MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa M18 chromosome

Total Repeats: 147528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017548	TCCGTG	2	12	480	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056072
2	NC_017548	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
3	NC_017548	TCT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386056072
4	NC_017548	CAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056072
5	NC_017548	CGA	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
6	NC_017548	GT	3	6	598	603	0 %	50 %	50 %	0 %	386056072
7	NC_017548	TCGG	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	386056072
8	NC_017548	TTA	2	6	708	713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386056072
9	NC_017548	GCA	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
10	NC_017548	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056072
11	NC_017548	GC	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	386056072
12	NC_017548	CCG	3	9	795	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056072
13	NC_017548	GCC	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056072
14	NC_017548	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
15	NC_017548	GAA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386056072
16	NC_017548	GCC	3	9	930	938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056072
17	NC_017548	AGC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
18	NC_017548	ACCTTC	2	12	1026	1037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386056072
19	NC_017548	TCG	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056072
20	NC_017548	CGC	3	9	1076	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056072
21	NC_017548	ATGC	2	8	1167	1174	25 %	25 %	25 %	25 %	386056072
22	NC_017548	ACC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056072
23	NC_017548	GAA	3	9	1193	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386056072
24	NC_017548	GGT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056072
25	NC_017548	TCG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056072
26	NC_017548	CGA	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
27	NC_017548	TTC	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386056072
28	NC_017548	AGG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386056072
29	NC_017548	TTC	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386056072
30	NC_017548	GGC	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056072
31	NC_017548	CAG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056072
32	NC_017548	GCC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056072
33	NC_017548	TGA	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386056072
34	NC_017548	CTT	2	6	1589	1594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386056072
35	NC_017548	CGTG	2	8	1619	1626	0 %	25 %	50 %	25 %	386056072
36	NC_017548	GCCG	2	8	1675	1682	0 %	0 %	50 %	50 %	386056072
37	NC_017548	ACA	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056072
38	NC_017548	TAC	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056072
39	NC_017548	TGT	2	6	1804	1809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386056072
40	NC_017548	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056072
41	NC_017548	GC	3	6	1833	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	386056072
42	NC_017548	ACCA	2	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	386056072
43	NC_017548	CGG	2	6	1910	1915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056072
44	NC_017548	CAC	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056072
45	NC_017548	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056072
46	NC_017548	CGT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056073
47	NC_017548	CGC	2	6	2122	2127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056073
48	NC_017548	TC	3	6	2142	2147	0 %	50 %	0 %	50 %	386056073
49	NC_017548	CTG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056073
50	NC_017548	TGGT	2	8	2213	2220	0 %	50 %	50 %	0 %	386056073
51	NC_017548	GCC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056073
52	NC_017548	GC	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	386056073
53	NC_017548	ACG	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056073
54	NC_017548	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056073
55	NC_017548	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056073
56	NC_017548	TGC	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056073
57	NC_017548	CGG	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056073
58	NC_017548	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056073
59	NC_017548	CCA	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056073
60	NC_017548	TGG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056073
61	NC_017548	CG	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	386056073
62	NC_017548	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056073
63	NC_017548	AAC	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056073
64	NC_017548	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386056073
65	NC_017548	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056073
66	NC_017548	CAG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056073
67	NC_017548	GTC	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056073
68	NC_017548	CTCCCC	2	12	3225	3236	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386056074
69	NC_017548	C	6	6	3233	3238	0 %	0 %	0 %	100 %	386056074
70	NC_017548	CTG	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056074
71	NC_017548	GC	3	6	3331	3336	0 %	0 %	50 %	50 %	386056074
72	NC_017548	CCG	2	6	3564	3569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056074
73	NC_017548	TGACC	2	10	3816	3825	20 %	20 %	20 %	40 %	386056074
74	NC_017548	CTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056074
75	NC_017548	CCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386056074
76	NC_017548	CAG	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056074
77	NC_017548	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056074
78	NC_017548	TC	3	6	3978	3983	0 %	50 %	0 %	50 %	386056074
79	NC_017548	CAG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056074
80	NC_017548	TGG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056074
81	NC_017548	TGG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056074
82	NC_017548	AGC	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056074
83	NC_017548	GCTT	2	8	4127	4134	0 %	50 %	25 %	25 %	386056074
84	NC_017548	TCA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056074
85	NC_017548	TC	3	6	4244	4249	0 %	50 %	0 %	50 %	386056074
86	NC_017548	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056075
87	NC_017548	CGA	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
88	NC_017548	CAC	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056075
89	NC_017548	GGT	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056075
90	NC_017548	CGA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
