MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 plasmid pPSEST03

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019939	TGG	2	6	73	78	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929442
2	NC_019939	GTT	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431929442
3	NC_019939	GGA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929442
4	NC_019939	GCA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929442
5	NC_019939	TAGC	2	8	183	190	25 %	25 %	25 %	25 %	431929442
6	NC_019939	CAA	2	6	218	223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431929442
7	NC_019939	GGTTGC	2	12	337	348	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	431929442
8	NC_019939	TCA	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929442
9	NC_019939	GAA	2	6	420	425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431929443
10	NC_019939	CGG	2	6	452	457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929443
11	NC_019939	TCA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929443
12	NC_019939	ACC	2	6	493	498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929443
13	NC_019939	TGT	2	6	599	604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431929443
14	NC_019939	TCAT	2	8	625	632	25 %	50 %	0 %	25 %	431929443
15	NC_019939	CGG	2	6	1525	1530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
16	NC_019939	GCC	2	6	1595	1600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929444
17	NC_019939	CAG	2	6	1606	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929444
18	NC_019939	AGC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929444
19	NC_019939	TGA	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431929444
20	NC_019939	GGT	2	6	1681	1686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929444
21	NC_019939	ATC	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431929444
22	NC_019939	ACC	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431929444
23	NC_019939	GCG	2	6	1707	1712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
24	NC_019939	TCG	3	9	1713	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929444
25	NC_019939	TCG	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431929444
26	NC_019939	TGCC	2	8	1873	1880	0 %	25 %	25 %	50 %	431929444
27	NC_019939	TGG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929444
28	NC_019939	CGC	2	6	1951	1956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431929444
29	NC_019939	TGG	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431929444
30	NC_019939	GAG	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929444
31	NC_019939	CGG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
32	NC_019939	AGG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431929444
33	NC_019939	GCA	2	6	2391	2396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431929444
34	NC_019939	GGC	2	6	2500	2505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431929444
35	NC_019939	GC	3	6	2611	2616	0 %	0 %	50 %	50 %	431929444
36	NC_019939	G	9	9	2645	2653	0 %	0 %	100 %	0 %	431929444

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.