MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 chromosome

Total Repeats: 117745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017986	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	395443651
2	NC_017986	GCT	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
3	NC_017986	CAG	2	6	846	851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
4	NC_017986	ATG	2	6	948	953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443651
5	NC_017986	GTC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
6	NC_017986	GTG	2	6	970	975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443651
7	NC_017986	CGGT	2	8	1122	1129	0 %	25 %	50 %	25 %	395443651
8	NC_017986	CCA	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443651
9	NC_017986	CCG	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
10	NC_017986	GCC	2	6	1189	1194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
11	NC_017986	GCC	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
12	NC_017986	GTA	2	6	1215	1220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443651
13	NC_017986	GCA	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
14	NC_017986	CGT	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
15	NC_017986	GCC	2	6	1332	1337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
16	NC_017986	GCC	2	6	1347	1352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
17	NC_017986	GTC	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
18	NC_017986	GCCA	2	8	1460	1467	25 %	0 %	25 %	50 %	395443651
19	NC_017986	CGCT	2	8	1519	1526	0 %	25 %	25 %	50 %	395443651
20	NC_017986	GTC	2	6	1554	1559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
21	NC_017986	CGG	2	6	1589	1594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
22	NC_017986	GAA	2	6	1632	1637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	395443651
23	NC_017986	GTC	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
24	NC_017986	GCTG	2	8	1715	1722	0 %	25 %	50 %	25 %	395443651
25	NC_017986	GTC	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
26	NC_017986	GCC	2	6	1779	1784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
27	NC_017986	TGG	3	9	1904	1912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443651
28	NC_017986	GCA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
29	NC_017986	CAC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443651
30	NC_017986	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
31	NC_017986	GCC	2	6	2023	2028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
32	NC_017986	CACT	2	8	2119	2126	25 %	25 %	0 %	50 %	395443651
33	NC_017986	TGCC	2	8	2157	2164	0 %	25 %	25 %	50 %	395443651
34	NC_017986	CAG	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
35	NC_017986	GCA	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
36	NC_017986	CAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443651
37	NC_017986	CAG	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
38	NC_017986	GCC	2	6	2408	2413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
39	NC_017986	AGGT	2	8	2476	2483	25 %	25 %	50 %	0 %	395443651
40	NC_017986	CGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
41	NC_017986	GTT	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	395443651
42	NC_017986	GCG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
43	NC_017986	GGT	2	6	2699	2704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443651
44	NC_017986	GCG	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
45	NC_017986	CAG	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
46	NC_017986	CGG	2	6	2888	2893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
47	NC_017986	CGA	2	6	3008	3013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
48	NC_017986	GCCG	2	8	3047	3054	0 %	0 %	50 %	50 %	395443651
49	NC_017986	GGC	2	6	3079	3084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
50	NC_017986	CAGGCT	2	12	3153	3164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	395443651
51	NC_017986	GGT	2	6	3188	3193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443651
52	NC_017986	TGG	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443651
53	NC_017986	GCG	3	9	3304	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
54	NC_017986	GCG	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
55	NC_017986	TGA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443651
56	NC_017986	GCAAT	2	10	3563	3572	40 %	20 %	20 %	20 %	395443651
57	NC_017986	CG	4	8	3587	3594	0 %	0 %	50 %	50 %	395443651
58	NC_017986	CTGG	2	8	3623	3630	0 %	25 %	50 %	25 %	395443651
59	NC_017986	GC	3	6	3638	3643	0 %	0 %	50 %	50 %	395443651
60	NC_017986	GGT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443651
61	NC_017986	CCAG	2	8	3755	3762	25 %	0 %	25 %	50 %	395443651
62	NC_017986	CAGG	2	8	3777	3784	25 %	0 %	50 %	25 %	395443651
63	NC_017986	GCT	2	6	3920	3925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443651
64	NC_017986	CCG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
65	NC_017986	TGGC	2	8	4042	4049	0 %	25 %	50 %	25 %	395443651
66	NC_017986	GCC	2	6	4083	4088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
67	NC_017986	TCCGGG	2	12	4153	4164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	395443651
68	NC_017986	GGC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
69	NC_017986	GTT	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	395443651
70	NC_017986	TGGCG	2	10	4280	4289	0 %	20 %	60 %	20 %	395443651
71	NC_017986	CGG	2	6	4385	4390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
72	NC_017986	CGC	2	6	4418	4423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443651
73	NC_017986	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443651
74	NC_017986	ACC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443651
