MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018746	GGTC	2	8	57646	57653	0 %	25 %	50 %	25 %	408669263
1002	NC_018746	TGC	2	6	57673	57678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669263
1003	NC_018746	GGCGA	2	10	57939	57948	20 %	0 %	60 %	20 %	408669263
1004	NC_018746	CGC	2	6	58011	58016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669263
1005	NC_018746	ACC	2	6	58077	58082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669263
1006	NC_018746	TGAA	2	8	58165	58172	50 %	25 %	25 %	0 %	408669263
1007	NC_018746	CTT	2	6	58185	58190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669263
1008	NC_018746	AG	3	6	58289	58294	50 %	0 %	50 %	0 %	408669264
1009	NC_018746	ACC	2	6	58295	58300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669264
1010	NC_018746	GCCA	2	8	58437	58444	25 %	0 %	25 %	50 %	408669264
1011	NC_018746	CCAAC	2	10	58522	58531	40 %	0 %	0 %	60 %	408669264
1012	NC_018746	GAAT	2	8	58592	58599	50 %	25 %	25 %	0 %	408669264
1013	NC_018746	TGA	2	6	59091	59096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669265
1014	NC_018746	CTG	2	6	59124	59129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669265
1015	NC_018746	CTG	2	6	59131	59136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669265
1016	NC_018746	TCG	2	6	59159	59164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669265
1017	NC_018746	CCGTT	2	10	59202	59211	0 %	40 %	20 %	40 %	408669265
1018	NC_018746	GA	3	6	59233	59238	50 %	0 %	50 %	0 %	408669265
1019	NC_018746	GAT	2	6	59275	59280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669265
1020	NC_018746	CCT	2	6	59764	59769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669266
1021	NC_018746	CAT	2	6	59803	59808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669266
1022	NC_018746	GCC	2	6	59812	59817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669266
1023	NC_018746	TCG	2	6	59884	59889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669266
1024	NC_018746	TCAACA	2	12	60438	60449	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	408669267
1025	NC_018746	GC	3	6	60454	60459	0 %	0 %	50 %	50 %	408669267
1026	NC_018746	AAT	2	6	60464	60469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408669267
1027	NC_018746	TCG	2	6	60656	60661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1028	NC_018746	AGC	2	6	60716	60721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1029	NC_018746	CAA	2	6	60871	60876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669268
1030	NC_018746	GCCG	2	8	60902	60909	0 %	0 %	50 %	50 %	408669268
1031	NC_018746	ACG	2	6	61273	61278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1032	NC_018746	TCA	2	6	61286	61291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669268
1033	NC_018746	A	6	6	61333	61338	100 %	0 %	0 %	0 %	408669268
1034	NC_018746	CCA	2	6	61373	61378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669268
1035	NC_018746	CCG	2	6	61448	61453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669268
1036	NC_018746	CAAAG	2	10	61455	61464	60 %	0 %	20 %	20 %	408669268
1037	NC_018746	TC	3	6	61467	61472	0 %	50 %	0 %	50 %	408669268
1038	NC_018746	CTT	2	6	61489	61494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669268
1039	NC_018746	CTG	2	6	61536	61541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1040	NC_018746	AGA	2	6	61568	61573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669268
1041	NC_018746	GAT	2	6	61634	61639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669268
1042	NC_018746	GCC	2	6	61673	61678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669268
1043	NC_018746	GA	3	6	61730	61735	50 %	0 %	50 %	0 %	408669268
1044	NC_018746	GGC	2	6	61743	61748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669268
1045	NC_018746	GCA	2	6	61799	61804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669268
1046	NC_018746	CGC	2	6	61976	61981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669269
1047	NC_018746	ACC	2	6	62082	62087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669269
1048	NC_018746	GAGC	2	8	62235	62242	25 %	0 %	50 %	25 %	408669270
1049	NC_018746	TTC	2	6	62341	62346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669270
1050	NC_018746	CCG	2	6	62375	62380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669270
1051	NC_018746	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	408669270
1052	NC_018746	TC	3	6	62412	62417	0 %	50 %	0 %	50 %	408669270
1053	NC_018746	GCT	2	6	62419	62424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669270
1054	NC_018746	GCG	2	6	62487	62492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669270
1055	NC_018746	GTC	2	6	62515	62520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669270
1056	NC_018746	CCG	2	6	62550	62555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669270
1057	NC_018746	CGA	2	6	62556	62561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669270
1058	NC_018746	CTG	2	6	62563	62568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669270
1059	NC_018746	AAC	2	6	62614	62619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669270
1060	NC_018746	AGC	2	6	62657	62662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669270
1061	NC_018746	TTC	2	6	62674	62679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669270
1062	NC_018746	GCA	2	6	62751	62756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669270
1063	NC_018746	AGT	2	6	62804	62809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669270
1064	NC_018746	C	6	6	62829	62834	0 %	0 %	0 %	100 %	408669270
1065	NC_018746	TAC	2	6	62908	62913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669270
