MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 chromosome

Total Repeats: 110055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017911	GCTG	2	8	212916	212923	0 %	25 %	50 %	25 %	387891422
4002	NC_017911	TGA	2	6	212982	212987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891422
4003	NC_017911	CCGCG	2	10	213045	213054	0 %	0 %	40 %	60 %	387891422
4004	NC_017911	GAA	2	6	213059	213064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891422
4005	NC_017911	CAGC	2	8	213176	213183	25 %	0 %	25 %	50 %	387891422
4006	NC_017911	GAA	2	6	213218	213223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891422
4007	NC_017911	GGC	2	6	213268	213273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891422
4008	NC_017911	CTG	2	6	213284	213289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891422
4009	NC_017911	AGG	2	6	213312	213317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387891422
4010	NC_017911	TTA	2	6	213401	213406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387891423
4011	NC_017911	CCG	2	6	213411	213416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891423
4012	NC_017911	GGT	2	6	213499	213504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891423
4013	NC_017911	CTC	2	6	213521	213526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891423
4014	NC_017911	TCG	2	6	213731	213736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4015	NC_017911	GCG	3	9	213747	213755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891423
4016	NC_017911	TGC	2	6	213970	213975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4017	NC_017911	GTA	2	6	213977	213982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891423
4018	NC_017911	TCG	2	6	214017	214022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4019	NC_017911	CGA	2	6	214058	214063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4020	NC_017911	GCA	2	6	214105	214110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4021	NC_017911	CGA	2	6	214123	214128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4022	NC_017911	TTC	2	6	214145	214150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891423
4023	NC_017911	GCC	2	6	214160	214165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891423
4024	NC_017911	A	6	6	214181	214186	100 %	0 %	0 %	0 %	387891423
4025	NC_017911	CGC	2	6	214187	214192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891423
4026	NC_017911	CGC	3	9	214223	214231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891423
4027	NC_017911	CAC	2	6	214259	214264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891423
4028	NC_017911	CTG	2	6	214292	214297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4029	NC_017911	GCC	2	6	214308	214313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891423
4030	NC_017911	TGC	2	6	214405	214410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891423
4031	NC_017911	TGCA	2	8	214559	214566	25 %	25 %	25 %	25 %	387891424
4032	NC_017911	CTG	3	9	214585	214593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891424
4033	NC_017911	CAGG	2	8	214621	214628	25 %	0 %	50 %	25 %	387891424
4034	NC_017911	CGC	2	6	214663	214668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891424
4035	NC_017911	TGG	2	6	214703	214708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891424
4036	NC_017911	TGG	2	6	214754	214759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891424
4037	NC_017911	GCC	2	6	214798	214803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891424
4038	NC_017911	CAG	2	6	214817	214822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891424
4039	NC_017911	GCC	2	6	214882	214887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891424
4040	NC_017911	GCA	2	6	214902	214907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891424
4041	NC_017911	CAC	2	6	214935	214940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891424
4042	NC_017911	GCC	2	6	215101	215106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891424
4043	NC_017911	TGC	2	6	215117	215122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891424
4044	NC_017911	GC	3	6	215148	215153	0 %	0 %	50 %	50 %	387891424
4045	NC_017911	TGAG	2	8	215273	215280	25 %	25 %	50 %	0 %	387891424
4046	NC_017911	T	6	6	215365	215370	0 %	100 %	0 %	0 %	387891424
4047	NC_017911	AGC	2	6	215417	215422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891424
4048	NC_017911	TCA	2	6	215434	215439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891424
4049	NC_017911	AGCC	2	8	215781	215788	25 %	0 %	25 %	50 %	387891425
4050	NC_017911	CCA	2	6	215810	215815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891425
4051	NC_017911	CGC	2	6	215919	215924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891425
4052	NC_017911	GAT	2	6	215925	215930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891425
4053	NC_017911	GCT	2	6	215956	215961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891425
4054	NC_017911	CCT	2	6	215985	215990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891425
4055	NC_017911	GCA	2	6	216027	216032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891425
4056	NC_017911	GTT	2	6	216037	216042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891425
4057	NC_017911	CGG	2	6	216251	216256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891425
4058	NC_017911	ATG	2	6	216316	216321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891425
4059	NC_017911	CGT	2	6	216336	216341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891425
4060	NC_017911	CAT	2	6	216385	216390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891425
4061	NC_017911	CCGC	2	8	216414	216421	0 %	0 %	25 %	75 %	387891425
4062	NC_017911	GCA	2	6	216438	216443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891425
4063	NC_017911	CCA	2	6	216483	216488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891425
4064	NC_017911	GTT	2	6	216574	216579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891425
4065	NC_017911	GCT	2	6	216614	216619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891425
4066	NC_017911	CGT	2	6	216621	216626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891425
4067	NC_017911	GAACA	2	10	216628	216637	60 %	0 %	20 %	20 %	387891425
4068	NC_017911	GCC	2	6	216652	216657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891425
4069	NC_017911	ACC	2	6	216671	216676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891425
4070	NC_017911	GCCA	2	8	216740	216747	25 %	0 %	25 %	50 %	387891425
4071	NC_017911	TCC	2	6	216791	216796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891425
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4074	NC_017911	ATC	2	6	216920	216925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891425
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4077	NC_017911	CGG	2	6	217214	217219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891426
