MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 chromosome

Total Repeats: 110055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017911	TTC	2	6	50231	50236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891303
1002	NC_017911	A	6	6	50252	50257	100 %	0 %	0 %	0 %	387891303
1003	NC_017911	T	6	6	50305	50310	0 %	100 %	0 %	0 %	387891304
1004	NC_017911	TGC	2	6	50370	50375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891304
1005	NC_017911	TGC	3	9	50454	50462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891304
1006	NC_017911	GCC	2	6	50467	50472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891304
1007	NC_017911	TCC	2	6	50495	50500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891304
1008	NC_017911	ACC	3	9	50516	50524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891304
1009	NC_017911	CTG	2	6	50598	50603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891304
1010	NC_017911	CGC	2	6	50620	50625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891304
1011	NC_017911	TCG	2	6	50639	50644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891304
1012	NC_017911	TGGT	2	8	50648	50655	0 %	50 %	50 %	0 %	387891304
1013	NC_017911	AACTC	2	10	50661	50670	40 %	20 %	0 %	40 %	387891304
1014	NC_017911	GAT	2	6	50687	50692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891304
1015	NC_017911	TGA	2	6	50727	50732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891304
1016	NC_017911	GAGC	2	8	50922	50929	25 %	0 %	50 %	25 %	387891304
1017	NC_017911	GT	3	6	50937	50942	0 %	50 %	50 %	0 %	387891304
1018	NC_017911	GATCAA	2	12	51231	51242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387891305
1019	NC_017911	CCTTGA	2	12	51274	51285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387891305
1020	NC_017911	GGT	2	6	51290	51295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891305
1021	NC_017911	GCG	2	6	51375	51380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891305
1022	NC_017911	CGC	2	6	51437	51442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891305
1023	NC_017911	GC	3	6	51496	51501	0 %	0 %	50 %	50 %	387891305
1024	NC_017911	GCG	2	6	51582	51587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891305
1025	NC_017911	TGC	2	6	51644	51649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891305
1026	NC_017911	TGC	2	6	51689	51694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891305
1027	NC_017911	GGC	2	6	51741	51746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891305
1028	NC_017911	GGC	2	6	51755	51760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891305
1029	NC_017911	GCC	2	6	51776	51781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891305
1030	NC_017911	TTC	2	6	51789	51794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891305
1031	NC_017911	TGC	2	6	51802	51807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891305
1032	NC_017911	AAGG	2	8	51816	51823	50 %	0 %	50 %	0 %	387891305
1033	NC_017911	CTT	2	6	51824	51829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891305
1034	NC_017911	CGG	2	6	51845	51850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891305
1035	NC_017911	TAA	2	6	51851	51856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387891305
1036	NC_017911	CAT	2	6	51988	51993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891306
1037	NC_017911	GAA	2	6	51994	51999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891306
1038	NC_017911	CGA	2	6	52141	52146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891306
1039	NC_017911	GCGT	2	8	52158	52165	0 %	25 %	50 %	25 %	387891306
1040	NC_017911	AAG	2	6	52166	52171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891306
1041	NC_017911	TGCCC	2	10	52228	52237	0 %	20 %	20 %	60 %	387891306
1042	NC_017911	TGG	2	6	52276	52281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891306
1043	NC_017911	TGCGCA	2	12	52332	52343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387891306
1044	NC_017911	GAA	2	6	52366	52371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891306
1045	NC_017911	GGC	2	6	52514	52519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891306
1046	NC_017911	GCG	2	6	52559	52564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891306
1047	NC_017911	GCG	2	6	52601	52606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891306
1048	NC_017911	AAG	2	6	52844	52849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891306
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1050	NC_017911	TGC	2	6	52953	52958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891306
1051	NC_017911	TTC	2	6	53051	53056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387891306
1052	NC_017911	CAA	2	6	53074	53079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891306
1053	NC_017911	GCGG	2	8	53090	53097	0 %	0 %	75 %	25 %	387891306
1054	NC_017911	CGA	2	6	53113	53118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891306
1055	NC_017911	G	7	7	53161	53167	0 %	0 %	100 %	0 %	387891306
