MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudanabaena sp. PCC 7367 chromosome

Total Repeats: 67895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_019701	ACC	2	6	1190467	1190472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428217184
18002	NC_019701	TTC	2	6	1190518	1190523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428217184
18003	NC_019701	TGT	2	6	1190546	1190551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428217184
18004	NC_019701	CG	3	6	1190651	1190656	0 %	0 %	50 %	50 %	428217184
18005	NC_019701	TCCA	2	8	1190710	1190717	25 %	25 %	0 %	50 %	428217184
18006	NC_019701	TCGA	2	8	1190741	1190748	25 %	25 %	25 %	25 %	428217184
18007	NC_019701	TTA	2	6	1190954	1190959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217184
18008	NC_019701	GTTT	2	8	1191942	1191949	0 %	75 %	25 %	0 %	428217185
18009	NC_019701	CAATG	2	10	1191980	1191989	40 %	20 %	20 %	20 %	428217185
18010	NC_019701	CGAT	2	8	1192020	1192027	25 %	25 %	25 %	25 %	428217185
18011	NC_019701	AT	3	6	1192026	1192031	50 %	50 %	0 %	0 %	428217185
18012	NC_019701	TGG	2	6	1192143	1192148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217185
18013	NC_019701	GCAAA	2	10	1192193	1192202	60 %	0 %	20 %	20 %	428217185
18014	NC_019701	CG	3	6	1192255	1192260	0 %	0 %	50 %	50 %	428217185
18015	NC_019701	ATCG	2	8	1192267	1192274	25 %	25 %	25 %	25 %	428217185
18016	NC_019701	AAT	2	6	1192302	1192307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428217185
18017	NC_019701	AGAAT	2	10	1192309	1192318	60 %	20 %	20 %	0 %	428217186
18018	NC_019701	TGT	2	6	1192337	1192342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428217186
18019	NC_019701	CAAA	2	8	1192353	1192360	75 %	0 %	0 %	25 %	428217186
18020	NC_019701	ATT	2	6	1192409	1192414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217186
18021	NC_019701	TCA	2	6	1192433	1192438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428217186
18022	NC_019701	GATC	2	8	1192679	1192686	25 %	25 %	25 %	25 %	428217186
18023	NC_019701	CAC	2	6	1192699	1192704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428217186
18024	NC_019701	CGAT	2	8	1192717	1192724	25 %	25 %	25 %	25 %	428217186
18025	NC_019701	GAT	2	6	1192824	1192829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217186
18026	NC_019701	AG	3	6	1192852	1192857	50 %	0 %	50 %	0 %	428217186
18027	NC_019701	TGA	2	6	1192913	1192918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217186
18028	NC_019701	CAA	2	6	1192920	1192925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428217186
18029	NC_019701	C	6	6	1192941	1192946	0 %	0 %	0 %	100 %	428217186
18030	NC_019701	ATT	2	6	1192960	1192965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217186
18031	NC_019701	TTG	2	6	1192972	1192977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428217186
18032	NC_019701	CGCTTG	2	12	1193038	1193049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428217186
18033	NC_019701	GAT	2	6	1193088	1193093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217186
18034	NC_019701	A	6	6	1193099	1193104	100 %	0 %	0 %	0 %	428217186
18035	NC_019701	GTG	2	6	1193163	1193168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217186
18036	NC_019701	A	7	7	1193296	1193302	100 %	0 %	0 %	0 %	428217186
18037	NC_019701	TGG	2	6	1193329	1193334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217186
18038	NC_019701	CGT	2	6	1193348	1193353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428217186
18039	NC_019701	TGCT	2	8	1193896	1193903	0 %	50 %	25 %	25 %	428217187
18040	NC_019701	AC	3	6	1193907	1193912	50 %	0 %	0 %	50 %	428217187
18041	NC_019701	CTA	2	6	1193957	1193962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428217187
18042	NC_019701	A	7	7	1193962	1193968	100 %	0 %	0 %	0 %	428217187
18043	NC_019701	GCC	2	6	1193984	1193989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428217187
18044	NC_019701	ACC	2	6	1194023	1194028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428217187
18045	NC_019701	GGGC	2	8	1194063	1194070	0 %	0 %	75 %	25 %	428217187
18046	NC_019701	A	6	6	1194109	1194114	100 %	0 %	0 %	0 %	428217187
18047	NC_019701	ATCG	2	8	1194184	1194191	25 %	25 %	25 %	25 %	428217187
18048	NC_019701	ACC	2	6	1194201	1194206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428217187
18049	NC_019701	TGGTT	2	10	1194230	1194239	0 %	60 %	40 %	0 %	428217187
18050	NC_019701	GCG	2	6	1194261	1194266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428217187
18051	NC_019701	CAG	2	6	1194303	1194308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428217187
18052	NC_019701	ATT	2	6	1194404	1194409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217187
18053	NC_019701	TGGC	2	8	1194412	1194419	0 %	25 %	50 %	25 %	428217187
18054	NC_019701	GATC	2	8	1194431	1194438	25 %	25 %	25 %	25 %	428217187
18055	NC_019701	CAT	2	6	1194644	1194649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428217188
18056	NC_019701	TGG	2	6	1194770	1194775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217188
18057	NC_019701	GTG	2	6	1194940	1194945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217188
18058	NC_019701	ATT	2	6	1194952	1194957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217188
18059	NC_019701	CGAT	2	8	1194999	1195006	25 %	25 %	25 %	25 %	428217188
18060	NC_019701	CACC	2	8	1195556	1195563	25 %	0 %	0 %	75 %	428217189
18061	NC_019701	ATCG	2	8	1195582	1195589	25 %	25 %	25 %	25 %	428217189
18062	NC_019701	TGT	2	6	1195638	1195643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428217189
18063	NC_019701	CGAT	2	8	1195655	1195662	25 %	25 %	25 %	25 %	428217189
18064	NC_019701	CAAT	2	8	1195715	1195722	50 %	25 %	0 %	25 %	428217189
18065	NC_019701	CAG	2	6	1195877	1195882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428217189
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18068	NC_019701	GGT	2	6	1195968	1195973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217189
