MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella intermedia 17 chromosome chromosome II

Total Repeats: 34969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017861	CAA	2	6	175921	175926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132232
3002	NC_017861	TAA	2	6	176162	176167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387132233
3003	NC_017861	TCT	2	6	176429	176434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3004	NC_017861	AAC	2	6	176445	176450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132234
3005	NC_017861	TGC	2	6	176568	176573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3006	NC_017861	CAA	2	6	176582	176587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132234
3007	NC_017861	CTC	2	6	176721	176726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387132234
3008	NC_017861	TCG	2	6	176764	176769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3009	NC_017861	TGC	2	6	176834	176839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3010	NC_017861	TGC	2	6	176883	176888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3011	NC_017861	CTG	2	6	176891	176896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3012	NC_017861	AAGT	2	8	176941	176948	50 %	25 %	25 %	0 %	387132234
3013	NC_017861	GTT	2	6	176967	176972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3014	NC_017861	CTT	2	6	176973	176978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3015	NC_017861	GTA	2	6	177096	177101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
3016	NC_017861	CTT	2	6	177129	177134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3017	NC_017861	AGT	2	6	177155	177160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
3018	NC_017861	CTT	2	6	177165	177170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3019	NC_017861	CCA	2	6	177175	177180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132234
3020	NC_017861	TGT	2	6	177257	177262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3021	NC_017861	ATAC	2	8	177405	177412	50 %	25 %	0 %	25 %	387132234
3022	NC_017861	GTA	2	6	177417	177422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
3023	NC_017861	AAC	2	6	177642	177647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132234
3024	NC_017861	GGTTC	2	10	177697	177706	0 %	40 %	40 %	20 %	387132234
3025	NC_017861	CCA	2	6	177841	177846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132234
3026	NC_017861	CTT	2	6	177962	177967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3027	NC_017861	AGC	2	6	177978	177983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3028	NC_017861	TTC	2	6	177994	177999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3029	NC_017861	CAG	2	6	178046	178051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3030	NC_017861	CTT	2	6	178109	178114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3031	NC_017861	GGT	2	6	178142	178147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132234
3032	NC_017861	TTG	3	9	178162	178170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3033	NC_017861	CTT	2	6	178220	178225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3034	NC_017861	AACTT	2	10	178252	178261	40 %	40 %	0 %	20 %	387132234
3035	NC_017861	ATT	2	6	178365	178370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387132234
3036	NC_017861	CTT	2	6	178398	178403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3037	NC_017861	ATG	2	6	178444	178449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
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3039	NC_017861	GCTT	2	8	178496	178503	0 %	50 %	25 %	25 %	387132234
3040	NC_017861	ACA	2	6	178525	178530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132234
3041	NC_017861	TG	3	6	178535	178540	0 %	50 %	50 %	0 %	387132234
3042	NC_017861	ATT	2	6	178596	178601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387132234
3043	NC_017861	TGA	2	6	178610	178615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
3044	NC_017861	GTT	2	6	178620	178625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3045	NC_017861	AGC	2	6	178641	178646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132234
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3047	NC_017861	CAT	2	6	178814	178819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132234
3048	NC_017861	CTT	2	6	178820	178825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3049	NC_017861	TG	3	6	178843	178848	0 %	50 %	50 %	0 %	387132234
3050	NC_017861	CTTT	2	8	178888	178895	0 %	75 %	0 %	25 %	387132234
3051	NC_017861	ACC	2	6	178917	178922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132234
3052	NC_017861	GTC	2	6	178937	178942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3053	NC_017861	GTT	2	6	178980	178985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3054	NC_017861	GTTAC	2	10	179080	179089	20 %	40 %	20 %	20 %	387132234
3055	NC_017861	TAC	2	6	179109	179114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132234
3056	NC_017861	CT	3	6	179202	179207	0 %	50 %	0 %	50 %	387132234
3057	NC_017861	ATTG	2	8	179240	179247	25 %	50 %	25 %	0 %	387132234
3058	NC_017861	AGA	2	6	179265	179270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132234
3059	NC_017861	TGA	2	6	179288	179293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
