MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas sp. UW4 chromosome

Total Repeats: 111489

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019670	CGG	2	6	178109	178114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407071
3002	NC_019670	TGC	3	9	178165	178173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407071
3003	NC_019670	CGA	2	6	178175	178180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407071
3004	NC_019670	GCTG	2	8	178225	178232	0 %	25 %	50 %	25 %	426407071
3005	NC_019670	GAA	2	6	178287	178292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426407071
3006	NC_019670	GTG	2	6	178317	178322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407071
3007	NC_019670	TCCG	2	8	178453	178460	0 %	25 %	25 %	50 %	426407071
3008	NC_019670	TTC	2	6	178644	178649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426407071
3009	NC_019670	CAG	2	6	178780	178785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407072
3010	NC_019670	CACCC	2	10	178805	178814	20 %	0 %	0 %	80 %	426407072
3011	NC_019670	CCA	2	6	178876	178881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407072
3012	NC_019670	AAC	2	6	178884	178889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426407072
3013	NC_019670	CGC	2	6	178993	178998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407072
3014	NC_019670	CCAG	2	8	179002	179009	25 %	0 %	25 %	50 %	426407072
3015	NC_019670	TCA	2	6	179071	179076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407072
3016	NC_019670	CCG	2	6	179137	179142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407072
3017	NC_019670	GGT	2	6	179254	179259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407072
3018	NC_019670	GGC	2	6	179261	179266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407072
3019	NC_019670	GGT	2	6	179278	179283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407072
3020	NC_019670	CGA	2	6	179284	179289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407072
3021	NC_019670	TTG	2	6	179299	179304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426407072
3022	NC_019670	TGA	2	6	179411	179416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426407073
3023	NC_019670	CTG	2	6	179461	179466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407073
3024	NC_019670	CGG	2	6	179468	179473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407073
3025	NC_019670	GCG	2	6	179481	179486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407073
3026	NC_019670	GCG	2	6	179516	179521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407073
3027	NC_019670	GAGC	2	8	179577	179584	25 %	0 %	50 %	25 %	426407073
3028	NC_019670	TGG	2	6	179609	179614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407073
3029	NC_019670	CCG	2	6	179617	179622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407073
3030	NC_019670	GCCA	2	8	179654	179661	25 %	0 %	25 %	50 %	426407073
3031	NC_019670	CTG	2	6	179698	179703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407073
3032	NC_019670	CGA	2	6	179736	179741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407073
3033	NC_019670	TTG	2	6	179770	179775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426407073
3034	NC_019670	TCA	2	6	179801	179806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407073
3035	NC_019670	TTG	2	6	179857	179862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426407073
3036	NC_019670	CCGCC	2	10	179888	179897	0 %	0 %	20 %	80 %	426407073
3037	NC_019670	GCG	2	6	179898	179903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407073
3038	NC_019670	AGC	2	6	179924	179929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407073
3039	NC_019670	GCC	2	6	179932	179937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407073
3040	NC_019670	TGT	2	6	179939	179944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426407073
3041	NC_019670	ACC	2	6	179959	179964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407073
3042	NC_019670	GCAGGG	2	12	179985	179996	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	426407073
3043	NC_019670	ATC	2	6	179998	180003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407073
3044	NC_019670	CGAAAT	2	12	180018	180029	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	426407073
3045	NC_019670	TGC	2	6	180036	180041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407073
3046	NC_019670	GA	3	6	180224	180229	50 %	0 %	50 %	0 %	426407074
3047	NC_019670	CAG	2	6	180239	180244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407074
3048	NC_019670	CAG	2	6	180254	180259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407074
3049	NC_019670	CGA	2	6	180276	180281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407074
3050	NC_019670	ACA	2	6	180297	180302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426407074
3051	NC_019670	CAG	2	6	180366	180371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407074
3052	NC_019670	GGC	2	6	180387	180392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407074
3053	NC_019670	GCG	2	6	180477	180482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407075
3054	NC_019670	TCG	2	6	180665	180670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407075
3055	NC_019670	CCGT	2	8	180682	180689	0 %	25 %	25 %	50 %	426407075
3056	NC_019670	TCG	2	6	180718	180723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407075
3057	NC_019670	ACC	2	6	180779	180784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407075
3058	NC_019670	ATG	2	6	180814	180819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426407075
3059	NC_019670	GC	3	6	180820	180825	0 %	0 %	50 %	50 %	426407075
