MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida ND6 chromosome

Total Repeats: 117745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017986	CTG	2	6	26370	26375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443675
502	NC_017986	GCA	2	6	26387	26392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443675
503	NC_017986	CAA	2	6	26432	26437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443675
504	NC_017986	GCC	2	6	26439	26444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443675
505	NC_017986	GCC	2	6	26454	26459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443675
506	NC_017986	CGC	3	9	26507	26515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443675
507	NC_017986	AGCC	2	8	26520	26527	25 %	0 %	25 %	50 %	395443675
508	NC_017986	CAA	2	6	26564	26569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443675
509	NC_017986	CGA	2	6	26603	26608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443675
510	NC_017986	CTG	2	6	26619	26624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443675
511	NC_017986	CTT	2	6	26630	26635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	395443675
512	NC_017986	GCT	2	6	26693	26698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443675
513	NC_017986	AAC	2	6	26794	26799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443675
514	NC_017986	GGGCCT	2	12	26822	26833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	395443675
515	NC_017986	GCCA	2	8	26950	26957	25 %	0 %	25 %	50 %	395443676
516	NC_017986	GACC	2	8	27024	27031	25 %	0 %	25 %	50 %	395443676
517	NC_017986	ACG	2	6	27095	27100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443676
518	NC_017986	GCC	2	6	27121	27126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443676
519	NC_017986	GCT	3	9	27162	27170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443676
520	NC_017986	ACCCCT	2	12	27239	27250	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	395443676
521	NC_017986	ACC	2	6	27275	27280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443676
522	NC_017986	GC	3	6	27334	27339	0 %	0 %	50 %	50 %	395443676
523	NC_017986	GAC	3	9	27436	27444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443676
524	NC_017986	TGC	2	6	27449	27454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443676
525	NC_017986	CGC	2	6	27557	27562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443676
526	NC_017986	GTT	2	6	27576	27581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	395443676
527	NC_017986	CAG	2	6	27607	27612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443676
528	NC_017986	TCA	2	6	27641	27646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443676
529	NC_017986	GCCGAC	2	12	27651	27662	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	395443676
530	NC_017986	TGC	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443676
531	NC_017986	GAA	2	6	27775	27780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	395443676
532	NC_017986	CTG	2	6	27838	27843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443676
533	NC_017986	TGC	2	6	27921	27926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443676
534	NC_017986	CCG	3	9	27941	27949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443676
535	NC_017986	CGC	2	6	27958	27963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443676
536	NC_017986	GCC	2	6	27979	27984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443676
537	NC_017986	CTGG	2	8	28059	28066	0 %	25 %	50 %	25 %	395443676
538	NC_017986	GAC	2	6	28114	28119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443676
539	NC_017986	CTG	2	6	28138	28143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443676
540	NC_017986	CGG	2	6	28221	28226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443676
541	NC_017986	GTCAG	2	10	28253	28262	20 %	20 %	40 %	20 %	395443676
542	NC_017986	GCAC	2	8	28310	28317	25 %	0 %	25 %	50 %	395443677
543	NC_017986	CCGG	2	8	28354	28361	0 %	0 %	50 %	50 %	395443677
544	NC_017986	GA	3	6	28380	28385	50 %	0 %	50 %	0 %	395443677
545	NC_017986	ACA	2	6	28386	28391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443677
546	NC_017986	C	6	6	28428	28433	0 %	0 %	0 %	100 %	395443678
547	NC_017986	GCT	2	6	28459	28464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443678
548	NC_017986	CGCC	2	8	28576	28583	0 %	0 %	25 %	75 %	395443678
549	NC_017986	TCG	2	6	28620	28625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443678
550	NC_017986	GGC	2	6	28640	28645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443678
551	NC_017986	AGCG	2	8	28646	28653	25 %	0 %	50 %	25 %	395443678
552	NC_017986	GTG	2	6	28682	28687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443678
553	NC_017986	ACACC	2	10	28729	28738	40 %	0 %	0 %	60 %	395443678
554	NC_017986	GGC	2	6	28748	28753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443678
555	NC_017986	AAC	2	6	28793	28798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443678
556	NC_017986	CACC	2	8	28879	28886	25 %	0 %	0 %	75 %	395443678
557	NC_017986	ACC	2	6	28937	28942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443678
558	NC_017986	AAGGC	2	10	29064	29073	40 %	0 %	40 %	20 %	395443678
559	NC_017986	GC	3	6	29131	29136	0 %	0 %	50 %	50 %	395443678
560	NC_017986	CGG	2	6	29161	29166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443678
561	NC_017986	CTG	2	6	29186	29191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443678
562	NC_017986	CTGC	2	8	29340	29347	0 %	25 %	25 %	50 %	395443679
563	NC_017986	TGC	2	6	29360	29365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443679
