MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 chromosome

Total Repeats: 110055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017911	GCA	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891256
2	NC_017911	CTGC	2	8	271	278	0 %	25 %	25 %	50 %	387891256
3	NC_017911	TCCG	2	8	299	306	0 %	25 %	25 %	50 %	387891256
4	NC_017911	CGA	2	6	327	332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891256
5	NC_017911	CGA	2	6	411	416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891256
6	NC_017911	CT	3	6	440	445	0 %	50 %	0 %	50 %	387891256
7	NC_017911	TTA	2	6	448	453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387891256
8	NC_017911	GCA	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891256
9	NC_017911	CGCGC	2	10	481	490	0 %	0 %	40 %	60 %	387891256
10	NC_017911	GCC	3	9	505	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891256
11	NC_017911	CGC	2	6	546	551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891256
12	NC_017911	CGT	2	6	584	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891256
13	NC_017911	AAT	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387891256
14	NC_017911	GC	3	6	710	715	0 %	0 %	50 %	50 %	387891256
15	NC_017911	GCC	2	6	796	801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891256
16	NC_017911	GGC	2	6	853	858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891256
17	NC_017911	ACC	2	6	899	904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891256
18	NC_017911	AGA	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891256
19	NC_017911	GGT	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891256
20	NC_017911	TTG	2	6	1033	1038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891256
21	NC_017911	TTC	2	6	1087	1092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891256
22	NC_017911	CAG	2	6	1123	1128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891256
23	NC_017911	GAA	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891256
24	NC_017911	TGA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891256
25	NC_017911	TGC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891256
26	NC_017911	TTC	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891256
27	NC_017911	CGTG	2	8	1335	1342	0 %	25 %	50 %	25 %	387891256
28	NC_017911	GC	3	6	1352	1357	0 %	0 %	50 %	50 %	387891256
29	NC_017911	TTG	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891256
30	NC_017911	TAC	2	6	1495	1500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891256
31	NC_017911	CTG	2	6	1519	1524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891256
32	NC_017911	ACCA	2	8	1591	1598	50 %	0 %	0 %	50 %	387891256
33	NC_017911	ACCAC	2	10	1637	1646	40 %	0 %	0 %	60 %	387891256
34	NC_017911	CTG	2	6	1720	1725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891256
35	NC_017911	TGA	2	6	1741	1746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891256
36	NC_017911	CGT	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891257
37	NC_017911	TGG	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891257
38	NC_017911	TGG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891257
39	NC_017911	GC	3	6	1995	2000	0 %	0 %	50 %	50 %	387891257
40	NC_017911	GCCT	2	8	2023	2030	0 %	25 %	25 %	50 %	387891257
41	NC_017911	TGG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891257
42	NC_017911	AGGC	2	8	2080	2087	25 %	0 %	50 %	25 %	387891257
43	NC_017911	AGA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891257
44	NC_017911	AGCAA	2	10	2173	2182	60 %	0 %	20 %	20 %	387891257
45	NC_017911	CGT	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891257
46	NC_017911	CAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891257
47	NC_017911	TAC	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891257
48	NC_017911	TGC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891257
49	NC_017911	CAT	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891257
50	NC_017911	GC	3	6	2394	2399	0 %	0 %	50 %	50 %	387891257
51	NC_017911	CAC	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891257
52	NC_017911	CG	3	6	2454	2459	0 %	0 %	50 %	50 %	387891257
53	NC_017911	ACC	2	6	2460	2465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891257
54	NC_017911	TTCACC	2	12	2472	2483	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387891257
55	NC_017911	GT	3	6	2521	2526	0 %	50 %	50 %	0 %	387891257
56	NC_017911	TGG	2	6	2548	2553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891257
57	NC_017911	CAA	2	6	2666	2671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891257
58	NC_017911	GAA	3	9	2691	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891257
59	NC_017911	CAG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891257
60	NC_017911	ACG	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891257
61	NC_017911	C	6	6	2970	2975	0 %	0 %	0 %	100 %	387891258
62	NC_017911	TCC	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891258
63	NC_017911	CCAT	2	8	3030	3037	25 %	25 %	0 %	50 %	387891258
64	NC_017911	CTG	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891258
65	NC_017911	TTCC	2	8	3055	3062	0 %	50 %	0 %	50 %	387891258
66	NC_017911	AGC	2	6	3149	3154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891258
67	NC_017911	GTG	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891258
68	NC_017911	GC	3	6	3212	3217	0 %	0 %	50 %	50 %	387891258
69	NC_017911	CGC	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891258
70	NC_017911	AGC	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891258
71	NC_017911	CGA	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891258
72	NC_017911	CCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891258
73	NC_017911	GTT	2	6	3538	3543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891258
