MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 94592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019936	TCA	2	6	162386	162391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925371
3502	NC_019936	GTG	2	6	162463	162468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925371
3503	NC_019936	AAG	2	6	162484	162489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925371
3504	NC_019936	TCG	2	6	162509	162514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925371
3505	NC_019936	CAT	2	6	162585	162590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925371
3506	NC_019936	GCA	2	6	162609	162614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925371
3507	NC_019936	AGGC	2	8	162644	162651	25 %	0 %	50 %	25 %	431925371
3508	NC_019936	CCG	2	6	162656	162661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925371
3509	NC_019936	GGGA	2	8	162672	162679	25 %	0 %	75 %	0 %	431925371
3510	NC_019936	GCG	2	6	162692	162697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925371
3511	NC_019936	CGT	2	6	162731	162736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925372
3512	NC_019936	ACC	2	6	162744	162749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925372
3513	NC_019936	GCT	2	6	162782	162787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925372
3514	NC_019936	GAG	2	6	162810	162815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925372
3515	NC_019936	CGG	2	6	162911	162916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925372
3516	NC_019936	CGA	2	6	162920	162925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925372
3517	NC_019936	GC	3	6	162941	162946	0 %	0 %	50 %	50 %	431925372
3518	NC_019936	TGC	2	6	162964	162969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925372
3519	NC_019936	AAC	2	6	163057	163062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925373
3520	NC_019936	GGC	2	6	163063	163068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925373
3521	NC_019936	GAAC	2	8	163080	163087	50 %	0 %	25 %	25 %	431925373
3522	NC_019936	GC	3	6	163091	163096	0 %	0 %	50 %	50 %	431925373
3523	NC_019936	GGAAT	2	10	163170	163179	40 %	20 %	40 %	0 %	431925373
3524	NC_019936	GAA	2	6	163276	163281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925373
3525	NC_019936	GCA	2	6	163302	163307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925373
3526	NC_019936	GCC	3	9	163339	163347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925373
3527	NC_019936	CAC	2	6	163600	163605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925374
3528	NC_019936	AC	3	6	163779	163784	50 %	0 %	0 %	50 %	431925374
3529	NC_019936	GCA	2	6	163847	163852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925374
3530	NC_019936	CAC	2	6	163858	163863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925374
3531	NC_019936	TGC	2	6	163887	163892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925374
3532	NC_019936	CTT	2	6	163899	163904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925374
3533	NC_019936	GCC	2	6	163915	163920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925374
3534	NC_019936	GCC	2	6	163951	163956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925374
3535	NC_019936	TCG	2	6	164009	164014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925374
3536	NC_019936	TTC	2	6	164024	164029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925374
3537	NC_019936	GGC	3	9	164056	164064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925374
3538	NC_019936	CAG	2	6	164137	164142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925374
3539	NC_019936	TC	3	6	164145	164150	0 %	50 %	0 %	50 %	431925374
3540	NC_019936	GC	3	6	164165	164170	0 %	0 %	50 %	50 %	431925374
3541	NC_019936	GCAT	2	8	164180	164187	25 %	25 %	25 %	25 %	431925374
3542	NC_019936	GGC	3	9	164212	164220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925374
3543	NC_019936	CGG	2	6	164239	164244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925374
3544	NC_019936	GCC	2	6	164260	164265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925374
3545	NC_019936	GCCG	2	8	164368	164375	0 %	0 %	50 %	50 %	431925374
3546	NC_019936	CGC	2	6	164379	164384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925374
3547	NC_019936	GAACGG	2	12	164392	164403	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	431925374
3548	NC_019936	ATC	2	6	164429	164434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925374
3549	NC_019936	CGG	2	6	164457	164462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925374
3550	NC_019936	GCCGG	2	10	164821	164830	0 %	0 %	60 %	40 %	431925375
3551	NC_019936	CTA	2	6	164874	164879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925375
3552	NC_019936	TAC	2	6	164932	164937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925375
3553	NC_019936	AGG	2	6	164969	164974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925375
3554	NC_019936	CAG	2	6	165037	165042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925375
3555	NC_019936	CGA	2	6	165045	165050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925375
3556	NC_019936	AGC	2	6	165077	165082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925375
3557	NC_019936	AGG	2	6	165089	165094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925375
3558	NC_019936	GAA	2	6	165127	165132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925375
3559	NC_019936	TGG	2	6	165143	165148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925375
3560	NC_019936	CTG	2	6	165154	165159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925375
3561	NC_019936	CAA	2	6	165162	165167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925375
3562	NC_019936	ATC	2	6	165172	165177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925375
3563	NC_019936	CAGCG	2	10	165186	165195	20 %	0 %	40 %	40 %	431925376
3564	NC_019936	GGC	2	6	165241	165246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925376
3565	NC_019936	TTC	2	6	165252	165257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925376
3566	NC_019936	GCG	2	6	165310	165315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925376
3567	NC_019936	TCG	2	6	165366	165371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925376
3568	NC_019936	GCG	2	6	165411	165416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925376
3569	NC_019936	AGA	3	9	165487	165495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925376
3570	NC_019936	T	6	6	165575	165580	0 %	100 %	0 %	0 %	431925376
3571	NC_019936	TGGA	2	8	165588	165595	25 %	25 %	50 %	0 %	431925376
