MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_017530	CAG	2	6	1231439	1231444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010700
23002	NC_017530	TGC	2	6	1231529	1231534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010701
23003	NC_017530	GCG	2	6	1231550	1231555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010701
23004	NC_017530	CAC	2	6	1231569	1231574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010701
23005	NC_017530	TCGCC	2	10	1231599	1231608	0 %	20 %	20 %	60 %	386010701
23006	NC_017530	CAG	2	6	1231663	1231668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010701
23007	NC_017530	CAG	2	6	1231865	1231870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23008	NC_017530	TGATGG	2	12	1231884	1231895	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386010702
23009	NC_017530	GGC	2	6	1231912	1231917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010702
23010	NC_017530	CTGG	2	8	1231927	1231934	0 %	25 %	50 %	25 %	386010702
23011	NC_017530	CGA	2	6	1231957	1231962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23012	NC_017530	CTG	2	6	1231970	1231975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23013	NC_017530	GGCC	2	8	1232008	1232015	0 %	0 %	50 %	50 %	386010702
23014	NC_017530	CGC	2	6	1232023	1232028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010702
23015	NC_017530	GGC	2	6	1232052	1232057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010702
23016	NC_017530	GC	3	6	1232191	1232196	0 %	0 %	50 %	50 %	386010702
23017	NC_017530	CGA	2	6	1232224	1232229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23018	NC_017530	GC	3	6	1232288	1232293	0 %	0 %	50 %	50 %	386010702
23019	NC_017530	ACC	2	6	1232332	1232337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010702
23020	NC_017530	GGC	2	6	1232344	1232349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010702
23021	NC_017530	CTG	3	9	1232384	1232392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23022	NC_017530	GCC	2	6	1232406	1232411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010702
23023	NC_017530	ACC	2	6	1232447	1232452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010702
23024	NC_017530	GGC	2	6	1232457	1232462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010702
23025	NC_017530	AATGCC	2	12	1232465	1232476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386010702
23026	NC_017530	GCT	2	6	1232497	1232502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23027	NC_017530	CGGC	2	8	1232557	1232564	0 %	0 %	50 %	50 %	386010702
23028	NC_017530	GCT	3	9	1232650	1232658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23029	NC_017530	GTG	2	6	1232744	1232749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010702
23030	NC_017530	GCA	2	6	1232773	1232778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010702
23031	NC_017530	CAC	2	6	1232973	1232978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010703
23032	NC_017530	TTG	2	6	1233082	1233087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010703
23033	NC_017530	CGA	2	6	1233131	1233136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010703
23034	NC_017530	CCA	2	6	1233197	1233202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010703
23035	NC_017530	CAG	2	6	1233222	1233227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010703
23036	NC_017530	CGG	2	6	1233362	1233367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010703
23037	NC_017530	CGAAGA	2	12	1233386	1233397	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386010703
23038	NC_017530	GTC	2	6	1233420	1233425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010703
23039	NC_017530	ATG	2	6	1233442	1233447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010703
23040	NC_017530	TGT	2	6	1233509	1233514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010703
23041	NC_017530	GGTCAG	2	12	1233516	1233527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386010703
23042	NC_017530	GTC	2	6	1233556	1233561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010703
23043	NC_017530	CAC	2	6	1233605	1233610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010703
23044	NC_017530	GAT	2	6	1233621	1233626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010703
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23052	NC_017530	GTGCG	2	10	1233932	1233941	0 %	20 %	60 %	20 %	386010703
23053	NC_017530	TGG	2	6	1233944	1233949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010703
23054	NC_017530	TGC	2	6	1233956	1233961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010703
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23056	NC_017530	GTC	2	6	1234017	1234022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010703
23057	NC_017530	TGGCGC	2	12	1234025	1234036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010703
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23059	NC_017530	GCT	2	6	1234080	1234085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010703
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23062	NC_017530	CAGGT	2	10	1234201	1234210	20 %	20 %	40 %	20 %	386010703
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23068	NC_017530	GCCG	2	8	1234488	1234495	0 %	0 %	50 %	50 %	386010703
23069	NC_017530	GCG	2	6	1234504	1234509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010703
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23073	NC_017530	GGTC	2	8	1234613	1234620	0 %	25 %	50 %	25 %	386010703
23074	NC_017530	TGC	2	6	1234628	1234633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010703
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23081	NC_017530	GCG	2	6	1234920	1234925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010703
23082	NC_017530	TCA	2	6	1235006	1235011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010703
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23087	NC_017530	CG	3	6	1235443	1235448	0 %	0 %	50 %	50 %	386010704
23088	NC_017530	GCA	2	6	1235462	1235467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010704
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23092	NC_017530	TGGCC	2	10	1235637	1235646	0 %	20 %	40 %	40 %	386010704
