MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 96495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018028	AGC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
2	NC_018028	TCG	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
3	NC_018028	CGG	2	6	1162	1167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419089
4	NC_018028	ATGC	2	8	1193	1200	25 %	25 %	25 %	25 %	392419089
5	NC_018028	CTG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
6	NC_018028	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419089
7	NC_018028	GCT	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
8	NC_018028	CGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
9	NC_018028	TTC	2	6	1364	1369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419089
10	NC_018028	A	6	6	1373	1378	100 %	0 %	0 %	0 %	392419089
11	NC_018028	AAG	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419089
12	NC_018028	GCT	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
13	NC_018028	CAG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
14	NC_018028	GCC	2	6	1534	1539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419089
15	NC_018028	TGA	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419089
16	NC_018028	ACG	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419089
17	NC_018028	TTC	2	6	1616	1621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419089
18	NC_018028	TAC	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419089
19	NC_018028	GCG	2	6	1840	1845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419089
20	NC_018028	ACCA	2	8	1901	1908	50 %	0 %	0 %	50 %	392419089
21	NC_018028	CAC	2	6	1951	1956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419089
22	NC_018028	TGC	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419089
23	NC_018028	GACCA	2	10	2078	2087	40 %	0 %	20 %	40 %	392419090
24	NC_018028	CGT	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
25	NC_018028	GCC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419090
26	NC_018028	GC	3	6	2300	2305	0 %	0 %	50 %	50 %	392419090
27	NC_018028	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419090
28	NC_018028	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419090
29	NC_018028	GAA	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419090
30	NC_018028	GCA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
31	NC_018028	GCA	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
32	NC_018028	CTA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419090
33	NC_018028	TGC	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
34	NC_018028	GC	3	6	2587	2592	0 %	0 %	50 %	50 %	392419090
35	NC_018028	GACG	2	8	2599	2606	25 %	0 %	50 %	25 %	392419090
36	NC_018028	CG	3	6	2698	2703	0 %	0 %	50 %	50 %	392419090
37	NC_018028	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
38	NC_018028	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419090
39	NC_018028	TTCACC	2	12	2777	2788	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	392419090
40	NC_018028	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419090
41	NC_018028	TGC	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
42	NC_018028	TGC	2	6	2874	2879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419090
43	NC_018028	TC	3	6	2905	2910	0 %	50 %	0 %	50 %	392419090
44	NC_018028	AAC	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419090
45	NC_018028	GAA	2	6	2987	2992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419090
46	NC_018028	TGA	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419090
47	NC_018028	TCTG	2	8	3106	3113	0 %	50 %	25 %	25 %	392419090
48	NC_018028	CAG	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
49	NC_018028	ACG	2	6	3150	3155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419090
50	NC_018028	CTC	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419091
51	NC_018028	GC	3	6	3344	3349	0 %	0 %	50 %	50 %	392419091
52	NC_018028	TCA	2	6	3378	3383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419091
53	NC_018028	GTCAG	2	10	3506	3515	20 %	20 %	40 %	20 %	392419091
54	NC_018028	TCT	2	6	3571	3576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419091
55	NC_018028	GCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
56	NC_018028	TGA	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419091
57	NC_018028	TTA	2	6	3862	3867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392419091
58	NC_018028	GGGAT	2	10	3871	3880	20 %	20 %	60 %	0 %	392419091
59	NC_018028	CG	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	392419091
60	NC_018028	CAG	2	6	4022	4027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
61	NC_018028	TGG	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419091
62	NC_018028	TG	3	6	4038	4043	0 %	50 %	50 %	0 %	392419091
63	NC_018028	ATCT	2	8	4097	4104	25 %	50 %	0 %	25 %	392419091
64	NC_018028	CGA	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419091
65	NC_018028	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419091
66	NC_018028	TCG	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
67	NC_018028	CGA	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
68	NC_018028	GTC	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
69	NC_018028	TCGA	2	8	4453	4460	25 %	25 %	25 %	25 %	392419092
70	NC_018028	CCAT	2	8	4499	4506	25 %	25 %	0 %	50 %	392419092
71	NC_018028	CGG	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
