MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paenibacillus polymyxa M1 main chromosome

Total Repeats: 93594

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017542	GCT	2	6	652210	652215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039216
10003	NC_017542	TGG	2	6	652226	652231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386039216
10004	NC_017542	AGT	2	6	652342	652347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039216
10005	NC_017542	CCA	2	6	652351	652356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386039216
10006	NC_017542	TCA	2	6	652398	652403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039216
10007	NC_017542	CTT	2	6	652480	652485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386039216
10008	NC_017542	TG	3	6	652502	652507	0 %	50 %	50 %	0 %	386039216
10009	NC_017542	GCA	2	6	652525	652530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039216
10010	NC_017542	GAA	2	6	652542	652547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386039216
10011	NC_017542	TAT	2	6	652609	652614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386039216
10012	NC_017542	A	6	6	652617	652622	100 %	0 %	0 %	0 %	386039216
10013	NC_017542	GT	3	6	652658	652663	0 %	50 %	50 %	0 %	386039216
10014	NC_017542	CAT	2	6	652718	652723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039216
10015	NC_017542	ACG	2	6	652733	652738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039216
10016	NC_017542	CAA	2	6	652870	652875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386039216
10017	NC_017542	AGC	2	6	652881	652886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039216
10018	NC_017542	ATC	2	6	653024	653029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039216
10019	NC_017542	TCT	2	6	653049	653054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386039216
10020	NC_017542	TTCC	2	8	653081	653088	0 %	50 %	0 %	50 %	386039216
10021	NC_017542	GT	3	6	653090	653095	0 %	50 %	50 %	0 %	386039216
10022	NC_017542	AATG	2	8	653099	653106	50 %	25 %	25 %	0 %	386039216
10023	NC_017542	TA	3	6	653119	653124	50 %	50 %	0 %	0 %	386039216
10024	NC_017542	CGTTC	2	10	653129	653138	0 %	40 %	20 %	40 %	386039216
10025	NC_017542	CTC	2	6	653156	653161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386039216
10026	NC_017542	CAT	2	6	653170	653175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039216
10027	NC_017542	CTG	2	6	653317	653322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039216
10028	NC_017542	TCA	2	6	653503	653508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039216
10029	NC_017542	GTG	2	6	653520	653525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386039216
10030	NC_017542	ATC	2	6	653549	653554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039216
10031	NC_017542	CGAT	2	8	653602	653609	25 %	25 %	25 %	25 %	386039216
10032	NC_017542	CGTT	2	8	653667	653674	0 %	50 %	25 %	25 %	386039216
10033	NC_017542	GGTCAT	2	12	653720	653731	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386039216
10034	NC_017542	AGC	2	6	653736	653741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039216
10035	NC_017542	GTC	2	6	654028	654033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039217
10036	NC_017542	ATT	2	6	654089	654094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386039217
10037	NC_017542	ATG	2	6	654201	654206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039217
10038	NC_017542	CCGT	2	8	654234	654241	0 %	25 %	25 %	50 %	386039217
10039	NC_017542	CTG	2	6	654284	654289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039217
10040	NC_017542	A	6	6	654319	654324	100 %	0 %	0 %	0 %	386039217
10041	NC_017542	T	7	7	654339	654345	0 %	100 %	0 %	0 %	386039217
10042	NC_017542	CTT	2	6	654442	654447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386039217
10043	NC_017542	CTGG	2	8	654457	654464	0 %	25 %	50 %	25 %	386039217
10044	NC_017542	GAGAT	2	10	654465	654474	40 %	20 %	40 %	0 %	386039217
10045	NC_017542	GGT	2	6	654725	654730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386039217
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10047	NC_017542	AAT	2	6	654785	654790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386039217
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10051	NC_017542	TGA	2	6	654945	654950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039218
10052	NC_017542	TCG	2	6	654954	654959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039218
10053	NC_017542	ACTC	2	8	655116	655123	25 %	25 %	0 %	50 %	386039218
10054	NC_017542	GGT	2	6	655132	655137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386039218
10055	NC_017542	TGA	2	6	655263	655268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039218
10056	NC_017542	TCTTTC	2	12	655362	655373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386039218
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10058	NC_017542	TGC	2	6	655473	655478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039218
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10060	NC_017542	TTA	2	6	655494	655499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386039218
10061	NC_017542	TCTGGA	2	12	655512	655523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386039218
10062	NC_017542	TTCT	2	8	655670	655677	0 %	75 %	0 %	25 %	386039218
10063	NC_017542	AT	3	6	655690	655695	50 %	50 %	0 %	0 %	386039218
10064	NC_017542	AAAG	2	8	655840	655847	75 %	0 %	25 %	0 %	386039219
10065	NC_017542	TGC	2	6	655870	655875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039219
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10067	NC_017542	TGG	2	6	655909	655914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386039219
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10085	NC_017542	AACT	2	8	657367	657374	50 %	25 %	0 %	25 %	386039220
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10087	NC_017542	CTG	2	6	657472	657477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039220
10088	NC_017542	ATC	2	6	657532	657537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039220
10089	NC_017542	CAT	2	6	657639	657644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039220
