MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017530	GTC	2	6	161626	161631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009792
3002	NC_017530	GGACAA	2	12	161901	161912	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386009792
3003	NC_017530	GAA	2	6	161976	161981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009792
3004	NC_017530	GTC	2	6	162010	162015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009792
3005	NC_017530	CGG	2	6	162048	162053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009792
3006	NC_017530	GC	3	6	162099	162104	0 %	0 %	50 %	50 %	386009792
3007	NC_017530	GGC	2	6	162114	162119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009792
3008	NC_017530	GTC	2	6	162218	162223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3009	NC_017530	GCT	2	6	162228	162233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3010	NC_017530	GCA	2	6	162297	162302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3011	NC_017530	CTG	2	6	162304	162309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3012	NC_017530	AGA	2	6	162338	162343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009793
3013	NC_017530	GCT	2	6	162351	162356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3014	NC_017530	TGG	2	6	162371	162376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009793
3015	NC_017530	TGG	2	6	162393	162398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009793
3016	NC_017530	CAG	2	6	162469	162474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3017	NC_017530	CAGCA	2	10	162502	162511	40 %	0 %	20 %	40 %	386009793
3018	NC_017530	GCC	2	6	162524	162529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009793
3019	NC_017530	CCGG	2	8	162568	162575	0 %	0 %	50 %	50 %	386009793
3020	NC_017530	GGCGAA	2	12	162601	162612	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386009793
3021	NC_017530	GTG	2	6	162625	162630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009793
3022	NC_017530	ATG	2	6	162631	162636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009793
3023	NC_017530	CTG	2	6	162751	162756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009793
3024	NC_017530	CGC	2	6	162764	162769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009793
3025	NC_017530	ACC	2	6	162908	162913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009793
3026	NC_017530	GAAA	2	8	163032	163039	75 %	0 %	25 %	0 %	386009794
3027	NC_017530	AGC	2	6	163058	163063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3028	NC_017530	CTG	2	6	163102	163107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3029	NC_017530	GCA	2	6	163124	163129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3030	NC_017530	GCT	2	6	163135	163140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3031	NC_017530	GGT	2	6	163155	163160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009794
3032	NC_017530	ACA	2	6	163202	163207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009794
3033	NC_017530	CCTGCC	2	12	163335	163346	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386009794
3034	NC_017530	A	6	6	163369	163374	100 %	0 %	0 %	0 %	386009794
3035	NC_017530	GAA	2	6	163380	163385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009794
3036	NC_017530	CGG	2	6	163392	163397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009794
3037	NC_017530	GCC	2	6	163419	163424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009794
3038	NC_017530	GC	4	8	163455	163462	0 %	0 %	50 %	50 %	386009794
3039	NC_017530	GAA	2	6	163486	163491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009794
3040	NC_017530	GTT	2	6	163515	163520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009794
3041	NC_017530	CAGG	2	8	163543	163550	25 %	0 %	50 %	25 %	386009794
3042	NC_017530	AGC	2	6	163551	163556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3043	NC_017530	CTG	2	6	163577	163582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3044	NC_017530	CTG	2	6	163664	163669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3045	NC_017530	GCC	2	6	163749	163754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009794
3046	NC_017530	TGCCC	2	10	163875	163884	0 %	20 %	20 %	60 %	386009794
3047	NC_017530	GCC	2	6	163896	163901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009794
3048	NC_017530	ACCT	2	8	164107	164114	25 %	25 %	0 %	50 %	386009794
3049	NC_017530	GCA	2	6	164115	164120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3050	NC_017530	ACA	2	6	164183	164188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009794
3051	NC_017530	CTG	2	6	164192	164197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3052	NC_017530	AGC	2	6	164245	164250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3053	NC_017530	GCC	2	6	164260	164265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009794
3054	NC_017530	CGC	2	6	164350	164355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009794
3055	NC_017530	GAA	2	6	164443	164448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009794
3056	NC_017530	CTG	2	6	164464	164469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3057	NC_017530	GAGC	2	8	164505	164512	25 %	0 %	50 %	25 %	386009794
3058	NC_017530	CGG	2	6	164547	164552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009794
3059	NC_017530	TGGCGA	2	12	164558	164569	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386009794
3060	NC_017530	CTGG	2	8	164617	164624	0 %	25 %	50 %	25 %	386009794
3061	NC_017530	GGC	2	6	164698	164703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009794
3062	NC_017530	CTG	3	9	164716	164724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009794
3063	NC_017530	GTG	2	6	164815	164820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009794
3064	NC_017530	CAC	2	6	164823	164828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009794
3065	NC_017530	AGCC	2	8	164945	164952	25 %	0 %	25 %	50 %	386009794
3066	NC_017530	A	7	7	165035	165041	100 %	0 %	0 %	0 %	386009795
3067	NC_017530	TGT	2	6	165060	165065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009795
3068	NC_017530	GCT	2	6	165187	165192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3069	NC_017530	CAG	2	6	165208	165213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3070	NC_017530	CTC	2	6	165322	165327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386009795
3071	NC_017530	GCT	2	6	165427	165432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3072	NC_017530	CAA	2	6	165451	165456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009795
