MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017530	CTG	2	6	135956	135961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009766
2503	NC_017530	TGC	2	6	135969	135974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009766
2504	NC_017530	GGC	2	6	136012	136017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009766
2505	NC_017530	GCG	2	6	136082	136087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009766
2506	NC_017530	TACCG	2	10	136126	136135	20 %	20 %	20 %	40 %	386009766
2507	NC_017530	CAC	2	6	136141	136146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009766
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2509	NC_017530	GCA	2	6	136218	136223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009766
2510	NC_017530	AGC	2	6	136254	136259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009766
2511	NC_017530	GCT	2	6	136544	136549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009767
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2515	NC_017530	GTG	2	6	136619	136624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009767
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2517	NC_017530	TGG	2	6	136668	136673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009767
2518	NC_017530	GTG	2	6	136692	136697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386009767
2519	NC_017530	GCT	2	6	136714	136719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009767
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2522	NC_017530	GGC	2	6	136907	136912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009767
2523	NC_017530	GC	3	6	136955	136960	0 %	0 %	50 %	50 %	386009767
2524	NC_017530	GGCTT	2	10	137069	137078	0 %	40 %	40 %	20 %	386009767
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2528	NC_017530	CGC	2	6	137539	137544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009768
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2532	NC_017530	CAG	2	6	137696	137701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009768
2533	NC_017530	GTGG	2	8	137725	137732	0 %	25 %	75 %	0 %	386009768
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2543	NC_017530	CTGG	2	8	138223	138230	0 %	25 %	50 %	25 %	386009768
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2553	NC_017530	GCAG	2	8	138586	138593	25 %	0 %	50 %	25 %	386009768
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2555	NC_017530	CGGCC	2	10	138695	138704	0 %	0 %	40 %	60 %	386009769
2556	NC_017530	ACC	2	6	138729	138734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386009769
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2558	NC_017530	CTG	2	6	138786	138791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009769
2559	NC_017530	TTC	2	6	138861	138866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386009769
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2561	NC_017530	TCG	2	6	138925	138930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009769
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2621	NC_017530	CTG	2	6	142053	142058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009772
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2981	NC_017530	GCT	2	6	160390	160395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009790
2982	NC_017530	GCA	2	6	160523	160528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009790
2983	NC_017530	GCC	2	6	160597	160602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009790
2984	NC_017530	CTG	2	6	160734	160739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009791
2985	NC_017530	CTG	2	6	160768	160773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386009791
2986	NC_017530	GCC	2	6	160794	160799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009791
2987	NC_017530	GGCCA	2	10	160803	160812	20 %	0 %	40 %	40 %	386009791
2988	NC_017530	CCG	2	6	160816	160821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009791
2989	NC_017530	GGCC	2	8	160880	160887	0 %	0 %	50 %	50 %	386009791
2990	NC_017530	AAC	2	6	160909	160914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386009791
2991	NC_017530	CGC	2	6	161000	161005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009791
2992	NC_017530	CCAG	2	8	161014	161021	25 %	0 %	25 %	50 %	386009791
2993	NC_017530	GCC	2	6	161037	161042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009791
2994	NC_017530	CG	3	6	161067	161072	0 %	0 %	50 %	50 %	386009791
2995	NC_017530	GGC	2	6	161082	161087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386009791
2996	NC_017530	GGGC	2	8	161171	161178	0 %	0 %	75 %	25 %	386009791
2997	NC_017530	AGC	2	6	161200	161205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386009791
2998	NC_017530	GCGCT	2	10	161501	161510	0 %	20 %	40 %	40 %	386009792
2999	NC_017530	CGC	2	6	161514	161519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009792
3000	NC_017530	GCC	2	6	161548	161553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386009792

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