MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 plasmid pND6-2

Total Repeats: 2030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018746	TCC	2	6	28162	28167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669228
502	NC_018746	TAC	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669228
503	NC_018746	GGTCA	2	10	28211	28220	20 %	20 %	40 %	20 %	408669228
504	NC_018746	GTC	2	6	28226	28231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669228
505	NC_018746	ATG	2	6	28309	28314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669228
506	NC_018746	TCC	2	6	28382	28387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669228
507	NC_018746	AAG	2	6	28396	28401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669228
508	NC_018746	GACTTC	2	12	28555	28566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408669228
509	NC_018746	CGA	2	6	28632	28637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
510	NC_018746	GAT	2	6	28720	28725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669229
511	NC_018746	AGC	2	6	28730	28735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
512	NC_018746	GAC	2	6	28749	28754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
513	NC_018746	TCA	2	6	28848	28853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669229
514	NC_018746	GATG	2	8	28860	28867	25 %	25 %	50 %	0 %	408669229
515	NC_018746	ATG	2	6	28919	28924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669229
516	NC_018746	GAT	2	6	28956	28961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669229
517	NC_018746	CAG	2	6	29023	29028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669229
518	NC_018746	GCC	2	6	29068	29073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669229
519	NC_018746	C	6	6	29072	29077	0 %	0 %	0 %	100 %	408669229
520	NC_018746	GT	3	6	29092	29097	0 %	50 %	50 %	0 %	408669229
521	NC_018746	GCT	2	6	29241	29246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669229
522	NC_018746	TGC	2	6	29313	29318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669229
523	NC_018746	GCG	2	6	29345	29350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669229
524	NC_018746	CACC	2	8	29376	29383	25 %	0 %	0 %	75 %	408669229
525	NC_018746	G	6	6	29436	29441	0 %	0 %	100 %	0 %	408669229
526	NC_018746	CCG	2	6	29468	29473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669229
527	NC_018746	TG	3	6	29577	29582	0 %	50 %	50 %	0 %	408669229
528	NC_018746	GGC	2	6	29609	29614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669229
529	NC_018746	AGG	2	6	29651	29656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669229
530	NC_018746	AAT	2	6	29764	29769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408669229
531	NC_018746	TCG	2	6	30250	30255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669231
532	NC_018746	GAT	2	6	30346	30351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669231
533	NC_018746	TCC	2	6	30365	30370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669231
534	NC_018746	CGG	2	6	30384	30389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669231
535	NC_018746	TTG	2	6	30455	30460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669231
536	NC_018746	AC	3	6	30504	30509	50 %	0 %	0 %	50 %	408669231
537	NC_018746	GGA	2	6	30535	30540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669231
538	NC_018746	TGG	2	6	30705	30710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669231
539	NC_018746	CCG	2	6	30726	30731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669231
540	NC_018746	GTA	2	6	30739	30744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669231
541	NC_018746	GAC	2	6	30784	30789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669231
542	NC_018746	GCA	3	9	30840	30848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669231
543	NC_018746	GAC	2	6	30887	30892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669231
544	NC_018746	TC	3	6	30894	30899	0 %	50 %	0 %	50 %	408669231
545	NC_018746	CTG	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669231
546	NC_018746	TGC	2	6	31094	31099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669231
547	NC_018746	GAC	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669231
548	NC_018746	ACGA	2	8	31191	31198	50 %	0 %	25 %	25 %	408669232
549	NC_018746	ATG	2	6	31200	31205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669232
550	NC_018746	CTTG	2	8	31207	31214	0 %	50 %	25 %	25 %	408669232
551	NC_018746	GCT	2	6	31370	31375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669232
552	NC_018746	AGG	2	6	31429	31434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669232
553	NC_018746	CGA	2	6	31516	31521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
554	NC_018746	CGA	2	6	31617	31622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
555	NC_018746	AGA	2	6	31623	31628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669232
556	NC_018746	AGC	2	6	31674	31679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
557	NC_018746	GCA	2	6	31695	31700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669232
558	NC_018746	CCT	2	6	31768	31773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669232
559	NC_018746	CTT	2	6	31780	31785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669232
560	NC_018746	GCC	2	6	32107	32112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669233
561	NC_018746	GGC	2	6	32273	32278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
562	NC_018746	GGA	2	6	32322	32327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669233
563	NC_018746	ACG	2	6	32342	32347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
564	NC_018746	TGA	2	6	32351	32356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669233
565	NC_018746	CT	3	6	32360	32365	0 %	50 %	0 %	50 %	408669233
566	NC_018746	TGT	2	6	32391	32396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669233
567	NC_018746	CCCTT	2	10	32406	32415	0 %	40 %	0 %	60 %	408669233
568	NC_018746	CA	3	6	32440	32445	50 %	0 %	0 %	50 %	408669233
569	NC_018746	GTC	2	6	32536	32541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
570	NC_018746	TGG	2	6	32594	32599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669233
571	NC_018746	CGT	2	6	32680	32685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
572	NC_018746	AGC	2	6	32699	32704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