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23096	NC_017530	CGA	2	6	1235715	1235720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010704
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23098	NC_017530	GCCAG	2	10	1235759	1235768	20 %	0 %	40 %	40 %	386010704
23099	NC_017530	GCTG	2	8	1235790	1235797	0 %	25 %	50 %	25 %	386010704
23100	NC_017530	GCG	2	6	1235846	1235851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010704
23101	NC_017530	GACC	2	8	1235877	1235884	25 %	0 %	25 %	50 %	386010704
23102	NC_017530	CT	3	6	1235907	1235912	0 %	50 %	0 %	50 %	386010704
23103	NC_017530	TGG	3	9	1235972	1235980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010704
23104	NC_017530	TGGC	2	8	1236013	1236020	0 %	25 %	50 %	25 %	386010704
23105	NC_017530	TGT	2	6	1236047	1236052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010704
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23107	NC_017530	T	6	6	1236204	1236209	0 %	100 %	0 %	0 %	386010704
23108	NC_017530	AAC	3	9	1236221	1236229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010704
23109	NC_017530	CTG	2	6	1236236	1236241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010704
23110	NC_017530	CG	3	6	1236325	1236330	0 %	0 %	50 %	50 %	386010704
23111	NC_017530	GGC	2	6	1236361	1236366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010704
23112	NC_017530	CCT	2	6	1236378	1236383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010704
23113	NC_017530	CGA	2	6	1236399	1236404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010704
23114	NC_017530	AGC	2	6	1236406	1236411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010704
23115	NC_017530	GTT	2	6	1236420	1236425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010704
23116	NC_017530	CAGG	2	8	1236534	1236541	25 %	0 %	50 %	25 %	386010704
23117	NC_017530	CGC	2	6	1236561	1236566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010704
23118	NC_017530	GCT	3	9	1236588	1236596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010704
23119	NC_017530	ACA	2	6	1236599	1236604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010704
23120	NC_017530	CTGG	2	8	1236765	1236772	0 %	25 %	50 %	25 %	386010704
23121	NC_017530	GGCT	2	8	1236918	1236925	0 %	25 %	50 %	25 %	386010705
23122	NC_017530	GT	3	6	1236935	1236940	0 %	50 %	50 %	0 %	386010705
23123	NC_017530	GCG	2	6	1236981	1236986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010705
23124	NC_017530	GGTC	2	8	1237013	1237020	0 %	25 %	50 %	25 %	386010705
23125	NC_017530	CGA	2	6	1237037	1237042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010705
23126	NC_017530	GCCATC	2	12	1237047	1237058	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386010705
23127	NC_017530	CGG	2	6	1237082	1237087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010705
23128	NC_017530	GTG	3	9	1237116	1237124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010705
23129	NC_017530	TGC	2	6	1237186	1237191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010705
23130	NC_017530	GCG	2	6	1237232	1237237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010705
23131	NC_017530	GCC	2	6	1237253	1237258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010705
23132	NC_017530	CCG	2	6	1237264	1237269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010705
23133	NC_017530	GGC	2	6	1237319	1237324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010706
23134	NC_017530	TCG	2	6	1237408	1237413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23135	NC_017530	CAC	2	6	1237460	1237465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010706
23136	NC_017530	TCG	2	6	1237471	1237476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23137	NC_017530	ACG	2	6	1237522	1237527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23138	NC_017530	GC	3	6	1237562	1237567	0 %	0 %	50 %	50 %	386010706
23139	NC_017530	CG	3	6	1237628	1237633	0 %	0 %	50 %	50 %	386010706
23140	NC_017530	GGCG	2	8	1237655	1237662	0 %	0 %	75 %	25 %	386010706
23141	NC_017530	GCA	2	6	1237664	1237669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23142	NC_017530	CGC	2	6	1237718	1237723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010706
23143	NC_017530	TTA	2	6	1237777	1237782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386010706
23144	NC_017530	CGG	2	6	1237792	1237797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010706
23145	NC_017530	TGG	2	6	1237807	1237812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010706
23146	NC_017530	TGAC	2	8	1237813	1237820	25 %	25 %	25 %	25 %	386010706
23147	NC_017530	GCA	2	6	1237825	1237830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23148	NC_017530	CTG	2	6	1237851	1237856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23149	NC_017530	GCA	2	6	1237894	1237899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23150	NC_017530	TGC	2	6	1237948	1237953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010706
23151	NC_017530	CGGTG	2	10	1237970	1237979	0 %	20 %	60 %	20 %	386010706
23152	NC_017530	AG	3	6	1238003	1238008	50 %	0 %	50 %	0 %	386010706
23153	NC_017530	GAA	2	6	1238064	1238069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010706
23154	NC_017530	TGG	2	6	1238089	1238094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010706
23155	NC_017530	GGC	2	6	1238111	1238116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010706
23156	NC_017530	GGT	3	9	1238159	1238167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010706
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23181	NC_017530	CTG	2	6	1239161	1239166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010707
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23184	NC_017530	GCC	2	6	1239254	1239259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010707
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23187	NC_017530	CGA	3	9	1239349	1239357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010707
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23190	NC_017530	TGC	2	6	1239489	1239494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010707
23191	NC_017530	TCC	2	6	1239496	1239501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010707
