MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_017530	CAG	2	6	1129174	1129179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010605
21003	NC_017530	GAT	2	6	1129512	1129517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010606
21004	NC_017530	TCC	2	6	1129532	1129537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010606
21005	NC_017530	CGA	2	6	1129602	1129607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010606
21006	NC_017530	TGC	2	6	1129654	1129659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010606
21007	NC_017530	CTG	3	9	1129702	1129710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010606
21008	NC_017530	TGCCTG	2	12	1129750	1129761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010606
21009	NC_017530	CTG	2	6	1129780	1129785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010606
21010	NC_017530	CTG	2	6	1129861	1129866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010606
21011	NC_017530	TGA	3	9	1129902	1129910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010606
21012	NC_017530	GC	3	6	1129987	1129992	0 %	0 %	50 %	50 %	386010607
21013	NC_017530	TTG	2	6	1130048	1130053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010607
21014	NC_017530	GGCCAA	2	12	1130071	1130082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21015	NC_017530	CTG	2	6	1130144	1130149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21016	NC_017530	AGC	2	6	1130303	1130308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21017	NC_017530	CAT	2	6	1130314	1130319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010607
21018	NC_017530	ACC	2	6	1130324	1130329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010607
21019	NC_017530	TGC	2	6	1130367	1130372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21020	NC_017530	TGC	2	6	1130515	1130520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21021	NC_017530	TGC	2	6	1130541	1130546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21022	NC_017530	CCG	2	6	1130577	1130582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010607
21023	NC_017530	TCGC	2	8	1130625	1130632	0 %	25 %	25 %	50 %	386010607
21024	NC_017530	ACC	2	6	1130735	1130740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010607
21025	NC_017530	TGA	2	6	1130751	1130756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010607
21026	NC_017530	CGC	2	6	1130896	1130901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010607
21027	NC_017530	ACG	2	6	1130916	1130921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21028	NC_017530	TGC	2	6	1130970	1130975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21029	NC_017530	CTG	2	6	1130993	1130998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21030	NC_017530	CG	3	6	1131094	1131099	0 %	0 %	50 %	50 %	386010607
21031	NC_017530	ATC	2	6	1131131	1131136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010607
21032	NC_017530	GCC	2	6	1131149	1131154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010607
21033	NC_017530	GTC	2	6	1131183	1131188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
21034	NC_017530	ATC	2	6	1131191	1131196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010607
21035	NC_017530	GCT	2	6	1131244	1131249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010607
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21037	NC_017530	GCA	2	6	1131313	1131318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010608
21038	NC_017530	CAC	2	6	1131328	1131333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010608
21039	NC_017530	TGG	2	6	1131369	1131374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010608
21040	NC_017530	TTGGCG	2	12	1131401	1131412	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386010608
21041	NC_017530	CAC	2	6	1131473	1131478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010608
21042	NC_017530	ACCTGC	2	12	1131489	1131500	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386010608
21043	NC_017530	GCT	2	6	1131539	1131544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010608
21044	NC_017530	CTG	2	6	1131554	1131559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010608
21045	NC_017530	GC	3	6	1131575	1131580	0 %	0 %	50 %	50 %	386010608
21046	NC_017530	GCC	2	6	1131602	1131607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010608
21047	NC_017530	GC	3	6	1131620	1131625	0 %	0 %	50 %	50 %	386010608
21048	NC_017530	GCT	2	6	1131637	1131642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010608
21049	NC_017530	CA	3	6	1131823	1131828	50 %	0 %	0 %	50 %	386010609
21050	NC_017530	CCA	2	6	1131851	1131856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010609
21051	NC_017530	CGC	2	6	1131893	1131898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010609
21052	NC_017530	ACCA	2	8	1131987	1131994	50 %	0 %	0 %	50 %	386010609
21053	NC_017530	CGG	2	6	1131995	1132000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010609
21054	NC_017530	TGTCA	2	10	1132031	1132040	20 %	40 %	20 %	20 %	386010609
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21057	NC_017530	CGC	2	6	1132180	1132185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010609
