MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella intermedia 17 chromosome chromosome II

Total Repeats: 34969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017861	ATT	2	6	110	115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387132090
2	NC_017861	ACT	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132090
3	NC_017861	TTAT	2	8	129	136	25 %	75 %	0 %	0 %	387132090
4	NC_017861	TGCA	2	8	148	155	25 %	25 %	25 %	25 %	387132090
5	NC_017861	AAG	2	6	172	177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132090
6	NC_017861	ACC	2	6	234	239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132090
7	NC_017861	CTATT	2	10	254	263	20 %	60 %	0 %	20 %	387132090
8	NC_017861	AGT	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132090
9	NC_017861	TTCCA	2	10	350	359	20 %	40 %	0 %	40 %	387132090
10	NC_017861	GAT	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132090
11	NC_017861	AAGA	2	8	434	441	75 %	0 %	25 %	0 %	387132090
12	NC_017861	GAA	2	6	478	483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132090
13	NC_017861	AGT	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132090
14	NC_017861	GCT	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132091
15	NC_017861	CGA	2	6	641	646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132091
16	NC_017861	TGG	2	6	649	654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132091
17	NC_017861	CAC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132091
18	NC_017861	AACC	2	8	676	683	50 %	0 %	0 %	50 %	387132091
19	NC_017861	GTT	2	6	755	760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132091
20	NC_017861	CAC	2	6	779	784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132091
21	NC_017861	TTC	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132091
22	NC_017861	CGT	3	9	851	859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132091
23	NC_017861	CTGC	2	8	880	887	0 %	25 %	25 %	50 %	387132091
24	NC_017861	GTC	2	6	902	907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132091
25	NC_017861	CTG	2	6	910	915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132091
26	NC_017861	TCTT	2	8	976	983	0 %	75 %	0 %	25 %	387132091
27	NC_017861	GTT	2	6	1163	1168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132092
28	NC_017861	GAAC	2	8	1189	1196	50 %	0 %	25 %	25 %	387132092
29	NC_017861	CGT	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132092
30	NC_017861	TCA	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132092
31	NC_017861	ACGA	2	8	1261	1268	50 %	0 %	25 %	25 %	387132092
32	NC_017861	TTC	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132092
33	NC_017861	TCT	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132092
34	NC_017861	ACC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132092
35	NC_017861	TTC	2	6	1431	1436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132092
36	NC_017861	GTC	3	9	1448	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132092
37	NC_017861	CAG	2	6	1553	1558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132092
38	NC_017861	AGT	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132092
39	NC_017861	ACC	2	6	1620	1625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132092
40	NC_017861	GCTT	2	8	1707	1714	0 %	50 %	25 %	25 %	387132092
41	NC_017861	TCT	2	6	1722	1727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132092
42	NC_017861	TTC	2	6	1776	1781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132092
43	NC_017861	TCG	3	9	1818	1826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132092
44	NC_017861	TCT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132093
45	NC_017861	TCT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132093
46	NC_017861	TGG	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132093
47	NC_017861	TGG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132093
48	NC_017861	TCT	2	6	2066	2071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132093
49	NC_017861	CAA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132093
50	NC_017861	CAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132093
51	NC_017861	CGG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387132093
52	NC_017861	TATG	2	8	2250	2257	25 %	50 %	25 %	0 %	387132093
53	NC_017861	CTTT	2	8	2264	2271	0 %	75 %	0 %	25 %	387132093
54	NC_017861	CAT	2	6	2317	2322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132093
55	NC_017861	GAT	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132093
56	NC_017861	CTA	2	6	2370	2375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132093
57	NC_017861	TTG	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132093
58	NC_017861	AAG	2	6	2405	2410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132093
59	NC_017861	AAC	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132093
60	NC_017861	AGC	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132093
61	NC_017861	AAC	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132093
62	NC_017861	GCA	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132093
63	NC_017861	AACG	2	8	2779	2786	50 %	0 %	25 %	25 %	387132093
64	NC_017861	CA	3	6	2813	2818	50 %	0 %	0 %	50 %	387132093
65	NC_017861	AGC	2	6	2900	2905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132093
66	NC_017861	ACA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132093
67	NC_017861	CGTG	2	8	2938	2945	0 %	25 %	50 %	25 %	387132093
68	NC_017861	AT	3	6	2969	2974	50 %	50 %	0 %	0 %	387132093
69	NC_017861	CAG	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132094