75	NC_017986	GCA	2	6	4505	4510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443651
76	NC_017986	GC	3	6	4545	4550	0 %	0 %	50 %	50 %	395443652
77	NC_017986	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
78	NC_017986	GC	3	6	4615	4620	0 %	0 %	50 %	50 %	395443652
79	NC_017986	CAG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
80	NC_017986	GGC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443652
81	NC_017986	GC	3	6	4711	4716	0 %	0 %	50 %	50 %	395443652
82	NC_017986	CCA	3	9	4730	4738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443652
83	NC_017986	AGC	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
84	NC_017986	TCG	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443652
85	NC_017986	GATGGA	2	12	4788	4799	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	395443652
86	NC_017986	CGT	2	6	4808	4813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443652
87	NC_017986	TCG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443652
88	NC_017986	CGT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443652
89	NC_017986	GTG	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443652
90	NC_017986	CGG	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443652
91	NC_017986	CAG	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
92	NC_017986	GCT	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443652
93	NC_017986	CCG	2	6	4955	4960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443652
94	NC_017986	TTC	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	395443652
95	NC_017986	GCAC	2	8	4984	4991	25 %	0 %	25 %	50 %	395443652
96	NC_017986	ACC	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443652
97	NC_017986	GCA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
98	NC_017986	CGG	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443652
99	NC_017986	TGA	2	6	5186	5191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443652
100	NC_017986	CGG	2	6	5302	5307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443652
101	NC_017986	CCA	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443652
102	NC_017986	GAA	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	395443652
103	NC_017986	TTC	2	6	5337	5342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	395443652
104	NC_017986	GCA	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
105	NC_017986	CTT	2	6	5396	5401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	395443652
106	NC_017986	TGC	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443652
107	NC_017986	GCG	2	6	5481	5486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443652
108	NC_017986	GCA	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443652
109	NC_017986	GGT	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443652
110	NC_017986	CCGAG	2	10	5531	5540	20 %	0 %	40 %	40 %	395443652
111	NC_017986	CAAGGC	2	12	6050	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443653
112	NC_017986	TGCAGG	2	12	6079	6090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	395443653
113	NC_017986	ACC	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443653
114	NC_017986	CAG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443653
115	NC_017986	GCC	2	6	6180	6185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443654
116	NC_017986	TGG	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443654
117	NC_017986	GGA	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	395443654
118	NC_017986	AGC	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443654
119	NC_017986	GC	3	6	6365	6370	0 %	0 %	50 %	50 %	395443654
120	NC_017986	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	395443654
121	NC_017986	GC	3	6	6462	6467	0 %	0 %	50 %	50 %	395443654
122	NC_017986	CGG	2	6	6475	6480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443654
123	NC_017986	GCC	2	6	6611	6616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443655
124	NC_017986	GTTC	2	8	6647	6654	0 %	50 %	25 %	25 %	395443655
125	NC_017986	CGC	2	6	6782	6787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443655
126	NC_017986	GCCG	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	395443655
127	NC_017986	AGC	2	6	6860	6865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443655
128	NC_017986	CG	3	6	6916	6921	0 %	0 %	50 %	50 %	395443655
129	NC_017986	GCG	2	6	6965	6970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443655
130	NC_017986	GCA	2	6	6990	6995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443655
131	NC_017986	GCAA	2	8	7041	7048	50 %	0 %	25 %	25 %	395443655
132	NC_017986	TGCAGC	2	12	7050	7061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	395443655
133	NC_017986	GCT	2	6	7225	7230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443655
134	NC_017986	CTG	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443655
135	NC_017986	GGCGCA	2	12	7387	7398	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	395443655
136	NC_017986	GCA	3	9	7396	7404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443655
137	NC_017986	AGC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443655
138	NC_017986	CGGGC	2	10	7487	7496	0 %	0 %	60 %	40 %	395443655
139	NC_017986	GCCAA	2	10	7497	7506	40 %	0 %	20 %	40 %	395443655
140	NC_017986	CTG	2	6	7563	7568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443655
141	NC_017986	AGC	2	6	7572	7577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443655
142	NC_017986	CGC	2	6	7627	7632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443655
143	NC_017986	CTC	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	395443655
144	NC_017986	TTGC	2	8	7723	7730	0 %	50 %	25 %	25 %	395443655
145	NC_017986	GCT	2	6	7828	7833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443655