3572	NC_019936	TCA	2	6	165616	165621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925376
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3574	NC_019936	AGC	2	6	165920	165925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925377
3575	NC_019936	CGGC	2	8	165935	165942	0 %	0 %	50 %	50 %	431925377
3576	NC_019936	CAG	2	6	165973	165978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925377
3577	NC_019936	TCA	2	6	166010	166015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925378
3578	NC_019936	T	7	7	166135	166141	0 %	100 %	0 %	0 %	431925378
3579	NC_019936	GCC	3	9	166178	166186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925378
3580	NC_019936	GCC	2	6	166195	166200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925378
3581	NC_019936	CCA	2	6	166219	166224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925378
3582	NC_019936	CAG	3	9	166232	166240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925378
3583	NC_019936	CGC	2	6	166308	166313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925378
3584	NC_019936	TCGC	2	8	166316	166323	0 %	25 %	25 %	50 %	431925378
3585	NC_019936	AGC	2	6	166406	166411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925378
3586	NC_019936	CGT	2	6	166441	166446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925378
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3588	NC_019936	ATC	2	6	166611	166616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925378
3589	NC_019936	CAG	2	6	166885	166890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925379
3590	NC_019936	GCA	2	6	166947	166952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925379
3591	NC_019936	GTGA	2	8	166957	166964	25 %	25 %	50 %	0 %	431925379
3592	NC_019936	GCT	2	6	167014	167019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925379
3593	NC_019936	TGC	2	6	167070	167075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925379
3594	NC_019936	ATG	2	6	167114	167119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925379
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3596	NC_019936	CACGC	2	10	167240	167249	20 %	0 %	20 %	60 %	431925380
3597	NC_019936	CAG	3	9	167262	167270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925380
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3600	NC_019936	CCG	2	6	167554	167559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925381
3601	NC_019936	ACA	2	6	167662	167667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925381
3602	NC_019936	GAC	2	6	167721	167726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925381
3603	NC_019936	CTG	3	9	167739	167747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925381
3604	NC_019936	CGA	2	6	167753	167758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925381
3605	NC_019936	GTG	2	6	167795	167800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925381
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3607	NC_019936	TGC	2	6	167869	167874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925381
3608	NC_019936	GCT	3	9	167975	167983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925381
3609	NC_019936	CGG	2	6	168140	168145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925382
3610	NC_019936	CGA	2	6	168366	168371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925382
3611	NC_019936	CGA	2	6	168393	168398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925382
3612	NC_019936	TCC	2	6	168401	168406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925382
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3614	NC_019936	ATC	2	6	168467	168472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925382
3615	NC_019936	ATGGA	2	10	168478	168487	40 %	20 %	40 %	0 %	431925382
3616	NC_019936	GC	3	6	168508	168513	0 %	0 %	50 %	50 %	431925382
3617	NC_019936	GCC	2	6	168525	168530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925382
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3620	NC_019936	TGC	2	6	168557	168562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925382
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3860	NC_019936	TG	3	6	181023	181028	0 %	50 %	50 %	0 %	431925392
3861	NC_019936	GCA	2	6	181134	181139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925392
3862	NC_019936	CGC	2	6	181228	181233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925392
3863	NC_019936	CCAG	2	8	181242	181249	25 %	0 %	25 %	50 %	431925392
3864	NC_019936	CGG	2	6	181309	181314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925392
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3880	NC_019936	GC	3	6	182423	182428	0 %	0 %	50 %	50 %	431925394
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3980	NC_019936	CTG	2	6	186634	186639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3981	NC_019936	ATC	2	6	186680	186685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925398
3982	NC_019936	TGG	2	6	186695	186700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925398
3983	NC_019936	CAG	2	6	186706	186711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3984	NC_019936	CGC	2	6	186720	186725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925398
3985	NC_019936	CTG	2	6	186781	186786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3986	NC_019936	GTT	2	6	186813	186818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925398
3987	NC_019936	GCC	2	6	186854	186859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925398
3988	NC_019936	AGC	2	6	186887	186892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3989	NC_019936	CTG	2	6	186925	186930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3990	NC_019936	CAG	2	6	186955	186960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3991	NC_019936	GCCG	2	8	187030	187037	0 %	0 %	50 %	50 %	431925398
3992	NC_019936	GCA	2	6	187056	187061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925398
3993	NC_019936	GC	3	6	187112	187117	0 %	0 %	50 %	50 %	431925398
3994	NC_019936	ACCGC	2	10	187181	187190	20 %	0 %	20 %	60 %	431925398
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3997	NC_019936	GCCAG	2	10	187227	187236	20 %	0 %	40 %	40 %	431925398
3998	NC_019936	GGC	2	6	187239	187244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925398
3999	NC_019936	GAT	2	6	187261	187266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925398
4000	NC_019936	GTC	2	6	187297	187302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925398

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