1056	NC_017911	GCCG	2	8	53196	53203	0 %	0 %	50 %	50 %	387891306
1057	NC_017911	CCG	2	6	53222	53227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891306
1058	NC_017911	GC	3	6	53257	53262	0 %	0 %	50 %	50 %	387891306
1059	NC_017911	CCG	2	6	53265	53270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891306
1060	NC_017911	TAC	2	6	53273	53278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891306
1061	NC_017911	GCA	2	6	53325	53330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891306
1062	NC_017911	GCT	2	6	53377	53382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891306
1063	NC_017911	ATG	2	6	53432	53437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891306
1064	NC_017911	A	6	6	53439	53444	100 %	0 %	0 %	0 %	387891306
1065	NC_017911	CCT	2	6	53523	53528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387891306
1066	NC_017911	ACC	2	6	53534	53539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891306
1067	NC_017911	TGG	2	6	53682	53687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891306
1068	NC_017911	CG	3	6	53711	53716	0 %	0 %	50 %	50 %	387891306
1069	NC_017911	CAG	2	6	53812	53817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891307
1070	NC_017911	TGCC	2	8	53890	53897	0 %	25 %	25 %	50 %	387891307
1071	NC_017911	GGC	2	6	53927	53932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891307
1072	NC_017911	CCA	2	6	53967	53972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891307
1073	NC_017911	GTA	2	6	54057	54062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891307
1074	NC_017911	CG	4	8	54094	54101	0 %	0 %	50 %	50 %	387891307
1075	NC_017911	CAGCGA	2	12	54103	54114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891307
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1078	NC_017911	TGG	2	6	54306	54311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891307
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1080	NC_017911	CGC	2	6	54342	54347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891307
1081	NC_017911	ACGG	2	8	54383	54390	25 %	0 %	50 %	25 %	387891307
1082	NC_017911	GCG	2	6	54447	54452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891307
1083	NC_017911	GAG	2	6	54482	54487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387891307
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1085	NC_017911	TGACC	2	10	54589	54598	20 %	20 %	20 %	40 %	387891307
1086	NC_017911	CGG	2	6	54627	54632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891307
1087	NC_017911	CGT	2	6	54825	54830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891307
1088	NC_017911	CGG	2	6	54850	54855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891307
1089	NC_017911	GCG	2	6	54875	54880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891307
1090	NC_017911	GCGA	2	8	54992	54999	25 %	0 %	50 %	25 %	387891307
1091	NC_017911	CAC	2	6	55030	55035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891307
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1093	NC_017911	CCA	2	6	55195	55200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891308
1094	NC_017911	CACC	2	8	55219	55226	25 %	0 %	0 %	75 %	387891308
1095	NC_017911	GCC	2	6	55265	55270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891308
1096	NC_017911	CAT	2	6	55310	55315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891308
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1098	NC_017911	CAG	2	6	55494	55499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891308
1099	NC_017911	GT	3	6	55518	55523	0 %	50 %	50 %	0 %	387891308
1100	NC_017911	CTG	2	6	55608	55613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891308
1101	NC_017911	ATC	2	6	55635	55640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891308
1102	NC_017911	CGACCT	2	12	55664	55675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387891308
1103	NC_017911	TGG	2	6	55702	55707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891308
1104	NC_017911	TGA	2	6	55711	55716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891308
1105	NC_017911	GTGCT	2	10	55833	55842	0 %	40 %	40 %	20 %	387891308
1106	NC_017911	GAT	2	6	55856	55861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891308
1107	NC_017911	CGGC	2	8	55903	55910	0 %	0 %	50 %	50 %	387891308
1108	NC_017911	GCG	2	6	55920	55925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891308
1109	NC_017911	ATG	2	6	55929	55934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891308
1110	NC_017911	GAG	2	6	55968	55973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387891308
1111	NC_017911	GGC	2	6	55979	55984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891308
1112	NC_017911	TGA	2	6	56011	56016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387891308
1113	NC_017911	GTG	2	6	56077	56082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891308
1114	NC_017911	CGG	2	6	56148	56153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891308