3060	NC_017861	TGT	2	6	179300	179305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3061	NC_017861	TGTT	2	8	179525	179532	0 %	75 %	25 %	0 %	387132234
3062	NC_017861	CTTCA	2	10	179643	179652	20 %	40 %	0 %	40 %	387132234
3063	NC_017861	CAT	2	6	179820	179825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132234
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3065	NC_017861	AG	3	6	179901	179906	50 %	0 %	50 %	0 %	387132234
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3068	NC_017861	CCA	2	6	180058	180063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132234
3069	NC_017861	CAA	2	6	180110	180115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132234
3070	NC_017861	CAC	2	6	180191	180196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387132234
3071	NC_017861	CCG	2	6	180220	180225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387132234
3072	NC_017861	TTGTCT	2	12	180233	180244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387132234
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3081	NC_017861	GCTT	2	8	180725	180732	0 %	50 %	25 %	25 %	387132234
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3085	NC_017861	AAT	2	6	180993	180998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387132234
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3087	NC_017861	GCTT	2	8	181051	181058	0 %	50 %	25 %	25 %	387132234
3088	NC_017861	CTT	2	6	181115	181120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3089	NC_017861	TCA	2	6	181162	181167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132234
3090	NC_017861	ACTTA	2	10	181200	181209	40 %	40 %	0 %	20 %	387132234
3091	NC_017861	ATCT	2	8	181227	181234	25 %	50 %	0 %	25 %	387132234
3092	NC_017861	CAG	2	6	181304	181309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132234
3093	NC_017861	CAT	2	6	181334	181339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132234
3094	NC_017861	GTAAA	2	10	181399	181408	60 %	20 %	20 %	0 %	387132234
3095	NC_017861	GT	3	6	181416	181421	0 %	50 %	50 %	0 %	387132234
3096	NC_017861	CTTGTG	2	12	181424	181435	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387132234
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3102	NC_017861	CTT	2	6	181745	181750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132234
3103	NC_017861	AGA	2	6	181794	181799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132234
3104	NC_017861	GTT	2	6	181903	181908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132234
3105	NC_017861	TCA	2	6	181927	181932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132234
3106	NC_017861	GTTT	2	8	181966	181973	0 %	75 %	25 %	0 %	387132234
3107	NC_017861	TAG	2	6	182061	182066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132234
3108	NC_017861	CAA	2	6	182561	182566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132235
3109	NC_017861	A	6	6	182642	182647	100 %	0 %	0 %	0 %	387132235
3110	NC_017861	AAG	2	6	182917	182922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387132236
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3112	NC_017861	CTAC	2	8	183054	183061	25 %	25 %	0 %	50 %	387132237
3113	NC_017861	TTCG	2	8	183070	183077	0 %	50 %	25 %	25 %	387132237
3114	NC_017861	GTC	2	6	183101	183106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132237
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3116	NC_017861	GAT	2	6	183119	183124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387132237
3117	NC_017861	TG	3	6	183154	183159	0 %	50 %	50 %	0 %	387132237
3118	NC_017861	TTG	2	6	183220	183225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132237
3119	NC_017861	CAA	2	6	183332	183337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387132237
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3121	NC_017861	TCC	2	6	183413	183418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387132237
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3231	NC_017861	GTT	2	6	190191	190196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387132241
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3234	NC_017861	AG	3	6	190251	190256	50 %	0 %	50 %	0 %	387132241
3235	NC_017861	TCT	2	6	190295	190300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387132241
3236	NC_017861	GCT	2	6	190319	190324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387132241
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3240	NC_017861	GCG	2	6	190405	190410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387132241
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3242	NC_017861	CA	3	6	190518	190523	50 %	0 %	0 %	50 %	387132241
3243	NC_017861	GCA	2	6	190555	190560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132241
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3485	NC_017861	GGT	2	6	207206	207211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132252
3486	NC_017861	TGG	2	6	207266	207271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387132252
3487	NC_017861	TCA	2	6	207282	207287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387132252
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3489	NC_017861	CAG	2	6	207351	207356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387132252
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