3060	NC_019670	CGC	2	6	180992	180997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407075
3061	NC_019670	GC	3	6	181016	181021	0 %	0 %	50 %	50 %	426407075
3062	NC_019670	TGAA	2	8	181102	181109	50 %	25 %	25 %	0 %	426407075
3063	NC_019670	TCG	2	6	181261	181266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407075
3064	NC_019670	CAT	2	6	181373	181378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407075
3065	NC_019670	CAC	2	6	181379	181384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407075
3066	NC_019670	GTT	2	6	181415	181420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426407075
3067	NC_019670	TGC	2	6	181513	181518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407075
3068	NC_019670	CG	3	6	181713	181718	0 %	0 %	50 %	50 %	426407076
3069	NC_019670	GCT	2	6	181725	181730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407076
3070	NC_019670	GCA	2	6	181793	181798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407076
3071	NC_019670	AGC	2	6	181825	181830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407076
3072	NC_019670	CGT	2	6	182042	182047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407076
3073	NC_019670	TCG	2	6	182092	182097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407076
3074	NC_019670	GCGA	2	8	182114	182121	25 %	0 %	50 %	25 %	426407076
3075	NC_019670	GCG	2	6	182160	182165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407076
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3077	NC_019670	GGT	2	6	182427	182432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407076
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3079	NC_019670	GT	3	6	182505	182510	0 %	50 %	50 %	0 %	426407076
3080	NC_019670	CG	3	6	182530	182535	0 %	0 %	50 %	50 %	426407076
3081	NC_019670	GTC	2	6	182541	182546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407076
3082	NC_019670	TTGC	2	8	182613	182620	0 %	50 %	25 %	25 %	426407076
3083	NC_019670	GAGG	2	8	182643	182650	25 %	0 %	75 %	0 %	426407076
3084	NC_019670	GTG	2	6	182830	182835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407077
3085	NC_019670	CGG	2	6	182939	182944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407077
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3087	NC_019670	T	6	6	182997	183002	0 %	100 %	0 %	0 %	426407077
3088	NC_019670	TGA	2	6	183080	183085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426407077
3089	NC_019670	TGGC	2	8	183097	183104	0 %	25 %	50 %	25 %	426407077
3090	NC_019670	CGC	2	6	183133	183138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407077
3091	NC_019670	CAC	2	6	183154	183159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407077
3092	NC_019670	GC	3	6	183192	183197	0 %	0 %	50 %	50 %	426407077
3093	NC_019670	TGA	2	6	183236	183241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426407077
3094	NC_019670	ACA	2	6	183248	183253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426407077
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3096	NC_019670	ACGC	2	8	183318	183325	25 %	0 %	25 %	50 %	426407077
3097	NC_019670	CGA	2	6	183440	183445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407077
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3101	NC_019670	TCA	2	6	183527	183532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407077
3102	NC_019670	TAC	2	6	183547	183552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407077
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3104	NC_019670	TGG	2	6	183604	183609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407077
3105	NC_019670	GCA	2	6	183644	183649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407077
3106	NC_019670	CAT	2	6	183661	183666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407077
3107	NC_019670	GAA	2	6	183796	183801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426407077
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3109	NC_019670	ACTC	2	8	183988	183995	25 %	25 %	0 %	50 %	426407078
3110	NC_019670	GGCT	2	8	184059	184066	0 %	25 %	50 %	25 %	426407078
3111	NC_019670	AAC	2	6	184191	184196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426407078
3112	NC_019670	TTGC	2	8	184301	184308	0 %	50 %	25 %	25 %	426407078
3113	NC_019670	GGT	2	6	184442	184447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407078
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3115	NC_019670	TGT	2	6	184543	184548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426407078
3116	NC_019670	CAG	2	6	184571	184576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407078
3117	NC_019670	CTG	2	6	184667	184672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407078
3118	NC_019670	CGA	2	6	184684	184689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407078
3119	NC_019670	TCA	2	6	184767	184772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407078
3120	NC_019670	GCA	2	6	184873	184878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407078
3121	NC_019670	CCA	2	6	184915	184920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407078
3122	NC_019670	GTGCG	2	10	184946	184955	0 %	20 %	60 %	20 %	426407078
3123	NC_019670	GAA	2	6	184973	184978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426407078
3124	NC_019670	GCA	2	6	185011	185016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407078
3125	NC_019670	GGA	2	6	185036	185041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426407078
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3140	NC_019670	CTG	2	6	185712	185717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407079
