MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_017530	GCG	2	6	919825	919830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010429
17002	NC_017530	GAT	2	6	919953	919958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010429
17003	NC_017530	GGC	2	6	919976	919981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010429
17004	NC_017530	TTC	2	6	920052	920057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010429
17005	NC_017530	TGG	2	6	920068	920073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010429
17006	NC_017530	TCA	2	6	920092	920097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010429
17007	NC_017530	AGG	2	6	920218	920223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010429
17008	NC_017530	TCGAC	2	10	920239	920248	20 %	20 %	20 %	40 %	386010429
17009	NC_017530	GCG	2	6	920280	920285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010429
17010	NC_017530	CGC	2	6	920291	920296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010429
17011	NC_017530	GCG	2	6	920308	920313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010429
17012	NC_017530	GCGG	2	8	920320	920327	0 %	0 %	75 %	25 %	386010429
17013	NC_017530	CGG	2	6	920342	920347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010429
17014	NC_017530	G	9	9	920355	920363	0 %	0 %	100 %	0 %	386010429
17015	NC_017530	GTT	2	6	920372	920377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010429
17016	NC_017530	CGC	2	6	920631	920636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010430
17017	NC_017530	CGGG	2	8	920891	920898	0 %	0 %	75 %	25 %	386010431
17018	NC_017530	CAG	2	6	920901	920906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010431
17019	NC_017530	TACT	2	8	920929	920936	25 %	50 %	0 %	25 %	386010431
17020	NC_017530	ATC	2	6	920970	920975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010431
17021	NC_017530	GTG	2	6	921313	921318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010432
17022	NC_017530	CAT	2	6	921371	921376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010432
17023	NC_017530	CTGCAC	2	12	921444	921455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386010432
17024	NC_017530	GAC	2	6	921459	921464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010432
17025	NC_017530	GCTG	2	8	921541	921548	0 %	25 %	50 %	25 %	386010432
17026	NC_017530	GAA	2	6	921558	921563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010432
17027	NC_017530	CTGCGG	2	12	921569	921580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010432
17028	NC_017530	GTT	2	6	921644	921649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010432
17029	NC_017530	CCG	2	6	921671	921676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010432
17030	NC_017530	CGA	2	6	921806	921811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010432
17031	NC_017530	CGTG	2	8	921830	921837	0 %	25 %	50 %	25 %	386010432
17032	NC_017530	CGT	2	6	921964	921969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17033	NC_017530	TCG	2	6	921977	921982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17034	NC_017530	CCG	2	6	921986	921991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
17035	NC_017530	TGA	2	6	921998	922003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010433
17036	NC_017530	GC	3	6	922094	922099	0 %	0 %	50 %	50 %	386010433
17037	NC_017530	GCC	2	6	922120	922125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
17038	NC_017530	CAA	2	6	922134	922139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010433
17039	NC_017530	GCA	2	6	922168	922173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17040	NC_017530	TGC	2	6	922179	922184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17041	NC_017530	CTA	2	6	922200	922205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010433
17042	NC_017530	GC	3	6	922230	922235	0 %	0 %	50 %	50 %	386010433
17043	NC_017530	CGC	2	6	922352	922357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
17044	NC_017530	AAC	2	6	922360	922365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010433
17045	NC_017530	CTGG	2	8	922366	922373	0 %	25 %	50 %	25 %	386010433
17046	NC_017530	GCC	2	6	922436	922441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
17047	NC_017530	ACCT	2	8	922486	922493	25 %	25 %	0 %	50 %	386010433
17048	NC_017530	CCG	2	6	922593	922598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010433
17049	NC_017530	CAG	2	6	922630	922635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17050	NC_017530	AGC	2	6	922640	922645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17051	NC_017530	CAG	2	6	922657	922662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010433
17052	NC_017530	GC	3	6	922753	922758	0 %	0 %	50 %	50 %	386010434
17053	NC_017530	GCA	2	6	922854	922859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010434
17054	NC_017530	GAACAC	2	12	922933	922944	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386010434
17055	NC_017530	GCCC	2	8	922949	922956	0 %	0 %	25 %	75 %	386010434
17056	NC_017530	CTT	2	6	923091	923096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010434
17057	NC_017530	ATC	2	6	923126	923131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010434
17058	NC_017530	GCA	2	6	923168	923173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010434
17059	NC_017530	TCA	2	6	923220	923225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010434
17060	NC_017530	GAA	2	6	923266	923271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010434
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17062	NC_017530	CAC	2	6	923407	923412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010434
17063	NC_017530	TGC	2	6	923426	923431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010434
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17067	NC_017530	TTG	2	6	923678	923683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010434
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17070	NC_017530	TGA	2	6	923805	923810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010434
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17072	NC_017530	GGCC	2	8	923910	923917	0 %	0 %	50 %	50 %	386010434
17073	NC_017530	CAG	2	6	923974	923979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010434
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17078	NC_017530	GAT	3	9	924112	924120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010434
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17086	NC_017530	CGACC	2	10	924387	924396	20 %	0 %	20 %	60 %	386010434
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17088	NC_017530	TGGCG	2	10	924495	924504	0 %	20 %	60 %	20 %	386010434
17089	NC_017530	GAT	2	6	924568	924573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010434
17090	NC_017530	TTC	2	6	924574	924579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010434
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17094	NC_017530	GTCG	2	8	924808	924815	0 %	25 %	50 %	25 %	386010434
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17099	NC_017530	GC	3	6	925255	925260	0 %	0 %	50 %	50 %	386010435
17100	NC_017530	CAT	2	6	925289	925294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010435
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17103	NC_017530	CGA	2	6	925514	925519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010435
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17105	NC_017530	CGTG	2	8	925586	925593	0 %	25 %	50 %	25 %	386010435
17106	NC_017530	CGA	2	6	925601	925606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010435
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17123	NC_017530	TGC	2	6	926591	926596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010437
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