MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prevotella intermedia 17 chromosome chromosome I

Total Repeats: 9302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017860	TG	3	6	2923	2928	0 %	50 %	50 %	0 %	387131619
2	NC_017860	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131619
3	NC_017860	TCT	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131619
4	NC_017860	TTCT	2	8	2995	3002	0 %	75 %	0 %	25 %	387131619
5	NC_017860	TGG	2	6	3094	3099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131619
6	NC_017860	GCGA	2	8	3114	3121	25 %	0 %	50 %	25 %	387131619
7	NC_017860	CTG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131619
8	NC_017860	CTG	2	6	3691	3696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131620
9	NC_017860	GGA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131620
10	NC_017860	CTA	2	6	3814	3819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131620
11	NC_017860	CAG	2	6	3904	3909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131620
12	NC_017860	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131620
13	NC_017860	TAT	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387131620
14	NC_017860	ATA	2	6	4104	4109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131620
15	NC_017860	TGG	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131620
16	NC_017860	CAG	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131620
17	NC_017860	TTCATT	2	12	4227	4238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387131620
18	NC_017860	GAA	2	6	4275	4280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131620
19	NC_017860	AAGGA	2	10	4297	4306	60 %	0 %	40 %	0 %	387131620
20	NC_017860	CT	3	6	4403	4408	0 %	50 %	0 %	50 %	387131621
21	NC_017860	AAAGCC	2	12	4424	4435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	387131621
22	NC_017860	CAC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131621
23	NC_017860	GCCA	2	8	4479	4486	25 %	0 %	25 %	50 %	387131621
24	NC_017860	CCA	2	6	4807	4812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131622
25	NC_017860	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
26	NC_017860	AAC	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
27	NC_017860	CGA	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
28	NC_017860	TTG	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131622
29	NC_017860	GAC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
30	NC_017860	CTTG	2	8	5170	5177	0 %	50 %	25 %	25 %	387131622
31	NC_017860	GTG	2	6	5244	5249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
32	NC_017860	GCC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131622
33	NC_017860	GCA	2	6	5350	5355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
34	NC_017860	GTT	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131622
35	NC_017860	GTG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
36	NC_017860	AAGC	2	8	5470	5477	50 %	0 %	25 %	25 %	387131622
37	NC_017860	GAAG	2	8	5510	5517	50 %	0 %	50 %	0 %	387131622
38	NC_017860	TGG	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
39	NC_017860	AGAC	2	8	5620	5627	50 %	0 %	25 %	25 %	387131622
40	NC_017860	TC	3	6	5669	5674	0 %	50 %	0 %	50 %	387131622
41	NC_017860	CAA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
42	NC_017860	CAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
43	NC_017860	AAGGAA	2	12	5838	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
44	NC_017860	ACA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
45	NC_017860	TCA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
46	NC_017860	CAT	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
47	NC_017860	GAA	2	6	6137	6142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
48	NC_017860	TTC	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387131622
49	NC_017860	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131622
50	NC_017860	GAAG	2	8	6263	6270	50 %	0 %	50 %	0 %	387131622
51	NC_017860	ATG	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131622
52	NC_017860	AGGC	2	8	6295	6302	25 %	0 %	50 %	25 %	387131622
53	NC_017860	CT	3	6	6354	6359	0 %	50 %	0 %	50 %	387131622
54	NC_017860	GAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
55	NC_017860	GACC	2	8	6386	6393	25 %	0 %	25 %	50 %	387131622
56	NC_017860	ATG	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131622
57	NC_017860	GCGG	2	8	6429	6436	0 %	0 %	75 %	25 %	387131622
58	NC_017860	AAGA	2	8	6450	6457	75 %	0 %	25 %	0 %	387131622
59	NC_017860	TGC	2	6	6488	6493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131622
60	NC_017860	GAT	2	6	6641	6646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131622
61	NC_017860	GAA	2	6	6668	6673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
62	NC_017860	TAC	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
63	NC_017860	TCA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
64	NC_017860	GTG	2	6	6747	6752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131622
65	NC_017860	TAC	2	6	6771	6776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131622
66	NC_017860	CAA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
67	NC_017860	CT	3	6	6801	6806	0 %	50 %	0 %	50 %	387131622
68	NC_017860	CAA	2	6	6872	6877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131622
69	NC_017860	ACCTTC	2	12	6891	6902	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387131622
70	NC_017860	CGA	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
71	NC_017860	TCGCT	2	10	6952	6961	0 %	40 %	20 %	40 %	387131622
72	NC_017860	CAAG	2	8	6967	6974	50 %	0 %	25 %	25 %	387131622
73	NC_017860	AAG	3	9	6972	6980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
74	NC_017860	AGA	2	6	7024	7029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
75	NC_017860	GCTTCA	2	12	7030	7041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387131622
76	NC_017860	CTCAA	2	10	7116	7125	40 %	20 %	0 %	40 %	387131622
77	NC_017860	AC	3	6	7192	7197	50 %	0 %	0 %	50 %	387131622
78	NC_017860	AGA	2	6	7276	7281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131622
79	NC_017860	CGA	3	9	7340	7348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131622
80	NC_017860	GAAG	2	8	7361	7368	50 %	0 %	50 %	0 %	387131622
81	NC_017860	TAA	2	6	7552	7557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387131622
82	NC_017860	A	6	6	8643	8648	100 %	0 %	0 %	0 %	387131623
83	NC_017860	GCA	2	6	8703	8708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131623
84	NC_017860	ACA	2	6	8712	8717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131623
85	NC_017860	ACG	2	6	8718	8723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131623
86	NC_017860	AAC	2	6	8826	8831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131623
87	NC_017860	ATG	2	6	8873	8878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131623
88	NC_017860	AGT	2	6	8893	8898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131623
