MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri CCUG 29243 chromosome

Total Repeats: 96495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018028	GCCC	2	8	50274	50281	0 %	0 %	25 %	75 %	392419134
1002	NC_018028	GCA	2	6	50284	50289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1003	NC_018028	GCG	2	6	50304	50309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419134
1004	NC_018028	CGC	3	9	50326	50334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419134
1005	NC_018028	CAG	2	6	50402	50407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1006	NC_018028	CG	3	6	50409	50414	0 %	0 %	50 %	50 %	392419134
1007	NC_018028	TGG	2	6	50421	50426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419134
1008	NC_018028	GGT	2	6	50429	50434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419134
1009	NC_018028	CGA	2	6	50521	50526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1010	NC_018028	CTG	2	6	50552	50557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419134
1011	NC_018028	GTGACC	2	12	50903	50914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419135
1012	NC_018028	CGA	2	6	50926	50931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419135
1013	NC_018028	CCGATG	2	12	50982	50993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419135
1014	NC_018028	CGA	2	6	51013	51018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419135
1015	NC_018028	CAG	2	6	51059	51064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419135
1016	NC_018028	CCA	2	6	51118	51123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419136
1017	NC_018028	GC	3	6	51146	51151	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1018	NC_018028	GCG	2	6	51219	51224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419136
1019	NC_018028	CCG	2	6	51255	51260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1020	NC_018028	GGCC	2	8	51310	51317	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1021	NC_018028	GC	3	6	51409	51414	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1022	NC_018028	CGGT	2	8	51420	51427	0 %	25 %	50 %	25 %	392419136
1023	NC_018028	GCTC	2	8	51442	51449	0 %	25 %	25 %	50 %	392419136
1024	NC_018028	CCG	2	6	51478	51483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1025	NC_018028	GCC	2	6	51527	51532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1026	NC_018028	ACG	2	6	51547	51552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419136
1027	NC_018028	CGC	2	6	51568	51573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1028	NC_018028	CCAT	2	8	51588	51595	25 %	25 %	0 %	50 %	392419136
1029	NC_018028	CGA	2	6	51604	51609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419136
1030	NC_018028	CCA	2	6	51634	51639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419136
1031	NC_018028	GGC	2	6	51640	51645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419136
1032	NC_018028	CGAT	2	8	51666	51673	25 %	25 %	25 %	25 %	392419136
1033	NC_018028	CGA	2	6	51677	51682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419136
1034	NC_018028	TCA	2	6	51778	51783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419136
1035	NC_018028	GCC	2	6	51785	51790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1036	NC_018028	GGTCG	2	10	51944	51953	0 %	20 %	60 %	20 %	392419136
1037	NC_018028	ACC	2	6	51954	51959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419136
1038	NC_018028	AGT	2	6	52009	52014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419136
1039	NC_018028	GCC	2	6	52025	52030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1040	NC_018028	CCG	2	6	52098	52103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1041	NC_018028	GGT	2	6	52133	52138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419136
1042	NC_018028	GC	3	6	52209	52214	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1043	NC_018028	GGCCG	2	10	52244	52253	0 %	0 %	60 %	40 %	392419136
1044	NC_018028	TGG	2	6	52258	52263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419136
1045	NC_018028	GCC	2	6	52277	52282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1046	NC_018028	CGG	2	6	52289	52294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419136
1047	NC_018028	TGA	2	6	52309	52314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419136
1048	NC_018028	GC	3	6	52330	52335	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1049	NC_018028	CGC	2	6	52402	52407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419136
1050	NC_018028	GGC	2	6	52543	52548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419136
1051	NC_018028	GTG	2	6	52569	52574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419136
1052	NC_018028	GAG	2	6	52611	52616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419136
1053	NC_018028	CTG	2	6	52646	52651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419136
1054	NC_018028	CCGG	2	8	52669	52676	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1055	NC_018028	GTA	2	6	52682	52687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419136
1056	NC_018028	GC	3	6	52688	52693	0 %	0 %	50 %	50 %	392419136
1057	NC_018028	GGC	2	6	52748	52753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419136
1058	NC_018028	CGA	2	6	53002	53007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419137
1059	NC_018028	GC	3	6	53020	53025	0 %	0 %	50 %	50 %	392419137
1060	NC_018028	AAGG	2	8	53114	53121	50 %	0 %	50 %	0 %	392419137
1061	NC_018028	GCA	2	6	53136	53141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419137
1062	NC_018028	ACA	2	6	53178	53183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419137
1063	NC_018028	GCCGTA	2	12	53394	53405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1064	NC_018028	GCC	2	6	53424	53429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1065	NC_018028	CCGC	2	8	53461	53468	0 %	0 %	25 %	75 %	392419138
1066	NC_018028	TCAGCC	2	12	53530	53541	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392419138
