MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE02

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019969	T	7	7	890	896	0 %	100 %	0 %	0 %	433653601
2	NC_019969	ATAA	2	8	914	921	75 %	25 %	0 %	0 %	433653601
3	NC_019969	ACC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433653601
4	NC_019969	CAA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653601
5	NC_019969	AAAT	2	8	967	974	75 %	25 %	0 %	0 %	433653601
6	NC_019969	TGCT	2	8	1003	1010	0 %	50 %	25 %	25 %	433653601
7	NC_019969	AT	3	6	1024	1029	50 %	50 %	0 %	0 %	433653601
8	NC_019969	TAA	2	6	1094	1099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653601
9	NC_019969	T	6	6	1135	1140	0 %	100 %	0 %	0 %	433653601
10	NC_019969	TGA	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653601
11	NC_019969	CTT	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653601
12	NC_019969	TTCG	2	8	1177	1184	0 %	50 %	25 %	25 %	433653601
13	NC_019969	TCA	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653601
14	NC_019969	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653601
15	NC_019969	TC	3	6	1360	1365	0 %	50 %	0 %	50 %	433653602
16	NC_019969	TGA	3	9	1402	1410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653602
17	NC_019969	TTGTT	2	10	1413	1422	0 %	80 %	20 %	0 %	433653602
18	NC_019969	T	6	6	1421	1426	0 %	100 %	0 %	0 %	433653602
19	NC_019969	TTC	2	6	1430	1435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653602
20	NC_019969	TCT	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653602
21	NC_019969	CT	4	8	1544	1551	0 %	50 %	0 %	50 %	433653602
22	NC_019969	ATTT	2	8	1619	1626	25 %	75 %	0 %	0 %	433653602
23	NC_019969	CCTTA	2	10	1659	1668	20 %	40 %	0 %	40 %	433653602
24	NC_019969	T	6	6	1742	1747	0 %	100 %	0 %	0 %	433653602
25	NC_019969	ATC	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653602
26	NC_019969	TG	3	6	1804	1809	0 %	50 %	50 %	0 %	433653602
27	NC_019969	TGT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653602
28	NC_019969	TTA	2	6	1903	1908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653602
29	NC_019969	AATT	2	8	1943	1950	50 %	50 %	0 %	0 %	433653602
30	NC_019969	TGA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653602
31	NC_019969	GAT	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653602
32	NC_019969	TCT	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653602
33	NC_019969	ATTG	2	8	2214	2221	25 %	50 %	25 %	0 %	433653602
34	NC_019969	GTT	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653602
35	NC_019969	TCA	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653603
36	NC_019969	ACTT	2	8	2380	2387	25 %	50 %	0 %	25 %	433653603
37	NC_019969	TCA	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653603
38	NC_019969	ATA	2	6	2951	2956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653604
39	NC_019969	TAC	2	6	3029	3034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653604
40	NC_019969	AAT	2	6	3036	3041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653604
41	NC_019969	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	433653604
42	NC_019969	T	7	7	3170	3176	0 %	100 %	0 %	0 %	433653604
43	NC_019969	AT	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	433653604
44	NC_019969	TTTC	2	8	3196	3203	0 %	75 %	0 %	25 %	433653604
45	NC_019969	A	6	6	3206	3211	100 %	0 %	0 %	0 %	433653604
46	NC_019969	TTAA	2	8	3345	3352	50 %	50 %	0 %	0 %	433653605
47	NC_019969	TATATT	2	12	3358	3369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653605
48	NC_019969	TCT	2	6	3399	3404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653605
49	NC_019969	TTGC	2	8	3427	3434	0 %	50 %	25 %	25 %	433653605
50	NC_019969	T	6	6	3442	3447	0 %	100 %	0 %	0 %	433653605
51	NC_019969	AT	3	6	3472	3477	50 %	50 %	0 %	0 %	433653605
52	NC_019969	ATC	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653605
53	NC_019969	AATT	2	8	3556	3563	50 %	50 %	0 %	0 %	433653605
54	NC_019969	TAT	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653605
55	NC_019969	GAAT	2	8	3610	3617	50 %	25 %	25 %	0 %	433653605
56	NC_019969	CTATCA	2	12	3618	3629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653605
57	NC_019969	TAA	2	6	3711	3716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653605
58	NC_019969	TCT	2	6	3726	3731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653605
59	NC_019969	AATCT	2	10	3748	3757	40 %	40 %	0 %	20 %	433653605
60	NC_019969	CAT	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653605
61	NC_019969	TCA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653605
62	NC_019969	TTA	2	6	3828	3833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653605
63	NC_019969	AT	3	6	3897	3902	50 %	50 %	0 %	0 %	433653605
64	NC_019969	TTA	2	6	4008	4013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653605
65	NC_019969	CAA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653605
66	NC_019969	A	7	7	4067	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	433653605
67	NC_019969	GTAA	2	8	4135	4142	50 %	25 %	25 %	0 %	433653605
68	NC_019969	T	7	7	4152	4158	0 %	100 %	0 %	0 %	433653605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.