MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa M1 plasmid pPPM1a

Total Repeats: 5288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017543	ATTT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	386037982
2	NC_017543	AAT	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037982
3	NC_017543	CAAG	2	8	929	936	50 %	0 %	25 %	25 %	386037982
4	NC_017543	TGG	2	6	976	981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037982
5	NC_017543	CTC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386037982
6	NC_017543	TAA	2	6	1044	1049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037982
7	NC_017543	TGTTC	2	10	1080	1089	0 %	60 %	20 %	20 %	386037982
8	NC_017543	CAA	2	6	1111	1116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037982
9	NC_017543	TCACCT	2	12	1142	1153	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386037982
10	NC_017543	CCA	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037982
11	NC_017543	CTG	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037982
12	NC_017543	AAT	2	6	1266	1271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037982
13	NC_017543	AT	3	6	1308	1313	50 %	50 %	0 %	0 %	386037982
14	NC_017543	AGC	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037982
15	NC_017543	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037982
16	NC_017543	A	7	7	1429	1435	100 %	0 %	0 %	0 %	386037982
17	NC_017543	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037982
18	NC_017543	TAA	2	6	1542	1547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037982
19	NC_017543	T	6	6	1552	1557	0 %	100 %	0 %	0 %	386037982
20	NC_017543	CATC	2	8	1581	1588	25 %	25 %	0 %	50 %	386037982
21	NC_017543	C	6	6	1722	1727	0 %	0 %	0 %	100 %	386037982
22	NC_017543	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037982
23	NC_017543	TGG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386037983
24	NC_017543	CTT	2	6	2724	2729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037983
25	NC_017543	T	6	6	2754	2759	0 %	100 %	0 %	0 %	386037983
26	NC_017543	TTTC	2	8	2780	2787	0 %	75 %	0 %	25 %	386037983
27	NC_017543	AT	3	6	2788	2793	50 %	50 %	0 %	0 %	386037983
28	NC_017543	GCA	3	9	2798	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037983
29	NC_017543	TTTGTA	2	12	2849	2860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386037983
30	NC_017543	T	6	6	2900	2905	0 %	100 %	0 %	0 %	386037983
31	NC_017543	TTC	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037983
32	NC_017543	ATT	2	6	2995	3000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037984
33	NC_017543	AGG	2	6	3131	3136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386037984
34	NC_017543	A	6	6	3173	3178	100 %	0 %	0 %	0 %	386037984
35	NC_017543	ATC	3	9	3206	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037984
36	NC_017543	GAC	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037984
37	NC_017543	ATAA	2	8	3239	3246	75 %	25 %	0 %	0 %	386037984
38	NC_017543	TTTCA	2	10	3293	3302	20 %	60 %	0 %	20 %	386037984
39	NC_017543	CATCC	2	10	3547	3556	20 %	20 %	0 %	60 %	386037985
40	NC_017543	T	7	7	3568	3574	0 %	100 %	0 %	0 %	386037985
41	NC_017543	ATGA	2	8	3589	3596	50 %	25 %	25 %	0 %	386037985
42	NC_017543	AGT	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037985
43	NC_017543	AAC	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037985
44	NC_017543	ATC	3	9	3710	3718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037985
45	NC_017543	TCT	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037985
46	NC_017543	ATT	2	6	3856	3861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037986
47	NC_017543	AAAC	2	8	3885	3892	75 %	0 %	0 %	25 %	386037986
48	NC_017543	CAT	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037986
49	NC_017543	TCA	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037986
50	NC_017543	TGAA	2	8	4019	4026	50 %	25 %	25 %	0 %	386037986
51	NC_017543	TCA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037986
52	NC_017543	A	7	7	4152	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	386037987
53	NC_017543	TAA	2	6	4204	4209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037987
54	NC_017543	TCA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037987
55	NC_017543	ACA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037987
56	NC_017543	AAG	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386037987
57	NC_017543	TC	3	6	4341	4346	0 %	50 %	0 %	50 %	386037987
58	NC_017543	ATT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037987
59	NC_017543	TCT	2	6	4558	4563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037987
60	NC_017543	CCA	2	6	4599	4604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037987
61	NC_017543	TCC	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386037987
62	NC_017543	T	7	7	4984	4990	0 %	100 %	0 %	0 %	386037988
63	NC_017543	TGA	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037988
64	NC_017543	GTT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386037988
65	NC_017543	ATT	2	6	5055	5060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037988
66	NC_017543	AAC	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037988
67	NC_017543	TCA	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037988
68	NC_017543	GA	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	386037988