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4080	NC_017911	CAA	2	6	217341	217346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891426
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4082	NC_017911	TCG	2	6	217501	217506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891426
4083	NC_017911	CGCTG	2	10	217560	217569	0 %	20 %	40 %	40 %	387891426
4084	NC_017911	CGC	2	6	217607	217612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891426
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4087	NC_017911	GGT	2	6	217731	217736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891426
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4090	NC_017911	GC	3	6	217784	217789	0 %	0 %	50 %	50 %	387891426
4091	NC_017911	CAG	2	6	217794	217799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891426
4092	NC_017911	GGT	2	6	217836	217841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891426
4093	NC_017911	TCG	2	6	218091	218096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891427
4094	NC_017911	GAC	2	6	218099	218104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891427
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4099	NC_017911	CG	3	6	218388	218393	0 %	0 %	50 %	50 %	387891427
4100	NC_017911	GTG	2	6	218396	218401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891427
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4102	NC_017911	CAC	2	6	218428	218433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891427
4103	NC_017911	CAAC	2	8	218437	218444	50 %	0 %	0 %	50 %	387891427
4104	NC_017911	CTG	2	6	218456	218461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891427
4105	NC_017911	TTG	2	6	218487	218492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891427
4106	NC_017911	CAC	2	6	218523	218528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891427
4107	NC_017911	GCT	2	6	218563	218568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891427
4108	NC_017911	TGA	2	6	218608	218613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891427
4109	NC_017911	CTGC	2	8	218626	218633	0 %	25 %	25 %	50 %	387891427
4110	NC_017911	CGT	2	6	218656	218661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891427
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4112	NC_017911	GGT	3	9	218844	218852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891428
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4118	NC_017911	ATC	2	6	219082	219087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891428
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4120	NC_017911	CGG	2	6	219165	219170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891428
4121	NC_017911	CGA	2	6	219210	219215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891428
4122	NC_017911	CGC	2	6	219330	219335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891428
4123	NC_017911	TGG	2	6	219431	219436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891428
4124	NC_017911	TGT	2	6	219449	219454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891428
4125	NC_017911	TGG	2	6	219512	219517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891428
4126	NC_017911	ATGC	2	8	219598	219605	25 %	25 %	25 %	25 %	387891428
4127	NC_017911	TGC	2	6	219653	219658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891428
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4129	NC_017911	GGT	2	6	219714	219719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891428
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4131	NC_017911	GCAT	2	8	220402	220409	25 %	25 %	25 %	25 %	387891429
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4134	NC_017911	TGG	2	6	220519	220524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891429
4135	NC_017911	GAT	2	6	220536	220541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891429
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4139	NC_017911	GGT	2	6	220613	220618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891429
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4152	NC_017911	GGC	2	6	221029	221034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891429
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4209	NC_017911	TCG	2	6	223513	223518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891434
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4220	NC_017911	ACC	2	6	224029	224034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891435
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4225	NC_017911	CAA	2	6	224331	224336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891436
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4228	NC_017911	ACC	2	6	224394	224399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891436
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4237	NC_017911	CAA	2	6	225007	225012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891437
4238	NC_017911	CTG	2	6	225032	225037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891437
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4241	NC_017911	TGA	2	6	225066	225071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891437
4242	NC_017911	CGC	2	6	225121	225126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891437
4243	NC_017911	GAA	2	6	225149	225154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891437
4244	NC_017911	CCA	2	6	225187	225192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891437
4245	NC_017911	AGC	2	6	225219	225224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891437
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4247	NC_017911	CCGGC	2	10	225288	225297	0 %	0 %	40 %	60 %	387891437
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4346	NC_017911	GCTCAC	2	12	229981	229992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387891440
4347	NC_017911	GCAT	2	8	230016	230023	25 %	25 %	25 %	25 %	387891440
4348	NC_017911	CGC	3	9	230039	230047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891440
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4350	NC_017911	GCT	2	6	230299	230304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891441
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4352	NC_017911	CTG	2	6	230442	230447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891441
4353	NC_017911	CAG	2	6	230553	230558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891441
4354	NC_017911	TGG	2	6	230578	230583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891441
4355	NC_017911	GTT	2	6	230670	230675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891441
4356	NC_017911	GCCCA	2	10	230791	230800	20 %	0 %	20 %	60 %	387891441
4357	NC_017911	CTT	2	6	230814	230819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891441
4358	NC_017911	GTG	2	6	230850	230855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891441
