MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudonocardia dioxanivorans CB1190 plasmid pPSED02

Total Repeats: 604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017772	TGG	2	6	314	319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644977
2	NC_017772	CCA	2	6	328	333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386644977
3	NC_017772	CGG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644977
4	NC_017772	GGC	2	6	372	377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644977
5	NC_017772	TCG	3	9	413	421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644977
6	NC_017772	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644977
7	NC_017772	CTG	2	6	514	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644977
8	NC_017772	TCGAC	2	10	528	537	20 %	20 %	20 %	40 %	386644977
9	NC_017772	GTA	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644978
10	NC_017772	CGC	2	6	854	859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644978
11	NC_017772	GCTC	2	8	880	887	0 %	25 %	25 %	50 %	386644978
12	NC_017772	GCGT	2	8	888	895	0 %	25 %	50 %	25 %	386644978
13	NC_017772	GAT	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644978
14	NC_017772	GAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644978
15	NC_017772	GCT	2	6	1107	1112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644978
16	NC_017772	GCT	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644978
17	NC_017772	AGT	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644978
18	NC_017772	AG	3	6	1203	1208	50 %	0 %	50 %	0 %	386644978
19	NC_017772	GGC	2	6	1215	1220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644978
20	NC_017772	GAT	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644979
21	NC_017772	GAC	2	6	1855	1860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644979
22	NC_017772	AGC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644979
23	NC_017772	CGA	2	6	1988	1993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644979
24	NC_017772	CG	3	6	2022	2027	0 %	0 %	50 %	50 %	386644979
25	NC_017772	CGG	2	6	2063	2068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644979
26	NC_017772	CGCGAC	2	12	2093	2104	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386644979
27	NC_017772	CGA	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644979
28	NC_017772	GTCCC	2	10	2261	2270	0 %	20 %	20 %	60 %	386644979
29	NC_017772	GCC	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644979
30	NC_017772	CG	4	8	2283	2290	0 %	0 %	50 %	50 %	386644979
31	NC_017772	TTG	2	6	2515	2520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386644980
32	NC_017772	GACC	2	8	2526	2533	25 %	0 %	25 %	50 %	386644980
33	NC_017772	TCG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644980
34	NC_017772	GACC	2	8	2682	2689	25 %	0 %	25 %	50 %	386644980
35	NC_017772	CCG	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644980
36	NC_017772	CTG	2	6	2713	2718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644980
37	NC_017772	CGT	2	6	2729	2734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644980
38	NC_017772	GCGAG	2	10	2754	2763	20 %	0 %	60 %	20 %	386644980
39	NC_017772	CAG	2	6	2779	2784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
40	NC_017772	ACCGA	2	10	2788	2797	40 %	0 %	20 %	40 %	386644980
41	NC_017772	CGA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
42	NC_017772	CGC	2	6	2844	2849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644980
43	NC_017772	CG	3	6	2872	2877	0 %	0 %	50 %	50 %	386644980
44	NC_017772	CAC	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386644980
45	NC_017772	CGG	2	6	3112	3117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644980
46	NC_017772	GAA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386644980
47	NC_017772	CGCGGC	2	12	3306	3317	0 %	0 %	50 %	50 %	386644980
48	NC_017772	GC	3	6	3385	3390	0 %	0 %	50 %	50 %	386644980
49	NC_017772	GCC	2	6	3416	3421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644980
50	NC_017772	CGC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644980
51	NC_017772	CCGC	2	8	3557	3564	0 %	0 %	25 %	75 %	386644980
52	NC_017772	CGG	2	6	3585	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644980
53	NC_017772	GCC	2	6	3593	3598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644980
54	NC_017772	GCT	2	6	3609	3614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644980
55	NC_017772	GC	3	6	3669	3674	0 %	0 %	50 %	50 %	386644980
56	NC_017772	CGG	2	6	3714	3719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644980
57	NC_017772	ACG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
58	NC_017772	CGA	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
59	NC_017772	CAC	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386644980
60	NC_017772	GTG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644980
61	NC_017772	CAC	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386644980
62	NC_017772	CAA	2	6	3897	3902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386644980
63	NC_017772	CGA	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
64	NC_017772	CGA	2	6	4131	4136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
65	NC_017772	CGC	2	6	4158	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644980
66	NC_017772	CTG	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644980
67	NC_017772	GC	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	386644980
68	NC_017772	CAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386644980
69	NC_017772	CGG	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644980
70	NC_017772	TCG	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644980
71	NC_017772	CGA	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644980
72	NC_017772	TGC	2	6	5021	5026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644981
73	NC_017772	GAG	2	6	5079	5084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386644981
74	NC_017772	TGG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644981
75	NC_017772	G	6	6	5095	5100	0 %	0 %	100 %	0 %	386644981
76	NC_017772	GCG	2	6	5123	5128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644981
77	NC_017772	GAC	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644981
78	NC_017772	TGA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644982
79	NC_017772	TGC	2	6	5313	5318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644982
80	NC_017772	TGC	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644982
81	NC_017772	ACG	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644982