70	NC_017861	GGTG	2	8	3451	3458	0 %	25 %	75 %	0 %	387132094
71	NC_017861	ATT	2	6	3468	3473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387132094
72	NC_017861	TAA	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387132094
73	NC_017861	GGC	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387132095
74	NC_017861	CTTT	2	8	4069	4076	0 %	75 %	0 %	25 %	387132095
75	NC_017861	TAGT	2	8	4082	4089	25 %	50 %	25 %	0 %	387132095
76	NC_017861	TGG	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132095
77	NC_017861	TCA	2	6	4739	4744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132096
78	NC_017861	TGA	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132096
79	NC_017861	GGA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387132096
80	NC_017861	AAGG	2	8	4927	4934	50 %	0 %	50 %	0 %	387132096
81	NC_017861	AAG	2	6	4958	4963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132096
82	NC_017861	TGA	3	9	5018	5026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132096
83	NC_017861	AGG	2	6	5070	5075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387132096
84	NC_017861	TGG	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132097
85	NC_017861	GAAGGT	2	12	5178	5189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387132097
86	NC_017861	TTG	2	6	5217	5222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132097
87	NC_017861	AGTA	2	8	5251	5258	50 %	25 %	25 %	0 %	387132097
88	NC_017861	AGG	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387132097
89	NC_017861	CGG	2	6	5286	5291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387132097
90	NC_017861	CAT	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132097
91	NC_017861	CTG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132097
92	NC_017861	GC	3	6	5460	5465	0 %	0 %	50 %	50 %	387132097
93	NC_017861	GGT	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132097
94	NC_017861	ATG	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132097
95	NC_017861	GAA	2	6	5583	5588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132097
96	NC_017861	ACGGCT	2	12	5609	5620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387132097
97	NC_017861	AAGG	2	8	5655	5662	50 %	0 %	50 %	0 %	387132097
98	NC_017861	ACA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132097
99	NC_017861	GAT	2	6	5809	5814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132097
100	NC_017861	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132097
101	NC_017861	GAC	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
102	NC_017861	AGC	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
103	NC_017861	ACG	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
104	NC_017861	GAA	2	6	6105	6110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132097
105	NC_017861	ACC	2	6	6203	6208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132097
106	NC_017861	TGA	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132097
107	NC_017861	AGG	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387132097
108	NC_017861	CTC	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387132097
109	NC_017861	GAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132097
110	NC_017861	GGCAAG	2	12	6373	6384	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	387132097
111	NC_017861	AGC	2	6	6458	6463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
112	NC_017861	AAC	2	6	6499	6504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132097
113	NC_017861	AGA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132097
114	NC_017861	CTG	2	6	6580	6585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132097
115	NC_017861	ACG	2	6	6590	6595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
116	NC_017861	AC	3	6	6667	6672	50 %	0 %	0 %	50 %	387132097
117	NC_017861	TGG	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132097
118	NC_017861	AGC	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
119	NC_017861	GAT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132097
120	NC_017861	CAC	2	6	6767	6772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132097
121	NC_017861	AGG	2	6	6773	6778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387132097
122	NC_017861	TATC	2	8	6783	6790	25 %	50 %	0 %	25 %	387132097
123	NC_017861	GAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132097
124	NC_017861	CAG	2	6	6886	6891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132097
125	NC_017861	CAA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132097
126	NC_017861	TGA	2	6	6950	6955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132097
127	NC_017861	ACA	2	6	7239	7244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132098
128	NC_017861	CAA	2	6	7247	7252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132098
129	NC_017861	AGC	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132098
130	NC_017861	CAGC	2	8	7333	7340	25 %	0 %	25 %	50 %	387132098
131	NC_017861	GAA	2	6	7355	7360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132098
132	NC_017861	GA	3	6	7432	7437	50 %	0 %	50 %	0 %	387132098
133	NC_017861	CAGA	2	8	7458	7465	50 %	0 %	25 %	25 %	387132098
134	NC_017861	AAG	2	6	7641	7646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132098
135	NC_017861	TGGT	2	8	7823	7830	0 %	50 %	50 %	0 %	387132098
136	NC_017861	ATG	2	6	7833	7838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132098
137	NC_017861	TGG	2	6	7873	7878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132098
