MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_017530	GGC	2	6	1280435	1280440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010739
24003	NC_017530	ATC	2	6	1280475	1280480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010739
24004	NC_017530	CGC	2	6	1280530	1280535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010739
24005	NC_017530	TGGCC	2	10	1280569	1280578	0 %	20 %	40 %	40 %	386010739
24006	NC_017530	AC	3	6	1280608	1280613	50 %	0 %	0 %	50 %	386010739
24007	NC_017530	TTC	2	6	1280658	1280663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010739
24008	NC_017530	CGG	2	6	1280715	1280720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010739
24009	NC_017530	TCG	2	6	1280736	1280741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010739
24010	NC_017530	GTG	2	6	1280742	1280747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010739
24011	NC_017530	CAG	2	6	1280753	1280758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010739
24012	NC_017530	GA	3	6	1280760	1280765	50 %	0 %	50 %	0 %	386010739
24013	NC_017530	AGTC	2	8	1281221	1281228	25 %	25 %	25 %	25 %	386010740
24014	NC_017530	GAG	2	6	1281231	1281236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010740
24015	NC_017530	CGGG	2	8	1281239	1281246	0 %	0 %	75 %	25 %	386010740
24016	NC_017530	TGA	2	6	1281511	1281516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010740
24017	NC_017530	ATGGGC	2	12	1281616	1281627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386010740
24018	NC_017530	TGC	3	9	1281628	1281636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010740
24019	NC_017530	GGC	2	6	1281678	1281683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010740
24020	NC_017530	GCA	2	6	1281703	1281708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010740
24021	NC_017530	GTG	2	6	1281757	1281762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010740
24022	NC_017530	TGG	3	9	1281769	1281777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010740
24023	NC_017530	TGG	2	6	1281836	1281841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010740
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24026	NC_017530	GCA	2	6	1281926	1281931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010740
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24030	NC_017530	GGC	2	6	1282146	1282151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010740
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24033	NC_017530	GT	3	6	1282225	1282230	0 %	50 %	50 %	0 %	386010740
24034	NC_017530	CGG	2	6	1282247	1282252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010740
24035	NC_017530	GC	3	6	1282310	1282315	0 %	0 %	50 %	50 %	386010740
24036	NC_017530	TGT	2	6	1282342	1282347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010740
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24039	NC_017530	TCG	2	6	1282585	1282590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010740
24040	NC_017530	GAGTTG	2	12	1282620	1282631	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386010740
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24042	NC_017530	GGC	2	6	1282705	1282710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010740
24043	NC_017530	GCA	2	6	1282765	1282770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010740
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24046	NC_017530	GAC	2	6	1282833	1282838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010740
24047	NC_017530	CTG	3	9	1282881	1282889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010740
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24049	NC_017530	GCA	2	6	1282909	1282914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010740
24050	NC_017530	GTT	2	6	1282970	1282975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010740
24051	NC_017530	GCA	2	6	1282994	1282999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010740
24052	NC_017530	ATG	2	6	1283082	1283087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010740
24053	NC_017530	ATGGTC	2	12	1283116	1283127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386010740
24054	NC_017530	TGACC	2	10	1283180	1283189	20 %	20 %	20 %	40 %	386010740
24055	NC_017530	ATC	2	6	1283362	1283367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010741
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24058	NC_017530	CAT	2	6	1283607	1283612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010741
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24061	NC_017530	TTC	2	6	1283836	1283841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010742
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24068	NC_017530	CTGA	2	8	1284461	1284468	25 %	25 %	25 %	25 %	386010743
24069	NC_017530	CTTG	2	8	1284499	1284506	0 %	50 %	25 %	25 %	386010743
24070	NC_017530	CTGG	2	8	1284530	1284537	0 %	25 %	50 %	25 %	386010743
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24078	NC_017530	ATCG	2	8	1285089	1285096	25 %	25 %	25 %	25 %	386010744
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24087	NC_017530	TGC	2	6	1285431	1285436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010744
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24090	NC_017530	GC	3	6	1285861	1285866	0 %	0 %	50 %	50 %	386010745
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24103	NC_017530	TTC	2	6	1286397	1286402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010746
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24105	NC_017530	GCT	2	6	1286498	1286503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010746
