237	GGT	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677489
96	NC_021237	CGA	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
97	NC_021237	CGA	2	6	4086	4091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
98	NC_021237	CAT	3	9	4098	4106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677489
99	NC_021237	AGA	2	6	4170	4175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677489
100	NC_021237	TCA	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677489
101	NC_021237	CGG	2	6	4218	4223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677489
102	NC_021237	CGA	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
103	NC_021237	CGG	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677489
104	NC_021237	GAG	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501677489
105	NC_021237	ACC	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677489
106	NC_021237	TCCT	2	8	4498	4505	0 %	50 %	0 %	50 %	501677489
107	NC_021237	GGC	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677489
108	NC_021237	CAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677489
109	NC_021237	TGT	2	6	4712	4717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501677489
110	NC_021237	CAA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677489
111	NC_021237	CGG	2	6	4746	4751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677489
112	NC_021237	TGG	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677489
113	NC_021237	AAC	2	6	4795	4800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677489
114	NC_021237	CCA	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677489
115	NC_021237	GAC	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
116	NC_021237	ATC	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677489
117	NC_021237	TTC	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677489
118	NC_021237	CTG	2	6	4996	5001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677489
119	NC_021237	TGG	3	9	5024	5032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677489
120	NC_021237	GAT	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677489
121	NC_021237	GCG	2	6	5065	5070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677489
122	NC_021237	GC	3	6	5102	5107	0 %	0 %	50 %	50 %	501677489
123	NC_021237	TGG	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677489
124	NC_021237	CTG	2	6	5195	5200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677489
125	NC_021237	CCGCAA	2	12	5220	5231	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	501677489
126	NC_021237	GAT	2	6	5295	5300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677489
127	NC_021237	CTC	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501677489
128	NC_021237	ACA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677489
129	NC_021237	CAT	4	12	5391	5402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677489
130	NC_021237	CTG	3	9	5440	5448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677489
131	NC_021237	CTT	3	9	5451	5459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677489
132	NC_021237	CTACAT	2	12	5490	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677489
133	NC_021237	GCC	2	6	5508	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677489
134	NC_021237	GCAA	2	8	5534	5541	50 %	0 %	25 %	25 %	501677489
135	NC_021237	GAC	3	9	5557	5565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
136	NC_021237	GAA	2	6	5623	5628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677489
137	NC_021237	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677489
138	NC_021237	GCCG	2	8	5751	5758	0 %	0 %	50 %	50 %	501677489
139	NC_021237	CGC	2	6	5784	5789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677489
140	NC_021237	TGGC	2	8	5800	5807	0 %	25 %	50 %	25 %	501677489
141	NC_021237	ACG	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
142	NC_021237	TG	3	6	5889	5894	0 %	50 %	50 %	0 %	501677489
143	NC_021237	CTT	2	6	5955	5960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677489
144	NC_021237	GCA	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677489
145	NC_021237	CGT	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677489
146	NC_021237	CTG	2	6	6013	6018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677489
147	NC_021237	GCG	2	6	6041	6046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677489
148	NC_021237	AGG	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501677489
149	NC_021237	ACC	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677489
150	NC_021237	TCG	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677489
151	NC_021237	TTG	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501677490
152	NC_021237	T	7	7	6582	6588	0 %	100 %	0 %	0 %	501677490
153	NC_021237	TGA	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677490
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155	NC_021237	GT	3	6	6763	6768	0 %	50 %	50 %	0 %	501677490
156	NC_021237	AGCG	2	8	6777	6784	25 %	0 %	50 %	25 %	501677490
157	NC_021237	ATGGA	2	10	7012	7021	40 %	20 %	40 %	0 %	501677491
158	NC_021237	G	6	6	7120	7125	0 %	0 %	100 %	0 %	501677491
159	NC_021237	CTA	2	6	7154	7159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677491
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161	NC_021237	GCA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677491
162	NC_021237	CGA	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677491
163	NC_021237	GC	3	6	7479	7484	0 %	0 %	50 %	50 %	501677491
164	NC_021237	GAT	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677492
165	NC_021237	GTT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501677492
166	NC_021237	TGA	2	6	7785	7790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501677492
167	NC_021237	CAT	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677492
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169	NC_021237	GGC	2	6	7897	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677492
170	NC_021237	GAA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501677492
171	NC_021237	CAT	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677492
172	NC_021237	GGC	2	6	7959	7964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677492
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174	NC_021237	ACA	2	6	8051	8056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677492
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176	NC_021237	TAC	2	6	8104	8109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677492
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183	NC_021237	TTC	2	6	8535	8540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677494
184	NC_021237	GCGAC	2	10	8543	8552	20 %	0 %	40 %	40 %	501677494
185	NC_021237	TTG	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501677494
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189	NC_021237	GGC	2	6	8876	8881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677494
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242	NC_021237	ACT	2	6	12355	12360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677496
243	NC_021237	GC	3	6	12375	12380	0 %	0 %	50 %	50 %	501677496
244	NC_021237	CCGG	2	8	12429	12436	0 %	0 %	50 %	50 %	501677496
245	NC_021237	TGC	2	6	12442	12447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677496
246	NC_021237	TCG	2	6	12457	12462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677496
247	NC_021237	CTG	2	6	12570	12575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677496
248	NC_021237	TGG	2	6	12613	12618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501677496
249	NC_021237	AAC	2	6	12694	12699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501677496
250	NC_021237	CGG	2	6	12703	12708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677496
251	NC_021237	CAG	2	6	12726	12731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677496
252	NC_021237	GCT	2	6	12758	12763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677496
253	NC_021237	TGGC	2	8	12788	12795	0 %	25 %	50 %	25 %	501677496
254	NC_021237	GC	4	8	12878	12885	0 %	0 %	50 %	50 %	501677496
255	NC_021237	AGC	2	6	12964	12969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677496
256	NC_021237	TGCTGG	2	12	13063	13074	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	501677496
257	NC_021237	GAC	2	6	13137	13142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501677496
258	NC_021237	CTG	2	6	13200	13205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677496
259	NC_021237	GGCT	2	8	13269	13276	0 %	25 %	50 %	25 %	501677496
260	NC_021237	GGCCTG	2	12	13377	13388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	501677496
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380	NC_021237	GGCC	2	8	19035	19042	0 %	0 %	50 %	50 %	501677502
381	NC_021237	CTG	2	6	19232	19237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501677502
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384	NC_021237	CCA	2	6	19278	19283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501677502
385	NC_021237	TCA	2	6	19302	19307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501677502
386	NC_021237	G	7	7	19322	19328	0 %	0 %	100 %	0 %	501677502
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389	NC_021237	CTT	2	6	19384	19389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501677502
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393	NC_021237	CCT	2	6	19548	19553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501677502
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406	NC_021237	CGG	2	6	20359	20364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677504
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414	NC_021237	CGG	2	6	20751	20756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501677505
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419	NC_021237	CGATGT	2	12	20930	20941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	501677505
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495	NC_021237	GCC	2	6	23772	23777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501677507
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