1115	NC_017911	GCAG	2	8	56194	56201	25 %	0 %	50 %	25 %	387891308
1116	NC_017911	TGT	2	6	56209	56214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387891308
1117	NC_017911	CCG	2	6	56506	56511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891309
1118	NC_017911	GCA	2	6	56522	56527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891309
1119	NC_017911	ACG	2	6	56557	56562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891309
1120	NC_017911	CAG	2	6	56571	56576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387891309
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1122	NC_017911	TCA	2	6	56626	56631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891309
1123	NC_017911	GTG	2	6	56715	56720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891309
1124	NC_017911	GGT	2	6	56742	56747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891309
1125	NC_017911	CAT	2	6	56795	56800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891309
1126	NC_017911	GCG	2	6	56821	56826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891309
1127	NC_017911	TGCG	2	8	56830	56837	0 %	25 %	50 %	25 %	387891309
1128	NC_017911	ACTGCG	2	12	56926	56937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387891309
1129	NC_017911	GAA	2	6	56970	56975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387891309
1130	NC_017911	CACC	2	8	57005	57012	25 %	0 %	0 %	75 %	387891309
1131	NC_017911	ACA	2	6	57067	57072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387891309
1132	NC_017911	GCG	2	6	57111	57116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891309
1133	NC_017911	GC	3	6	57165	57170	0 %	0 %	50 %	50 %	387891309
1134	NC_017911	TCA	2	6	57257	57262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891310
1135	NC_017911	TGC	2	6	57267	57272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891310
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1138	NC_017911	GCC	2	6	57372	57377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891310
1139	NC_017911	CAT	2	6	57399	57404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891310
1140	NC_017911	CGG	2	6	57405	57410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891310
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1142	NC_017911	CGC	2	6	57437	57442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891310
1143	NC_017911	CGG	3	9	57458	57466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891310
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1145	NC_017911	TGG	2	6	57554	57559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387891310
1146	NC_017911	GCT	2	6	57578	57583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891310
1147	NC_017911	CGG	2	6	57602	57607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891310
1148	NC_017911	GC	3	6	57677	57682	0 %	0 %	50 %	50 %	387891310
1149	NC_017911	CTGG	2	8	57706	57713	0 %	25 %	50 %	25 %	387891310
1150	NC_017911	GCTG	2	8	57726	57733	0 %	25 %	50 %	25 %	387891310
1151	NC_017911	CGG	3	9	57750	57758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891310
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1158	NC_017911	TGC	2	6	58277	58282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891310
1159	NC_017911	ATC	2	6	58417	58422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891310
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1167	NC_017911	CGAC	2	8	58981	58988	25 %	0 %	25 %	50 %	387891311
1168	NC_017911	ATTG	2	8	59050	59057	25 %	50 %	25 %	0 %	387891311
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1246	NC_017911	CCA	2	6	62992	62997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387891314
1247	NC_017911	GCG	2	6	63147	63152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387891314
1248	NC_017911	TGCTTC	2	12	63174	63185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387891314
1249	NC_017911	TCG	2	6	63238	63243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891314
1250	NC_017911	CG	3	6	63246	63251	0 %	0 %	50 %	50 %	387891314
1251	NC_017911	GC	3	6	63306	63311	0 %	0 %	50 %	50 %	387891314
1252	NC_017911	GCC	2	6	63314	63319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387891314
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1254	NC_017911	TAC	2	6	63398	63403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387891315
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1265	NC_017911	CTGGG	2	10	63715	63724	0 %	20 %	60 %	20 %	387891315
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1288	NC_017911	CA	3	6	64759	64764	50 %	0 %	0 %	50 %	387891317
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1291	NC_017911	CGCC	2	8	64897	64904	0 %	0 %	25 %	75 %	387891317
1292	NC_017911	CTG	2	6	65010	65015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387891317
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1500	NC_017911	AGG	2	6	74446	74451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387891327

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