MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudanabaena sp. PCC 7367 chromosome

Total Repeats: 67895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019701	GCC	2	6	33096	33101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216310
502	NC_019701	CCAGA	2	10	33157	33166	40 %	0 %	20 %	40 %	428216310
503	NC_019701	CCG	2	6	33178	33183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216310
504	NC_019701	GTC	2	6	33272	33277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216310
505	NC_019701	ACC	2	6	33356	33361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216310
506	NC_019701	CAGG	2	8	33388	33395	25 %	0 %	50 %	25 %	428216310
507	NC_019701	CAG	2	6	33473	33478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216310
508	NC_019701	GTC	2	6	33479	33484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216310
509	NC_019701	ACC	2	6	33518	33523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216310
510	NC_019701	CAC	2	6	33547	33552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216310
511	NC_019701	CAAA	2	8	33577	33584	75 %	0 %	0 %	25 %	428216310
512	NC_019701	ACA	2	6	33609	33614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216310
513	NC_019701	GTC	2	6	33641	33646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216310
514	NC_019701	TCA	3	9	33666	33674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216310
515	NC_019701	CAC	2	6	33679	33684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216310
516	NC_019701	GTC	2	6	33722	33727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216310
517	NC_019701	CCA	2	6	33729	33734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216310
518	NC_019701	TCA	2	6	33804	33809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216310
519	NC_019701	A	6	6	33836	33841	100 %	0 %	0 %	0 %	428216310
520	NC_019701	AGC	2	6	34597	34602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216311
521	NC_019701	CGAT	2	8	34613	34620	25 %	25 %	25 %	25 %	428216311
522	NC_019701	GTG	2	6	34659	34664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216311
523	NC_019701	T	6	6	34709	34714	0 %	100 %	0 %	0 %	428216311
524	NC_019701	CCG	2	6	34728	34733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216311
525	NC_019701	TTG	2	6	34816	34821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216311
526	NC_019701	CGG	3	9	34827	34835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216311
527	NC_019701	GGC	2	6	34909	34914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216311
528	NC_019701	CAG	2	6	34930	34935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216311
529	NC_019701	CGC	2	6	34977	34982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216311
530	NC_019701	T	6	6	35117	35122	0 %	100 %	0 %	0 %	428216311
531	NC_019701	TAT	2	6	35234	35239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216311
532	NC_019701	GTT	2	6	35272	35277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216311
533	NC_019701	CAAT	2	8	35311	35318	50 %	25 %	0 %	25 %	428216311
534	NC_019701	TTTG	2	8	35392	35399	0 %	75 %	25 %	0 %	428216311
535	NC_019701	CGAT	2	8	35758	35765	25 %	25 %	25 %	25 %	428216312
536	NC_019701	TGG	2	6	35893	35898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216312
537	NC_019701	CAC	2	6	35915	35920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216312
538	NC_019701	AAGC	2	8	35928	35935	50 %	0 %	25 %	25 %	428216312
539	NC_019701	GAA	2	6	35964	35969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216312
540	NC_019701	AT	3	6	36008	36013	50 %	50 %	0 %	0 %	428216312
541	NC_019701	GCC	2	6	36014	36019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216312
542	NC_019701	TCGA	2	8	36078	36085	25 %	25 %	25 %	25 %	428216312
543	NC_019701	TTTG	2	8	36125	36132	0 %	75 %	25 %	0 %	428216312
544	NC_019701	GGT	2	6	36161	36166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216312
545	NC_019701	ATCG	2	8	36170	36177	25 %	25 %	25 %	25 %	428216312
546	NC_019701	CTG	2	6	36322	36327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216312
547	NC_019701	CGCCC	2	10	36384	36393	0 %	0 %	20 %	80 %	428216312
548	NC_019701	TTG	2	6	36456	36461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216312
549	NC_019701	TG	3	6	36472	36477	0 %	50 %	50 %	0 %	428216312
550	NC_019701	TGT	2	6	36499	36504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216312
551	NC_019701	AACC	2	8	36538	36545	50 %	0 %	0 %	50 %	428216312
552	NC_019701	GCG	2	6	36609	36614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216312
553	NC_019701	AAT	2	6	36635	36640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216312
554	NC_019701	CAAT	2	8	36644	36651	50 %	25 %	0 %	25 %	428216312
555	NC_019701	GCC	2	6	36695	36700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216312
556	NC_019701	GTTG	2	8	36775	36782	0 %	50 %	50 %	0 %	428216312
557	NC_019701	GTC	2	6	36787	36792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216312
558	NC_019701	TTTA	2	8	37114	37121	25 %	75 %	0 %	0 %	428216313
559	NC_019701	TGG	2	6	37181	37186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216313
560	NC_019701	GCA	2	6	37262	37267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216313
561	NC_019701	AAGC	2	8	37273	37280	50 %	0 %	25 %	25 %	428216313
562	NC_019701	GCT	2	6	37303	37308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216313
563	NC_019701	AAT	2	6	37315	37320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216313
564	NC_019701	CCAC	2	8	37397	37404	25 %	0 %	0 %	75 %	428216313
565	NC_019701	CAC	2	6	37431	37436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216313