23192	NC_017530	TGCG	2	8	1239597	1239604	0 %	25 %	50 %	25 %	386010707
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23194	NC_017530	CTG	2	6	1239695	1239700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010707
23195	NC_017530	GC	3	6	1239955	1239960	0 %	0 %	50 %	50 %	386010707
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23200	NC_017530	TGT	2	6	1240362	1240367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010707
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23202	NC_017530	TGC	2	6	1240479	1240484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010707
23203	NC_017530	GTG	2	6	1240487	1240492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010707
23204	NC_017530	CGCC	2	8	1240618	1240625	0 %	0 %	25 %	75 %	386010708
23205	NC_017530	TG	3	6	1240689	1240694	0 %	50 %	50 %	0 %	386010708
23206	NC_017530	CCTGC	2	10	1240781	1240790	0 %	20 %	20 %	60 %	386010708
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23208	NC_017530	GGCCTG	2	12	1240829	1240840	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010708
23209	NC_017530	GC	3	6	1240887	1240892	0 %	0 %	50 %	50 %	386010708
23210	NC_017530	ACC	2	6	1240950	1240955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010708
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23212	NC_017530	GTG	2	6	1241036	1241041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010708
23213	NC_017530	TGA	2	6	1241049	1241054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010708
23214	NC_017530	TCG	2	6	1241058	1241063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010708
23215	NC_017530	G	6	6	1241192	1241197	0 %	0 %	100 %	0 %	386010708
23216	NC_017530	CTGG	3	12	1241198	1241209	0 %	25 %	50 %	25 %	386010708
23217	NC_017530	TTG	2	6	1241210	1241215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010708
23218	NC_017530	GCT	3	9	1241248	1241256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010708
23219	NC_017530	CTG	2	6	1241279	1241284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010708
23220	NC_017530	GC	4	8	1241298	1241305	0 %	0 %	50 %	50 %	386010708
23221	NC_017530	GC	3	6	1241309	1241314	0 %	0 %	50 %	50 %	386010708
23222	NC_017530	GTGGC	2	10	1241337	1241346	0 %	20 %	60 %	20 %	386010708
23223	NC_017530	GGC	2	6	1241435	1241440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010708
23224	NC_017530	GCCA	2	8	1241465	1241472	25 %	0 %	25 %	50 %	386010708
23225	NC_017530	CGC	2	6	1241481	1241486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010708
23226	NC_017530	GCG	2	6	1241508	1241513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010708
23227	NC_017530	CGA	2	6	1241554	1241559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010708
23228	NC_017530	TGA	2	6	1241616	1241621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010708
23229	NC_017530	GTG	2	6	1241639	1241644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010708
23230	NC_017530	TGC	3	9	1241664	1241672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010708
23231	NC_017530	GAC	2	6	1241706	1241711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010708
23232	NC_017530	GCA	2	6	1241727	1241732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010709
23233	NC_017530	TGG	2	6	1241774	1241779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010709
23234	NC_017530	TCA	2	6	1241786	1241791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010709
23235	NC_017530	CTG	2	6	1241797	1241802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010709
23236	NC_017530	GTG	2	6	1241809	1241814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010709
23237	NC_017530	CAG	2	6	1241928	1241933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010709
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23240	NC_017530	TGG	2	6	1242199	1242204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010710
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23242	NC_017530	GGCC	2	8	1242242	1242249	0 %	0 %	50 %	50 %	386010710
23243	NC_017530	GGCCA	2	10	1242258	1242267	20 %	0 %	40 %	40 %	386010710
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23262	NC_017530	CTG	3	9	1243315	1243323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010712
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23272	NC_017530	TGC	2	6	1243768	1243773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010713
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23328	NC_017530	TGC	2	6	1247121	1247126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010717
23329	NC_017530	TGGGCT	2	12	1247191	1247202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386010717
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23332	NC_017530	ATC	2	6	1247464	1247469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010718
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23338	NC_017530	GCCG	2	8	1247729	1247736	0 %	0 %	50 %	50 %	386010718
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23342	NC_017530	AGGC	2	8	1247991	1247998	25 %	0 %	50 %	25 %	386010718
23343	NC_017530	CGT	2	6	1248005	1248010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010718
23344	NC_017530	GAT	2	6	1248015	1248020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010718
23345	NC_017530	GGT	2	6	1248092	1248097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010718
23346	NC_017530	TGG	2	6	1248127	1248132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010718
23347	NC_017530	TGG	2	6	1248190	1248195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010718
23348	NC_017530	CAGC	2	8	1248207	1248214	25 %	0 %	25 %	50 %	386010718
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23350	NC_017530	ATC	2	6	1248250	1248255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010718
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23453	NC_017530	TGC	2	6	1253502	1253507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010720
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23457	NC_017530	CGA	2	6	1253649	1253654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010720
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