89	NC_017860	AGCC	2	8	8907	8914	25 %	0 %	25 %	50 %	387131623
90	NC_017860	AAG	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131623
91	NC_017860	GCAC	2	8	8972	8979	25 %	0 %	25 %	50 %	387131623
92	NC_017860	CAA	2	6	8980	8985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131623
93	NC_017860	TGA	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387131623
94	NC_017860	CAG	2	6	9039	9044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131623
95	NC_017860	TGC	2	6	9232	9237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131623
96	NC_017860	TCA	2	6	9240	9245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131623
97	NC_017860	AAG	3	9	9275	9283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131623
98	NC_017860	AAAG	2	8	9310	9317	75 %	0 %	25 %	0 %	387131623
99	NC_017860	CA	3	6	9506	9511	50 %	0 %	0 %	50 %	387131624
100	NC_017860	TTCA	2	8	9515	9522	25 %	50 %	0 %	25 %	387131624
101	NC_017860	GAA	2	6	9547	9552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131624
102	NC_017860	ACT	2	6	9553	9558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131624
103	NC_017860	CGG	2	6	9579	9584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131624
104	NC_017860	GGT	2	6	9646	9651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131624
105	NC_017860	GGTA	2	8	9715	9722	25 %	25 %	50 %	0 %	387131624
106	NC_017860	CAA	2	6	9760	9765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131624
107	NC_017860	ACC	2	6	9800	9805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131624
108	NC_017860	CACC	2	8	9833	9840	25 %	0 %	0 %	75 %	387131624
109	NC_017860	CAAC	2	8	9861	9868	50 %	0 %	0 %	50 %	387131624
110	NC_017860	GAA	2	6	9878	9883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131624
111	NC_017860	GAA	2	6	9956	9961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131624
112	NC_017860	CTA	2	6	10027	10032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131624
113	NC_017860	ACC	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131624
114	NC_017860	AGTC	2	8	10083	10090	25 %	25 %	25 %	25 %	387131624
115	NC_017860	TCC	2	6	10095	10100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387131624
116	NC_017860	GCGA	2	8	10107	10114	25 %	0 %	50 %	25 %	387131624
117	NC_017860	ACA	2	6	10167	10172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131624
118	NC_017860	GGT	2	6	10186	10191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131624
119	NC_017860	GTG	2	6	10194	10199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131624
120	NC_017860	GGT	2	6	10232	10237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131624
121	NC_017860	TCA	2	6	10239	10244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131624
122	NC_017860	TCA	2	6	10248	10253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131624
123	NC_017860	ACGC	2	8	10263	10270	25 %	0 %	25 %	50 %	387131624
124	NC_017860	ACT	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131624
125	NC_017860	AAG	2	6	10413	10418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131624
126	NC_017860	TTCT	2	8	10570	10577	0 %	75 %	0 %	25 %	387131624
127	NC_017860	CGC	2	6	10607	10612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387131624
128	NC_017860	ACC	2	6	10614	10619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131624
129	NC_017860	TTG	2	6	10635	10640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387131624
130	NC_017860	AAC	2	6	10673	10678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131624
131	NC_017860	GAA	2	6	10714	10719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131624
132	NC_017860	GAC	2	6	10721	10726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131624
133	NC_017860	TCG	2	6	10743	10748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131624
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255	NC_017860	CGA	2	6	17365	17370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131628
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257	NC_017860	TCG	2	6	17475	17480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387131628
258	NC_017860	ACA	2	6	17514	17519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131628
259	NC_017860	CCA	2	6	17535	17540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387131628
260	NC_017860	GGC	2	6	17561	17566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387131628
261	NC_017860	GCA	2	6	17658	17663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131628
262	NC_017860	GAC	2	6	17679	17684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131629
263	NC_017860	ACG	2	6	17700	17705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131629
264	NC_017860	GAC	3	9	17708	17716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131629
265	NC_017860	TGG	2	6	17775	17780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131629
266	NC_017860	GTG	2	6	17834	17839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387131629
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270	NC_017860	CAA	2	6	17935	17940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387131629
271	NC_017860	ATC	2	6	17984	17989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387131629
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273	NC_017860	TGCAA	2	10	18259	18268	40 %	20 %	20 %	20 %	387131630
274	NC_017860	CTTT	2	8	18318	18325	0 %	75 %	0 %	25 %	387131630
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277	NC_017860	GAC	2	6	18867	18872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131631
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280	NC_017860	GAA	2	6	18931	18936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131631
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283	NC_017860	GAAAG	2	10	19558	19567	60 %	0 %	40 %	0 %	387131632
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287	NC_017860	CGA	2	6	19810	19815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131632
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290	NC_017860	TGAA	2	8	19860	19867	50 %	25 %	25 %	0 %	387131632
291	NC_017860	A	6	6	19936	19941	100 %	0 %	0 %	0 %	387131632
292	NC_017860	GAA	2	6	20000	20005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131632
293	NC_017860	AG	4	8	20032	20039	50 %	0 %	50 %	0 %	387131632
294	NC_017860	TAGA	2	8	20091	20098	50 %	25 %	25 %	0 %	387131632
295	NC_017860	GGA	2	6	20185	20190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387131632
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297	NC_017860	AGA	2	6	20287	20292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387131632
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304	NC_017860	GT	3	6	21098	21103	0 %	50 %	50 %	0 %	387131633
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383	NC_017860	ACG	2	6	25740	25745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387131637
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