4359	NC_017911	GTT	2	6	230856	230861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891441
4360	NC_017911	CGC	2	6	230873	230878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891441
4361	NC_017911	CGA	2	6	230879	230884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891441
4362	NC_017911	TGG	2	6	230906	230911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891441
4363	NC_017911	CGG	2	6	230972	230977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891441
4364	NC_017911	CAT	2	6	230994	230999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891441
4365	NC_017911	CAG	3	9	231036	231044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891441
4366	NC_017911	GTC	2	6	231111	231116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891441
4367	NC_017911	GCA	2	6	231191	231196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891441
4368	NC_017911	GTG	2	6	231255	231260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891441
4369	NC_017911	CAGCCA	2	12	231306	231317	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387891441
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4373	NC_017911	TCA	2	6	231416	231421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891441
4374	NC_017911	CCA	2	6	231434	231439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891441
4375	NC_017911	CTG	2	6	231691	231696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891442
4376	NC_017911	GCTG	2	8	231770	231777	0 %	25 %	50 %	25 %	387891442
4377	NC_017911	GC	3	6	231781	231786	0 %	0 %	50 %	50 %	387891442
4378	NC_017911	TG	3	6	231792	231797	0 %	50 %	50 %	0 %	387891442
4379	NC_017911	CAA	2	6	231862	231867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891442
4380	NC_017911	CG	3	6	231976	231981	0 %	0 %	50 %	50 %	387891442
4381	NC_017911	CGA	2	6	232008	232013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891442
4382	NC_017911	GCG	2	6	232112	232117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891442
4383	NC_017911	GCG	2	6	232139	232144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891442
4384	NC_017911	CTG	2	6	232306	232311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891442
4385	NC_017911	CTG	2	6	232372	232377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891442
4386	NC_017911	ATC	2	6	232402	232407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891442
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4389	NC_017911	CGA	2	6	232512	232517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891442
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4391	NC_017911	GCG	2	6	232558	232563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891442
4392	NC_017911	GCGCA	2	10	232570	232579	20 %	0 %	40 %	40 %	387891442
4393	NC_017911	CTG	2	6	232687	232692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891442
4394	NC_017911	GTT	2	6	232710	232715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891442
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4396	NC_017911	GCA	2	6	232908	232913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891442
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4400	NC_017911	GC	3	6	233042	233047	0 %	0 %	50 %	50 %	387891442
4401	NC_017911	CAAT	2	8	233063	233070	50 %	25 %	0 %	25 %	387891442
4402	NC_017911	GCC	2	6	233078	233083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891442
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4424	NC_017911	GC	4	8	234692	234699	0 %	0 %	50 %	50 %	387891444
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4432	NC_017911	GCG	2	6	234943	234948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891444
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4441	NC_017911	CAT	2	6	235460	235465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891445
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4443	NC_017911	CGC	2	6	235520	235525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891445
4444	NC_017911	TCA	2	6	235528	235533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891445
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4450	NC_017911	GTG	2	6	235776	235781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891445
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4454	NC_017911	TGC	3	9	236089	236097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891445
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4460	NC_017911	CTG	3	9	236260	236268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891446
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4474	NC_017911	TGG	2	6	237113	237118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891447
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4479	NC_017911	AAC	2	6	237428	237433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891447
4480	NC_017911	GCCAGC	2	12	237443	237454	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387891447
4481	NC_017911	CTG	2	6	237496	237501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891447
4482	NC_017911	CGA	2	6	237504	237509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891447
4483	NC_017911	GCTG	2	8	237554	237561	0 %	25 %	50 %	25 %	387891447
4484	NC_017911	GC	3	6	237562	237567	0 %	0 %	50 %	50 %	387891447
4485	NC_017911	GTG	2	6	237646	237651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891447
4486	NC_017911	CTG	2	6	237775	237780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891447
4487	NC_017911	GCG	2	6	237832	237837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891447
4488	NC_017911	ACT	2	6	237868	237873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891447
4489	NC_017911	GTG	2	6	237922	237927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891447
4490	NC_017911	TTC	2	6	237973	237978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891447
4491	NC_017911	TAA	2	6	238003	238008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387891447
4492	NC_017911	CCA	2	6	238234	238239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891448
4493	NC_017911	AAC	2	6	238242	238247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891448
4494	NC_017911	CAT	2	6	238270	238275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891448
4495	NC_017911	GTA	2	6	238301	238306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891448
4496	NC_017911	CGA	2	6	238312	238317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891448
4497	NC_017911	CAC	2	6	238334	238339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891448
4498	NC_017911	CGC	2	6	238351	238356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891448
4499	NC_017911	CCG	2	6	238369	238374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891448
4500	NC_017911	GCC	2	6	238383	238388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891448

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