MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa M1 main chromosome

Total Repeats: 93594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017542	CAT	2	6	200945	200950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038848
3002	NC_017542	ATC	2	6	200983	200988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038848
3003	NC_017542	AGAGGA	2	12	200996	201007	50 %	0 %	50 %	0 %	386038848
3004	NC_017542	CGC	2	6	201120	201125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386038848
3005	NC_017542	CTGA	2	8	201195	201202	25 %	25 %	25 %	25 %	386038848
3006	NC_017542	TAA	2	6	201300	201305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386038848
3007	NC_017542	TTAT	2	8	201521	201528	25 %	75 %	0 %	0 %	386038849
3008	NC_017542	ATT	2	6	201569	201574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038849
3009	NC_017542	TCTT	2	8	201593	201600	0 %	75 %	0 %	25 %	386038849
3010	NC_017542	T	6	6	201599	201604	0 %	100 %	0 %	0 %	386038849
3011	NC_017542	CGCT	2	8	201617	201624	0 %	25 %	25 %	50 %	386038849
3012	NC_017542	TAT	2	6	201720	201725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038849
3013	NC_017542	TCG	2	6	201788	201793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038849
3014	NC_017542	AAT	2	6	201821	201826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386038849
3015	NC_017542	GAA	2	6	201848	201853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038849
3016	NC_017542	GGA	3	9	201880	201888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038849
3017	NC_017542	GAA	2	6	201890	201895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038849
3018	NC_017542	TGA	2	6	201907	201912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038849
3019	NC_017542	ATG	2	6	201923	201928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038849
3020	NC_017542	GCT	2	6	201931	201936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038849
3021	NC_017542	TAT	2	6	201938	201943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038849
3022	NC_017542	CGA	2	6	201957	201962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038849
3023	NC_017542	CTG	2	6	202019	202024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038849
3024	NC_017542	GAG	2	6	202073	202078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038849
3025	NC_017542	AAT	2	6	202103	202108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386038849
3026	NC_017542	TAC	2	6	202124	202129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038849
3027	NC_017542	ATT	2	6	202160	202165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038849
3028	NC_017542	GGA	2	6	202174	202179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038849
3029	NC_017542	T	6	6	202218	202223	0 %	100 %	0 %	0 %	386038849
3030	NC_017542	GGC	2	6	202235	202240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386038849
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3032	NC_017542	GAG	2	6	202346	202351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038849
3033	NC_017542	GA	3	6	202389	202394	50 %	0 %	50 %	0 %	386038849
3034	NC_017542	CTT	2	6	202407	202412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386038849
3035	NC_017542	CGG	2	6	202466	202471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386038849
3036	NC_017542	CAG	2	6	202547	202552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038849
3037	NC_017542	CTATCA	2	12	202579	202590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038849
3038	NC_017542	GAA	2	6	202657	202662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038849
3039	NC_017542	TCTT	2	8	202682	202689	0 %	75 %	0 %	25 %	386038849
3040	NC_017542	AGA	2	6	202792	202797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038849
3041	NC_017542	AC	4	8	202874	202881	50 %	0 %	0 %	50 %	386038849
3042	NC_017542	ATC	2	6	203011	203016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038849
3043	NC_017542	GCA	2	6	203029	203034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038849
3044	NC_017542	CAT	3	9	203147	203155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038849
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3050	NC_017542	TTA	2	6	203649	203654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038850
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3053	NC_017542	GGA	2	6	203800	203805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038850
3054	NC_017542	CTT	2	6	203812	203817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386038850
3055	NC_017542	TCG	2	6	203851	203856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038850
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3059	NC_017542	ACG	2	6	204122	204127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038850
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3073	NC_017542	TGC	2	6	205339	205344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038851
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3078	NC_017542	TA	3	6	205566	205571	50 %	50 %	0 %	0 %	386038851
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3083	NC_017542	TGC	2	6	205723	205728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038852
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3089	NC_017542	ATT	2	6	206186	206191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038852
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3103	NC_017542	TA	3	6	207198	207203	50 %	50 %	0 %	0 %	386038853
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3106	NC_017542	GCTG	2	8	207469	207476	0 %	25 %	50 %	25 %	386038853
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3108	NC_017542	AAG	2	6	207589	207594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038853