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21059	NC_017530	TGG	2	6	1132198	1132203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010609
21060	NC_017530	TAC	2	6	1132281	1132286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010609
21061	NC_017530	CGT	2	6	1132302	1132307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010609
21062	NC_017530	CGT	2	6	1132359	1132364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010609
21063	NC_017530	TGTC	2	8	1132413	1132420	0 %	50 %	25 %	25 %	386010610
21064	NC_017530	TTTGCT	2	12	1132456	1132467	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386010610
21065	NC_017530	TGG	2	6	1132485	1132490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010610
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21068	NC_017530	GC	3	6	1132557	1132562	0 %	0 %	50 %	50 %	386010610
21069	NC_017530	GGC	2	6	1132660	1132665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010610
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21074	NC_017530	CAT	2	6	1132882	1132887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010610
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21076	NC_017530	GCCGAC	2	12	1132943	1132954	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386010610
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21084	NC_017530	CAT	2	6	1133216	1133221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010610
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21086	NC_017530	TTG	2	6	1133340	1133345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010611
21087	NC_017530	CAT	2	6	1133432	1133437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010611
21088	NC_017530	ATG	2	6	1133445	1133450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010611
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21091	NC_017530	CGGC	2	8	1133508	1133515	0 %	0 %	50 %	50 %	386010611
21092	NC_017530	CGA	2	6	1133521	1133526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010611
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21096	NC_017530	CGGG	2	8	1133580	1133587	0 %	0 %	75 %	25 %	386010611
21097	NC_017530	TGC	2	6	1133649	1133654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010612
21098	NC_017530	GCAG	2	8	1133890	1133897	25 %	0 %	50 %	25 %	386010612
21099	NC_017530	GTTG	2	8	1133983	1133990	0 %	50 %	50 %	0 %	386010612
21100	NC_017530	CAGGTT	2	12	1134026	1134037	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386010612
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21102	NC_017530	CAA	2	6	1134080	1134085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010612
21103	NC_017530	CGAG	2	8	1134112	1134119	25 %	0 %	50 %	25 %	386010612
21104	NC_017530	GCC	2	6	1134142	1134147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010612
21105	NC_017530	ACA	2	6	1134199	1134204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010612
21106	NC_017530	CTT	2	6	1134232	1134237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010612
21107	NC_017530	AGC	2	6	1134240	1134245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010612
21108	NC_017530	GC	3	6	1134278	1134283	0 %	0 %	50 %	50 %	386010612
21109	NC_017530	TCGA	2	8	1134285	1134292	25 %	25 %	25 %	25 %	386010612
21110	NC_017530	GCA	2	6	1134310	1134315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010612
21111	NC_017530	CTG	2	6	1134361	1134366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010612
21112	NC_017530	GCCGGA	2	12	1134425	1134436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386010612
21113	NC_017530	GAT	2	6	1134449	1134454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010612
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21115	NC_017530	CGCA	2	8	1134523	1134530	25 %	0 %	25 %	50 %	386010613
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21121	NC_017530	GCA	2	6	1134684	1134689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010613
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21228	NC_017530	ACG	2	6	1140184	1140189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010620
21229	NC_017530	GTC	2	6	1140237	1140242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010620
21230	NC_017530	GC	3	6	1140246	1140251	0 %	0 %	50 %	50 %	386010620
21231	NC_017530	GCA	2	6	1140639	1140644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010621
21232	NC_017530	CG	3	6	1140672	1140677	0 %	0 %	50 %	50 %	386010621
21233	NC_017530	CAT	2	6	1140691	1140696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010621
21234	NC_017530	GCG	2	6	1140855	1140860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010621
21235	NC_017530	GTT	2	6	1140862	1140867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010621
21236	NC_017530	TGA	2	6	1140954	1140959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010621
21237	NC_017530	CGA	2	6	1141003	1141008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010621
21238	NC_017530	ACG	2	6	1141080	1141085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010621
21239	NC_017530	TCG	2	6	1141092	1141097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010621