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24110	NC_017530	GGCA	2	8	1286683	1286690	25 %	0 %	50 %	25 %	386010746
24111	NC_017530	GCC	2	6	1286709	1286714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010746
24112	NC_017530	CAG	2	6	1286739	1286744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010746
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24116	NC_017530	TGT	2	6	1286987	1286992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010746
24117	NC_017530	TGG	3	9	1287020	1287028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010746
24118	NC_017530	GCCG	2	8	1287030	1287037	0 %	0 %	50 %	50 %	386010746
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24227	NC_017530	TG	3	6	1293354	1293359	0 %	50 %	50 %	0 %	386010754
24228	NC_017530	GCC	2	6	1293405	1293410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010754
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24231	NC_017530	GGC	2	6	1293508	1293513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010754
24232	NC_017530	GCT	2	6	1293520	1293525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010754
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24347	NC_017530	GC	3	6	1299619	1299624	0 %	0 %	50 %	50 %	386010760
24348	NC_017530	CAT	2	6	1299699	1299704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010760
24349	NC_017530	CGC	2	6	1299716	1299721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010760
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24358	NC_017530	G	6	6	1300111	1300116	0 %	0 %	100 %	0 %	386010761
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24455	NC_017530	TCG	2	6	1304397	1304402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010764
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24461	NC_017530	TTC	2	6	1304863	1304868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010765
24462	NC_017530	GATC	2	8	1305027	1305034	25 %	25 %	25 %	25 %	386010765
24463	NC_017530	TTCCAC	2	12	1305035	1305046	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386010765
24464	NC_017530	GCT	2	6	1305093	1305098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24465	NC_017530	GCA	2	6	1305174	1305179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24466	NC_017530	ACA	2	6	1305186	1305191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010765
24467	NC_017530	CCA	2	6	1305216	1305221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010765
24468	NC_017530	CAG	2	6	1305286	1305291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24469	NC_017530	GCA	2	6	1305303	1305308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24470	NC_017530	CAG	2	6	1305325	1305330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24471	NC_017530	T	6	6	1305331	1305336	0 %	100 %	0 %	0 %	386010765
24472	NC_017530	GCA	2	6	1305366	1305371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24473	NC_017530	CAC	2	6	1305442	1305447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010765
24474	NC_017530	TTC	2	6	1305505	1305510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010765
24475	NC_017530	CAC	2	6	1305547	1305552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010765
24476	NC_017530	TGG	2	6	1305598	1305603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010765
24477	NC_017530	GAA	2	6	1305655	1305660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010765
24478	NC_017530	GCC	2	6	1305673	1305678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010765
24479	NC_017530	CGG	2	6	1305696	1305701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010765
24480	NC_017530	AGC	2	6	1305914	1305919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24481	NC_017530	GCA	2	6	1305963	1305968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24482	NC_017530	GCA	3	9	1306023	1306031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24483	NC_017530	TTC	2	6	1306072	1306077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010765
24484	NC_017530	GCCA	2	8	1306096	1306103	25 %	0 %	25 %	50 %	386010765
24485	NC_017530	CGT	2	6	1306105	1306110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24486	NC_017530	AGG	2	6	1306124	1306129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010765
24487	NC_017530	CCG	2	6	1306157	1306162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010765
24488	NC_017530	GCA	2	6	1306184	1306189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24489	NC_017530	TCG	2	6	1306190	1306195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010765
24490	NC_017530	GGT	2	6	1306249	1306254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010765
24491	NC_017530	TCG	2	6	1306324	1306329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010766
24492	NC_017530	CAGGC	2	10	1306452	1306461	20 %	0 %	40 %	40 %	386010766
24493	NC_017530	CGC	2	6	1306499	1306504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010766
24494	NC_017530	GCC	2	6	1306505	1306510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010766
24495	NC_017530	GGCG	2	8	1306511	1306518	0 %	0 %	75 %	25 %	386010766
24496	NC_017530	AGC	2	6	1306525	1306530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010766
24497	NC_017530	CCG	2	6	1306588	1306593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010766
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24499	NC_017530	CCA	2	6	1306836	1306841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010766
24500	NC_017530	TTGGC	2	10	1306869	1306878	0 %	40 %	40 %	20 %	386010766

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