18069	NC_019701	GGT	2	6	1195998	1196003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217189
18070	NC_019701	TGG	2	6	1196070	1196075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217189
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18072	NC_019701	TGAT	2	8	1196144	1196151	25 %	50 %	25 %	0 %	428217189
18073	NC_019701	CTG	2	6	1196158	1196163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428217189
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18083	NC_019701	TGG	2	6	1196742	1196747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217189
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18087	NC_019701	GATT	2	8	1196981	1196988	25 %	50 %	25 %	0 %	428217189
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18089	NC_019701	ATCG	2	8	1197606	1197613	25 %	25 %	25 %	25 %	428217190
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18097	NC_019701	ATG	2	6	1198099	1198104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217190
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18099	NC_019701	TGA	2	6	1198228	1198233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217190
18100	NC_019701	GAT	2	6	1198359	1198364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217190
18101	NC_019701	CGC	2	6	1198368	1198373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428217190
18102	NC_019701	TTGGG	2	10	1198407	1198416	0 %	40 %	60 %	0 %	428217190
18103	NC_019701	GCCA	2	8	1198491	1198498	25 %	0 %	25 %	50 %	428217190
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18105	NC_019701	GTCT	2	8	1199321	1199328	0 %	50 %	25 %	25 %	428217191
18106	NC_019701	ATA	2	6	1199361	1199366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428217191
18107	NC_019701	ATCG	2	8	1199443	1199450	25 %	25 %	25 %	25 %	428217191
18108	NC_019701	GAT	2	6	1199674	1199679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217191
18109	NC_019701	GGGA	2	8	1199757	1199764	25 %	0 %	75 %	0 %	428217191
18110	NC_019701	CGG	2	6	1199766	1199771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428217191
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18112	NC_019701	AGC	2	6	1199841	1199846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428217191
18113	NC_019701	CAT	2	6	1199857	1199862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428217191
18114	NC_019701	GAT	2	6	1199935	1199940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217191
18115	NC_019701	TTA	2	6	1199982	1199987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217191
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18117	NC_019701	AAG	2	6	1200030	1200035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428217191
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18218	NC_019701	AATC	2	8	1206242	1206249	50 %	25 %	0 %	25 %	428217196
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18221	NC_019701	C	7	7	1206377	1206383	0 %	0 %	0 %	100 %	428217196
18222	NC_019701	AGC	2	6	1206384	1206389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428217196
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18227	NC_019701	CGC	2	6	1206764	1206769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428217196
18228	NC_019701	GAT	2	6	1206785	1206790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217196
18229	NC_019701	CTT	2	6	1206812	1206817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428217196
18230	NC_019701	ATT	2	6	1206839	1206844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428217196
18231	NC_019701	GCTC	2	8	1206918	1206925	0 %	25 %	25 %	50 %	428217196
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18351	NC_019701	C	6	6	1216036	1216041	0 %	0 %	0 %	100 %	428217207
18352	NC_019701	AGC	2	6	1216060	1216065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428217207
18353	NC_019701	TTG	2	6	1216097	1216102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428217207
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18456	NC_019701	T	8	8	1222992	1222999	0 %	100 %	0 %	0 %	428217213
18457	NC_019701	CTA	2	6	1223149	1223154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428217214
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18460	NC_019701	AG	3	6	1223319	1223324	50 %	0 %	50 %	0 %	428217214
18461	NC_019701	AGATCA	2	12	1223331	1223342	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428217214
18462	NC_019701	GTA	2	6	1223419	1223424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428217214
18463	NC_019701	TGG	2	6	1223495	1223500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428217214
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18465	NC_019701	CTG	2	6	1223794	1223799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428217215
18466	NC_019701	GTT	2	6	1223940	1223945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428217215
18467	NC_019701	TA	3	6	1224349	1224354	50 %	50 %	0 %	0 %	428217216
18468	NC_019701	CA	3	6	1224394	1224399	50 %	0 %	0 %	50 %	428217216
18469	NC_019701	CA	3	6	1224571	1224576	50 %	0 %	0 %	50 %	428217216
18470	NC_019701	GCA	2	6	1224591	1224596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428217216
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18481	NC_019701	AT	3	6	1225387	1225392	50 %	50 %	0 %	0 %	428217216
18482	NC_019701	CGG	2	6	1225438	1225443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428217216
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18493	NC_019701	TCT	2	6	1226408	1226413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428217217
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18496	NC_019701	A	6	6	1226635	1226640	100 %	0 %	0 %	0 %	428217217
18497	NC_019701	AAT	2	6	1226689	1226694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428217217
18498	NC_019701	GATC	2	8	1226718	1226725	25 %	25 %	25 %	25 %	428217217
18499	NC_019701	CTTG	2	8	1226781	1226788	0 %	50 %	25 %	25 %	428217217
18500	NC_019701	TTGAT	2	10	1226815	1226824	20 %	60 %	20 %	0 %	428217217

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