MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Pseudomonas putida HB3267 plasmid pPC9

Total Repeats: 1322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019906	GAT	2	6	61722	61727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805327
1002	NC_019906	CCGG	2	8	61754	61761	0 %	0 %	50 %	50 %	431805327
1003	NC_019906	TCG	2	6	61786	61791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805327
1004	NC_019906	TCG	2	6	61816	61821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805327
1005	NC_019906	GC	3	6	61901	61906	0 %	0 %	50 %	50 %	431805327
1006	NC_019906	AC	3	6	61942	61947	50 %	0 %	0 %	50 %	431805327
1007	NC_019906	GAA	2	6	62051	62056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805327
1008	NC_019906	ATC	2	6	62127	62132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805327
1009	NC_019906	CTG	3	9	62157	62165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805327
1010	NC_019906	GGC	2	6	62233	62238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805327
1011	NC_019906	CTG	2	6	62244	62249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805327
1012	NC_019906	TG	3	6	62511	62516	0 %	50 %	50 %	0 %	431805328
1013	NC_019906	AG	3	6	62588	62593	50 %	0 %	50 %	0 %	431805328
1014	NC_019906	CGT	2	6	62888	62893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805328
1015	NC_019906	TGA	2	6	62948	62953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805328
1016	NC_019906	ACC	2	6	63018	63023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431805328
1017	NC_019906	CTT	2	6	63060	63065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431805328
1018	NC_019906	TCG	2	6	63214	63219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805328
1019	NC_019906	GCC	2	6	63230	63235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805328
1020	NC_019906	AGC	2	6	63241	63246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805328
1021	NC_019906	GTG	2	6	63324	63329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805328
1022	NC_019906	CAC	2	6	64738	64743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431805329
1023	NC_019906	GC	3	6	64844	64849	0 %	0 %	50 %	50 %	431805329
1024	NC_019906	GGTC	2	8	64852	64859	0 %	25 %	50 %	25 %	431805329
1025	NC_019906	T	6	6	64861	64866	0 %	100 %	0 %	0 %	431805329
1026	NC_019906	GCT	2	6	64898	64903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805329
1027	NC_019906	CAG	2	6	64937	64942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805329
1028	NC_019906	TCG	2	6	64953	64958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805329
1029	NC_019906	GCG	2	6	65024	65029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805329
1030	NC_019906	TGC	2	6	65032	65037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805329
1031	NC_019906	TCCGGC	2	12	65049	65060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	431805329
1032	NC_019906	GCC	2	6	65109	65114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805329
1033	NC_019906	T	7	7	65148	65154	0 %	100 %	0 %	0 %	431805329
1034	NC_019906	GCC	2	6	65278	65283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805330
1035	NC_019906	CGC	2	6	65289	65294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805330
1036	NC_019906	TGC	2	6	65299	65304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805330
1037	NC_019906	GCG	2	6	65339	65344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805330
1038	NC_019906	CGGCG	2	10	65394	65403	0 %	0 %	60 %	40 %	431805330
1039	NC_019906	TGG	2	6	65405	65410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805330
1040	NC_019906	GGC	2	6	65426	65431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805330
1041	NC_019906	ACCG	2	8	65438	65445	25 %	0 %	25 %	50 %	431805330
1042	NC_019906	TG	4	8	65469	65476	0 %	50 %	50 %	0 %	431805330
1043	NC_019906	GC	3	6	65490	65495	0 %	0 %	50 %	50 %	431805330
1044	NC_019906	TCA	2	6	65591	65596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805331
1045	NC_019906	A	6	6	65599	65604	100 %	0 %	0 %	0 %	431805331
1046	NC_019906	CT	3	6	65613	65618	0 %	50 %	0 %	50 %	431805331
1047	NC_019906	GTT	2	6	65632	65637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805331
1048	NC_019906	GCC	2	6	65650	65655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805331
1049	NC_019906	AAG	2	6	65716	65721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805331
1050	NC_019906	GAT	2	6	65794	65799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431805331
1051	NC_019906	AAG	2	6	65863	65868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805331
1052	NC_019906	GCG	2	6	65985	65990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1053	NC_019906	CCG	3	9	66103	66111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805332
1054	NC_019906	TGGC	2	8	66112	66119	0 %	25 %	50 %	25 %	431805332
1055	NC_019906	CCGA	2	8	66153	66160	25 %	0 %	25 %	50 %	431805332
1056	NC_019906	GCC	2	6	66204	66209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805332