82	NC_017772	ACGCGA	2	12	5388	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644982
83	NC_017772	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644982
84	NC_017772	GCG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644982
85	NC_017772	GGC	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644982
86	NC_017772	GAT	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644982
87	NC_017772	GCGG	2	8	5560	5567	0 %	0 %	75 %	25 %	386644983
88	NC_017772	ACCA	2	8	5611	5618	50 %	0 %	0 %	50 %	386644983
89	NC_017772	CGT	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
90	NC_017772	CCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386644983
91	NC_017772	GCG	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644983
92	NC_017772	TCG	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
93	NC_017772	GCA	2	6	5722	5727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644983
94	NC_017772	GGC	2	6	5730	5735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644983
95	NC_017772	CCG	3	9	5752	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644983
96	NC_017772	CGAC	2	8	5822	5829	25 %	0 %	25 %	50 %	386644983
97	NC_017772	GTC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
98	NC_017772	CGC	2	6	5892	5897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644983
99	NC_017772	GCG	2	6	5991	5996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644983
100	NC_017772	GC	3	6	6021	6026	0 %	0 %	50 %	50 %	386644983
101	NC_017772	CGG	2	6	6095	6100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644983
102	NC_017772	CG	3	6	6112	6117	0 %	0 %	50 %	50 %	386644983
103	NC_017772	CGAGAC	2	12	6144	6155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644983
104	NC_017772	CGT	2	6	6172	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
105	NC_017772	GAG	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386644983
106	NC_017772	TTC	2	6	6220	6225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386644983
107	NC_017772	CGG	2	6	6226	6231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644983
108	NC_017772	TGC	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
109	NC_017772	GCC	2	6	6270	6275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644983
110	NC_017772	TCG	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
111	NC_017772	CGC	2	6	6300	6305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644983
112	NC_017772	GCT	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644983
113	NC_017772	GCC	2	6	6429	6434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644983
114	NC_017772	ACGA	2	8	6443	6450	50 %	0 %	25 %	25 %	386644983
115	NC_017772	GCG	2	6	6463	6468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644983
116	NC_017772	GCC	2	6	6529	6534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644983
117	NC_017772	CG	3	6	6661	6666	0 %	0 %	50 %	50 %	386644983
118	NC_017772	CTG	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644984
119	NC_017772	GTG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644984
120	NC_017772	GCC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644984
121	NC_017772	GCA	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644984
122	NC_017772	CGC	4	12	7220	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644984
123	NC_017772	CCG	2	6	7236	7241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644984
124	NC_017772	GACC	2	8	7253	7260	25 %	0 %	25 %	50 %	386644984
125	NC_017772	GC	3	6	7265	7270	0 %	0 %	50 %	50 %	386644984
126	NC_017772	GCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644984
127	NC_017772	CGG	2	6	7375	7380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644984
128	NC_017772	CGG	2	6	7424	7429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644984
129	NC_017772	GTC	2	6	7449	7454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644984
130	NC_017772	CGCTG	2	10	7455	7464	0 %	20 %	40 %	40 %	386644984
131	NC_017772	CGA	2	6	7490	7495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644984
132	NC_017772	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644984
133	NC_017772	GC	3	6	7524	7529	0 %	0 %	50 %	50 %	386644984
134	NC_017772	CGC	2	6	7550	7555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644984
135	NC_017772	CGCGC	2	10	7566	7575	0 %	0 %	40 %	60 %	386644984
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142	NC_017772	CCGGA	2	10	7691	7700	20 %	0 %	40 %	40 %	386644984
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169	NC_017772	CG	3	6	8464	8469	0 %	0 %	50 %	50 %	386644984
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243	NC_017772	ATCT	2	8	10959	10966	25 %	50 %	0 %	25 %	386644987
244	NC_017772	AGTA	2	8	10978	10985	50 %	25 %	25 %	0 %	386644987
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249	NC_017772	CTGA	2	8	11106	11113	25 %	25 %	25 %	25 %	386644987
250	NC_017772	TGC	2	6	11133	11138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644987
251	NC_017772	GAT	2	6	11202	11207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644987
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253	NC_017772	GAT	2	6	11352	11357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644987
254	NC_017772	ATC	2	6	11427	11432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386644987
255	NC_017772	GAC	2	6	11443	11448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386644987
256	NC_017772	GGT	2	6	11464	11469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386644987
257	NC_017772	GGA	2	6	11478	11483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386644987
258	NC_017772	TC	3	6	11499	11504	0 %	50 %	0 %	50 %	386644987
259	NC_017772	TCG	3	9	11545	11553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386644987
260	NC_017772	CGC	2	6	11974	11979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386644988
261	NC_017772	GCG	2	6	11993	11998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644988
262	NC_017772	ACT	2	6	12018	12023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386644988
263	NC_017772	AGT	2	6	12037	12042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386644988
264	NC_017772	CGG	2	6	12081	12086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644988
265	NC_017772	GATC	2	8	12125	12132	25 %	25 %	25 %	25 %	386644988
266	NC_017772	GGC	2	6	12162	12167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386644988
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500	NC_017772	GC	3	6	20798	20803	0 %	0 %	50 %	50 %	386644992

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