MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01

Total Repeats: 4782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019690	CAAG	2	8	424	431	50 %	0 %	25 %	25 %	428219847
2	NC_019690	CT	3	6	802	807	0 %	50 %	0 %	50 %	428219848
3	NC_019690	CGAT	2	8	837	844	25 %	25 %	25 %	25 %	428219848
4	NC_019690	TGG	2	6	918	923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219848
5	NC_019690	CCA	2	6	949	954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219848
6	NC_019690	ACC	2	6	1073	1078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219848
7	NC_019690	CTAT	2	8	1155	1162	25 %	50 %	0 %	25 %	428219848
8	NC_019690	CCA	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219848
9	NC_019690	TTG	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219848
10	NC_019690	A	6	6	1394	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	428219849
11	NC_019690	ATC	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219849
12	NC_019690	G	6	6	1421	1426	0 %	0 %	100 %	0 %	428219849
13	NC_019690	TTA	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428219849
14	NC_019690	TAC	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219849
15	NC_019690	TGA	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428219849
16	NC_019690	AAC	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428219849
17	NC_019690	GCT	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219849
18	NC_019690	GCAA	2	8	1927	1934	50 %	0 %	25 %	25 %	428219849
19	NC_019690	TTTA	3	12	2309	2320	25 %	75 %	0 %	0 %	428219850
20	NC_019690	CTG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219850
21	NC_019690	AAC	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428219850
22	NC_019690	GCT	2	6	2448	2453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219850
23	NC_019690	CTG	2	6	2489	2494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219850
24	NC_019690	GCA	2	6	2638	2643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219850
25	NC_019690	CGG	2	6	2653	2658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219850
26	NC_019690	TGA	2	6	2671	2676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428219850
27	NC_019690	CTG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219850
28	NC_019690	AGGT	2	8	2821	2828	25 %	25 %	50 %	0 %	428219850
29	NC_019690	GCAG	2	8	2859	2866	25 %	0 %	50 %	25 %	428219850
30	NC_019690	CAG	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219850
31	NC_019690	G	6	6	2992	2997	0 %	0 %	100 %	0 %	428219850
32	NC_019690	TTG	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219850
33	NC_019690	GCG	2	6	3078	3083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219850
34	NC_019690	GACTA	2	10	3173	3182	40 %	20 %	20 %	20 %	428219850
35	NC_019690	GA	3	6	3778	3783	50 %	0 %	50 %	0 %	428219851
36	NC_019690	T	6	6	3800	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	428219851
37	NC_019690	GCG	2	6	3809	3814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219851
38	NC_019690	TGT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219851
39	NC_019690	TGT	2	6	4115	4120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219852
40	NC_019690	CTG	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219852
41	NC_019690	TAA	2	6	4213	4218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219852
42	NC_019690	AAT	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219852
43	NC_019690	GCT	2	6	4414	4419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219852
44	NC_019690	GGC	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219852
45	NC_019690	CGA	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219852
46	NC_019690	TTG	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219852
47	NC_019690	ATC	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219852
48	NC_019690	T	6	6	4690	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	428219852
49	NC_019690	GCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219852
50	NC_019690	G	7	7	4761	4767	0 %	0 %	100 %	0 %	428219852
51	NC_019690	GGGT	2	8	4776	4783	0 %	25 %	75 %	0 %	428219852
52	NC_019690	GGC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219852
53	NC_019690	CTGT	2	8	4915	4922	0 %	50 %	25 %	25 %	428219853
54	NC_019690	GAT	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428219853
55	NC_019690	TCAT	2	8	5105	5112	25 %	50 %	0 %	25 %	428219853
56	NC_019690	TTGCTT	2	12	5149	5160	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428219853
57	NC_019690	T	6	6	5159	5164	0 %	100 %	0 %	0 %	428219853
58	NC_019690	CTT	2	6	5202	5207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219853
59	NC_019690	TCT	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219853
60	NC_019690	A	6	6	5268	5273	100 %	0 %	0 %	0 %	428219853
61	NC_019690	AAT	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219853
62	NC_019690	TGAA	2	8	5344	5351	50 %	25 %	25 %	0 %	428219853
63	NC_019690	TC	3	6	5429	5434	0 %	50 %	0 %	50 %	428219853
64	NC_019690	TTTC	2	8	5448	5455	0 %	75 %	0 %	25 %	428219853
65	NC_019690	CTC	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428219853
66	NC_019690	AATT	2	8	5535	5542	50 %	50 %	0 %	0 %	428219853
67	NC_019690	GA	3	6	5545	5550	50 %	0 %	50 %	0 %	428219853