1057	NC_019906	GCG	3	9	66220	66228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1058	NC_019906	GGC	2	6	66275	66280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1059	NC_019906	GC	3	6	66304	66309	0 %	0 %	50 %	50 %	431805332
1060	NC_019906	CGG	2	6	66338	66343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1061	NC_019906	TG	3	6	66363	66368	0 %	50 %	50 %	0 %	431805332
1062	NC_019906	CGC	2	6	66389	66394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805332
1063	NC_019906	CGG	2	6	66431	66436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1064	NC_019906	CCAC	2	8	66441	66448	25 %	0 %	0 %	75 %	431805332
1065	NC_019906	CCG	2	6	66450	66455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805332
1066	NC_019906	GCT	2	6	66473	66478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805332
1067	NC_019906	CAG	3	9	66483	66491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805332
1068	NC_019906	GAA	2	6	66501	66506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431805332
1069	NC_019906	GAC	2	6	66585	66590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805332
1070	NC_019906	CGT	2	6	66629	66634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805332
1071	NC_019906	CGG	2	6	66673	66678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1072	NC_019906	CCG	2	6	66681	66686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805332
1073	NC_019906	GCGA	2	8	66735	66742	25 %	0 %	50 %	25 %	431805332
1074	NC_019906	TCG	2	6	66774	66779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805332
1075	NC_019906	GTG	2	6	66780	66785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	431805332
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1081	NC_019906	GC	3	6	66998	67003	0 %	0 %	50 %	50 %	431805332
1082	NC_019906	CTG	2	6	67011	67016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805332
1083	NC_019906	CGGC	2	8	67141	67148	0 %	0 %	50 %	50 %	431805332
1084	NC_019906	GGC	2	6	67181	67186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1085	NC_019906	CGGC	2	8	67189	67196	0 %	0 %	50 %	50 %	431805332
1086	NC_019906	CGG	2	6	67220	67225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1087	NC_019906	GCG	2	6	67230	67235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805332
1088	NC_019906	GCCG	2	8	67253	67260	0 %	0 %	50 %	50 %	431805332
1089	NC_019906	CAC	2	6	67314	67319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431805332
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1092	NC_019906	TCA	2	6	67399	67404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431805332
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1095	NC_019906	CAA	2	6	67589	67594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805332
1096	NC_019906	AGC	2	6	67603	67608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805332
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1098	NC_019906	GGCT	2	8	67668	67675	0 %	25 %	50 %	25 %	431805333
1099	NC_019906	CTG	2	6	67715	67720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805333
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1103	NC_019906	GCGG	2	8	67804	67811	0 %	0 %	75 %	25 %	431805333
1104	NC_019906	GCG	2	6	67868	67873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431805333
1105	NC_019906	CGA	2	6	67879	67884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805333
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1107	NC_019906	TCG	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431805333
1108	NC_019906	CCGA	2	8	67973	67980	25 %	0 %	25 %	50 %	431805333
1109	NC_019906	AAC	2	6	68011	68016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431805333
1110	NC_019906	CCG	2	6	68135	68140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805334
1111	NC_019906	CCGG	2	8	68252	68259	0 %	0 %	50 %	50 %	431805335
1112	NC_019906	ATGG	2	8	68260	68267	25 %	25 %	50 %	0 %	431805335
1113	NC_019906	ACG	2	6	68268	68273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431805335
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1119	NC_019906	CCG	2	6	68614	68619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805335
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1122	NC_019906	CCG	2	6	68822	68827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805335
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1126	NC_019906	CCA	2	6	69022	69027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431805335
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1243	NC_019906	GCC	2	6	75728	75733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431805343
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1251	NC_019906	TTG	2	6	75917	75922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431805343
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1253	NC_019906	CAC	2	6	75961	75966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431805343
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