MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018746	GAC	2	6	86697	86702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1502	NC_018746	GTT	2	6	86726	86731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669295
1503	NC_018746	GGCC	2	8	86738	86745	0 %	0 %	50 %	50 %	408669295
1504	NC_018746	GTA	2	6	86914	86919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669295
1505	NC_018746	AGC	2	6	86968	86973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1506	NC_018746	CTT	2	6	86993	86998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669295
1507	NC_018746	CTG	2	6	87102	87107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1508	NC_018746	AGC	2	6	87117	87122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1509	NC_018746	TCC	2	6	87138	87143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669295
1510	NC_018746	GGA	2	6	87207	87212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669295
1511	NC_018746	T	6	6	87223	87228	0 %	100 %	0 %	0 %	408669295
1512	NC_018746	TTG	2	6	87243	87248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669295
1513	NC_018746	CAGC	2	8	87323	87330	25 %	0 %	25 %	50 %	408669295
1514	NC_018746	CTC	2	6	87342	87347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669295
1515	NC_018746	ACG	2	6	87351	87356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1516	NC_018746	TCC	2	6	87376	87381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669295
1517	NC_018746	CGG	2	6	87396	87401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669295
1518	NC_018746	GCT	2	6	87456	87461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1519	NC_018746	CAG	2	6	87473	87478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295
1520	NC_018746	CCA	2	6	87547	87552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669295
1521	NC_018746	TTG	2	6	87622	87627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669295
1522	NC_018746	GAA	2	6	87633	87638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669295
1523	NC_018746	A	6	6	87673	87678	100 %	0 %	0 %	0 %	408669295
1524	NC_018746	ACC	2	6	87681	87686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669295
1525	NC_018746	CAA	2	6	87808	87813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669296
1526	NC_018746	ATC	2	6	88082	88087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669296
1527	NC_018746	TGAT	2	8	88147	88154	25 %	50 %	25 %	0 %	408669296
1528	NC_018746	CGC	2	6	88255	88260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669296
1529	NC_018746	CCTG	2	8	88293	88300	0 %	25 %	25 %	50 %	408669296
1530	NC_018746	CAA	2	6	88303	88308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669296
1531	NC_018746	ACT	2	6	88344	88349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669296
1532	NC_018746	GAA	2	6	88406	88411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669296
1533	NC_018746	GCT	2	6	88428	88433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669296
1534	NC_018746	ATC	2	6	88442	88447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669296
1535	NC_018746	CTG	2	6	88451	88456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669296
1536	NC_018746	CTG	2	6	88508	88513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669296
1537	NC_018746	GTG	2	6	88572	88577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669296
1538	NC_018746	GGC	2	6	88672	88677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669296
1539	NC_018746	AGC	2	6	88754	88759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669297
1540	NC_018746	C	7	7	88801	88807	0 %	0 %	0 %	100 %	408669297
1541	NC_018746	CA	3	6	88847	88852	50 %	0 %	0 %	50 %	408669297
1542	NC_018746	TTGG	2	8	88867	88874	0 %	50 %	50 %	0 %	408669297
1543	NC_018746	ACC	2	6	88877	88882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669297
1544	NC_018746	GCA	2	6	88886	88891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669297
1545	NC_018746	CCG	2	6	88899	88904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669297
1546	NC_018746	GCT	2	6	89013	89018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669297
1547	NC_018746	GTT	2	6	89041	89046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669297
1548	NC_018746	CCA	2	6	89051	89056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669297
1549	NC_018746	GTCCA	2	10	89069	89078	20 %	20 %	20 %	40 %	408669297
1550	NC_018746	CCG	2	6	89201	89206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669297
1551	NC_018746	AGA	2	6	89229	89234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669297
1552	NC_018746	CAG	2	6	89245	89250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669297
1553	NC_018746	GTG	2	6	89313	89318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669297
1554	NC_018746	GGC	2	6	89468	89473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669298
1555	NC_018746	TCG	3	9	89514	89522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669298
1556	NC_018746	CAT	2	6	89531	89536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669298
1557	NC_018746	GCT	2	6	89557	89562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669298
1558	NC_018746	ACA	2	6	89583	89588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669298
1559	NC_018746	AGGT	2	8	89604	89611	25 %	25 %	50 %	0 %	408669298
1560	NC_018746	AGCC	2	8	89644	89651	25 %	0 %	25 %	50 %	408669298
1561	NC_018746	CCT	2	6	89872	89877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669298
1562	NC_018746	AGA	2	6	89975	89980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669298
1563	NC_018746	GCG	2	6	90030	90035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669299
