MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_017530	CGT	2	6	1331618	1331623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010790
25003	NC_017530	AAC	2	6	1331668	1331673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010790
25004	NC_017530	TTGGCG	2	12	1331674	1331685	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386010790
25005	NC_017530	TGCCGG	2	12	1331717	1331728	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010790
25006	NC_017530	CGT	2	6	1331732	1331737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010790
25007	NC_017530	GCG	2	6	1331748	1331753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010790
25008	NC_017530	AAC	2	6	1331773	1331778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010790
25009	NC_017530	GGC	2	6	1331780	1331785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010790
25010	NC_017530	GTG	2	6	1331818	1331823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010790
25011	NC_017530	GCT	2	6	1331843	1331848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010790
25012	NC_017530	CAGC	2	8	1331863	1331870	25 %	0 %	25 %	50 %	386010790
25013	NC_017530	GCA	2	6	1331879	1331884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010790
25014	NC_017530	AGC	2	6	1331893	1331898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010790
25015	NC_017530	TTCA	2	8	1332001	1332008	25 %	50 %	0 %	25 %	386010791
25016	NC_017530	CAG	2	6	1332045	1332050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010791
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25018	NC_017530	CCA	2	6	1332140	1332145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010791
25019	NC_017530	GAT	2	6	1332180	1332185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010791
25020	NC_017530	CTG	2	6	1332195	1332200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010791
25021	NC_017530	GAT	3	9	1332201	1332209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010791
25022	NC_017530	TCG	2	6	1332232	1332237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010791
25023	NC_017530	AGC	4	12	1332238	1332249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010791
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25025	NC_017530	CTG	2	6	1332288	1332293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010791
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25028	NC_017530	GCGA	2	8	1332438	1332445	25 %	0 %	50 %	25 %	386010791
25029	NC_017530	CGG	2	6	1332451	1332456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010791
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25031	NC_017530	GCG	2	6	1332554	1332559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010791
25032	NC_017530	TCA	2	6	1332572	1332577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010791
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25038	NC_017530	TCA	2	6	1332968	1332973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010792
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25041	NC_017530	CGG	2	6	1333022	1333027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010792
25042	NC_017530	CCAG	2	8	1333061	1333068	25 %	0 %	25 %	50 %	386010792
25043	NC_017530	CTTC	2	8	1333088	1333095	0 %	50 %	0 %	50 %	386010792
25044	NC_017530	GCG	2	6	1333101	1333106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010792
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25048	NC_017530	TGG	2	6	1333249	1333254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010792
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25053	NC_017530	GCA	2	6	1333507	1333512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010793
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25114	NC_017530	GCC	2	6	1336278	1336283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010795
25115	NC_017530	GTA	2	6	1336284	1336289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010795
25116	NC_017530	GAT	2	6	1336323	1336328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010795
25117	NC_017530	GAG	2	6	1336330	1336335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010795
25118	NC_017530	CGG	2	6	1336409	1336414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010795
25119	NC_017530	CTG	2	6	1336434	1336439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010795
25120	NC_017530	CGG	2	6	1336496	1336501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010795
25121	NC_017530	GGC	2	6	1336578	1336583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010795
25122	NC_017530	TGATCA	2	12	1336589	1336600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386010795
25123	NC_017530	CTTCGT	2	12	1336604	1336615	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386010795
25124	NC_017530	GCTG	2	8	1336627	1336634	0 %	25 %	50 %	25 %	386010795
25125	NC_017530	TGGAGC	2	12	1336637	1336648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386010795
25126	NC_017530	CGT	2	6	1336676	1336681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010795
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25345	NC_017530	GGC	2	6	1349362	1349367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010806
25346	NC_017530	TGT	2	6	1349413	1349418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010806
25347	NC_017530	GC	3	6	1349462	1349467	0 %	0 %	50 %	50 %	386010806
25348	NC_017530	GCGCA	2	10	1349502	1349511	20 %	0 %	40 %	40 %	386010806
25349	NC_017530	GCA	3	9	1349516	1349524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010806
25350	NC_017530	CGC	2	6	1349597	1349602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010807
25351	NC_017530	CTGTCA	2	12	1349707	1349718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386010807
25352	NC_017530	TCGCC	2	10	1349725	1349734	0 %	20 %	20 %	60 %	386010807
25353	NC_017530	GCC	2	6	1349771	1349776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010807
25354	NC_017530	GTT	3	9	1349777	1349785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010807
25355	NC_017530	TGA	2	6	1349794	1349799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010807
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25357	NC_017530	ATC	2	6	1349873	1349878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010807
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25362	NC_017530	GTC	2	6	1350248	1350253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010807