1067	NC_018028	CTG	2	6	53562	53567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1068	NC_018028	CG	3	6	53576	53581	0 %	0 %	50 %	50 %	392419138
1069	NC_018028	CTG	3	9	53637	53645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1070	NC_018028	CGC	2	6	53711	53716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1071	NC_018028	TCGAAC	2	12	53728	53739	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	392419138
1072	NC_018028	CGC	2	6	53743	53748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1073	NC_018028	CGC	2	6	53768	53773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1074	NC_018028	TGG	2	6	53791	53796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419138
1075	NC_018028	ACG	2	6	53815	53820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1076	NC_018028	GCAGC	2	10	53975	53984	20 %	0 %	40 %	40 %	392419138
1077	NC_018028	CGGTTT	2	12	54056	54067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	392419138
1078	NC_018028	CGA	2	6	54113	54118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1079	NC_018028	CCG	2	6	54121	54126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1080	NC_018028	CAG	2	6	54135	54140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1081	NC_018028	GAG	2	6	54150	54155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419138
1082	NC_018028	GACCA	2	10	54183	54192	40 %	0 %	20 %	40 %	392419138
1083	NC_018028	AGC	2	6	54279	54284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1084	NC_018028	TGG	2	6	54295	54300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419138
1085	NC_018028	CAG	3	9	54369	54377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1086	NC_018028	CGA	2	6	54431	54436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1087	NC_018028	ACC	2	6	54450	54455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419138
1088	NC_018028	GTCG	2	8	54473	54480	0 %	25 %	50 %	25 %	392419138
1089	NC_018028	GAT	2	6	54527	54532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392419138
1090	NC_018028	CTCGC	2	10	54543	54552	0 %	20 %	20 %	60 %	392419138
1091	NC_018028	AAC	2	6	54615	54620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419138
1092	NC_018028	GGC	2	6	54644	54649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419138
1093	NC_018028	GCA	2	6	54653	54658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419138
1094	NC_018028	CGC	2	6	54668	54673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419138
1095	NC_018028	TTCGG	2	10	54819	54828	0 %	40 %	40 %	20 %	392419138
1096	NC_018028	GC	3	6	55401	55406	0 %	0 %	50 %	50 %	392419139
1097	NC_018028	GAA	2	6	55423	55428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419139
1098	NC_018028	TGC	2	6	55523	55528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1099	NC_018028	CG	3	6	55534	55539	0 %	0 %	50 %	50 %	392419139
1100	NC_018028	GCG	2	6	55592	55597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419139
1101	NC_018028	GGC	2	6	55616	55621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419139
1102	NC_018028	CAT	2	6	55665	55670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419139
1103	NC_018028	CCA	2	6	55671	55676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392419139
1104	NC_018028	GAG	2	6	55693	55698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419139
1105	NC_018028	GAG	2	6	55735	55740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419139
1106	NC_018028	CAGCCT	2	12	55803	55814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392419139
1107	NC_018028	GCA	2	6	55854	55859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1108	NC_018028	CAG	2	6	55885	55890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1109	NC_018028	GCTG	2	8	55994	56001	0 %	25 %	50 %	25 %	392419139
1110	NC_018028	CAAGGC	2	12	56007	56018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1111	NC_018028	GAA	2	6	56188	56193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419139
1112	NC_018028	AGA	2	6	56210	56215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392419139
1113	NC_018028	CGG	2	6	56238	56243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419139
1114	NC_018028	CAA	2	6	56259	56264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392419139
1115	NC_018028	CTG	2	6	56266	56271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1116	NC_018028	CAT	2	6	56277	56282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419139
1117	NC_018028	GTG	2	6	56318	56323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419139
1118	NC_018028	GCTGGA	2	12	56328	56339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392419139
1119	NC_018028	GCC	2	6	56353	56358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419139
1120	NC_018028	GC	3	6	56373	56378	0 %	0 %	50 %	50 %	392419139
1121	NC_018028	GCT	2	6	56397	56402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1122	NC_018028	GCA	2	6	56415	56420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392419139
1123	NC_018028	TGG	2	6	56456	56461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419139
1124	NC_018028	GGA	2	6	56469	56474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392419139
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1245	NC_018028	CTG	3	9	63356	63364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392419146
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1370	NC_018028	CG	3	6	70039	70044	0 %	0 %	50 %	50 %	392419155
1371	NC_018028	CTT	2	6	70054	70059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392419155
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1496	NC_018028	TGG	2	6	76258	76263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392419163
1497	NC_018028	GC	3	6	76278	76283	0 %	0 %	50 %	50 %	392419163
1498	NC_018028	CGC	2	6	76336	76341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392419163
1499	NC_018028	GCG	2	6	76343	76348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392419163
1500	NC_018028	ATC	2	6	76401	76406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392419163

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