3109	NC_017542	A	6	6	207628	207633	100 %	0 %	0 %	0 %	386038854
3110	NC_017542	GAT	2	6	207642	207647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038854
3111	NC_017542	AGCC	2	8	207652	207659	25 %	0 %	25 %	50 %	386038854
3112	NC_017542	CTG	2	6	207660	207665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038854
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3114	NC_017542	A	8	8	207844	207851	100 %	0 %	0 %	0 %	386038854
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3118	NC_017542	ACC	2	6	208043	208048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386038854
3119	NC_017542	TTC	2	6	208056	208061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386038854
3120	NC_017542	GAG	2	6	208069	208074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038854
3121	NC_017542	A	7	7	208137	208143	100 %	0 %	0 %	0 %	386038854
3122	NC_017542	AAGG	2	8	208162	208169	50 %	0 %	50 %	0 %	386038854
3123	NC_017542	GCT	2	6	208185	208190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038854
3124	NC_017542	GCT	2	6	208315	208320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038854
3125	NC_017542	GCTC	2	8	208410	208417	0 %	25 %	25 %	50 %	386038854
3126	NC_017542	AAG	2	6	208436	208441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038854
3127	NC_017542	ATC	2	6	208484	208489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038854
3128	NC_017542	TGA	2	6	208503	208508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038854
3129	NC_017542	G	6	6	208526	208531	0 %	0 %	100 %	0 %	386038854
3130	NC_017542	AGT	2	6	208701	208706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038855
3131	NC_017542	CTG	2	6	208739	208744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038855
3132	NC_017542	GTT	2	6	208746	208751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386038855
3133	NC_017542	AATA	2	8	208765	208772	75 %	25 %	0 %	0 %	386038855
3134	NC_017542	AGA	2	6	208797	208802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038855
3135	NC_017542	CAT	2	6	208824	208829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038855
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3137	NC_017542	ATT	2	6	209276	209281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038856
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3141	NC_017542	CGA	2	6	209341	209346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038856
3142	NC_017542	GTG	2	6	209377	209382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038856
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3145	NC_017542	GGAA	2	8	209432	209439	50 %	0 %	50 %	0 %	386038856
3146	NC_017542	GCT	2	6	209445	209450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038856
3147	NC_017542	TGC	2	6	209468	209473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038856
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3150	NC_017542	ATA	2	6	209701	209706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386038856
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3152	NC_017542	AC	3	6	209866	209871	50 %	0 %	0 %	50 %	386038856
3153	NC_017542	AACA	2	8	210225	210232	75 %	0 %	0 %	25 %	386038857
3154	NC_017542	A	7	7	210236	210242	100 %	0 %	0 %	0 %	386038857
3155	NC_017542	GCA	2	6	210312	210317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038857
3156	NC_017542	CAG	2	6	210327	210332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038857
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3158	NC_017542	AATGG	2	10	210367	210376	40 %	20 %	40 %	0 %	386038857
3159	NC_017542	GCA	2	6	210432	210437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038857
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3161	NC_017542	ACA	2	6	210508	210513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386038857
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3232	NC_017542	CTG	2	6	214473	214478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038860
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3234	NC_017542	TCT	2	6	214550	214555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386038860
3235	NC_017542	ACAA	2	8	214623	214630	75 %	0 %	0 %	25 %	386038860
3236	NC_017542	CTG	3	9	215067	215075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038861
3237	NC_017542	CTG	2	6	215093	215098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038861
3238	NC_017542	GTT	2	6	215108	215113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386038861
3239	NC_017542	GAGAA	2	10	215211	215220	60 %	0 %	40 %	0 %	386038861
3240	NC_017542	ATG	2	6	215274	215279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038861
3241	NC_017542	GCA	2	6	215288	215293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038861
3242	NC_017542	TTCC	2	8	215330	215337	0 %	50 %	0 %	50 %	386038861
3243	NC_017542	ATT	2	6	215420	215425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038861
3244	NC_017542	GGT	2	6	215426	215431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038861
3245	NC_017542	CTG	2	6	215468	215473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038861
3246	NC_017542	ATT	2	6	215492	215497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038861
3247	NC_017542	GGC	2	6	215498	215503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386038861
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3250	NC_017542	GTT	2	6	215783	215788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386038861
3251	NC_017542	CAT	2	6	215881	215886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038861
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3253	NC_017542	TGG	2	6	215956	215961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038861
3254	NC_017542	GTT	2	6	216005	216010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386038861
