MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus sp. ST04 chromosome

Total Repeats: 32038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_017946	GA	3	6	1734509	1734514	50 %	0 %	50 %	0 %	389853196
32002	NC_017946	CGT	2	6	1734522	1734527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853196
32003	NC_017946	T	6	6	1734531	1734536	0 %	100 %	0 %	0 %	389853196
32004	NC_017946	TAAA	2	8	1734576	1734583	75 %	25 %	0 %	0 %	389853196
32005	NC_017946	TAT	2	6	1734618	1734623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853196
32006	NC_017946	ACA	2	6	1734655	1734660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853196
32007	NC_017946	TCCC	2	8	1734663	1734670	0 %	25 %	0 %	75 %	389853196
32008	NC_017946	CGA	2	6	1734692	1734697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853196
32009	NC_017946	AGA	2	6	1734753	1734758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853196
32010	NC_017946	CTC	2	6	1734789	1734794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389853196
32011	NC_017946	TAT	2	6	1734816	1734821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853196
32012	NC_017946	TCC	2	6	1734857	1734862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389853196
32013	NC_017946	ATC	2	6	1734864	1734869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853196
32014	NC_017946	AAG	2	6	1734870	1734875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853196
32015	NC_017946	AGA	2	6	1734917	1734922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853196
32016	NC_017946	CTT	2	6	1734936	1734941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853196
32017	NC_017946	TACC	2	8	1734991	1734998	25 %	25 %	0 %	50 %	389853196
32018	NC_017946	ATC	2	6	1735092	1735097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853196
32019	NC_017946	GAG	2	6	1735136	1735141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389853196
32020	NC_017946	TC	3	6	1735199	1735204	0 %	50 %	0 %	50 %	389853196
32021	NC_017946	CCA	2	6	1735215	1735220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389853196
32022	NC_017946	AAT	2	6	1735336	1735341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853196
32023	NC_017946	AGTC	2	8	1735346	1735353	25 %	25 %	25 %	25 %	389853196
32024	NC_017946	AAG	2	6	1735370	1735375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853196
32025	NC_017946	TCA	2	6	1735378	1735383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853196
32026	NC_017946	AAT	2	6	1735478	1735483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853196
32027	NC_017946	CTT	2	6	1735565	1735570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853196
32028	NC_017946	TCT	2	6	1735577	1735582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853196
32029	NC_017946	T	6	6	1735606	1735611	0 %	100 %	0 %	0 %	389853196
32030	NC_017946	AGT	2	6	1735628	1735633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853196
32031	NC_017946	ACCAA	2	10	1735785	1735794	60 %	0 %	0 %	40 %	389853196
32032	NC_017946	TC	3	6	1735819	1735824	0 %	50 %	0 %	50 %	389853196
32033	NC_017946	TA	3	6	1735847	1735852	50 %	50 %	0 %	0 %	389853196
32034	NC_017946	ATA	2	6	1735872	1735877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853196
32035	NC_017946	ATT	2	6	1735939	1735944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853196
32036	NC_017946	AAG	2	6	1735947	1735952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853196
32037	NC_017946	A	7	7	1736363	1736369	100 %	0 %	0 %	0 %	389853197
32038	NC_017946	TGAAGA	2	12	1736426	1736437	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389853197

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.