MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri RCH2 chromosome

Total Repeats: 94592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019936	CCA	2	6	138553	138558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925348
3002	NC_019936	TCG	2	6	139071	139076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3003	NC_019936	TCG	2	6	139086	139091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3004	NC_019936	ATG	2	6	139176	139181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3005	NC_019936	CGT	2	6	139204	139209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3006	NC_019936	CCG	2	6	139218	139223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925349
3007	NC_019936	GTA	2	6	139247	139252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3008	NC_019936	TCG	2	6	139257	139262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3009	NC_019936	CG	3	6	139310	139315	0 %	0 %	50 %	50 %	431925349
3010	NC_019936	GTC	2	6	139340	139345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3011	NC_019936	TGA	2	6	139348	139353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3012	NC_019936	GTG	2	6	139455	139460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925349
3013	NC_019936	CTT	2	6	139517	139522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925349
3014	NC_019936	GTG	2	6	139589	139594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925349
3015	NC_019936	GC	3	6	139611	139616	0 %	0 %	50 %	50 %	431925349
3016	NC_019936	GCG	2	6	139629	139634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925349
3017	NC_019936	ATC	2	6	139635	139640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925349
3018	NC_019936	ATG	2	6	139641	139646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3019	NC_019936	GC	3	6	139660	139665	0 %	0 %	50 %	50 %	431925349
3020	NC_019936	ATGGTC	2	12	139671	139682	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	431925349
3021	NC_019936	GC	3	6	139687	139692	0 %	0 %	50 %	50 %	431925349
3022	NC_019936	GCC	2	6	139697	139702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925349
3023	NC_019936	GAG	2	6	139706	139711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925349
3024	NC_019936	GC	3	6	139777	139782	0 %	0 %	50 %	50 %	431925349
3025	NC_019936	AG	3	6	139809	139814	50 %	0 %	50 %	0 %	431925349
3026	NC_019936	CGA	2	6	139823	139828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3027	NC_019936	TGA	2	6	139843	139848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3028	NC_019936	CAC	2	6	139853	139858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925349
3029	NC_019936	GCA	2	6	139888	139893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3030	NC_019936	CGA	2	6	140098	140103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3031	NC_019936	GAT	2	6	140198	140203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3032	NC_019936	GTT	2	6	140204	140209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925349
3033	NC_019936	TTC	2	6	140322	140327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925349
3034	NC_019936	ACC	2	6	140349	140354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925349
3035	NC_019936	TGA	2	6	140374	140379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3036	NC_019936	GAT	2	6	140390	140395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3037	NC_019936	GTG	2	6	140475	140480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925349
3038	NC_019936	CCA	2	6	140518	140523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925349
3039	NC_019936	GAT	2	6	140555	140560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3040	NC_019936	GAA	2	6	140669	140674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925349
3041	NC_019936	GCA	2	6	140743	140748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3042	NC_019936	GAA	2	6	140765	140770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925349
3043	NC_019936	CAG	2	6	140771	140776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3044	NC_019936	CGG	2	6	140791	140796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925349
3045	NC_019936	TGC	2	6	140863	140868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3046	NC_019936	CGA	2	6	140890	140895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3047	NC_019936	AACC	2	8	140931	140938	50 %	0 %	0 %	50 %	431925349
3048	NC_019936	TGG	2	6	140944	140949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925349
3049	NC_019936	TGA	2	6	140950	140955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3050	NC_019936	CAG	3	9	141017	141025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3051	NC_019936	CTG	2	6	141037	141042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925349
3052	NC_019936	ATG	2	6	141063	141068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925349
3053	NC_019936	GCG	2	6	141087	141092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925349
3054	NC_019936	GCCT	2	8	141405	141412	0 %	25 %	25 %	50 %	431925350
3055	NC_019936	ACC	2	6	141469	141474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925350
3056	NC_019936	GCA	2	6	141506	141511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925350
3057	NC_019936	CGG	2	6	141523	141528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925350
3058	NC_019936	ACGA	2	8	141586	141593	50 %	0 %	25 %	25 %	431925350
3059	NC_019936	TCC	2	6	141637	141642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925350
3060	NC_019936	GC	3	6	141672	141677	0 %	0 %	50 %	50 %	431925350
3061	NC_019936	GCGTTC	2	12	141726	141737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925350
3062	NC_019936	CGC	2	6	141773	141778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925350
3063	NC_019936	GCG	2	6	141798	141803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925350
3064	NC_019936	GCA	2	6	141809	141814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925350
3065	NC_019936	CGA	2	6	141866	141871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925350
3066	NC_019936	GTC	2	6	141901	141906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925350
3067	NC_019936	CGG	2	6	141921	141926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925350
3068	NC_019936	CAGG	2	8	141974	141981	25 %	0 %	50 %	25 %	431925350