69	NC_017543	CAA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037988
70	NC_017543	TCA	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037988
71	NC_017543	T	8	8	5238	5245	0 %	100 %	0 %	0 %	386037988
72	NC_017543	TGC	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037988
73	NC_017543	A	7	7	5271	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	386037988
74	NC_017543	TCT	2	6	5369	5374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037989
75	NC_017543	CTG	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037989
76	NC_017543	TC	3	6	5462	5467	0 %	50 %	0 %	50 %	386037989
77	NC_017543	TCA	3	9	5473	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037989
78	NC_017543	TCG	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037989
79	NC_017543	TAA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037989
80	NC_017543	GCA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037990
81	NC_017543	ATT	3	9	6090	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037990
82	NC_017543	CAG	2	6	6145	6150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037990
83	NC_017543	CTTT	2	8	6214	6221	0 %	75 %	0 %	25 %	386037990
84	NC_017543	A	7	7	6253	6259	100 %	0 %	0 %	0 %	386037990
85	NC_017543	TCT	2	6	6316	6321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037990
86	NC_017543	TTCGTA	2	12	6330	6341	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386037990
87	NC_017543	TAG	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037990
88	NC_017543	AAT	2	6	6394	6399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037990
89	NC_017543	T	7	7	6595	6601	0 %	100 %	0 %	0 %	386037991
90	NC_017543	AGC	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037991
91	NC_017543	GCT	2	6	6804	6809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037991
92	NC_017543	GTC	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386037991
93	NC_017543	TG	3	6	6895	6900	0 %	50 %	50 %	0 %	386037991
94	NC_017543	TCA	2	6	6910	6915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037991
95	NC_017543	TTTG	2	8	6955	6962	0 %	75 %	25 %	0 %	386037991
96	NC_017543	CTT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037991
97	NC_017543	CAT	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037991
98	NC_017543	AT	3	6	7085	7090	50 %	50 %	0 %	0 %	386037991
99	NC_017543	TCT	2	6	7242	7247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037992
100	NC_017543	TCCA	2	8	7347	7354	25 %	25 %	0 %	50 %	386037992
101	NC_017543	GAT	2	6	7373	7378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037992
102	NC_017543	TTC	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037992
103	NC_017543	GATC	2	8	7433	7440	25 %	25 %	25 %	25 %	386037992
104	NC_017543	AAT	2	6	7463	7468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386037992
105	NC_017543	TCC	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386037992
106	NC_017543	AGG	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386037992
107	NC_017543	TTAA	2	8	7789	7796	50 %	50 %	0 %	0 %	386037992
108	NC_017543	CCA	2	6	7888	7893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386037992
109	NC_017543	AT	3	6	7933	7938	50 %	50 %	0 %	0 %	386037992
110	NC_017543	GAT	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037992
111	NC_017543	ACTTT	2	10	7957	7966	20 %	60 %	0 %	20 %	386037992
112	NC_017543	CTT	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037992
113	NC_017543	GGA	2	6	8026	8031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386037992
114	NC_017543	TCT	2	6	8053	8058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037992
115	NC_017543	GAA	2	6	8097	8102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386037992
116	NC_017543	CAG	2	6	8116	8121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037992
117	NC_017543	CTC	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386037992
118	NC_017543	TACT	2	8	8284	8291	25 %	50 %	0 %	25 %	386037993
119	NC_017543	GTT	2	6	8374	8379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386037993
120	NC_017543	TA	3	6	8439	8444	50 %	50 %	0 %	0 %	386037993
121	NC_017543	CATCAG	2	12	8451	8462	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386037993
122	NC_017543	CGA	2	6	8568	8573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386037993
123	NC_017543	GAT	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037993
124	NC_017543	CAA	2	6	8595	8600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386037993
125	NC_017543	TCA	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386037993
126	NC_017543	ATG	2	6	8658	8663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037993
127	NC_017543	TAG	2	6	8718	8723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386037993
128	NC_017543	TA	3	6	8746	8751	50 %	50 %	0 %	0 %	386037993
129	NC_017543	TTG	2	6	8768	8773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386037993
130	NC_017543	TC	3	6	8775	8780	0 %	50 %	0 %	50 %	386037993
131	NC_017543	TTC	2	6	8858	8863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386037993
132	NC_017543	ATTTT	2	10	8889	8898	20 %	80 %	0 %	0 %	386037993
133	NC_017543	CATT	2	8	9036	9043	25 %	50 %	0 %	25 %	386037993
134	NC_017543	TAAT	2	8	9424	9431	50 %	50 %	0 %	0 %	386037994
135	NC_017543	ATT	2	6	9509	9514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386037994
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