91	NC_017548	CCAT	2	8	4465	4472	25 %	25 %	0 %	50 %	386056075
92	NC_017548	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386056075
93	NC_017548	GCG	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056075
94	NC_017548	TCC	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386056075
95	NC_017548	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056075
96	NC_017548	CGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
97	NC_017548	CGG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056075
98	NC_017548	GGT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056075
99	NC_017548	CAA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056075
100	NC_017548	ACC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056075
101	NC_017548	TCCT	2	8	4860	4867	0 %	50 %	0 %	50 %	386056075
102	NC_017548	CTG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056075
103	NC_017548	CGA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
104	NC_017548	AGG	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386056075
105	NC_017548	TCG	2	6	4951	4956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056075
106	NC_017548	CAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056075
107	NC_017548	CTGCT	2	10	5076	5085	0 %	40 %	20 %	40 %	386056075
108	NC_017548	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056075
109	NC_017548	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056075
110	NC_017548	CACC	2	8	5117	5124	25 %	0 %	0 %	75 %	386056075
111	NC_017548	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056075
112	NC_017548	GAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386056075
113	NC_017548	CCA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056075
114	NC_017548	CGA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
115	NC_017548	ATC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056075
116	NC_017548	TCC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386056075
117	NC_017548	CTG	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056075
118	NC_017548	GAT	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386056075
119	NC_017548	CGC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056075
120	NC_017548	CG	3	6	5432	5437	0 %	0 %	50 %	50 %	386056075
121	NC_017548	GC	3	6	5442	5447	0 %	0 %	50 %	50 %	386056075
122	NC_017548	CGC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056075
123	NC_017548	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	386056075
124	NC_017548	CTC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386056075
125	NC_017548	AGG	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386056075
126	NC_017548	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386056075
127	NC_017548	CAT	4	12	5756	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056075
128	NC_017548	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056075
129	NC_017548	CTT	3	9	5816	5824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386056075
130	NC_017548	CTACAT	2	12	5855	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386056075
131	NC_017548	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
132	NC_017548	GCG	2	6	6012	6017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056075
133	NC_017548	GAC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056075
134	NC_017548	GC	3	6	6183	6188	0 %	0 %	50 %	50 %	386056075
135	NC_017548	CCG	3	9	6193	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056075
136	NC_017548	TGG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056075
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138	NC_017548	GCT	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056075
139	NC_017548	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056075
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145	NC_017548	GCT	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056076
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147	NC_017548	GC	3	6	7116	7121	0 %	0 %	50 %	50 %	386056076
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154	NC_017548	GCTG	2	8	7396	7403	0 %	25 %	50 %	25 %	386056076
155	NC_017548	CGATGG	2	12	7408	7419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386056076
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165	NC_017548	CGTA	2	8	7867	7874	25 %	25 %	25 %	25 %	386056077
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173	NC_017548	TGGT	2	8	8168	8175	0 %	50 %	50 %	0 %	386056077
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248	NC_017548	CG	3	6	11181	11186	0 %	0 %	50 %	50 %	386056079
249	NC_017548	CGC	2	6	11229	11234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056079
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251	NC_017548	GTA	3	9	11245	11253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386056079
252	NC_017548	GC	4	8	11327	11334	0 %	0 %	50 %	50 %	386056079
253	NC_017548	GCC	2	6	11350	11355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056079
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257	NC_017548	ACC	2	6	11525	11530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056079
258	NC_017548	TGA	2	6	11586	11591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386056079
259	NC_017548	GCA	2	6	11598	11603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056079
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261	NC_017548	TGG	2	6	11652	11657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386056079
262	NC_017548	CTC	2	6	11692	11697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386056079
263	NC_017548	TCG	2	6	11744	11749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056079
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265	NC_017548	CGG	2	6	11787	11792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056079
266	NC_017548	TCG	2	6	11978	11983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386056079
267	NC_017548	CTC	2	6	12022	12027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386056079
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270	NC_017548	CGA	2	6	12084	12089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056079
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274	NC_017548	CGC	2	6	12180	12185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386056079
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282	NC_017548	GGC	2	6	12428	12433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386056079
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292	NC_017548	CGA	2	6	13067	13072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386056080
293	NC_017548	ACC	2	6	13162	13167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386056080
294	NC_017548	GTA	2	6	13176	13181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386056080
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384	NC_017548	GCAGC	2	10	17931	17940	20 %	0 %	40 %	40 %	386056087
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500	NC_017548	GAA	2	6	22863	22868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386056092

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