MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_017530	TCG	2	6	1362153	1362158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25502	NC_017530	CTG	2	6	1362180	1362185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25503	NC_017530	TTGA	2	8	1362224	1362231	25 %	50 %	25 %	0 %	386010812
25504	NC_017530	GGCG	2	8	1362248	1362255	0 %	0 %	75 %	25 %	386010812
25505	NC_017530	TTC	2	6	1362335	1362340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010812
25506	NC_017530	CCT	2	6	1362542	1362547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010812
25507	NC_017530	GCA	2	6	1362559	1362564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25508	NC_017530	TCG	2	6	1362660	1362665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25509	NC_017530	ATC	2	6	1362672	1362677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010812
25510	NC_017530	TGCC	2	8	1362705	1362712	0 %	25 %	25 %	50 %	386010812
25511	NC_017530	TGC	2	6	1362715	1362720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25512	NC_017530	ATG	2	6	1362828	1362833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010812
25513	NC_017530	TGC	2	6	1362836	1362841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25514	NC_017530	TACG	2	8	1362852	1362859	25 %	25 %	25 %	25 %	386010812
25515	NC_017530	CGA	2	6	1363015	1363020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010812
25516	NC_017530	TGGG	2	8	1363047	1363054	0 %	25 %	75 %	0 %	386010812
25517	NC_017530	TCT	2	6	1363072	1363077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010812
25518	NC_017530	GT	3	6	1363112	1363117	0 %	50 %	50 %	0 %	386010812
25519	NC_017530	GAA	2	6	1363357	1363362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010812
25520	NC_017530	TTC	2	6	1363467	1363472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010812
25521	NC_017530	GGA	2	6	1363486	1363491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010812
25522	NC_017530	TGA	2	6	1363710	1363715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010812
25523	NC_017530	GC	3	6	1363736	1363741	0 %	0 %	50 %	50 %	386010812
25524	NC_017530	CTGG	2	8	1363754	1363761	0 %	25 %	50 %	25 %	386010812
25525	NC_017530	TGGA	2	8	1363783	1363790	25 %	25 %	50 %	0 %	386010812
25526	NC_017530	CAA	2	6	1363837	1363842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010812
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25528	NC_017530	TAC	2	6	1363880	1363885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010812
25529	NC_017530	CGTA	2	8	1364084	1364091	25 %	25 %	25 %	25 %	386010813
25530	NC_017530	GGTC	2	8	1364117	1364124	0 %	25 %	50 %	25 %	386010813
25531	NC_017530	GC	3	6	1364171	1364176	0 %	0 %	50 %	50 %	386010813
25532	NC_017530	TGC	2	6	1364272	1364277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010813
25533	NC_017530	CTG	2	6	1364514	1364519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010813
25534	NC_017530	CTG	2	6	1364522	1364527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010813
25535	NC_017530	CAT	2	6	1364579	1364584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010813
25536	NC_017530	CAA	2	6	1364594	1364599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010813
25537	NC_017530	GAT	2	6	1364628	1364633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010813
25538	NC_017530	CAA	2	6	1364681	1364686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010813
25539	NC_017530	CGC	3	9	1364696	1364704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010813
25540	NC_017530	AGCG	2	8	1364718	1364725	25 %	0 %	50 %	25 %	386010813
25541	NC_017530	GGGC	2	8	1364726	1364733	0 %	0 %	75 %	25 %	386010813
25542	NC_017530	GCT	2	6	1364743	1364748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010813
25543	NC_017530	TGGC	2	8	1364768	1364775	0 %	25 %	50 %	25 %	386010813
25544	NC_017530	GAG	2	6	1364805	1364810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010813
25545	NC_017530	TGCA	2	8	1364929	1364936	25 %	25 %	25 %	25 %	386010813
25546	NC_017530	GAG	2	6	1364950	1364955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010813
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25549	NC_017530	CTGC	2	8	1365015	1365022	0 %	25 %	25 %	50 %	386010814
25550	NC_017530	TGGCCA	2	12	1365045	1365056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386010814
25551	NC_017530	ATT	2	6	1365118	1365123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386010814
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25553	NC_017530	TGC	2	6	1365296	1365301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010814
25554	NC_017530	TGT	2	6	1365311	1365316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010814
25555	NC_017530	CAAC	2	8	1365346	1365353	50 %	0 %	0 %	50 %	386010814
25556	NC_017530	CTG	2	6	1365466	1365471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010814
25557	NC_017530	CGT	2	6	1365546	1365551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010814
25558	NC_017530	CGT	2	6	1365609	1365614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010814
25559	NC_017530	GCG	2	6	1365660	1365665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010814
25560	NC_017530	CTG	2	6	1365727	1365732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010814
25561	NC_017530	GT	3	6	1365734	1365739	0 %	50 %	50 %	0 %	386010814
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25564	NC_017530	CTAC	2	8	1365878	1365885	25 %	25 %	0 %	50 %	386010814
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25600	NC_017530	GCT	2	6	1367646	1367651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010816
25601	NC_017530	TG	3	6	1367683	1367688	0 %	50 %	50 %	0 %	386010816
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25603	NC_017530	CATCG	2	10	1367967	1367976	20 %	20 %	20 %	40 %	386010817
25604	NC_017530	TCG	2	6	1368019	1368024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010817
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25608	NC_017530	GCC	2	6	1368255	1368260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010817
25609	NC_017530	TTCA	2	8	1368284	1368291	25 %	50 %	0 %	25 %	386010817
25610	NC_017530	CGA	2	6	1368296	1368301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010817
25611	NC_017530	CTA	2	6	1368382	1368387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010817
25612	NC_017530	ACT	2	6	1368403	1368408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010817
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25846	NC_017530	GCA	2	6	1379404	1379409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010827
25847	NC_017530	TCG	2	6	1379484	1379489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010827
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25947	NC_017530	GAC	2	6	1385294	1385299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010830
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25950	NC_017530	ATGC	2	8	1385513	1385520	25 %	25 %	25 %	25 %	386010831
25951	NC_017530	CCGC	2	8	1385525	1385532	0 %	0 %	25 %	75 %	386010831
25952	NC_017530	GATG	2	8	1385635	1385642	25 %	25 %	50 %	0 %	386010831
25953	NC_017530	GGCCT	2	10	1385646	1385655	0 %	20 %	40 %	40 %	386010831
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25956	NC_017530	TCG	2	6	1386197	1386202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010832
25957	NC_017530	GAC	2	6	1386205	1386210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010832
25958	NC_017530	CCG	2	6	1386230	1386235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010832
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25965	NC_017530	TGC	2	6	1386500	1386505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010832
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