566	NC_019701	TTAG	2	8	37483	37490	25 %	50 %	25 %	0 %	428216313
567	NC_019701	CAG	2	6	37499	37504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216313
568	NC_019701	AATTT	2	10	37678	37687	40 %	60 %	0 %	0 %	428216313
569	NC_019701	GCAG	2	8	37702	37709	25 %	0 %	50 %	25 %	428216313
570	NC_019701	GTA	2	6	37836	37841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216313
571	NC_019701	TTG	2	6	37960	37965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216313
572	NC_019701	A	6	6	37977	37982	100 %	0 %	0 %	0 %	428216313
573	NC_019701	TCAA	2	8	38014	38021	50 %	25 %	0 %	25 %	428216313
574	NC_019701	CGGG	2	8	38033	38040	0 %	0 %	75 %	25 %	428216313
575	NC_019701	GTT	2	6	38051	38056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216313
576	NC_019701	GCTTG	2	10	38057	38066	0 %	40 %	40 %	20 %	428216313
577	NC_019701	CGG	2	6	38132	38137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216313
578	NC_019701	TAA	2	6	38285	38290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216313
579	NC_019701	CGAT	2	8	38311	38318	25 %	25 %	25 %	25 %	428216313
580	NC_019701	TGGCGG	2	12	38973	38984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428216314
581	NC_019701	CAA	2	6	39001	39006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216314
582	NC_019701	TGG	3	9	39030	39038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216314
583	NC_019701	CAGC	2	8	39057	39064	25 %	0 %	25 %	50 %	428216314
584	NC_019701	CGC	2	6	39071	39076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216314
585	NC_019701	GCG	2	6	39194	39199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216314
586	NC_019701	GGC	2	6	39247	39252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216314
587	NC_019701	TGT	2	6	39291	39296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216314
588	NC_019701	GCG	2	6	39337	39342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428216314
589	NC_019701	TGC	2	6	39366	39371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216314
590	NC_019701	CGC	2	6	39466	39471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428216314
591	NC_019701	GCA	2	6	39574	39579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
592	NC_019701	TTC	2	6	39628	39633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428216314
593	NC_019701	AGT	2	6	39667	39672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216314
594	NC_019701	AAT	2	6	39752	39757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428216314
595	NC_019701	TGT	2	6	39766	39771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428216314
596	NC_019701	GCA	2	6	39802	39807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
597	NC_019701	AG	3	6	39808	39813	50 %	0 %	50 %	0 %	428216314
598	NC_019701	AATT	2	8	39868	39875	50 %	50 %	0 %	0 %	428216314
599	NC_019701	T	6	6	39902	39907	0 %	100 %	0 %	0 %	428216314
600	NC_019701	GCA	4	12	39969	39980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
601	NC_019701	ACC	2	6	40045	40050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216314
602	NC_019701	GCA	2	6	40057	40062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
603	NC_019701	CCCAA	2	10	40092	40101	40 %	0 %	0 %	60 %	428216314
604	NC_019701	AATT	2	8	40144	40151	50 %	50 %	0 %	0 %	428216314
605	NC_019701	CAG	2	6	40199	40204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
606	NC_019701	TG	3	6	40270	40275	0 %	50 %	50 %	0 %	428216314
607	NC_019701	AAC	2	6	40335	40340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216314
608	NC_019701	AGA	2	6	40363	40368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216314
609	NC_019701	AGC	2	6	40423	40428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
610	NC_019701	ATT	2	6	40454	40459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216314
611	NC_019701	GCA	2	6	40550	40555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216314
612	NC_019701	GCT	2	6	40573	40578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216314
613	NC_019701	TGG	2	6	40722	40727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216314
614	NC_019701	AGG	2	6	40914	40919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428216314
615	NC_019701	GAA	2	6	41048	41053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428216314
616	NC_019701	AGCGA	2	10	41083	41092	40 %	0 %	40 %	20 %	428216314
617	NC_019701	AGT	2	6	41433	41438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428216315
618	NC_019701	TTGGT	2	10	41463	41472	0 %	60 %	40 %	0 %	428216315
619	NC_019701	CCA	2	6	41501	41506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428216315
620	NC_019701	GA	3	6	41563	41568	50 %	0 %	50 %	0 %	428216315
621	NC_019701	ATTA	2	8	41589	41596	50 %	50 %	0 %	0 %	428216315
622	NC_019701	AGC	2	6	41661	41666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428216315
623	NC_019701	TCAA	2	8	41725	41732	50 %	25 %	0 %	25 %	428216315
624	NC_019701	TAT	2	6	41768	41773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428216315
625	NC_019701	ATC	2	6	41791	41796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428216315
626	NC_019701	AAC	2	6	42624	42629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428216316
627	NC_019701	CT	3	6	42745	42750	0 %	50 %	0 %	50 %	428216316
628	NC_019701	GTC	2	6	42791	42796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216316
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756	NC_019701	TGG	2	6	52870	52875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428216323
757	NC_019701	TGC	2	6	52882	52887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428216323
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