MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella dentalis DSM 3688 plasmid pPREDE01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019961	TAAT	2	8	416	423	50 %	50 %	0 %	0 %	433653594
2	NC_019961	TATT	2	8	430	437	25 %	75 %	0 %	0 %	433653594
3	NC_019961	TTC	3	9	465	473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653594
4	NC_019961	AT	3	6	542	547	50 %	50 %	0 %	0 %	433653594
5	NC_019961	T	6	6	663	668	0 %	100 %	0 %	0 %	433653594
6	NC_019961	TAA	2	6	680	685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653594
7	NC_019961	CTATCA	2	12	688	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653594
8	NC_019961	A	6	6	743	748	100 %	0 %	0 %	0 %	433653594
9	NC_019961	ATC	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653594
10	NC_019961	TCAAAA	2	12	802	813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	433653594
11	NC_019961	ATA	2	6	856	861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653594
12	NC_019961	TTC	2	6	882	887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653594
13	NC_019961	GCTTTA	2	12	988	999	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433653594
14	NC_019961	TTTG	2	8	1003	1010	0 %	75 %	25 %	0 %	433653594
15	NC_019961	ATT	2	6	1071	1076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653594
16	NC_019961	TTA	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653594
17	NC_019961	CAA	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653594
18	NC_019961	GTAA	2	8	1205	1212	50 %	25 %	25 %	0 %	433653594
19	NC_019961	ATT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653595
20	NC_019961	T	6	6	1609	1614	0 %	100 %	0 %	0 %	433653595
21	NC_019961	ATT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653595
22	NC_019961	TCT	2	6	1637	1642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653595
23	NC_019961	TTTAT	2	10	1655	1664	20 %	80 %	0 %	0 %	433653595
24	NC_019961	T	6	6	1674	1679	0 %	100 %	0 %	0 %	433653595
25	NC_019961	TAA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653595
26	NC_019961	TTCT	2	8	1755	1762	0 %	75 %	0 %	25 %	433653595
27	NC_019961	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433653595
28	NC_019961	T	6	6	2339	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	433653596
29	NC_019961	TA	3	6	2385	2390	50 %	50 %	0 %	0 %	433653596
30	NC_019961	ATAAA	2	10	2489	2498	80 %	20 %	0 %	0 %	433653596
31	NC_019961	ACA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653596
32	NC_019961	TTTC	2	8	2998	3005	0 %	75 %	0 %	25 %	433653597
33	NC_019961	ATAA	2	8	3022	3029	75 %	25 %	0 %	0 %	433653597
34	NC_019961	ACCAA	2	10	3072	3081	60 %	0 %	0 %	40 %	433653597
35	NC_019961	AAC	2	6	3203	3208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433653597
36	NC_019961	AAT	2	6	3227	3232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433653597
37	NC_019961	T	7	7	3243	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	433653597
38	NC_019961	CTT	2	6	3273	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653597
39	NC_019961	TCA	2	6	3296	3301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653597
40	NC_019961	ATG	2	6	3326	3331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653597
41	NC_019961	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433653597
42	NC_019961	GTT	2	6	3453	3458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653598
43	NC_019961	TGA	3	9	3510	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653598
44	NC_019961	TTGTT	2	10	3521	3530	0 %	80 %	20 %	0 %	433653598
45	NC_019961	T	6	6	3529	3534	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
46	NC_019961	TTC	3	9	3647	3655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433653598
47	NC_019961	ATTT	2	8	3730	3737	25 %	75 %	0 %	0 %	433653598
48	NC_019961	CAATTT	2	12	3844	3855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433653598
49	NC_019961	T	6	6	3853	3858	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
50	NC_019961	ATC	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653598
51	NC_019961	ATC	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653598
52	NC_019961	GTTT	2	8	3987	3994	0 %	75 %	25 %	0 %	433653598
53	NC_019961	GTT	3	9	4006	4014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653598
54	NC_019961	T	7	7	4028	4034	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
55	NC_019961	TGA	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433653598
56	NC_019961	GTTT	2	8	4248	4255	0 %	75 %	25 %	0 %	433653598
57	NC_019961	T	6	6	4297	4302	0 %	100 %	0 %	0 %	433653598
58	NC_019961	ATTG	2	8	4325	4332	25 %	50 %	25 %	0 %	433653598
59	NC_019961	GTT	2	6	4365	4370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653598
60	NC_019961	CAT	3	9	4373	4381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653598
61	NC_019961	ATATT	2	10	4602	4611	40 %	60 %	0 %	0 %	433653599
62	NC_019961	CAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433653599
63	NC_019961	ATGTTG	2	12	4637	4648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	433653599
64	NC_019961	CTTTAA	2	12	4814	4825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	433653599
65	NC_019961	GTT	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433653599

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.