21240	NC_017530	TGA	2	6	1141264	1141269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010621
21241	NC_017530	CTG	2	6	1141370	1141375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010621
21242	NC_017530	CTG	2	6	1141420	1141425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010622
21243	NC_017530	CCTGTT	2	12	1141470	1141481	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386010622
21244	NC_017530	GGTC	2	8	1141491	1141498	0 %	25 %	50 %	25 %	386010622
21245	NC_017530	GGT	2	6	1141501	1141506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010622
21246	NC_017530	GGC	3	9	1141510	1141518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010622
21247	NC_017530	GCT	2	6	1141524	1141529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010622
21248	NC_017530	GGTG	2	8	1141548	1141555	0 %	25 %	75 %	0 %	386010622
21249	NC_017530	TCG	3	9	1141571	1141579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010622
21250	NC_017530	CTG	2	6	1141681	1141686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010622
21251	NC_017530	GGT	2	6	1141701	1141706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010622
21252	NC_017530	CCG	2	6	1141748	1141753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010622
21253	NC_017530	TTG	2	6	1141826	1141831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010622
21254	NC_017530	GTGG	2	8	1141911	1141918	0 %	25 %	75 %	0 %	386010622
21255	NC_017530	TTTC	2	8	1141976	1141983	0 %	75 %	0 %	25 %	386010622
21256	NC_017530	GAC	2	6	1141987	1141992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010622
21257	NC_017530	ACC	2	6	1142101	1142106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010622
21258	NC_017530	TCC	2	6	1142221	1142226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010623
21259	NC_017530	GCT	4	12	1142243	1142254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010623
21260	NC_017530	AGC	2	6	1142289	1142294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010623
21261	NC_017530	GTCG	2	8	1142447	1142454	0 %	25 %	50 %	25 %	386010623
21262	NC_017530	CCGA	2	8	1142463	1142470	25 %	0 %	25 %	50 %	386010623
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21264	NC_017530	CCAT	2	8	1142566	1142573	25 %	25 %	0 %	50 %	386010623
21265	NC_017530	AC	3	6	1142575	1142580	50 %	0 %	0 %	50 %	386010623
21266	NC_017530	GGA	2	6	1142597	1142602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010623
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21269	NC_017530	GGC	2	6	1142717	1142722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010624
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21281	NC_017530	GGCCAA	2	12	1143275	1143286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010624
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21284	NC_017530	CTGG	2	8	1143368	1143375	0 %	25 %	50 %	25 %	386010625
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21288	NC_017530	GTC	2	6	1143481	1143486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010625
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21295	NC_017530	CAG	2	6	1143952	1143957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010626
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21299	NC_017530	CTG	2	6	1144102	1144107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010627
21300	NC_017530	CAC	2	6	1144155	1144160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010627
21301	NC_017530	CGA	2	6	1144203	1144208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010627
21302	NC_017530	GATC	2	8	1144224	1144231	25 %	25 %	25 %	25 %	386010627
21303	NC_017530	GC	3	6	1144281	1144286	0 %	0 %	50 %	50 %	386010627
21304	NC_017530	CCTG	2	8	1144341	1144348	0 %	25 %	25 %	50 %	386010627
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21309	NC_017530	CAT	2	6	1144518	1144523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010627
21310	NC_017530	CGC	2	6	1144566	1144571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010627
21311	NC_017530	TCA	2	6	1144604	1144609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010627
21312	NC_017530	ACCATC	2	12	1144648	1144659	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386010627
21313	NC_017530	TACC	2	8	1144722	1144729	25 %	25 %	0 %	50 %	386010627
21314	NC_017530	GTCAAG	2	12	1144759	1144770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386010627
21315	NC_017530	GAAG	2	8	1144812	1144819	50 %	0 %	50 %	0 %	386010627
21316	NC_017530	CATG	2	8	1144863	1144870	25 %	25 %	25 %	25 %	386010627
21317	NC_017530	CGAC	2	8	1144922	1144929	25 %	0 %	25 %	50 %	386010627
21318	NC_017530	CATG	2	8	1145010	1145017	25 %	25 %	25 %	25 %	386010627
21319	NC_017530	GC	3	6	1145039	1145044	0 %	0 %	50 %	50 %	386010627
21320	NC_017530	GATC	2	8	1145178	1145185	25 %	25 %	25 %	25 %	386010627
21321	NC_017530	CCG	2	6	1145253	1145258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010627
21322	NC_017530	CGA	2	6	1145398	1145403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010628
21323	NC_017530	CCGA	2	8	1145438	1145445	25 %	0 %	25 %	50 %	386010628
21324	NC_017530	CTG	2	6	1145501	1145506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010628