68	NC_019690	TAA	2	6	5567	5572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219853
69	NC_019690	AT	3	6	5591	5596	50 %	50 %	0 %	0 %	428219853
70	NC_019690	A	6	6	5620	5625	100 %	0 %	0 %	0 %	428219853
71	NC_019690	ATCC	2	8	5665	5672	25 %	25 %	0 %	50 %	428219853
72	NC_019690	ACC	3	9	5766	5774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219854
73	NC_019690	TCA	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219854
74	NC_019690	CGAT	2	8	5983	5990	25 %	25 %	25 %	25 %	428219855
75	NC_019690	CCAA	2	8	6044	6051	50 %	0 %	0 %	50 %	428219855
76	NC_019690	GCA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219855
77	NC_019690	ACG	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219855
78	NC_019690	CTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219855
79	NC_019690	TGG	2	6	6260	6265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219855
80	NC_019690	TGG	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219855
81	NC_019690	TGG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219855
82	NC_019690	AACAGG	2	12	6342	6353	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428219855
83	NC_019690	CCA	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219855
84	NC_019690	TCC	2	6	6376	6381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428219855
85	NC_019690	GCCAT	2	10	6474	6483	20 %	20 %	20 %	40 %	428219856
86	NC_019690	TAA	2	6	6649	6654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219856
87	NC_019690	G	6	6	6730	6735	0 %	0 %	100 %	0 %	428219856
88	NC_019690	ATCA	2	8	6808	6815	50 %	25 %	0 %	25 %	428219856
89	NC_019690	GGC	3	9	6844	6852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219856
90	NC_019690	TGG	2	6	6900	6905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219856
91	NC_019690	GGC	2	6	6961	6966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219856
92	NC_019690	CCT	2	6	6998	7003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428219856
93	NC_019690	CAT	2	6	7337	7342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219857
94	NC_019690	CG	3	6	7384	7389	0 %	0 %	50 %	50 %	428219857
95	NC_019690	TAA	2	6	7498	7503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219857
96	NC_019690	GGTTT	2	10	7513	7522	0 %	60 %	40 %	0 %	428219857
97	NC_019690	TTAA	2	8	7536	7543	50 %	50 %	0 %	0 %	428219857
98	NC_019690	GGC	2	6	7553	7558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219857
99	NC_019690	TTA	2	6	7570	7575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428219857
100	NC_019690	AGG	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428219858
101	NC_019690	TGT	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219858
102	NC_019690	TAG	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428219858
103	NC_019690	AG	3	6	8085	8090	50 %	0 %	50 %	0 %	428219858
104	NC_019690	CCATTG	2	12	8116	8127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428219858
105	NC_019690	GGAA	2	8	8135	8142	50 %	0 %	50 %	0 %	428219858
106	NC_019690	GAG	2	6	8174	8179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428219858
107	NC_019690	AATCA	2	10	8235	8244	60 %	20 %	0 %	20 %	428219858
108	NC_019690	CTT	2	6	8459	8464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
109	NC_019690	GGC	2	6	8469	8474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219858
110	NC_019690	GTT	2	6	8579	8584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219858
111	NC_019690	TCT	2	6	8608	8613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
112	NC_019690	TTCCG	2	10	8629	8638	0 %	40 %	20 %	40 %	428219858
113	NC_019690	GTT	2	6	8720	8725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219858
114	NC_019690	TTC	2	6	8760	8765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
115	NC_019690	TTG	2	6	8793	8798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219858
116	NC_019690	T	6	6	8819	8824	0 %	100 %	0 %	0 %	428219858
117	NC_019690	CTT	2	6	8825	8830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
118	NC_019690	CCA	2	6	8831	8836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219858
119	NC_019690	CCG	2	6	8864	8869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428219858
120	NC_019690	CTT	2	6	8891	8896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
121	NC_019690	TCCCGT	2	12	8902	8913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428219858
122	NC_019690	CTT	2	6	8960	8965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
123	NC_019690	T	6	6	9083	9088	0 %	100 %	0 %	0 %	428219858
124	NC_019690	ATCG	2	8	9094	9101	25 %	25 %	25 %	25 %	428219858
125	NC_019690	GTT	2	6	9147	9152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219858
126	NC_019690	CTG	2	6	9228	9233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219858
127	NC_019690	CTT	2	6	9248	9253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
128	NC_019690	GGC	3	9	9303	9311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219858
129	NC_019690	CAT	2	6	9320	9325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219858
130	NC_019690	GGC	2	6	9390	9395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219858
131	NC_019690	CAC	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219858