146	NC_017986	GCA	2	6	7905	7910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443655
147	NC_017986	GGCA	2	8	7915	7922	25 %	0 %	50 %	25 %	395443655
148	NC_017986	GCCAA	2	10	7947	7956	40 %	0 %	20 %	40 %	395443655
149	NC_017986	GCC	2	6	7986	7991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443655
150	NC_017986	CTG	2	6	8039	8044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443655
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152	NC_017986	GGC	2	6	8065	8070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443655
153	NC_017986	GCC	2	6	8075	8080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443655
154	NC_017986	TGC	2	6	8112	8117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443655
155	NC_017986	ACC	2	6	8133	8138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443655
156	NC_017986	ATG	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443655
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158	NC_017986	CAG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443656
159	NC_017986	GCAGC	2	10	8648	8657	20 %	0 %	40 %	40 %	395443656
160	NC_017986	CTG	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443656
161	NC_017986	CCGA	2	8	8685	8692	25 %	0 %	25 %	50 %	395443656
162	NC_017986	GCAA	2	8	8710	8717	50 %	0 %	25 %	25 %	395443656
163	NC_017986	ACA	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443656
164	NC_017986	TCT	2	6	8833	8838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	395443656
165	NC_017986	GGTT	2	8	8855	8862	0 %	50 %	50 %	0 %	395443656
166	NC_017986	GGC	2	6	8874	8879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443656
167	NC_017986	TGC	2	6	8918	8923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443656
168	NC_017986	GAA	2	6	8993	8998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	395443656
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170	NC_017986	CAA	2	6	9089	9094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443656
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172	NC_017986	GCG	2	6	9373	9378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443656
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176	NC_017986	CCA	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443657
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193	NC_017986	GAT	2	6	10674	10679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443658
194	NC_017986	CAG	2	6	10681	10686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443658
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243	NC_017986	CAC	2	6	13247	13252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443660
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245	NC_017986	ACG	2	6	13369	13374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443660
246	NC_017986	CA	3	6	13390	13395	50 %	0 %	0 %	50 %	395443660
247	NC_017986	GCCG	2	8	13417	13424	0 %	0 %	50 %	50 %	395443660
248	NC_017986	GCC	2	6	13476	13481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443660
249	NC_017986	GCC	2	6	13488	13493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443660
250	NC_017986	ACT	2	6	13498	13503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443660
251	NC_017986	TCCT	2	8	13536	13543	0 %	50 %	0 %	50 %	395443660
252	NC_017986	AAC	2	6	13570	13575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443660
253	NC_017986	GCC	2	6	13578	13583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443660
254	NC_017986	CTGCC	2	10	13597	13606	0 %	20 %	20 %	60 %	395443660
255	NC_017986	CCA	2	6	13669	13674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443660
256	NC_017986	GC	3	6	13719	13724	0 %	0 %	50 %	50 %	395443660
257	NC_017986	CAG	2	6	13755	13760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443660
258	NC_017986	CGG	2	6	13784	13789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443660
259	NC_017986	GC	3	6	13817	13822	0 %	0 %	50 %	50 %	395443660
260	NC_017986	GGC	2	6	13920	13925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443660
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371	NC_017986	CAC	2	6	19719	19724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443666
372	NC_017986	CTGG	2	8	19805	19812	0 %	25 %	50 %	25 %	395443666
373	NC_017986	ACCTGA	2	12	19819	19830	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	395443666
374	NC_017986	T	7	7	19929	19935	0 %	100 %	0 %	0 %	395443666
375	NC_017986	CGGCG	2	10	19938	19947	0 %	0 %	60 %	40 %	395443667
376	NC_017986	ACC	2	6	19974	19979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443667
377	NC_017986	CAA	2	6	19991	19996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443667
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380	NC_017986	AGC	3	9	20214	20222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443667
381	NC_017986	C	6	6	20305	20310	0 %	0 %	0 %	100 %	395443667
382	NC_017986	CGG	2	6	20351	20356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443667
383	NC_017986	CAG	2	6	20375	20380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443667
384	NC_017986	CAG	2	6	20384	20389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443667
385	NC_017986	CAG	2	6	20414	20419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443667
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387	NC_017986	CGCCCC	2	12	20498	20509	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	395443667
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499	NC_017986	AAC	2	6	26254	26259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443675
500	NC_017986	ACC	2	6	26299	26304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443675

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