MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017530	CGG	2	6	1051655	1051660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010535
19503	NC_017530	GT	3	6	1051698	1051703	0 %	50 %	50 %	0 %	386010535
19504	NC_017530	TCA	2	6	1051732	1051737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
19505	NC_017530	CGA	2	6	1051778	1051783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19506	NC_017530	ACC	2	6	1051861	1051866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010535
19507	NC_017530	GTG	2	6	1051884	1051889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010535
19508	NC_017530	GCCACG	2	12	1051900	1051911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386010535
19509	NC_017530	ATC	2	6	1051929	1051934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
19510	NC_017530	CG	3	6	1051959	1051964	0 %	0 %	50 %	50 %	386010535
19511	NC_017530	ACG	2	6	1051981	1051986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19512	NC_017530	TCG	2	6	1051990	1051995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19513	NC_017530	TCA	2	6	1052047	1052052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
19514	NC_017530	TTC	2	6	1052073	1052078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010535
19515	NC_017530	GCGCC	2	10	1052136	1052145	0 %	0 %	40 %	60 %	386010535
19516	NC_017530	TTC	2	6	1052352	1052357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010535
19517	NC_017530	TCC	2	6	1052358	1052363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010535
19518	NC_017530	AGC	2	6	1052371	1052376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19519	NC_017530	CAT	2	6	1052399	1052404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
19520	NC_017530	CCG	2	6	1052504	1052509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010535
19521	NC_017530	GCA	2	6	1052558	1052563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19522	NC_017530	GAA	2	6	1052571	1052576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010535
19523	NC_017530	TTC	2	6	1052592	1052597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010535
19524	NC_017530	GCA	2	6	1052605	1052610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19525	NC_017530	CAT	2	6	1052615	1052620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010535
19526	NC_017530	CGGT	2	8	1052629	1052636	0 %	25 %	50 %	25 %	386010535
19527	NC_017530	TGC	2	6	1052638	1052643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010535
19528	NC_017530	GCC	2	6	1052662	1052667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010535
19529	NC_017530	GAAG	2	8	1052669	1052676	50 %	0 %	50 %	0 %	386010535
19530	NC_017530	GC	3	6	1052721	1052726	0 %	0 %	50 %	50 %	386010535
19531	NC_017530	AAG	3	9	1052745	1052753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010535
19532	NC_017530	CGG	3	9	1052798	1052806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010535
19533	NC_017530	ACCT	2	8	1052814	1052821	25 %	25 %	0 %	50 %	386010535
19534	NC_017530	TCG	2	6	1053129	1053134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010536
19535	NC_017530	ATC	2	6	1053144	1053149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010536
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19538	NC_017530	GC	3	6	1053328	1053333	0 %	0 %	50 %	50 %	386010536
19539	NC_017530	TCG	2	6	1053378	1053383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010536
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19541	NC_017530	GCA	2	6	1053400	1053405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010536
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19543	NC_017530	GCA	2	6	1053583	1053588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010536
19544	NC_017530	TGT	2	6	1053715	1053720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010536
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19546	NC_017530	CGT	2	6	1053904	1053909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010536
19547	NC_017530	TCA	2	6	1053925	1053930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010536
19548	NC_017530	TTC	2	6	1054002	1054007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010536
19549	NC_017530	GCG	2	6	1054059	1054064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010536
19550	NC_017530	GGC	2	6	1054076	1054081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010536
19551	NC_017530	G	6	6	1054090	1054095	0 %	0 %	100 %	0 %	386010536
19552	NC_017530	GAG	2	6	1054097	1054102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010536
19553	NC_017530	TGA	2	6	1054307	1054312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010537
19554	NC_017530	GCC	3	9	1054340	1054348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010537
19555	NC_017530	TGAC	2	8	1054409	1054416	25 %	25 %	25 %	25 %	386010537
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19557	NC_017530	GGTCC	2	10	1054623	1054632	0 %	20 %	40 %	40 %	386010538
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19565	NC_017530	GCGCC	2	10	1054881	1054890	0 %	0 %	40 %	60 %	386010538
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19581	NC_017530	GC	3	6	1055547	1055552	0 %	0 %	50 %	50 %	386010538
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19603	NC_017530	CGTA	2	8	1056632	1056639	25 %	25 %	25 %	25 %	386010539
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19846	NC_017530	GCT	2	6	1070020	1070025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010549
19847	NC_017530	CAC	2	6	1070041	1070046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010549
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19944	NC_017530	GC	3	6	1074707	1074712	0 %	0 %	50 %	50 %	386010554
19945	NC_017530	GGT	2	6	1074875	1074880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010555
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19949	NC_017530	ATC	2	6	1075054	1075059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010555
19950	NC_017530	TGC	2	6	1075066	1075071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010555
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19952	NC_017530	G	7	7	1075097	1075103	0 %	0 %	100 %	0 %	386010555
19953	NC_017530	CGA	2	6	1075115	1075120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010555
19954	NC_017530	GGT	2	6	1075184	1075189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010555
19955	NC_017530	CAA	2	6	1075229	1075234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010555
19956	NC_017530	CCG	2	6	1075235	1075240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010555
19957	NC_017530	CTG	2	6	1075255	1075260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010555
19958	NC_017530	GCAGGG	2	12	1075298	1075309	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386010555
19959	NC_017530	CGCC	2	8	1075334	1075341	0 %	0 %	25 %	75 %	386010555
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