1066	NC_018746	TCGA	2	8	62996	63003	25 %	25 %	25 %	25 %	408669271
1067	NC_018746	CCG	2	6	63155	63160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669271
1068	NC_018746	GGGC	2	8	63233	63240	0 %	0 %	75 %	25 %	408669271
1069	NC_018746	CGG	2	6	63393	63398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669272
1070	NC_018746	GAC	2	6	63421	63426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669272
1071	NC_018746	CAG	2	6	63602	63607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669273
1072	NC_018746	GCC	2	6	63687	63692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669273
1073	NC_018746	CCGC	2	8	63835	63842	0 %	0 %	25 %	75 %	408669273
1074	NC_018746	CTG	2	6	63866	63871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669273
1075	NC_018746	GGT	2	6	63892	63897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669273
1076	NC_018746	TTC	2	6	63903	63908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669273
1077	NC_018746	A	6	6	63990	63995	100 %	0 %	0 %	0 %	408669273
1078	NC_018746	TCA	2	6	64051	64056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669273
1079	NC_018746	TC	3	6	64185	64190	0 %	50 %	0 %	50 %	408669273
1080	NC_018746	ATC	3	9	64197	64205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669273
1081	NC_018746	TCA	2	6	64297	64302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669274
1082	NC_018746	ATCG	2	8	64477	64484	25 %	25 %	25 %	25 %	408669274
1083	NC_018746	GGCA	2	8	64559	64566	25 %	0 %	50 %	25 %	408669274
1084	NC_018746	GAT	2	6	64601	64606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669274
1085	NC_018746	TTC	2	6	64610	64615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669274
1086	NC_018746	TTG	2	6	64687	64692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669274
1087	NC_018746	GCC	2	6	64706	64711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669274
1088	NC_018746	CTT	3	9	64717	64725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669274
1089	NC_018746	ATC	2	6	64746	64751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669274
1090	NC_018746	TCG	2	6	64776	64781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1091	NC_018746	ATC	2	6	64803	64808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669274
1092	NC_018746	AGC	2	6	64815	64820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1093	NC_018746	AGTGA	2	10	64829	64838	40 %	20 %	40 %	0 %	408669274
1094	NC_018746	TTC	2	6	64854	64859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669274
1095	NC_018746	GCA	2	6	64887	64892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1096	NC_018746	CGG	2	6	64907	64912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669274
1097	NC_018746	CGT	2	6	64918	64923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1098	NC_018746	CGC	2	6	64927	64932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669274
1099	NC_018746	GTC	2	6	64934	64939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1100	NC_018746	TCT	2	6	64948	64953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669274
1101	NC_018746	CTACCT	2	12	65044	65055	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	408669274
1102	NC_018746	GTG	2	6	65177	65182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669274
1103	NC_018746	CGG	2	6	65272	65277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669274
1104	NC_018746	GGT	2	6	65342	65347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669274
1105	NC_018746	TTC	2	6	65412	65417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669274
1106	NC_018746	ACC	2	6	65493	65498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669274
1107	NC_018746	GCC	2	6	65557	65562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669274
1108	NC_018746	GC	3	6	65603	65608	0 %	0 %	50 %	50 %	408669274
1109	NC_018746	AAT	2	6	65653	65658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408669274
1110	NC_018746	CAA	2	6	65708	65713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408669274
1111	NC_018746	TCA	2	6	65719	65724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669274
1112	NC_018746	GCCA	2	8	65805	65812	25 %	0 %	25 %	50 %	408669274
1113	NC_018746	GTC	2	6	65898	65903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1114	NC_018746	CGC	2	6	65928	65933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669274
1115	NC_018746	TCG	2	6	65967	65972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1116	NC_018746	ACC	2	6	66012	66017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669274
1117	NC_018746	T	6	6	66062	66067	0 %	100 %	0 %	0 %	408669274
1118	NC_018746	ACC	2	6	66088	66093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669274
1119	NC_018746	AGC	2	6	66182	66187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669274
1120	NC_018746	GTA	2	6	66194	66199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669274
1121	NC_018746	TTC	2	6	66206	66211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669274
1122	NC_018746	TTCC	2	8	66256	66263	0 %	50 %	0 %	50 %	408669274
1123	NC_018746	C	8	8	66272	66279	0 %	0 %	0 %	100 %	408669274
1124	NC_018746	GACA	2	8	66462	66469	50 %	0 %	25 %	25 %	408669275
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1126	NC_018746	A	7	7	66511	66517	100 %	0 %	0 %	0 %	408669275
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1498	NC_018746	CAT	2	6	86543	86548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669295
1499	NC_018746	GGCTA	2	10	86616	86625	20 %	20 %	40 %	20 %	408669295
1500	NC_018746	GCA	2	6	86656	86661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669295

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