MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus sp. ST04 chromosome

Total Repeats: 32038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017946	CCT	2	6	165587	165592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851617
3002	NC_017946	T	7	7	165658	165664	0 %	100 %	0 %	0 %	389851617
3003	NC_017946	G	6	6	165703	165708	0 %	0 %	100 %	0 %	389851617
3004	NC_017946	TAT	2	6	165745	165750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851617
3005	NC_017946	CAA	2	6	165842	165847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851618
3006	NC_017946	AAC	2	6	165879	165884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851618
3007	NC_017946	GCCT	2	8	165907	165914	0 %	25 %	25 %	50 %	389851618
3008	NC_017946	TGGCAT	2	12	165924	165935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	389851618
3009	NC_017946	AT	3	6	165953	165958	50 %	50 %	0 %	0 %	389851618
3010	NC_017946	ACC	2	6	166030	166035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389851618
3011	NC_017946	GAAGT	2	10	166079	166088	40 %	20 %	40 %	0 %	389851618
3012	NC_017946	G	6	6	166090	166095	0 %	0 %	100 %	0 %	389851618
3013	NC_017946	TCT	2	6	166129	166134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851618
3014	NC_017946	CTT	2	6	166233	166238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851618
3015	NC_017946	CTT	2	6	166261	166266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851618
3016	NC_017946	TCT	2	6	166325	166330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851618
3017	NC_017946	TTA	2	6	166346	166351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851618
3018	NC_017946	ATCT	2	8	166452	166459	25 %	50 %	0 %	25 %	389851618
3019	NC_017946	TCC	2	6	166493	166498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851618
3020	NC_017946	AGA	2	6	166585	166590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851619
3021	NC_017946	TCC	2	6	166593	166598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851619
3022	NC_017946	TCT	2	6	166599	166604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851619
3023	NC_017946	TCC	2	6	166605	166610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851619
3024	NC_017946	TGC	2	6	166628	166633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851619
3025	NC_017946	CT	3	6	166650	166655	0 %	50 %	0 %	50 %	389851619
3026	NC_017946	CCTG	2	8	166758	166765	0 %	25 %	25 %	50 %	389851619
3027	NC_017946	TGGG	2	8	166838	166845	0 %	25 %	75 %	0 %	389851619
3028	NC_017946	CT	3	6	166867	166872	0 %	50 %	0 %	50 %	389851619
3029	NC_017946	TGA	2	6	166948	166953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851619
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3033	NC_017946	CTT	2	6	167034	167039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851619
3034	NC_017946	TGT	3	9	167101	167109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389851619
3035	NC_017946	CTT	2	6	167126	167131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851619
3036	NC_017946	GAG	2	6	167153	167158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851619
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3038	NC_017946	CT	3	6	167211	167216	0 %	50 %	0 %	50 %	389851619
3039	NC_017946	TC	3	6	167242	167247	0 %	50 %	0 %	50 %	389851619
3040	NC_017946	GTTG	2	8	167255	167262	0 %	50 %	50 %	0 %	389851619
3041	NC_017946	TGC	3	9	167303	167311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851619
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3044	NC_017946	TGC	3	9	167447	167455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851619
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3052	NC_017946	TGA	2	6	167734	167739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851619
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3055	NC_017946	AAC	2	6	167843	167848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851619
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3058	NC_017946	GCCA	2	8	168025	168032	25 %	0 %	25 %	50 %	389851619
3059	NC_017946	TCT	2	6	168046	168051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851619
3060	NC_017946	CCT	2	6	168184	168189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851619
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3066	NC_017946	CAT	2	6	168490	168495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851619
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3107	NC_017946	CAA	2	6	170341	170346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851621
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3110	NC_017946	ATA	2	6	170414	170419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851621
3111	NC_017946	TAG	2	6	170429	170434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851621
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3113	NC_017946	CAT	2	6	170503	170508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851621
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3120	NC_017946	GAA	2	6	170880	170885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851621
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3492	NC_017946	TTG	2	6	192648	192653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389851648
3493	NC_017946	TGC	2	6	192667	192672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851648
3494	NC_017946	TATGA	2	10	192728	192737	40 %	40 %	20 %	0 %	389851648
3495	NC_017946	GAG	2	6	192770	192775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851648
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3498	NC_017946	A	6	6	192814	192819	100 %	0 %	0 %	0 %	389851648
3499	NC_017946	CT	3	6	192910	192915	0 %	50 %	0 %	50 %	389851648
3500	NC_017946	GAACA	2	10	192937	192946	60 %	0 %	20 %	20 %	389851648

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