MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. 3480 chromosome

Total Repeats: 42451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017764	TCT	2	6	36	41	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386833613
2	NC_017764	TTA	2	6	169	174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833613
3	NC_017764	AGA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833613
4	NC_017764	AAATC	2	10	402	411	60 %	20 %	0 %	20 %	386833613
5	NC_017764	TGG	2	6	485	490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386833613
6	NC_017764	TAA	2	6	581	586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833613
7	NC_017764	CAA	2	6	594	599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833613
8	NC_017764	A	6	6	639	644	100 %	0 %	0 %	0 %	386833613
9	NC_017764	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386833613
10	NC_017764	AGAAAA	2	12	695	706	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386833613
11	NC_017764	A	6	6	703	708	100 %	0 %	0 %	0 %	386833613
12	NC_017764	AAG	2	6	712	717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833613
13	NC_017764	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833613
14	NC_017764	ATCGG	2	10	773	782	20 %	20 %	40 %	20 %	386833613
15	NC_017764	ACC	2	6	843	848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386833613
16	NC_017764	GCC	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386833613
17	NC_017764	AAAG	2	8	893	900	75 %	0 %	25 %	0 %	386833613
18	NC_017764	GAA	2	6	903	908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833613
19	NC_017764	ATTT	2	8	915	922	25 %	75 %	0 %	0 %	386833613
20	NC_017764	GAA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833613
21	NC_017764	T	6	6	939	944	0 %	100 %	0 %	0 %	386833613
22	NC_017764	CGTG	2	8	968	975	0 %	25 %	50 %	25 %	386833613
23	NC_017764	GCG	2	6	1026	1031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386833613
24	NC_017764	GTG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386833613
25	NC_017764	TCGA	2	8	1172	1179	25 %	25 %	25 %	25 %	386833613
26	NC_017764	ACA	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833613
27	NC_017764	GA	3	6	1313	1318	50 %	0 %	50 %	0 %	386833613
28	NC_017764	AGA	2	6	1334	1339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833613
29	NC_017764	CT	3	6	1365	1370	0 %	50 %	0 %	50 %	386833613
30	NC_017764	TTA	2	6	1417	1422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833614
31	NC_017764	ACA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833614
32	NC_017764	GT	3	6	1438	1443	0 %	50 %	50 %	0 %	386833614
33	NC_017764	GCC	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386833614
34	NC_017764	AAT	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833614
35	NC_017764	TAC	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386833614
36	NC_017764	GTG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386833614
37	NC_017764	GAA	2	6	1639	1644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833614
38	NC_017764	AGTT	2	8	1656	1663	25 %	50 %	25 %	0 %	386833614
39	NC_017764	GAA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833614
40	NC_017764	CGT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833614
41	NC_017764	ACGC	2	8	1838	1845	25 %	0 %	25 %	50 %	386833614
42	NC_017764	TAC	2	6	1970	1975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386833614
43	NC_017764	GCCC	2	8	2025	2032	0 %	0 %	25 %	75 %	386833614
44	NC_017764	ATT	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833614
45	NC_017764	TCG	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833614
46	NC_017764	GC	3	6	2193	2198	0 %	0 %	50 %	50 %	386833614
47	NC_017764	AAG	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833614
48	NC_017764	GAA	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833614
49	NC_017764	ATT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833615
50	NC_017764	AAC	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833615
51	NC_017764	ATTTT	2	10	2707	2716	20 %	80 %	0 %	0 %	386833615
52	NC_017764	AATT	2	8	2851	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	386833615
53	NC_017764	TGG	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386833615
54	NC_017764	CGT	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833615
55	NC_017764	T	6	6	2909	2914	0 %	100 %	0 %	0 %	386833615
56	NC_017764	TCA	3	9	2930	2938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386833615
57	NC_017764	TTA	2	6	2976	2981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833615
58	NC_017764	AAC	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833615
59	NC_017764	GCG	2	6	2994	2999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386833615
60	NC_017764	ACA	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833615
61	NC_017764	TCA	2	6	3167	3172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386833615
62	NC_017764	TG	3	6	3340	3345	0 %	50 %	50 %	0 %	386833615
63	NC_017764	AGAA	2	8	3382	3389	75 %	0 %	25 %	0 %	386833615
64	NC_017764	TGAT	2	8	3406	3413	25 %	50 %	25 %	0 %	386833615
65	NC_017764	TTA	2	6	3450	3455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833615
66	NC_017764	CAA	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833615
67	NC_017764	GAA	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386833615
