MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens A506 chromosome

Total Repeats: 110055

< Previous12...209210211212213214215216217218219220221Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
110001	NC_017911	GCA	2	6	5959037	5959042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896520
110002	NC_017911	TCT	2	6	5959111	5959116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896520
110003	NC_017911	AATC	2	8	5959124	5959131	50 %	25 %	0 %	25 %	387896520
110004	NC_017911	GGC	2	6	5959337	5959342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896520
110005	NC_017911	AGC	2	6	5959355	5959360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896520
110006	NC_017911	GCA	3	9	5959364	5959372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896520
110007	NC_017911	ACC	2	6	5959389	5959394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896520
110008	NC_017911	CGCC	2	8	5959556	5959563	0 %	0 %	25 %	75 %	387896520
110009	NC_017911	CAG	2	6	5959619	5959624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896520
110010	NC_017911	GAG	2	6	5959637	5959642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387896520
110011	NC_017911	TCA	2	6	5959646	5959651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896520
110012	NC_017911	T	6	6	5959741	5959746	0 %	100 %	0 %	0 %	387896521
110013	NC_017911	GA	3	6	5959785	5959790	50 %	0 %	50 %	0 %	387896521
110014	NC_017911	ACA	2	6	5959794	5959799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896521
110015	NC_017911	GTT	2	6	5959801	5959806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896521
110016	NC_017911	ACC	2	6	5959808	5959813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896521
110017	NC_017911	CAGTA	2	10	5959814	5959823	40 %	20 %	20 %	20 %	387896521
110018	NC_017911	CAG	2	6	5959830	5959835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110019	NC_017911	GAA	3	9	5959846	5959854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896521
110020	NC_017911	GAT	2	6	5959861	5959866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896521
110021	NC_017911	CAT	2	6	5959870	5959875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896521
110022	NC_017911	CGG	2	6	5959903	5959908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896521
110023	NC_017911	GCT	2	6	5959923	5959928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110024	NC_017911	ATG	2	6	5959949	5959954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896521
110025	NC_017911	TCT	2	6	5960112	5960117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896521
110026	NC_017911	CAT	2	6	5960134	5960139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896521
110027	NC_017911	TCA	2	6	5960162	5960167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896521
110028	NC_017911	TGT	2	6	5960171	5960176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896521
110029	NC_017911	GCTG	2	8	5960233	5960240	0 %	25 %	50 %	25 %	387896521
110030	NC_017911	GAA	2	6	5960251	5960256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896521
110031	NC_017911	GAT	2	6	5960284	5960289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896521
110032	NC_017911	CGA	2	6	5960307	5960312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110033	NC_017911	TGC	2	6	5960324	5960329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110034	NC_017911	AGA	2	6	5960337	5960342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896521
110035	NC_017911	ATG	2	6	5960504	5960509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896521
110036	NC_017911	TGC	2	6	5960588	5960593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110037	NC_017911	TTTC	2	8	5960622	5960629	0 %	75 %	0 %	25 %	387896521
110038	NC_017911	T	6	6	5960662	5960667	0 %	100 %	0 %	0 %	387896521
110039	NC_017911	GCG	2	6	5960693	5960698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896521
110040	NC_017911	TCT	2	6	5960937	5960942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896521
110041	NC_017911	GAC	2	6	5960961	5960966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110042	NC_017911	CCG	2	6	5961032	5961037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896521
110043	NC_017911	CAC	2	6	5961114	5961119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896521
110044	NC_017911	TTG	2	6	5961173	5961178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896521
110045	NC_017911	GGCAG	2	10	5961314	5961323	20 %	0 %	60 %	20 %	387896521
110046	NC_017911	CGA	2	6	5961381	5961386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896521
110047	NC_017911	CTG	2	6	5961693	5961698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896522
110048	NC_017911	GC	3	6	5961787	5961792	0 %	0 %	50 %	50 %	387896522
110049	NC_017911	CAAC	2	8	5961809	5961816	50 %	0 %	0 %	50 %	387896522
110050	NC_017911	TGG	2	6	5961827	5961832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387896522
110051	NC_017911	CTT	2	6	5961895	5961900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896522
110052	NC_017911	GAT	2	6	5961924	5961929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896522
110053	NC_017911	GTT	2	6	5961937	5961942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896522
110054	NC_017911	G	6	6	5962014	5962019	0 %	0 %	100 %	0 %	387896522
110055	NC_017911	CAC	2	6	5962054	5962059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896522

< Previous12...209210211212213214215216217218219220221Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.