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3144	NC_019670	CAG	2	6	185870	185875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407079
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3231	NC_019670	CG	3	6	190401	190406	0 %	0 %	50 %	50 %	426407082
3232	NC_019670	TCG	2	6	190423	190428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407082
3233	NC_019670	ATCC	2	8	190695	190702	25 %	25 %	0 %	50 %	426407083
3234	NC_019670	GCC	2	6	190761	190766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407083
3235	NC_019670	GCT	2	6	190790	190795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407083
3236	NC_019670	TCT	2	6	190810	190815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426407083
3237	NC_019670	CGA	2	6	190835	190840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407083
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3239	NC_019670	CTG	2	6	190923	190928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407083
3240	NC_019670	GGT	2	6	191021	191026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407083
3241	NC_019670	CGG	2	6	191039	191044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407083
3242	NC_019670	ACCGCC	2	12	191064	191075	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	426407083
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3244	NC_019670	CCGG	2	8	191159	191166	0 %	0 %	50 %	50 %	426407083
3245	NC_019670	CGG	2	6	191173	191178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407083
3246	NC_019670	GGT	2	6	191237	191242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407083
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3252	NC_019670	GTCA	2	8	191526	191533	25 %	25 %	25 %	25 %	426407083
3253	NC_019670	CGG	2	6	191555	191560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407083
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3260	NC_019670	CATG	2	8	192022	192029	25 %	25 %	25 %	25 %	426407084
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3263	NC_019670	AGC	2	6	192168	192173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407084
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3269	NC_019670	CG	3	6	192435	192440	0 %	0 %	50 %	50 %	426407084
3270	NC_019670	GAA	2	6	192512	192517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426407084
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3333	NC_019670	ACT	2	6	195738	195743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407086
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3337	NC_019670	GTTC	2	8	195819	195826	0 %	50 %	25 %	25 %	426407086
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3340	NC_019670	TGG	2	6	195985	195990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407087
3341	NC_019670	CACCG	2	10	196001	196010	20 %	0 %	20 %	60 %	426407087
3342	NC_019670	CTG	2	6	196011	196016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407087
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3344	NC_019670	TCA	2	6	196117	196122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407087
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3346	NC_019670	CGT	2	6	196713	196718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407088
3347	NC_019670	GCTG	2	8	196736	196743	0 %	25 %	50 %	25 %	426407088
3348	NC_019670	GCC	2	6	196752	196757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407088
3349	NC_019670	GGC	2	6	196817	196822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407088
3350	NC_019670	CTG	2	6	196863	196868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407088
3351	NC_019670	CGG	2	6	196876	196881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407088
3352	NC_019670	CTG	2	6	196941	196946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407088
3353	NC_019670	GTC	2	6	196962	196967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407088
3354	NC_019670	GC	3	6	197016	197021	0 %	0 %	50 %	50 %	426407088
3355	NC_019670	GGCGGG	2	12	197048	197059	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	426407088
3356	NC_019670	TCA	2	6	197081	197086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426407088
3357	NC_019670	GCT	2	6	197244	197249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407089
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3359	NC_019670	ACCGGC	2	12	197389	197400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	426407089
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3478	NC_019670	GTGTAC	2	12	203463	203474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	426407094
3479	NC_019670	ACC	2	6	203484	203489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426407094
3480	NC_019670	AAG	2	6	203529	203534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426407094
3481	NC_019670	CGT	2	6	203578	203583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426407094
3482	NC_019670	ACG	2	6	203587	203592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407094
3483	NC_019670	CCG	2	6	203629	203634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	426407094
3484	NC_019670	CAG	2	6	203730	203735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426407094
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3491	NC_019670	CGG	2	6	204185	204190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	426407094
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3493	NC_019670	GGT	2	6	204215	204220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426407094
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3497	NC_019670	GTGTTC	2	12	204306	204317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	426407094
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