MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa NCGM2.S1 chromosome 1

Total Repeats: 155708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017549	TCCGTG	2	12	480	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062974
2	NC_017549	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
3	NC_017549	TCT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386062974
4	NC_017549	CAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062974
5	NC_017549	CGA	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
6	NC_017549	GT	3	6	598	603	0 %	50 %	50 %	0 %	386062974
7	NC_017549	TCGG	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	386062974
8	NC_017549	GCCC	2	8	695	702	0 %	0 %	25 %	75 %	386062974
9	NC_017549	TTA	2	6	708	713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386062974
10	NC_017549	GCA	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
11	NC_017549	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062974
12	NC_017549	GC	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	386062974
13	NC_017549	CCG	3	9	795	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062974
14	NC_017549	GTG	3	9	834	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062974
15	NC_017549	GCC	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062974
16	NC_017549	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
17	NC_017549	GCC	2	6	930	935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062974
18	NC_017549	GCCG	2	8	941	948	0 %	0 %	50 %	50 %	386062974
19	NC_017549	GC	3	6	994	999	0 %	0 %	50 %	50 %	386062974
20	NC_017549	ACCTTC	2	12	1026	1037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386062974
21	NC_017549	TCG	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062974
22	NC_017549	CGC	3	9	1076	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062974
23	NC_017549	ATGC	2	8	1167	1174	25 %	25 %	25 %	25 %	386062974
24	NC_017549	ACC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062974
25	NC_017549	GAA	3	9	1193	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386062974
26	NC_017549	GGT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062974
27	NC_017549	TCG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062974
28	NC_017549	CGA	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
29	NC_017549	TTC	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386062974
30	NC_017549	AGG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386062974
31	NC_017549	TTC	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386062974
32	NC_017549	GGC	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062974
33	NC_017549	CAG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
34	NC_017549	GCC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062974
35	NC_017549	TGA	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386062974
36	NC_017549	ACG	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062974
37	NC_017549	CTT	2	6	1589	1594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386062974
38	NC_017549	CGTG	2	8	1619	1626	0 %	25 %	50 %	25 %	386062974
39	NC_017549	GCCG	2	8	1675	1682	0 %	0 %	50 %	50 %	386062974
40	NC_017549	TTG	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386062974
41	NC_017549	ACA	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062974
42	NC_017549	TAC	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062974
43	NC_017549	TGT	2	6	1804	1809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386062974
44	NC_017549	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062974
45	NC_017549	GC	3	6	1833	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	386062974
46	NC_017549	ACCA	2	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	386062974
47	NC_017549	CGG	2	6	1910	1915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062974
48	NC_017549	CAC	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062974
49	NC_017549	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062974
50	NC_017549	CGT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062975
51	NC_017549	CGC	2	6	2122	2127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062975
52	NC_017549	TC	3	6	2142	2147	0 %	50 %	0 %	50 %	386062975
53	NC_017549	CTG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062975
54	NC_017549	TGGT	2	8	2213	2220	0 %	50 %	50 %	0 %	386062975
55	NC_017549	GCC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062975
56	NC_017549	GC	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	386062975
57	NC_017549	ACG	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062975
58	NC_017549	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062975
59	NC_017549	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062975
60	NC_017549	TGC	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062975
61	NC_017549	CGG	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062975
62	NC_017549	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062975
63	NC_017549	CCA	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062975
64	NC_017549	TGG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062975
65	NC_017549	CG	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	386062975
66	NC_017549	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062975
67	NC_017549	AAC	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062975
68	NC_017549	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386062975
69	NC_017549	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062975
70	NC_017549	CAG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062975
71	NC_017549	GTC	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062975
72	NC_017549	CTCCCC	2	12	3225	3236	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386062976
73	NC_017549	CTG	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062976
74	NC_017549	GC	3	6	3331	3336	0 %	0 %	50 %	50 %	386062976
75	NC_017549	TGACC	2	10	3816	3825	20 %	20 %	20 %	40 %	386062976
76	NC_017549	CTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062976
77	NC_017549	CCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386062976
78	NC_017549	CAG	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062976
79	NC_017549	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062976
80	NC_017549	TC	3	6	3978	3983	0 %	50 %	0 %	50 %	386062976
81	NC_017549	CAG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062976
82	NC_017549	TGG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062976
83	NC_017549	TGG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062976
84	NC_017549	AGC	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062976
85	NC_017549	GCTT	2	8	4127	4134	0 %	50 %	25 %	25 %	386062976
86	NC_017549	TCA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062976
87	NC_017549	TC	3	6	4244	4249	0 %	50 %	0 %	50 %	386062976
88	NC_017549	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
89	NC_017549	CGA	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062977
90	NC_017549	CAC	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062977
91	NC_017549	GGT	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062977
92	NC_017549	CGA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062977
93	NC_017549	CCAT	2	8	4465	4472	25 %	25 %	0 %	50 %	386062977
94	NC_017549	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386062977
95	NC_017549	GCG	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062977
96	NC_017549	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062977
97	NC_017549	ACA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
98	NC_017549	CGG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062977
99	NC_017549	GGT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062977
100	NC_017549	CAA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
101	NC_017549	ACC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062977
102	NC_017549	TCCT	2	8	4860	4867	0 %	50 %	0 %	50 %	386062977
103	NC_017549	CTG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062977
104	NC_017549	CGA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062977
105	NC_017549	AGG	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386062977
106	NC_017549	TCG	2	6	4951	4956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062977
107	NC_017549	CAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
108	NC_017549	CTGCT	2	10	5076	5085	0 %	40 %	20 %	40 %	386062977
109	NC_017549	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
110	NC_017549	GGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062977
111	NC_017549	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
112	NC_017549	GAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386062977
113	NC_017549	CCA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386062977
114	NC_017549	CGA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062977
115	NC_017549	ATC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062977
116	NC_017549	TCC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386062977
117	NC_017549	CTG	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062977
118	NC_017549	GAT	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386062977
119	NC_017549	CGC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062977
120	NC_017549	CGCA	2	8	5432	5439	25 %	0 %	25 %	50 %	386062977
121	NC_017549	GC	3	6	5442	5447	0 %	0 %	50 %	50 %	386062977
122	NC_017549	CGC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386062977
123	NC_017549	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	386062977
124	NC_017549	GC	3	6	5646	5651	0 %	0 %	50 %	50 %	386062977
125	NC_017549	CTC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386062977
126	NC_017549	AGG	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386062977
127	NC_017549	GAG	2	6	5721	5726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386062977
128	NC_017549	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386062977
129	NC_017549	CAT	4	12	5756	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062977
130	NC_017549	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062977
131	NC_017549	CTT	3	9	5816	5824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386062977
132	NC_017549	CTACAT	2	12	5855	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386062977
133	NC_017549	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062977
134	NC_017549	GCG	2	6	6012	6017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062977
135	NC_017549	GAC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386062977
136	NC_017549	GC	3	6	6183	6188	0 %	0 %	50 %	50 %	386062977
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247	NC_017549	CG	3	6	11249	11254	0 %	0 %	50 %	50 %	386062981
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250	NC_017549	GTA	3	9	11313	11321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386062981
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259	NC_017549	TTG	3	9	11674	11682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386062981
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261	NC_017549	TGG	2	6	11720	11725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386062981
262	NC_017549	CTC	2	6	11760	11765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386062981
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265	NC_017549	CGG	2	6	11855	11860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386062981
266	NC_017549	TCG	2	6	12046	12051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386062981
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