72	NC_018028	TCA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419092
73	NC_018028	CGG	2	6	4611	4616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
74	NC_018028	GGT	2	6	4674	4679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419092
75	NC_018028	GAG	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419092
76	NC_018028	CCG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
77	NC_018028	CGT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
78	NC_018028	CGTT	2	8	4979	4986	0 %	50 %	25 %	25 %	392419092
79	NC_018028	ACAA	2	8	4999	5006	75 %	0 %	0 %	25 %	392419092
80	NC_018028	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
81	NC_018028	CAA	2	6	5118	5123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419092
82	NC_018028	CGG	2	6	5139	5144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419092
83	NC_018028	TCCGC	2	10	5162	5171	0 %	20 %	20 %	60 %	392419092
84	NC_018028	AAG	2	6	5218	5223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419092
85	NC_018028	CGA	2	6	5244	5249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
86	NC_018028	TCC	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419092
87	NC_018028	GAT	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
88	NC_018028	CGC	2	6	5439	5444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
89	NC_018028	GC	3	6	5461	5466	0 %	0 %	50 %	50 %	392419092
90	NC_018028	CGT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
91	NC_018028	CAAG	2	8	5604	5611	50 %	0 %	25 %	25 %	392419092
92	NC_018028	GAT	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
93	NC_018028	ACA	2	6	5756	5761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419092
94	NC_018028	CAT	4	12	5784	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419092
95	NC_018028	CCGACG	2	12	5798	5809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392419092
96	NC_018028	GCT	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419092
97	NC_018028	CTT	3	9	5844	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419092
98	NC_018028	TA	3	6	5888	5893	50 %	50 %	0 %	0 %	392419092
99	NC_018028	GCC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
100	NC_018028	GAC	2	6	5950	5955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419092
101	NC_018028	GGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419092
102	NC_018028	TGG	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419092
103	NC_018028	TGA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
104	NC_018028	CGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
105	NC_018028	CTGG	2	8	6192	6199	0 %	25 %	50 %	25 %	392419092
106	NC_018028	TTC	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419092
107	NC_018028	CAAG	2	8	6465	6472	50 %	0 %	25 %	25 %	392419092
108	NC_018028	TGA	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419092
109	NC_018028	CGC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419092
110	NC_018028	ACC	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419092
111	NC_018028	CAGAT	2	10	6626	6635	40 %	20 %	20 %	20 %	392419092
112	NC_018028	CCGCG	2	10	6667	6676	0 %	0 %	40 %	60 %	392419092
113	NC_018028	GCA	2	6	7089	7094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419093
114	NC_018028	AAC	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419093
115	NC_018028	AGGG	2	8	7181	7188	25 %	0 %	75 %	0 %	392419093
116	NC_018028	GT	3	6	7217	7222	0 %	50 %	50 %	0 %	392419093
117	NC_018028	TCC	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419093
118	NC_018028	TGA	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419093
119	NC_018028	AGCCT	2	10	7316	7325	20 %	20 %	20 %	40 %	392419093
120	NC_018028	GCG	2	6	7363	7368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419093
121	NC_018028	CTG	2	6	7376	7381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419093
122	NC_018028	GAG	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419093
123	NC_018028	TAC	2	6	7546	7551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419093
124	NC_018028	CAGCT	2	10	7559	7568	20 %	20 %	20 %	40 %	392419093
125	NC_018028	AAGC	2	8	7619	7626	50 %	0 %	25 %	25 %	392419093
126	NC_018028	GCTG	2	8	7810	7817	0 %	25 %	50 %	25 %	392419093
127	NC_018028	AGA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419093
128	NC_018028	CCA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419093
129	NC_018028	CTG	2	6	8068	8073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419094
130	NC_018028	CTG	2	6	8189	8194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419094
131	NC_018028	T	6	6	8205	8210	0 %	100 %	0 %	0 %	392419094
132	NC_018028	GCT	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419094
133	NC_018028	ATT	2	6	8279	8284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392419094
134	NC_018028	ATTG	2	8	8364	8371	25 %	50 %	25 %	0 %	392419094
135	NC_018028	ATC	2	6	8380	8385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419094
136	NC_018028	ACTT	2	8	8411	8418	25 %	50 %	0 %	25 %	392419094
137	NC_018028	TC	3	6	8459	8464	0 %	50 %	0 %	50 %	392419094
138	NC_018028	TTGCT	2	10	8541	8550	0 %	60 %	20 %	20 %	392419094
139	NC_018028	TGG	2	6	8595	8600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419094
140	NC_018028	AGGA	2	8	8672	8679	50 %	0 %	50 %	0 %	392419094
141	NC_018028	TAAA	2	8	8686	8693	75 %	25 %	0 %	0 %	392419094
142	NC_018028	CGT	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419095