3073	NC_017530	ATC	2	6	165473	165478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009795
3074	NC_017530	GCA	2	6	165592	165597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3075	NC_017530	CAG	2	6	165638	165643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3076	NC_017530	CGC	2	6	165712	165717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009795
3077	NC_017530	CCGC	2	8	165733	165740	0 %	0 %	25 %	75 %	386009795
3078	NC_017530	CAG	2	6	165771	165776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3079	NC_017530	TGC	2	6	165780	165785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009795
3080	NC_017530	TGC	2	6	166031	166036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3081	NC_017530	T	6	6	166043	166048	0 %	100 %	0 %	0 %	386009796
3082	NC_017530	CT	3	6	166102	166107	0 %	50 %	0 %	50 %	386009796
3083	NC_017530	CAA	2	6	166129	166134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009796
3084	NC_017530	AAAGCG	2	12	166142	166153	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386009796
3085	NC_017530	CTG	2	6	166231	166236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3086	NC_017530	GCA	2	6	166284	166289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3087	NC_017530	TGA	2	6	166362	166367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009796
3088	NC_017530	CGTT	2	8	166373	166380	0 %	50 %	25 %	25 %	386009796
3089	NC_017530	ACC	3	9	166432	166440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009796
3090	NC_017530	GCA	2	6	166459	166464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3091	NC_017530	TGG	2	6	166523	166528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009796
3092	NC_017530	GTG	2	6	166555	166560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009796
3093	NC_017530	GCT	2	6	166647	166652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3094	NC_017530	GGC	2	6	166788	166793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009796
3095	NC_017530	CTG	2	6	166794	166799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3096	NC_017530	GGTT	2	8	166804	166811	0 %	50 %	50 %	0 %	386009796
3097	NC_017530	ACG	2	6	166833	166838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3098	NC_017530	CGT	2	6	166870	166875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3099	NC_017530	ATC	2	6	166903	166908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009796
3100	NC_017530	TG	3	6	166927	166932	0 %	50 %	50 %	0 %	386009796
3101	NC_017530	GCC	2	6	166958	166963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009796
3102	NC_017530	AGC	2	6	167063	167068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3103	NC_017530	GGC	2	6	167118	167123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009796
3104	NC_017530	GGC	2	6	167157	167162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009796
3105	NC_017530	GC	3	6	167161	167166	0 %	0 %	50 %	50 %	386009796
3106	NC_017530	TTG	2	6	167167	167172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009796
3107	NC_017530	CCAG	2	8	167192	167199	25 %	0 %	25 %	50 %	386009796
3108	NC_017530	GTG	2	6	167236	167241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009796
3109	NC_017530	CGA	2	6	167295	167300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3110	NC_017530	GCC	2	6	167398	167403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009796
3111	NC_017530	GCG	2	6	167408	167413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009796
3112	NC_017530	ATC	2	6	167425	167430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009796
3113	NC_017530	ACTTGC	2	12	167444	167455	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386009796
3114	NC_017530	TGC	2	6	167495	167500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009796
3115	NC_017530	GTT	2	6	167535	167540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386009796
3116	NC_017530	CGG	2	6	167599	167604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009796
3117	NC_017530	CCCAG	2	10	167728	167737	20 %	0 %	20 %	60 %	386009797
3118	NC_017530	ACCT	2	8	167754	167761	25 %	25 %	0 %	50 %	386009797
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3120	NC_017530	TGC	2	6	167788	167793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009797
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3361	NC_017530	GCAG	2	8	179792	179799	25 %	0 %	50 %	25 %	386009807
3362	NC_017530	GCT	2	6	179808	179813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009807
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3479	NC_017530	CCA	2	6	185436	185441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009812
3480	NC_017530	CGA	2	6	185490	185495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3481	NC_017530	GCA	2	6	185559	185564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3482	NC_017530	GTA	2	6	185569	185574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009812
3483	NC_017530	GAA	2	6	185593	185598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386009812
3484	NC_017530	CAG	2	6	185668	185673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3485	NC_017530	CGG	2	6	185730	185735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009812
3486	NC_017530	GCG	2	6	185777	185782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009812
3487	NC_017530	CTG	2	6	185794	185799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3488	NC_017530	GGCAGC	2	12	185858	185869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386009812
3489	NC_017530	GCG	2	6	185897	185902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009812
3490	NC_017530	CAG	2	6	185923	185928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3491	NC_017530	GTC	2	6	185983	185988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3492	NC_017530	CACGCT	2	12	186018	186029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386009812
3493	NC_017530	AC	3	6	186063	186068	50 %	0 %	0 %	50 %	386009812
3494	NC_017530	ATC	2	6	186086	186091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009812
3495	NC_017530	GCA	2	6	186131	186136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009812
3496	NC_017530	CCCAC	2	10	186148	186157	20 %	0 %	0 %	80 %	386009812
3497	NC_017530	TCA	2	6	186168	186173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386009812
3498	NC_017530	CGC	2	6	186174	186179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009812
3499	NC_017530	GAT	2	6	186187	186192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386009812
3500	NC_017530	GGCC	2	8	186195	186202	0 %	0 %	50 %	50 %	386009812

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