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25367	NC_017530	TGC	2	6	1350522	1350527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010807
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25372	NC_017530	GTG	2	6	1350642	1350647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010807
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25374	NC_017530	GCA	2	6	1350690	1350695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010807
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25379	NC_017530	TTG	2	6	1350807	1350812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010807
25380	NC_017530	GC	3	6	1350860	1350865	0 %	0 %	50 %	50 %	386010807
25381	NC_017530	TCG	2	6	1350879	1350884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010807
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25398	NC_017530	CGC	3	9	1351673	1351681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010807
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25402	NC_017530	GCCT	2	8	1351733	1351740	0 %	25 %	25 %	50 %	386010807
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25405	NC_017530	GCGAG	2	10	1351930	1351939	20 %	0 %	60 %	20 %	386010807
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25445	NC_017530	GTC	2	6	1354065	1354070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010809
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25447	NC_017530	CGG	2	6	1354110	1354115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010809
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25450	NC_017530	CGG	2	6	1354272	1354277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010809
25451	NC_017530	ACC	2	6	1354287	1354292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010809
25452	NC_017530	GCA	2	6	1354350	1354355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010809
25453	NC_017530	GCC	2	6	1354358	1354363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010809
25454	NC_017530	CGG	2	6	1354366	1354371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010809
25455	NC_017530	TGGCTG	2	12	1354373	1354384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386010809
25456	NC_017530	AG	3	6	1354405	1354410	50 %	0 %	50 %	0 %	386010809
25457	NC_017530	GCC	2	6	1360198	1360203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010810
25458	NC_017530	GTAT	2	8	1360242	1360249	25 %	50 %	25 %	0 %	386010810
25459	NC_017530	GTC	2	6	1360364	1360369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25460	NC_017530	CCA	2	6	1360415	1360420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010810
25461	NC_017530	GGC	2	6	1360453	1360458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010810
25462	NC_017530	GAT	4	12	1360464	1360475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010810
25463	NC_017530	AAG	2	6	1360495	1360500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010810
25464	NC_017530	ATG	2	6	1360540	1360545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010810
25465	NC_017530	CCA	2	6	1360566	1360571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010810
25466	NC_017530	ACA	2	6	1360586	1360591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010810
25467	NC_017530	GC	3	6	1360597	1360602	0 %	0 %	50 %	50 %	386010810
25468	NC_017530	GAA	3	9	1360627	1360635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010810
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25470	NC_017530	CGC	2	6	1360674	1360679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010810
25471	NC_017530	CCG	2	6	1360719	1360724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010810
25472	NC_017530	CG	3	6	1360776	1360781	0 %	0 %	50 %	50 %	386010810
25473	NC_017530	CGGTGC	2	12	1360800	1360811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010810
25474	NC_017530	TCA	2	6	1360871	1360876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010810
25475	NC_017530	CGA	2	6	1360902	1360907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25476	NC_017530	CGCTG	2	10	1360932	1360941	0 %	20 %	40 %	40 %	386010810
25477	NC_017530	TCG	2	6	1360942	1360947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25478	NC_017530	GCC	2	6	1360975	1360980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010810
25479	NC_017530	ATC	2	6	1360987	1360992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010810
25480	NC_017530	TTC	2	6	1361026	1361031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010810
25481	NC_017530	GGC	2	6	1361041	1361046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010810
25482	NC_017530	CGA	3	9	1361238	1361246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25483	NC_017530	TGG	2	6	1361272	1361277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010810
25484	NC_017530	CGT	2	6	1361286	1361291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25485	NC_017530	TCG	2	6	1361311	1361316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25486	NC_017530	TGC	2	6	1361383	1361388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010810
25487	NC_017530	GT	3	6	1361475	1361480	0 %	50 %	50 %	0 %	386010811
25488	NC_017530	CGG	2	6	1361486	1361491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010811
25489	NC_017530	ATG	2	6	1361496	1361501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010811
25490	NC_017530	GTG	2	6	1361550	1361555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010811
25491	NC_017530	GAC	2	6	1361565	1361570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010811
25492	NC_017530	CTG	2	6	1361706	1361711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010811
25493	NC_017530	GCT	2	6	1361714	1361719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010811
25494	NC_017530	GC	3	6	1361813	1361818	0 %	0 %	50 %	50 %	386010811
25495	NC_017530	AC	3	6	1361990	1361995	50 %	0 %	0 %	50 %	386010812
25496	NC_017530	CG	3	6	1362049	1362054	0 %	0 %	50 %	50 %	386010812
25497	NC_017530	C	6	6	1362064	1362069	0 %	0 %	0 %	100 %	386010812
25498	NC_017530	CCG	2	6	1362088	1362093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010812
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25500	NC_017530	CA	3	6	1362127	1362132	50 %	0 %	0 %	50 %	386010812

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