143	NC_018028	GTC	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419095
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149	NC_018028	ACTGA	2	10	9079	9088	40 %	20 %	20 %	20 %	392419095
150	NC_018028	ACT	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419095
151	NC_018028	GA	3	6	9213	9218	50 %	0 %	50 %	0 %	392419095
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153	NC_018028	GGC	2	6	9347	9352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419095
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156	NC_018028	CGCA	2	8	9409	9416	25 %	0 %	25 %	50 %	392419095
157	NC_018028	CA	3	6	9427	9432	50 %	0 %	0 %	50 %	392419095
158	NC_018028	GCC	2	6	9435	9440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419095
159	NC_018028	CGC	2	6	9498	9503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419095
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161	NC_018028	CAGC	2	8	9573	9580	25 %	0 %	25 %	50 %	392419095
162	NC_018028	GTA	2	6	9586	9591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419095
163	NC_018028	CGG	2	6	9698	9703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419096
164	NC_018028	T	6	6	9706	9711	0 %	100 %	0 %	0 %	392419096
165	NC_018028	GAC	2	6	9755	9760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419096
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174	NC_018028	ATCT	2	8	10327	10334	25 %	50 %	0 %	25 %	392419097
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189	NC_018028	CTCTGA	2	12	12280	12291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392419098
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193	NC_018028	TA	4	8	12406	12413	50 %	50 %	0 %	0 %	392419098
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199	NC_018028	CTGGGT	2	12	12844	12855	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392419098
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202	NC_018028	CTG	2	6	13011	13016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419098
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215	NC_018028	TTCG	2	8	13773	13780	0 %	50 %	25 %	25 %	392419099
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220	NC_018028	GAA	2	6	14670	14675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419101
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222	NC_018028	GGT	3	9	14802	14810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419101
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228	NC_018028	GT	3	6	15207	15212	0 %	50 %	50 %	0 %	392419102
229	NC_018028	CTGA	2	8	15264	15271	25 %	25 %	25 %	25 %	392419102
230	NC_018028	GA	3	6	15298	15303	50 %	0 %	50 %	0 %	392419102
231	NC_018028	TGC	2	6	15325	15330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419102
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234	NC_018028	TTC	2	6	15480	15485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419102
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239	NC_018028	CG	3	6	15663	15668	0 %	0 %	50 %	50 %	392419102
240	NC_018028	TGG	2	6	15700	15705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419102
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242	NC_018028	GAG	2	6	15831	15836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419102
243	NC_018028	CAA	2	6	15962	15967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419102
244	NC_018028	GGC	2	6	15980	15985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419102
245	NC_018028	TG	3	6	16031	16036	0 %	50 %	50 %	0 %	392419102
246	NC_018028	TTGCC	2	10	16084	16093	0 %	40 %	20 %	40 %	392419102
247	NC_018028	TGC	2	6	16150	16155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419102
248	NC_018028	GCT	2	6	16224	16229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419102
249	NC_018028	CTG	2	6	16297	16302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419102
250	NC_018028	GCTGGT	2	12	16334	16345	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	392419102
251	NC_018028	CGGA	2	8	16350	16357	25 %	0 %	50 %	25 %	392419102
252	NC_018028	CAG	2	6	16365	16370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419102
253	NC_018028	CGG	2	6	16427	16432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419102
254	NC_018028	CAT	2	6	16454	16459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419102
255	NC_018028	ATC	2	6	16530	16535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419102
256	NC_018028	TTCG	2	8	16565	16572	0 %	50 %	25 %	25 %	392419102
257	NC_018028	CTC	2	6	16578	16583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392419102
258	NC_018028	GACT	2	8	16612	16619	25 %	25 %	25 %	25 %	392419102
259	NC_018028	CGT	2	6	16632	16637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419102
260	NC_018028	GCA	2	6	16643	16648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419102
261	NC_018028	GTT	2	6	16827	16832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392419102
262	NC_018028	CTGA	2	8	16878	16885	25 %	25 %	25 %	25 %	392419102
263	NC_018028	AAG	2	6	16968	16973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419102
264	NC_018028	CAC	2	6	17020	17025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419102
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382	NC_018028	TTCGA	2	10	23356	23365	20 %	40 %	20 %	20 %	392419107
383	NC_018028	TGA	2	6	23378	23383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419107
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