68	NC_017764	TTGCA	2	10	3566	3575	20 %	40 %	20 %	20 %	386833615
69	NC_017764	TAAA	2	8	3805	3812	75 %	25 %	0 %	0 %	386833616
70	NC_017764	TGA	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386833616
71	NC_017764	TCT	2	6	3891	3896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386833616
72	NC_017764	ACATC	2	10	3904	3913	40 %	20 %	0 %	40 %	386833616
73	NC_017764	TG	3	6	3915	3920	0 %	50 %	50 %	0 %	386833616
74	NC_017764	AC	3	6	3943	3948	50 %	0 %	0 %	50 %	386833616
75	NC_017764	CTTT	2	8	3967	3974	0 %	75 %	0 %	25 %	386833616
76	NC_017764	TGCTT	2	10	4110	4119	0 %	60 %	20 %	20 %	386833616
77	NC_017764	CGT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833616
78	NC_017764	ACC	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386833616
79	NC_017764	A	6	6	4314	4319	100 %	0 %	0 %	0 %	386833616
80	NC_017764	CAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386833616
81	NC_017764	TCT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386833617
82	NC_017764	CCA	2	6	4578	4583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386833617
83	NC_017764	TAA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833617
84	NC_017764	TTAC	2	8	4709	4716	25 %	50 %	0 %	25 %	386833617
85	NC_017764	AGCTG	2	10	4748	4757	20 %	20 %	40 %	20 %	386833617
86	NC_017764	AATT	2	8	4789	4796	50 %	50 %	0 %	0 %	386833617
87	NC_017764	T	6	6	4804	4809	0 %	100 %	0 %	0 %	386833617
88	NC_017764	A	7	7	4897	4903	100 %	0 %	0 %	0 %	386833617
89	NC_017764	CATCTT	2	12	4941	4952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386833617
90	NC_017764	ATA	2	6	4984	4989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833617
91	NC_017764	TTG	2	6	5233	5238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386833618
92	NC_017764	T	8	8	5260	5267	0 %	100 %	0 %	0 %	386833618
93	NC_017764	TCT	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386833618
94	NC_017764	TTG	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386833619
95	NC_017764	GT	3	6	5446	5451	0 %	50 %	50 %	0 %	386833619
96	NC_017764	CA	3	6	5496	5501	50 %	0 %	0 %	50 %	386833619
97	NC_017764	TGA	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386833619
98	NC_017764	A	6	6	5608	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	386833619
99	NC_017764	TTC	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386833619
100	NC_017764	ATA	2	6	5720	5725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833619
101	NC_017764	CG	3	6	5735	5740	0 %	0 %	50 %	50 %	386833619
102	NC_017764	ATCA	2	8	5803	5810	50 %	25 %	0 %	25 %	386833619
103	NC_017764	GCA	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386833619
104	NC_017764	TGT	2	6	5893	5898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386833619
105	NC_017764	CAC	2	6	6033	6038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386833620
106	NC_017764	GAC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386833620
107	NC_017764	TGC	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833620
108	NC_017764	GCC	2	6	6263	6268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386833620
109	NC_017764	T	7	7	6447	6453	0 %	100 %	0 %	0 %	386833620
110	NC_017764	AAT	2	6	6493	6498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833621
111	NC_017764	T	7	7	6525	6531	0 %	100 %	0 %	0 %	386833621
112	NC_017764	CT	3	6	6533	6538	0 %	50 %	0 %	50 %	386833621
113	NC_017764	TGC	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833621
114	NC_017764	CAT	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386833621
115	NC_017764	AAT	2	6	6748	6753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833621
116	NC_017764	TAAC	2	8	6765	6772	50 %	25 %	0 %	25 %	386833621
117	NC_017764	T	6	6	6796	6801	0 %	100 %	0 %	0 %	386833621
118	NC_017764	T	6	6	6804	6809	0 %	100 %	0 %	0 %	386833621
119	NC_017764	GCA	2	6	6845	6850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386833621
120	NC_017764	AATA	2	8	6856	6863	75 %	25 %	0 %	0 %	386833621
121	NC_017764	CTT	2	6	7071	7076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386833621
122	NC_017764	TTG	2	6	7120	7125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386833621
123	NC_017764	ACA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386833621
124	NC_017764	TGC	2	6	7265	7270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386833621
125	NC_017764	G	6	6	7320	7325	0 %	0 %	100 %	0 %	386833621
126	NC_017764	AG	3	6	7479	7484	50 %	0 %	50 %	0 %	386833621
127	NC_017764	GCA	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386833621
128	NC_017764	TAA	2	6	7588	7593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386833621
129	NC_017764	AGC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386833621
130	NC_017764	CCA	2	6	7628	7633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386833621
131	NC_017764	CGA	3	9	7641	7649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386833621
132	NC_017764	TTGA	2	8	7656	7663	25 %	50 %	25 %	0 %	386833621
133	NC_017764	ATG	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386833621
134	NC_017764	ATT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386833622
135	NC_017764	TGA	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386833622
136	NC_017764	T	7	7	7946	7952	0 %	100 %	0 %	0 %	386833622
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