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3266	NC_017542	CGT	2	6	216806	216811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038862
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3274	NC_017542	ATGG	2	8	217292	217299	25 %	25 %	50 %	0 %	386038863
3275	NC_017542	GCG	2	6	217320	217325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386038863
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3314	NC_017542	CTGA	2	8	219479	219486	25 %	25 %	25 %	25 %	386038864
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3332	NC_017542	GTTTT	2	10	220929	220938	0 %	80 %	20 %	0 %	386038866
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3339	NC_017542	GACT	2	8	221496	221503	25 %	25 %	25 %	25 %	386038866
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3341	NC_017542	TGA	2	6	221743	221748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038866
3342	NC_017542	GAT	2	6	221765	221770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038866
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3351	NC_017542	ACAGA	2	10	222326	222335	60 %	0 %	20 %	20 %	386038866
3352	NC_017542	AT	3	6	222349	222354	50 %	50 %	0 %	0 %	386038866
3353	NC_017542	GAG	2	6	222371	222376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038866
3354	NC_017542	ATC	2	6	222386	222391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038866
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3358	NC_017542	AGC	2	6	222492	222497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038866
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3360	NC_017542	TCG	2	6	222606	222611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038866
3361	NC_017542	GCAACG	2	12	222619	222630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038866
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3363	NC_017542	AG	3	6	222746	222751	50 %	0 %	50 %	0 %	386038866
3364	NC_017542	GGCG	2	8	222758	222765	0 %	0 %	75 %	25 %	386038866
3365	NC_017542	GGC	2	6	222769	222774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386038866
3366	NC_017542	GGC	2	6	222791	222796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386038866
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3368	NC_017542	CAC	2	6	222811	222816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386038866
3369	NC_017542	GTG	3	9	222831	222839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038866
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3371	NC_017542	GAA	2	6	222934	222939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038866
3372	NC_017542	GGT	2	6	223001	223006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038866
3373	NC_017542	GCA	2	6	223013	223018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038866
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3379	NC_017542	ACGCGT	2	12	223597	223608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386038867
3380	NC_017542	TGC	3	9	223613	223621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038867
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3382	NC_017542	CTG	2	6	223717	223722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038867
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3384	NC_017542	ATG	2	6	225124	225129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038868
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3389	NC_017542	CT	3	6	225365	225370	0 %	50 %	0 %	50 %	386038868
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3393	NC_017542	ATC	2	6	225857	225862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386038869
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3397	NC_017542	TGAT	2	8	226143	226150	25 %	50 %	25 %	0 %	386038869
3398	NC_017542	ATTTT	2	10	226282	226291	20 %	80 %	0 %	0 %	386038869
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3472	NC_017542	GTC	2	6	230298	230303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386038873
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3483	NC_017542	AGG	2	6	230944	230949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038873
3484	NC_017542	TCC	2	6	230984	230989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386038873
3485	NC_017542	CCG	2	6	231000	231005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386038873
3486	NC_017542	TGA	2	6	231007	231012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038873
3487	NC_017542	AGC	2	6	231029	231034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038873
3488	NC_017542	ACAGC	2	10	231064	231073	40 %	0 %	20 %	40 %	386038873
3489	NC_017542	A	8	8	231112	231119	100 %	0 %	0 %	0 %	386038873
3490	NC_017542	GGT	2	6	231167	231172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038873
3491	NC_017542	AGT	2	6	231176	231181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386038873
3492	NC_017542	AGC	2	6	231200	231205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038873
3493	NC_017542	AGC	2	6	231230	231235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038873
3494	NC_017542	GCA	2	6	231274	231279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386038873
3495	NC_017542	GGT	2	6	231315	231320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386038873
3496	NC_017542	TAT	2	6	231402	231407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386038873
3497	NC_017542	GGA	2	6	231470	231475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386038873
3498	NC_017542	TA	3	6	231486	231491	50 %	50 %	0 %	0 %	386038873
3499	NC_017542	A	7	7	231599	231605	100 %	0 %	0 %	0 %	386038873
3500	NC_017542	GAA	2	6	231606	231611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386038873

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