573	NC_018746	CAT	2	6	32753	32758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669233
574	NC_018746	CGAT	2	8	32759	32766	25 %	25 %	25 %	25 %	408669233
575	NC_018746	CGAG	2	8	32781	32788	25 %	0 %	50 %	25 %	408669233
576	NC_018746	AGC	3	9	32803	32811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
577	NC_018746	TCGA	2	8	32812	32819	25 %	25 %	25 %	25 %	408669233
578	NC_018746	CGGA	2	8	32885	32892	25 %	0 %	50 %	25 %	408669233
579	NC_018746	GCAA	2	8	33002	33009	50 %	0 %	25 %	25 %	408669233
580	NC_018746	GCT	2	6	33087	33092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
581	NC_018746	GGCC	2	8	33099	33106	0 %	0 %	50 %	50 %	408669233
582	NC_018746	TGA	2	6	33119	33124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669233
583	NC_018746	CGG	2	6	33191	33196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
584	NC_018746	TCG	2	6	33199	33204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
585	NC_018746	CTCA	2	8	33217	33224	25 %	25 %	0 %	50 %	408669233
586	NC_018746	CGG	2	6	33333	33338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
587	NC_018746	CCT	2	6	33387	33392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669233
588	NC_018746	CAG	2	6	33394	33399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
589	NC_018746	GAT	2	6	33430	33435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408669233
590	NC_018746	CGC	2	6	33504	33509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669233
591	NC_018746	GAG	2	6	33538	33543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669233
592	NC_018746	CCA	2	6	33554	33559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669233
593	NC_018746	GTG	2	6	33631	33636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669233
594	NC_018746	GGC	2	6	33684	33689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
595	NC_018746	G	6	6	33849	33854	0 %	0 %	100 %	0 %	408669233
596	NC_018746	ACC	2	6	33949	33954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669233
597	NC_018746	GCCG	2	8	33963	33970	0 %	0 %	50 %	50 %	408669233
598	NC_018746	TGC	2	6	33992	33997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
599	NC_018746	CCA	2	6	34016	34021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669233
600	NC_018746	TTC	2	6	34117	34122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669233
601	NC_018746	CAG	2	6	34155	34160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
602	NC_018746	CGC	3	9	34257	34265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669233
603	NC_018746	GCAG	2	8	34308	34315	25 %	0 %	50 %	25 %	408669233
604	NC_018746	AGC	2	6	34352	34357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
605	NC_018746	GTG	2	6	34369	34374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669233
606	NC_018746	CGG	2	6	34394	34399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
607	NC_018746	TGG	2	6	34442	34447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669233
608	NC_018746	CCGC	2	8	34492	34499	0 %	0 %	25 %	75 %	408669233
609	NC_018746	GCT	2	6	34522	34527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
610	NC_018746	AGGA	2	8	34540	34547	50 %	0 %	50 %	0 %	408669233
611	NC_018746	GTG	2	6	34606	34611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669233
612	NC_018746	CGG	2	6	34658	34663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408669233
613	NC_018746	AGCC	2	8	34821	34828	25 %	0 %	25 %	50 %	408669233
614	NC_018746	TGC	2	6	34911	34916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
615	NC_018746	ACC	2	6	34918	34923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669233
616	NC_018746	CCA	2	6	34926	34931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408669233
617	NC_018746	CCT	2	6	34941	34946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669233
618	NC_018746	AGG	2	6	34988	34993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408669233
619	NC_018746	GAA	2	6	35158	35163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669233
620	NC_018746	GAA	2	6	35184	35189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408669233
621	NC_018746	ACG	2	6	35303	35308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
622	NC_018746	GCC	2	6	35342	35347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669233
623	NC_018746	TTC	2	6	35407	35412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669233
624	NC_018746	CT	3	6	35451	35456	0 %	50 %	0 %	50 %	408669233
625	NC_018746	TCG	2	6	35483	35488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669233
626	NC_018746	CTC	2	6	35592	35597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669233
627	NC_018746	TGT	2	6	35612	35617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408669233
628	NC_018746	TCA	4	12	35712	35723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408669233
629	NC_018746	CAGA	2	8	35868	35875	50 %	0 %	25 %	25 %	408669233
630	NC_018746	GCA	2	6	35910	35915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
631	NC_018746	CTCA	2	8	36069	36076	25 %	25 %	0 %	50 %	408669233
632	NC_018746	GCA	2	6	36107	36112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408669233
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643	NC_018746	CTT	2	6	36579	36584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669233
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661	NC_018746	TGGG	2	8	37512	37519	0 %	25 %	75 %	0 %	408669233
662	NC_018746	GCCA	2	8	37540	37547	25 %	0 %	25 %	50 %	408669233
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669	NC_018746	GTG	2	6	37666	37671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408669233
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753	NC_018746	CCG	2	6	42943	42948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408669241
754	NC_018746	GCT	2	6	42971	42976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408669241
755	NC_018746	TTC	2	6	43078	43083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408669242
756	NC_018746	TCGC	2	8	43147	43154	0 %	25 %	25 %	50 %	408669242
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758	NC_018746	TCC	2	6	43221	43226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408669242
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877	NC_018746	C	6	6	50016	50021	0 %	0 %	0 %	100 %	408669253
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