564	NC_017986	GCC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443679
565	NC_017986	CAG	2	6	29461	29466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443679
566	NC_017986	GTG	2	6	29471	29476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443679
567	NC_017986	AGCC	2	8	29490	29497	25 %	0 %	25 %	50 %	395443679
568	NC_017986	GCT	2	6	29571	29576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443679
569	NC_017986	ACA	2	6	29591	29596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	395443679
570	NC_017986	GCC	2	6	29824	29829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443679
571	NC_017986	TGGC	2	8	29851	29858	0 %	25 %	50 %	25 %	395443679
572	NC_017986	TGG	2	6	29870	29875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443679
573	NC_017986	GGT	2	6	29883	29888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443679
574	NC_017986	CAG	2	6	30024	30029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443680
575	NC_017986	GC	3	6	30109	30114	0 %	0 %	50 %	50 %	395443680
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577	NC_017986	TGG	2	6	30205	30210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443680
578	NC_017986	GAT	2	6	30285	30290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	395443680
579	NC_017986	T	6	6	30352	30357	0 %	100 %	0 %	0 %	395443680
580	NC_017986	CGAT	2	8	30412	30419	25 %	25 %	25 %	25 %	395443680
581	NC_017986	TCA	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443681
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584	NC_017986	GCCA	2	8	30754	30761	25 %	0 %	25 %	50 %	395443682
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587	NC_017986	CG	3	6	30999	31004	0 %	0 %	50 %	50 %	395443682
588	NC_017986	GC	3	6	31028	31033	0 %	0 %	50 %	50 %	395443682
589	NC_017986	GGCCTT	2	12	31047	31058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443682
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592	NC_017986	CAT	2	6	31203	31208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443682
593	NC_017986	CAC	2	6	31209	31214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443682
594	NC_017986	CCA	2	6	31238	31243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443682
595	NC_017986	TGC	2	6	31331	31336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443682
596	NC_017986	TCG	2	6	31352	31357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443682
597	NC_017986	CAG	2	6	31393	31398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443682
598	NC_017986	CGG	2	6	31403	31408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443682
599	NC_017986	GGT	2	6	31416	31421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443682
600	NC_017986	TGC	2	6	31436	31441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443682
601	NC_017986	GCC	2	6	31457	31462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443682
602	NC_017986	TAC	2	6	31523	31528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443682
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604	NC_017986	GAC	2	6	31597	31602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443682
605	NC_017986	CCGC	2	8	32022	32029	0 %	0 %	25 %	75 %	395443683
606	NC_017986	TCA	2	6	32041	32046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443683
607	NC_017986	CCG	2	6	32074	32079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443683
608	NC_017986	GCC	2	6	32163	32168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	395443683
609	NC_017986	GCA	2	6	32176	32181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443683
610	NC_017986	AGGC	2	8	32347	32354	25 %	0 %	50 %	25 %	395443683
611	NC_017986	CAG	2	6	32391	32396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443683
612	NC_017986	TGT	2	6	32413	32418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	395443683
613	NC_017986	GCT	2	6	32422	32427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443683
614	NC_017986	AGC	2	6	32430	32435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443683
615	NC_017986	TGG	2	6	32545	32550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443683
616	NC_017986	CGCC	2	8	32553	32560	0 %	0 %	25 %	75 %	395443683
617	NC_017986	GTG	2	6	32592	32597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443683
618	NC_017986	CCA	2	6	32599	32604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	395443683
619	NC_017986	GTCG	2	8	32684	32691	0 %	25 %	50 %	25 %	395443683
620	NC_017986	GCA	2	6	32692	32697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443683
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622	NC_017986	GGC	2	6	32746	32751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	395443683
623	NC_017986	TCG	2	6	32767	32772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	395443683
624	NC_017986	CG	3	6	32790	32795	0 %	0 %	50 %	50 %	395443683
625	NC_017986	GGT	2	6	32801	32806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	395443683
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627	NC_017986	GCA	2	6	32842	32847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	395443683
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754	NC_017986	GGCC	2	8	39858	39865	0 %	0 %	50 %	50 %	395443692
755	NC_017986	GC	3	6	39947	39952	0 %	0 %	50 %	50 %	395443692
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761	NC_017986	ATC	2	6	40367	40372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	395443693
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872	NC_017986	ATGCC	2	10	46060	46069	20 %	20 %	20 %	40 %	395443696
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