MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_017530	TCA	2	6	998808	998813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010485
18503	NC_017530	ATG	2	6	998979	998984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010485
18504	NC_017530	GGC	2	6	999020	999025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010485
18505	NC_017530	TGG	2	6	999054	999059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010485
18506	NC_017530	ACC	2	6	999077	999082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010485
18507	NC_017530	AAGGTG	2	12	999083	999094	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386010485
18508	NC_017530	CCA	2	6	999099	999104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010485
18509	NC_017530	GCC	2	6	999236	999241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010485
18510	NC_017530	GGCC	2	8	999301	999308	0 %	0 %	50 %	50 %	386010485
18511	NC_017530	CG	3	6	999376	999381	0 %	0 %	50 %	50 %	386010486
18512	NC_017530	CAT	2	6	999426	999431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010486
18513	NC_017530	GGGC	2	8	999443	999450	0 %	0 %	75 %	25 %	386010486
18514	NC_017530	TGC	2	6	999461	999466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010486
18515	NC_017530	CCAGC	2	10	999486	999495	20 %	0 %	20 %	60 %	386010486
18516	NC_017530	TGCG	2	8	999560	999567	0 %	25 %	50 %	25 %	386010486
18517	NC_017530	CGC	2	6	999590	999595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010486
18518	NC_017530	GTG	2	6	999616	999621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010486
18519	NC_017530	CCG	2	6	999623	999628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010486
18520	NC_017530	CTG	2	6	999679	999684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010486
18521	NC_017530	GC	3	6	999706	999711	0 %	0 %	50 %	50 %	386010486
18522	NC_017530	TGC	2	6	999827	999832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010486
18523	NC_017530	CGA	2	6	999837	999842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010486
18524	NC_017530	TGG	2	6	999926	999931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010486
18525	NC_017530	TGGCGC	2	12	999953	999964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010486
18526	NC_017530	CTG	2	6	1000039	1000044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010486
18527	NC_017530	AAC	2	6	1000064	1000069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010486
18528	NC_017530	CCG	2	6	1000075	1000080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010486
18529	NC_017530	GCT	2	6	1000148	1000153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18530	NC_017530	TGC	2	6	1000162	1000167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18531	NC_017530	GCGGTA	2	12	1000179	1000190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386010487
18532	NC_017530	CAG	2	6	1000254	1000259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18533	NC_017530	GCC	2	6	1000286	1000291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010487
18534	NC_017530	ATG	2	6	1000297	1000302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010487
18535	NC_017530	GTT	3	9	1000376	1000384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010487
18536	NC_017530	GGCT	2	8	1000394	1000401	0 %	25 %	50 %	25 %	386010487
18537	NC_017530	TGC	2	6	1000430	1000435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18538	NC_017530	CGG	2	6	1000442	1000447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010487
18539	NC_017530	GCT	2	6	1000493	1000498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18540	NC_017530	GC	3	6	1000547	1000552	0 %	0 %	50 %	50 %	386010487
18541	NC_017530	TGGGGC	2	12	1000555	1000566	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386010487
18542	NC_017530	CGG	2	6	1000570	1000575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010487
18543	NC_017530	GTCG	2	8	1000640	1000647	0 %	25 %	50 %	25 %	386010487
18544	NC_017530	TTG	2	6	1000668	1000673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010487
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18546	NC_017530	TGC	2	6	1000724	1000729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
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18551	NC_017530	GC	3	6	1000855	1000860	0 %	0 %	50 %	50 %	386010487
18552	NC_017530	TGC	2	6	1000888	1000893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18553	NC_017530	GCC	2	6	1000918	1000923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010487
18554	NC_017530	TGC	2	6	1000924	1000929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010487
18555	NC_017530	GGT	2	6	1000990	1000995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010488
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18566	NC_017530	GGC	2	6	1001452	1001457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010488
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18588	NC_017530	TCAGCG	2	12	1002346	1002357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386010489
18589	NC_017530	C	6	6	1002394	1002399	0 %	0 %	0 %	100 %	386010489
18590	NC_017530	CCA	2	6	1002416	1002421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010489
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18596	NC_017530	CTC	2	6	1003328	1003333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010490
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18601	NC_017530	CTA	3	9	1003498	1003506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010490
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18733	NC_017530	TGC	2	6	1011243	1011248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010498
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18961	NC_017530	TCCGG	2	10	1022892	1022901	0 %	20 %	40 %	40 %	386010512
18962	NC_017530	GCT	2	6	1022979	1022984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010512
18963	NC_017530	TCGA	2	8	1023015	1023022	25 %	25 %	25 %	25 %	386010512
18964	NC_017530	GCT	4	12	1023054	1023065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010512
18965	NC_017530	CTT	2	6	1023080	1023085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010512
18966	NC_017530	GCT	2	6	1023087	1023092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010512
18967	NC_017530	GAC	2	6	1023144	1023149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010513
18968	NC_017530	TTC	2	6	1023202	1023207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010513
18969	NC_017530	TGA	2	6	1023245	1023250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010513
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18973	NC_017530	GCAA	2	8	1023518	1023525	50 %	0 %	25 %	25 %	386010513
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18984	NC_017530	CAA	2	6	1023858	1023863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010513
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18989	NC_017530	CTG	2	6	1024108	1024113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010513
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18992	NC_017530	CG	3	6	1024148	1024153	0 %	0 %	50 %	50 %	386010513
18993	NC_017530	CGA	2	6	1024155	1024160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010513
18994	NC_017530	CGC	2	6	1024210	1024215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010513
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18997	NC_017530	GCGA	2	8	1024368	1024375	25 %	0 %	50 %	25 %	386010514
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18999	NC_017530	GGGC	2	8	1024410	1024417	0 %	0 %	75 %	25 %	386010514
19000	NC_017530	GCTTG	2	10	1024427	1024436	0 %	40 %	40 %	20 %	386010514

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