21325	NC_017530	CGTG	2	8	1145509	1145516	0 %	25 %	50 %	25 %	386010628
21326	NC_017530	TGC	2	6	1145548	1145553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010628
21327	NC_017530	CGG	2	6	1145593	1145598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010628
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21329	NC_017530	GCC	2	6	1145685	1145690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010628
21330	NC_017530	CCA	2	6	1145700	1145705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010628
21331	NC_017530	CAT	2	6	1145758	1145763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010628
21332	NC_017530	ATC	2	6	1145816	1145821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010628
21333	NC_017530	TGG	2	6	1145901	1145906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010628
21334	NC_017530	CAA	2	6	1145908	1145913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010628
21335	NC_017530	GCA	2	6	1145929	1145934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010628
21336	NC_017530	GCT	2	6	1146158	1146163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010629
21337	NC_017530	ATC	2	6	1146189	1146194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010629
21338	NC_017530	GT	3	6	1146210	1146215	0 %	50 %	50 %	0 %	386010629
21339	NC_017530	CAT	2	6	1146247	1146252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010629
21340	NC_017530	CGTG	2	8	1146259	1146266	0 %	25 %	50 %	25 %	386010629
21341	NC_017530	GCG	2	6	1146278	1146283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010629
21342	NC_017530	TGG	2	6	1146285	1146290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010629
21343	NC_017530	GAC	2	6	1146332	1146337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010629
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21345	NC_017530	GCC	2	6	1146413	1146418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010629
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21460	NC_017530	TCG	2	6	1153291	1153296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010635
21461	NC_017530	GTG	2	6	1153348	1153353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010635
21462	NC_017530	GGGTCT	2	12	1153367	1153378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386010635
21463	NC_017530	TTC	2	6	1153392	1153397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010635
21464	NC_017530	CGA	2	6	1153415	1153420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010635
21465	NC_017530	CTT	2	6	1153512	1153517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010635
21466	NC_017530	TGA	2	6	1153532	1153537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010635
21467	NC_017530	GTT	2	6	1153563	1153568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010635
21468	NC_017530	TGC	2	6	1153593	1153598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010635
21469	NC_017530	GCA	2	6	1153679	1153684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010635
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21472	NC_017530	CAGC	2	8	1153842	1153849	25 %	0 %	25 %	50 %	386010635
21473	NC_017530	GCCTT	2	10	1153894	1153903	0 %	40 %	20 %	40 %	386010635
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21476	NC_017530	CGG	2	6	1153991	1153996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010635
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21478	NC_017530	GTC	2	6	1154653	1154658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010636
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21483	NC_017530	ATG	2	6	1154854	1154859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010637
21484	NC_017530	CTT	2	6	1154880	1154885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010637
21485	NC_017530	CAC	2	6	1155013	1155018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010637
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21488	NC_017530	TCG	2	6	1155118	1155123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010637
21489	NC_017530	GCA	2	6	1155179	1155184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010637
21490	NC_017530	CTG	2	6	1155213	1155218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010637
21491	NC_017530	CCGAG	2	10	1155296	1155305	20 %	0 %	40 %	40 %	386010637
21492	NC_017530	CAG	2	6	1155333	1155338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010637
21493	NC_017530	GC	4	8	1155374	1155381	0 %	0 %	50 %	50 %	386010637
21494	NC_017530	CGG	2	6	1155431	1155436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010637
21495	NC_017530	GGGC	2	8	1155468	1155475	0 %	0 %	75 %	25 %	386010637
21496	NC_017530	TGGTGA	2	12	1155596	1155607	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386010637
21497	NC_017530	TGG	2	6	1155661	1155666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010637
21498	NC_017530	GGGT	2	8	1155683	1155690	0 %	25 %	75 %	0 %	386010637
21499	NC_017530	TGC	2	6	1155905	1155910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010638
21500	NC_017530	CGA	2	6	1155990	1155995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010638

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