132	NC_019690	ATCG	2	8	9507	9514	25 %	25 %	25 %	25 %	428219858
133	NC_019690	TCA	2	6	9544	9549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219858
134	NC_019690	ACC	2	6	9570	9575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219858
135	NC_019690	CCT	2	6	9587	9592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428219858
136	NC_019690	TCT	3	9	9593	9601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428219858
137	NC_019690	GTT	2	6	9633	9638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219858
138	NC_019690	AGC	2	6	9675	9680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219858
139	NC_019690	ATG	4	12	9682	9693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428219858
140	NC_019690	GCC	2	6	9803	9808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428219858
141	NC_019690	GCG	2	6	9856	9861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219858
142	NC_019690	AGT	2	6	9909	9914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428219858
143	NC_019690	ACAG	2	8	9928	9935	50 %	0 %	25 %	25 %	428219858
144	NC_019690	CAGC	2	8	10289	10296	25 %	0 %	25 %	50 %	428219859
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149	NC_019690	AAT	2	6	10664	10669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219859
150	NC_019690	GACC	2	8	10693	10700	25 %	0 %	25 %	50 %	428219859
151	NC_019690	CAGC	2	8	10751	10758	25 %	0 %	25 %	50 %	428219859
152	NC_019690	GCA	2	6	10759	10764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219859
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157	NC_019690	GTT	2	6	11504	11509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219860
158	NC_019690	ATA	2	6	11697	11702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428219860
159	NC_019690	ATCCG	2	10	11728	11737	20 %	20 %	20 %	40 %	428219860
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165	NC_019690	CAC	2	6	12124	12129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428219860
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258	NC_019690	TCA	2	6	17772	17777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219863
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262	NC_019690	TCA	2	6	17992	17997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219863
263	NC_019690	A	6	6	18003	18008	100 %	0 %	0 %	0 %	428219863
264	NC_019690	GGC	2	6	18023	18028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219863
265	NC_019690	AGC	2	6	18080	18085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219863
266	NC_019690	T	6	6	18092	18097	0 %	100 %	0 %	0 %	428219863
267	NC_019690	TTGG	2	8	18209	18216	0 %	50 %	50 %	0 %	428219863
268	NC_019690	TTGA	2	8	18302	18309	25 %	50 %	25 %	0 %	428219863
269	NC_019690	CGAT	3	12	18311	18322	25 %	25 %	25 %	25 %	428219863
270	NC_019690	CGG	2	6	18532	18537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428219863
271	NC_019690	AGA	2	6	18599	18604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428219863
272	NC_019690	TTCT	2	8	18647	18654	0 %	75 %	0 %	25 %	428219863
273	NC_019690	GCA	2	6	18694	18699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219863
274	NC_019690	TGG	2	6	18730	18735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219863
275	NC_019690	CATAGC	2	12	18781	18792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428219863
276	NC_019690	CAG	2	6	18971	18976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428219864
277	NC_019690	ATTC	2	8	19027	19034	25 %	50 %	0 %	25 %	428219864
278	NC_019690	GGTG	2	8	19109	19116	0 %	25 %	75 %	0 %	428219864
279	NC_019690	TG	3	6	19131	19136	0 %	50 %	50 %	0 %	428219864
280	NC_019690	CGC	2	6	19139	19144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428219864
281	NC_019690	TTAGCC	2	12	19197	19208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428219864
282	NC_019690	GATC	2	8	19210	19217	25 %	25 %	25 %	25 %	428219864
283	NC_019690	TTG	2	6	19230	19235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428219864
284	NC_019690	ATC	2	6	19301	19306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219864
285	NC_019690	GGT	2	6	19338	19343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219864
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287	NC_019690	GGT	2	6	19398	19403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219864
288	NC_019690	AAC	2	6	19453	19458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428219864
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291	NC_019690	CAT	2	6	19699	19704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428219864
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295	NC_019690	CA	3	6	19867	19872	50 %	0 %	0 %	50 %	428219864
296	NC_019690	CGAT	2	8	19977	19984	25 %	25 %	25 %	25 %	428219864
297	NC_019690	AT	3	6	19992	19997	50 %	50 %	0 %	0 %	428219864
298	NC_019690	AAGT	2	8	20065	20072	50 %	25 %	25 %	0 %	428219864
299	NC_019690	TGG	2	6	20122	20127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428219864
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390	NC_019690	TCG	2	6	28576	28581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428219868
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