1564	NC_018746	TACTGG	2	12	90072	90083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	408669299
1565	NC_018746	AAC	2	6	90137	90142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669299
1566	NC_018746	GCA	2	6	91291	91296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1567	NC_018746	CTG	2	6	91399	91404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1568	NC_018746	CAC	2	6	91536	91541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669300
1569	NC_018746	CAT	2	6	91557	91562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669300
1570	NC_018746	ATC	2	6	91708	91713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669300
1571	NC_018746	CAAT	2	8	91772	91779	50 %	25 %	0 %	25 %	408669300
1572	NC_018746	TCC	2	6	91790	91795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669300
1573	NC_018746	GCT	2	6	91815	91820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1574	NC_018746	AAC	2	6	91828	91833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669300
1575	NC_018746	ATG	2	6	91844	91849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669300
1576	NC_018746	GTC	2	6	91954	91959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1577	NC_018746	TCCA	2	8	92013	92020	25 %	25 %	0 %	50 %	408669300
1578	NC_018746	GCT	2	6	92034	92039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1579	NC_018746	GAAG	2	8	92082	92089	50 %	0 %	50 %	0 %	408669300
1580	NC_018746	GGA	2	6	92106	92111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669300
1581	NC_018746	TCC	2	6	92198	92203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669300
1582	NC_018746	CCG	2	6	92334	92339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669300
1583	NC_018746	GCA	2	6	92428	92433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1584	NC_018746	GAA	2	6	92460	92465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669300
1585	NC_018746	GTC	2	6	92506	92511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1586	NC_018746	AAC	2	6	92512	92517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669300
1587	NC_018746	TCG	2	6	92528	92533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1588	NC_018746	CTG	2	6	92542	92547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669300
1589	NC_018746	CCT	2	6	92548	92553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669300
1590	NC_018746	GAA	2	6	92557	92562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669300
1591	NC_018746	AAAGG	2	10	92597	92606	60 %	0 %	40 %	0 %	408669300
1592	NC_018746	TGG	2	6	92996	93001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669301
1593	NC_018746	TGA	2	6	93016	93021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669301
1594	NC_018746	CCT	2	6	93031	93036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669301
1595	NC_018746	TCT	2	6	93070	93075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669301
1596	NC_018746	CGG	2	6	93143	93148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669301
1597	NC_018746	GCC	2	6	93273	93278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669301
1598	NC_018746	TGG	2	6	93376	93381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669301
1599	NC_018746	CGG	2	6	93399	93404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669301
1600	NC_018746	TAG	2	6	93440	93445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669301
1601	NC_018746	CTT	2	6	93446	93451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669301
1602	NC_018746	CAGA	2	8	93532	93539	50 %	0 %	25 %	25 %	408669301
1603	NC_018746	GCG	2	6	93593	93598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669301
1604	NC_018746	CAC	2	6	93601	93606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669301
1605	NC_018746	CAA	2	6	93607	93612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669301
1606	NC_018746	GAC	2	6	93641	93646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669301
1607	NC_018746	TTG	2	6	93654	93659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669301
1608	NC_018746	CCG	2	6	93663	93668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669301
1609	NC_018746	CCA	2	6	93745	93750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669301
1610	NC_018746	CCTT	2	8	93774	93781	0 %	50 %	0 %	50 %	408669301
1611	NC_018746	TCG	2	6	93844	93849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669301
1612	NC_018746	CAG	2	6	93871	93876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669301
1613	NC_018746	TCG	2	6	93903	93908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669301
1614	NC_018746	AGC	2	6	93909	93914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669301
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1616	NC_018746	ATTTC	2	10	94027	94036	20 %	60 %	0 %	20 %	408669302
1617	NC_018746	ATCC	2	8	94363	94370	25 %	25 %	0 %	50 %	408669302
1618	NC_018746	CGGA	2	8	94428	94435	25 %	0 %	50 %	25 %	408669302
1619	NC_018746	ATG	2	6	94445	94450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669302
1620	NC_018746	CGT	2	6	94455	94460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669302
1621	NC_018746	TGCT	2	8	94498	94505	0 %	50 %	25 %	25 %	408669302
1622	NC_018746	GCA	2	6	94548	94553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669302
1623	NC_018746	TCG	2	6	94565	94570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669302
1624	NC_018746	CTT	2	6	94618	94623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669302
1625	NC_018746	TGC	2	6	94656	94661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669302
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1988	NC_018746	GCC	2	6	113924	113929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669324
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