3069	NC_019936	GCG	2	6	142176	142181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925351
3070	NC_019936	TTGC	2	8	142190	142197	0 %	50 %	25 %	25 %	431925351
3071	NC_019936	TGG	2	6	142208	142213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925351
3072	NC_019936	CTG	2	6	142214	142219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925351
3073	NC_019936	CG	3	6	142372	142377	0 %	0 %	50 %	50 %	431925351
3074	NC_019936	TCG	2	6	142395	142400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925351
3075	NC_019936	CGG	2	6	142534	142539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925351
3076	NC_019936	TGA	2	6	142618	142623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925351
3077	NC_019936	GGC	2	6	142628	142633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925351
3078	NC_019936	ATG	2	6	142650	142655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925351
3079	NC_019936	CGG	2	6	143052	143057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925352
3080	NC_019936	GAA	2	6	143094	143099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925352
3081	NC_019936	GGA	2	6	143117	143122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431925352
3082	NC_019936	TCA	2	6	143141	143146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925352
3083	NC_019936	GTC	2	6	143193	143198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925352
3084	NC_019936	TGT	3	9	143216	143224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925352
3085	NC_019936	GGCG	2	8	143254	143261	0 %	0 %	75 %	25 %	431925352
3086	NC_019936	TTC	2	6	143277	143282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925352
3087	NC_019936	TGCA	2	8	143327	143334	25 %	25 %	25 %	25 %	431925353
3088	NC_019936	GCG	3	9	143340	143348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925353
3089	NC_019936	GCG	2	6	143389	143394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925353
3090	NC_019936	TCGGCC	2	12	143421	143432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	431925353
3091	NC_019936	GCG	2	6	143571	143576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925353
3092	NC_019936	GTC	2	6	143579	143584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925353
3093	NC_019936	CAG	2	6	143666	143671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925353
3094	NC_019936	GCAG	2	8	143779	143786	25 %	0 %	50 %	25 %	431925353
3095	NC_019936	GGC	2	6	143791	143796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925353
3096	NC_019936	CAT	2	6	143825	143830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925353
3097	NC_019936	GCT	2	6	143854	143859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925353
3098	NC_019936	GCCG	2	8	144011	144018	0 %	0 %	50 %	50 %	431925353
3099	NC_019936	CGC	2	6	144073	144078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925353
3100	NC_019936	CGA	3	9	144085	144093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925353
3101	NC_019936	TGCG	2	8	144118	144125	0 %	25 %	50 %	25 %	431925353
3102	NC_019936	GTA	2	6	144131	144136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925353
3103	NC_019936	CGG	3	9	144175	144183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925353
3104	NC_019936	CTG	2	6	144254	144259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925353
3105	NC_019936	ACACCC	2	12	144274	144285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925353
3106	NC_019936	CTG	2	6	144302	144307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925353
3107	NC_019936	TCT	2	6	144447	144452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925354
3108	NC_019936	CAGC	2	8	144468	144475	25 %	0 %	25 %	50 %	431925354
3109	NC_019936	CGC	2	6	144478	144483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925354
3110	NC_019936	CGT	2	6	144498	144503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925354
3111	NC_019936	GCAGC	2	10	144547	144556	20 %	0 %	40 %	40 %	431925354
3112	NC_019936	TGC	2	6	144789	144794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925354
3113	NC_019936	GCT	3	9	144846	144854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925354
3114	NC_019936	GAT	2	6	144886	144891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925354
3115	NC_019936	AGC	2	6	144971	144976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925354
3116	NC_019936	ACC	2	6	144983	144988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925354
3117	NC_019936	CAG	2	6	145009	145014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925354
3118	NC_019936	GC	3	6	145121	145126	0 %	0 %	50 %	50 %	431925354
3119	NC_019936	GTGC	2	8	145157	145164	0 %	25 %	50 %	25 %	431925354
3120	NC_019936	CTG	2	6	145285	145290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925354
3121	NC_019936	GTG	2	6	145308	145313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431925354
3122	NC_019936	GC	3	6	145363	145368	0 %	0 %	50 %	50 %	431925354
3123	NC_019936	GCC	2	6	145376	145381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925354
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3230	NC_019936	GGCC	2	8	149854	149861	0 %	0 %	50 %	50 %	431925358
3231	NC_019936	CG	3	6	149871	149876	0 %	0 %	50 %	50 %	431925358
3232	NC_019936	GTT	2	6	149900	149905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431925358
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3234	NC_019936	TTC	2	6	149973	149978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431925358
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3236	NC_019936	GAC	2	6	150018	150023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925358
3237	NC_019936	ACTTCG	2	12	150033	150044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	431925358
3238	NC_019936	CGG	2	6	150076	150081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925358
3239	NC_019936	CGA	2	6	150082	150087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925358
3240	NC_019936	GCG	2	6	150096	150101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925358
3241	NC_019936	CCGC	2	8	150150	150157	0 %	0 %	25 %	75 %	431925358
3242	NC_019936	GGC	2	6	150164	150169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925358
3243	NC_019936	GCC	2	6	150191	150196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925358