10090	NC_017542	CAC	2	6	657709	657714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386039220
10091	NC_017542	GAAC	2	8	657844	657851	50 %	0 %	25 %	25 %	386039221
10092	NC_017542	A	7	7	657886	657892	100 %	0 %	0 %	0 %	386039221
10093	NC_017542	GCA	2	6	657964	657969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039221
10094	NC_017542	TCCT	2	8	658035	658042	0 %	50 %	0 %	50 %	386039221
10095	NC_017542	GC	3	6	658055	658060	0 %	0 %	50 %	50 %	386039221
10096	NC_017542	TGC	2	6	658086	658091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039221
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10099	NC_017542	CCGCT	2	10	658306	658315	0 %	20 %	20 %	60 %	386039221
10100	NC_017542	ATT	2	6	658403	658408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386039221
10101	NC_017542	AAAAT	2	10	658523	658532	80 %	20 %	0 %	0 %	386039221
10102	NC_017542	GTAT	2	8	658645	658652	25 %	50 %	25 %	0 %	386039221
10103	NC_017542	TGC	2	6	658728	658733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039221
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10106	NC_017542	T	7	7	658959	658965	0 %	100 %	0 %	0 %	386039222
10107	NC_017542	TGCGT	2	10	659063	659072	0 %	40 %	40 %	20 %	386039222
10108	NC_017542	GCAG	2	8	659115	659122	25 %	0 %	50 %	25 %	386039222
10109	NC_017542	CTG	2	6	659196	659201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039222
10110	NC_017542	GCT	2	6	659274	659279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039222
10111	NC_017542	GCG	2	6	659370	659375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386039222
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10114	NC_017542	CTT	2	6	659534	659539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386039222
10115	NC_017542	GCTG	2	8	659573	659580	0 %	25 %	50 %	25 %	386039222
10116	NC_017542	GGA	2	6	659625	659630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386039222
10117	NC_017542	CAC	2	6	659632	659637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386039222
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10119	NC_017542	CTG	2	6	659701	659706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039222
10120	NC_017542	GGA	2	6	659711	659716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386039222
10121	NC_017542	CT	3	6	659735	659740	0 %	50 %	0 %	50 %	386039222
10122	NC_017542	AACGG	2	10	659762	659771	40 %	0 %	40 %	20 %	386039222
10123	NC_017542	CTT	2	6	659824	659829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386039222
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10125	NC_017542	CTGC	2	8	659898	659905	0 %	25 %	25 %	50 %	386039222
10126	NC_017542	CTG	2	6	659979	659984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039222
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10130	NC_017542	TCG	2	6	660243	660248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039222
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10145	NC_017542	GCAC	2	8	661020	661027	25 %	0 %	25 %	50 %	386039222
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10157	NC_017542	GCCA	2	8	661773	661780	25 %	0 %	25 %	50 %	386039222
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10203	NC_017542	TGC	2	6	665103	665108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039226
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10214	NC_017542	CTAC	2	8	665803	665810	25 %	25 %	0 %	50 %	386039226
10215	NC_017542	AGC	2	6	665903	665908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039226
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10219	NC_017542	G	6	6	666154	666159	0 %	0 %	100 %	0 %	386039226
10220	NC_017542	CTA	2	6	666213	666218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039226
10221	NC_017542	GCC	2	6	666226	666231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386039226
10222	NC_017542	GGCA	2	8	666488	666495	25 %	0 %	50 %	25 %	386039227
10223	NC_017542	GCT	2	6	666512	666517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039227
10224	NC_017542	ATC	2	6	666528	666533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039227
10225	NC_017542	AGC	2	6	666552	666557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386039227
10226	NC_017542	ATC	3	9	666708	666716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039227
10227	NC_017542	TACCTC	2	12	666995	667006	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386039228
10228	NC_017542	ATC	2	6	667032	667037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039228
10229	NC_017542	CTGC	2	8	667158	667165	0 %	25 %	25 %	50 %	386039228
10230	NC_017542	ATG	2	6	667240	667245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039228
10231	NC_017542	ATT	2	6	667257	667262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386039228
10232	NC_017542	GAA	2	6	667275	667280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386039228
10233	NC_017542	CTG	2	6	667425	667430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039228
10234	NC_017542	AGT	2	6	667550	667555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039228
10235	NC_017542	ATT	2	6	667575	667580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386039228
10236	NC_017542	GCT	2	6	667625	667630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039228
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10238	NC_017542	CAT	2	6	667715	667720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386039228
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10354	NC_017542	TGC	2	6	674500	674505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386039235
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10356	NC_017542	GGA	2	6	674567	674572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386039235
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10480	NC_017542	GAT	2	6	683023	683028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386039242
10481	NC_017542	AGG	2	6	683054	683059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386039242
10482	NC_017542	GTT	2	6	683286	683291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386039242
10483	NC_017542	GAA	2	6	683295	683300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386039242
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