74	NC_017911	TTA	2	6	3568	3573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387891258
75	NC_017911	AGTGC	2	10	3602	3611	20 %	20 %	40 %	20 %	387891258
76	NC_017911	AC	3	6	3646	3651	50 %	0 %	0 %	50 %	387891258
77	NC_017911	GGCC	2	8	3655	3662	0 %	0 %	50 %	50 %	387891258
78	NC_017911	GC	3	6	3667	3672	0 %	0 %	50 %	50 %	387891258
79	NC_017911	CA	3	6	3696	3701	50 %	0 %	0 %	50 %	387891258
80	NC_017911	TGC	2	6	3703	3708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891258
81	NC_017911	CAG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891258
82	NC_017911	TGCGT	2	10	3748	3757	0 %	40 %	40 %	20 %	387891258
83	NC_017911	ATTT	2	8	3803	3810	25 %	75 %	0 %	0 %	387891258
84	NC_017911	CGA	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891258
85	NC_017911	GCA	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891258
86	NC_017911	CCG	2	6	3847	3852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891258
87	NC_017911	TTG	2	6	3866	3871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891258
88	NC_017911	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387891258
89	NC_017911	GAA	2	6	4020	4025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891259
90	NC_017911	GAT	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891259
91	NC_017911	CAC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891259
92	NC_017911	GGT	2	6	4145	4150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891259
93	NC_017911	CGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891259
94	NC_017911	CGA	2	6	4187	4192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891259
95	NC_017911	ATC	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891259
96	NC_017911	CGTG	2	8	4229	4236	0 %	25 %	50 %	25 %	387891259
97	NC_017911	AGA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891259
98	NC_017911	CGG	2	6	4285	4290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891259
99	NC_017911	TCA	2	6	4297	4302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891259
100	NC_017911	CGA	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891259
101	NC_017911	GGT	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891259
102	NC_017911	GT	3	6	4375	4380	0 %	50 %	50 %	0 %	387891259
103	NC_017911	GAA	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891259
104	NC_017911	CCG	2	6	4421	4426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891259
105	NC_017911	TCG	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891259
106	NC_017911	ACC	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891259
107	NC_017911	GAA	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891259
108	NC_017911	CGTT	2	8	4687	4694	0 %	50 %	25 %	25 %	387891259
109	NC_017911	CAA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891259
110	NC_017911	TGT	2	6	4813	4818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891259
111	NC_017911	CAA	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891259
112	NC_017911	TGG	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891259
113	NC_017911	GAA	2	6	4925	4930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891259
114	NC_017911	CCA	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891259
115	NC_017911	ATC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891259
116	NC_017911	CGAA	2	8	5110	5117	50 %	0 %	25 %	25 %	387891259
117	NC_017911	GAT	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891259
118	NC_017911	CG	3	6	5168	5173	0 %	0 %	50 %	50 %	387891259
119	NC_017911	CGC	2	6	5193	5198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891259
120	NC_017911	GC	3	6	5203	5208	0 %	0 %	50 %	50 %	387891259
121	NC_017911	TGG	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891259
122	NC_017911	CTG	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891259
123	NC_017911	GAT	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891259
124	NC_017911	TCC	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891259
125	NC_017911	CAT	4	12	5492	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891259
126	NC_017911	CTG	3	9	5541	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891259
127	NC_017911	CTT	3	9	5552	5560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891259
128	NC_017911	CTACAT	2	12	5591	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891259
129	NC_017911	GCC	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891259
130	NC_017911	GCAA	2	8	5635	5642	50 %	0 %	25 %	25 %	387891259
131	NC_017911	GAC	3	9	5658	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891259
132	NC_017911	GCCG	2	8	5852	5859	0 %	0 %	50 %	50 %	387891259
133	NC_017911	CGC	2	6	5885	5890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891259
134	NC_017911	TGGC	2	8	5901	5908	0 %	25 %	50 %	25 %	387891259
135	NC_017911	AGCC	2	8	5960	5967	25 %	0 %	25 %	50 %	387891259
136	NC_017911	AACGT	2	10	5983	5992	40 %	20 %	20 %	20 %	387891259
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148	NC_017911	TCG	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891260
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169	NC_017911	GAGC	2	8	8269	8276	25 %	0 %	50 %	25 %	387891261
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254	NC_017911	CAGGGC	2	12	12303	12314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387891264
255	NC_017911	CAT	2	6	12317	12322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891264
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262	NC_017911	AAG	2	6	12592	12597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891264
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267	NC_017911	GCAG	2	8	12722	12729	25 %	0 %	50 %	25 %	387891264
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