3244	NC_019936	CGC	2	6	150208	150213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925358
3245	NC_019936	GGC	2	6	150215	150220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925358
3246	NC_019936	GAT	2	6	150221	150226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925358
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3248	NC_019936	GCT	2	6	150266	150271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925358
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3250	NC_019936	CGG	2	6	150703	150708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925359
3251	NC_019936	TGCCAG	2	12	150713	150724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	431925359
3252	NC_019936	CCT	2	6	150739	150744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431925359
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3255	NC_019936	CTG	2	6	150812	150817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925359
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3260	NC_019936	CGG	2	6	150971	150976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925359
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3262	NC_019936	CATG	2	8	151033	151040	25 %	25 %	25 %	25 %	431925359
3263	NC_019936	AGC	2	6	151056	151061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925359
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3267	NC_019936	AGC	2	6	151342	151347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925359
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3269	NC_019936	GC	4	8	151429	151436	0 %	0 %	50 %	50 %	431925359
3270	NC_019936	GGCC	2	8	151441	151448	0 %	0 %	50 %	50 %	431925359
3271	NC_019936	CCA	2	6	151480	151485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925359
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3276	NC_019936	TCG	2	6	151632	151637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925359
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3278	NC_019936	GCT	2	6	151688	151693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925359
3279	NC_019936	GATCCA	2	12	151714	151725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	431925359
3280	NC_019936	CTG	2	6	151775	151780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925359
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3282	NC_019936	GCTG	2	8	151852	151859	0 %	25 %	50 %	25 %	431925359
3283	NC_019936	GC	3	6	151883	151888	0 %	0 %	50 %	50 %	431925359
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3323	NC_019936	ATG	2	6	154147	154152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431925363
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3326	NC_019936	CGGG	2	8	154293	154300	0 %	0 %	75 %	25 %	431925363
3327	NC_019936	AGGCGC	2	12	154331	154342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	431925363
3328	NC_019936	CAT	2	6	154487	154492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431925364
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3330	NC_019936	ACG	2	6	154588	154593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925364
3331	NC_019936	CGA	2	6	154604	154609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925364
3332	NC_019936	ACC	2	6	154653	154658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431925364
3333	NC_019936	GCCA	2	8	154680	154687	25 %	0 %	25 %	50 %	431925364
3334	NC_019936	CGG	2	6	154709	154714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925364
3335	NC_019936	TCG	2	6	154807	154812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925364
3336	NC_019936	TCG	3	9	154846	154854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925364
3337	NC_019936	GAA	2	6	154865	154870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925364
3338	NC_019936	GGCG	2	8	154917	154924	0 %	0 %	75 %	25 %	431925364
3339	NC_019936	GAA	2	6	154958	154963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925364
3340	NC_019936	CTG	2	6	154992	154997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925364
3341	NC_019936	GCA	2	6	155108	155113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925364
3342	NC_019936	AAGGC	2	10	155134	155143	40 %	0 %	40 %	20 %	431925364
3343	NC_019936	GCC	2	6	155157	155162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925364
3344	NC_019936	GCC	2	6	155214	155219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925364
3345	NC_019936	CGC	2	6	155350	155355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431925365
3346	NC_019936	GCG	2	6	155357	155362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925365
3347	NC_019936	CTG	2	6	155414	155419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925365
3348	NC_019936	ACA	2	6	155439	155444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431925365
3349	NC_019936	GGC	2	6	155446	155451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925365
3350	NC_019936	CGA	2	6	155473	155478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925365
3351	NC_019936	GC	3	6	155524	155529	0 %	0 %	50 %	50 %	431925365
3352	NC_019936	GAC	2	6	155675	155680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925365
3353	NC_019936	GCGAT	2	10	155766	155775	20 %	20 %	40 %	20 %	431925365
3354	NC_019936	GAA	2	6	155839	155844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431925365
3355	NC_019936	GCCG	2	8	155888	155895	0 %	0 %	50 %	50 %	431925365
3356	NC_019936	TGC	2	6	155937	155942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431925365
3357	NC_019936	CGA	3	9	155986	155994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925365
3358	NC_019936	ACGC	2	8	156060	156067	25 %	0 %	25 %	50 %	431925365
3359	NC_019936	CTGAG	2	10	156073	156082	20 %	20 %	40 %	20 %	431925365
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3480	NC_019936	GGC	2	6	161243	161248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925370
3481	NC_019936	GCG	2	6	161265	161270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431925370
3482	NC_019936	GC	3	6	161313	161318	0 %	0 %	50 %	50 %	431925370
3483	NC_019936	CGA	2	6	161341	161346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925370
3484	NC_019936	AGC	2	6	161347	161352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431925370
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