138	NC_017861	AAG	2	6	7951	7956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132098
139	NC_017861	CCG	2	6	7961	7966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387132098
140	NC_017861	GGT	3	9	8052	8060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132098
141	NC_017861	AG	3	6	8095	8100	50 %	0 %	50 %	0 %	387132098
142	NC_017861	ATG	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132099
143	NC_017861	GGCAA	2	10	8170	8179	40 %	0 %	40 %	20 %	387132099
144	NC_017861	A	6	6	8345	8350	100 %	0 %	0 %	0 %	387132099
145	NC_017861	GCC	2	6	8395	8400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387132100
146	NC_017861	TCA	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132100
147	NC_017861	TCGT	2	8	8509	8516	0 %	50 %	25 %	25 %	387132100
148	NC_017861	GAA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132100
149	NC_017861	CGT	2	6	8599	8604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132100
150	NC_017861	ATGA	2	8	8620	8627	50 %	25 %	25 %	0 %	387132100
151	NC_017861	CCAAA	2	10	8690	8699	60 %	0 %	0 %	40 %	387132100
152	NC_017861	TCA	2	6	8711	8716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132100
153	NC_017861	TAA	2	6	8742	8747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387132100
154	NC_017861	TTGG	2	8	8750	8757	0 %	50 %	50 %	0 %	387132100
155	NC_017861	TGA	2	6	8780	8785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132100
156	NC_017861	AT	3	6	8868	8873	50 %	50 %	0 %	0 %	387132100
157	NC_017861	TGT	2	6	8952	8957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132100
158	NC_017861	AAG	2	6	8963	8968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132100
159	NC_017861	AT	3	6	8990	8995	50 %	50 %	0 %	0 %	387132100
160	NC_017861	AACA	2	8	9058	9065	75 %	0 %	0 %	25 %	387132101
161	NC_017861	CAT	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132101
162	NC_017861	GCGG	2	8	9115	9122	0 %	0 %	75 %	25 %	387132101
163	NC_017861	TGA	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132101
164	NC_017861	GTC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132101
165	NC_017861	A	7	7	9229	9235	100 %	0 %	0 %	0 %	387132101
166	NC_017861	TTG	2	6	9260	9265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132101
167	NC_017861	GGC	2	6	9303	9308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387132101
168	NC_017861	AGGA	2	8	9316	9323	50 %	0 %	50 %	0 %	387132101
169	NC_017861	A	6	6	9341	9346	100 %	0 %	0 %	0 %	387132101
170	NC_017861	CGAG	2	8	9417	9424	25 %	0 %	50 %	25 %	387132101
171	NC_017861	AAGC	2	8	9427	9434	50 %	0 %	25 %	25 %	387132101
172	NC_017861	GAC	2	6	9443	9448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132101
173	NC_017861	CAAG	2	8	9523	9530	50 %	0 %	25 %	25 %	387132101
174	NC_017861	CCAG	2	8	9534	9541	25 %	0 %	25 %	50 %	387132101
175	NC_017861	GAA	2	6	9674	9679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132102
176	NC_017861	T	6	6	9714	9719	0 %	100 %	0 %	0 %	387132102
177	NC_017861	AT	3	6	10040	10045	50 %	50 %	0 %	0 %	387132103
178	NC_017861	GCT	2	6	10094	10099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132103
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187	NC_017861	CAG	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132104
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256	NC_017861	GCT	2	6	14839	14844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132111
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259	NC_017861	TGTC	2	8	15056	15063	0 %	50 %	25 %	25 %	387132111
260	NC_017861	CGAT	2	8	15096	15103	25 %	25 %	25 %	25 %	387132111
261	NC_017861	CGG	2	6	15105	15110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387132111
262	NC_017861	CTG	2	6	15167	15172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132111
263	NC_017861	CAT	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132111
264	NC_017861	AG	3	6	15224	15229	50 %	0 %	50 %	0 %	387132111
265	NC_017861	TCA	2	6	15237	15242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132111
266	NC_017861	TTC	2	6	15315	15320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132111
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268	NC_017861	TCG	2	6	15435	15440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132111
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270	NC_017861	TAA	2	6	15510	15515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387132111
271	NC_017861	ATT	2	6	15521	15526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387132111
272	NC_017861	TCA	2	6	15535	15540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132111
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375	NC_017861	ACA	2	6	20631	20636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132118
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381	NC_017861	AAAGAC	2	12	21078	21089	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387132119
382	NC_017861	AT	3	6	21152	21157	50 %	50 %	0 %	0 %	387132119
383	NC_017861	CAGC	2	8	21179	21186	25 %	0 %	25 %	50 %	387132119
384	NC_017861	GCA	2	6	21231	21236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132119
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386	NC_017861	TGG	2	6	21449	21454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132120
387	NC_017861	ACA	2	6	21455	21460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132120
388	NC_017861	AACG	2	8	21492	21499	50 %	0 %	25 %	25 %	387132120
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