MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017530	GCC	2	6	867097	867102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010378
16003	NC_017530	GGC	2	6	867125	867130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010378
16004	NC_017530	TGG	2	6	867219	867224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010378
16005	NC_017530	TGA	2	6	867250	867255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010378
16006	NC_017530	CCT	2	6	867454	867459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010379
16007	NC_017530	GTC	2	6	867491	867496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010379
16008	NC_017530	CCA	2	6	867502	867507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010379
16009	NC_017530	CTGC	2	8	867556	867563	0 %	25 %	25 %	50 %	386010379
16010	NC_017530	CAG	2	6	867638	867643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010379
16011	NC_017530	CAGGC	2	10	867671	867680	20 %	0 %	40 %	40 %	386010379
16012	NC_017530	TTG	2	6	867756	867761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010379
16013	NC_017530	CAC	2	6	867770	867775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010379
16014	NC_017530	CTT	2	6	867784	867789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010379
16015	NC_017530	GTT	2	6	867824	867829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010379
16016	NC_017530	TCG	2	6	867912	867917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010379
16017	NC_017530	TCA	2	6	867931	867936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010379
16018	NC_017530	GC	3	6	867941	867946	0 %	0 %	50 %	50 %	386010379
16019	NC_017530	CGC	2	6	868015	868020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010379
16020	NC_017530	GAT	2	6	868094	868099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010379
16021	NC_017530	AGC	2	6	868159	868164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010379
16022	NC_017530	CAC	2	6	868166	868171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010379
16023	NC_017530	TTG	2	6	868212	868217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010379
16024	NC_017530	CGA	2	6	868264	868269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010379
16025	NC_017530	TGG	2	6	868276	868281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010379
16026	NC_017530	CAGC	2	8	868312	868319	25 %	0 %	25 %	50 %	386010379
16027	NC_017530	GCA	2	6	868320	868325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010379
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16029	NC_017530	CGA	2	6	868453	868458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010379
16030	NC_017530	GCA	2	6	868564	868569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010380
16031	NC_017530	GC	3	6	868614	868619	0 %	0 %	50 %	50 %	386010380
16032	NC_017530	GC	3	6	868621	868626	0 %	0 %	50 %	50 %	386010380
16033	NC_017530	GAT	2	6	868721	868726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010380
16034	NC_017530	GCC	3	9	868754	868762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010380
16035	NC_017530	TCG	2	6	868800	868805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010380
16036	NC_017530	CCA	2	6	868810	868815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010380
16037	NC_017530	GAA	2	6	868838	868843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010380
16038	NC_017530	GGT	2	6	868886	868891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010380
16039	NC_017530	CAA	2	6	868898	868903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010380
16040	NC_017530	CGT	2	6	868909	868914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010380
16041	NC_017530	CTTCTG	2	12	869180	869191	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386010381
16042	NC_017530	TCA	2	6	869230	869235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010381
16043	NC_017530	CGA	2	6	869249	869254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010381
16044	NC_017530	GAT	2	6	869292	869297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010381
16045	NC_017530	CAGG	2	8	869339	869346	25 %	0 %	50 %	25 %	386010381
16046	NC_017530	CGC	2	6	869396	869401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010381
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16048	NC_017530	TGA	2	6	869426	869431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010381
16049	NC_017530	ACG	2	6	869470	869475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010381
16050	NC_017530	CGAA	2	8	869476	869483	50 %	0 %	25 %	25 %	386010381
16051	NC_017530	ATG	2	6	869494	869499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010381
16052	NC_017530	TGA	3	9	869531	869539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010381
16053	NC_017530	CTT	2	6	869645	869650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010381
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16055	NC_017530	GGC	3	9	869696	869704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010381
16056	NC_017530	TTC	2	6	869902	869907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010382
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16060	NC_017530	GACAG	2	10	870062	870071	40 %	0 %	40 %	20 %	386010382
16061	NC_017530	GTGC	2	8	870073	870080	0 %	25 %	50 %	25 %	386010382
16062	NC_017530	CGG	2	6	870144	870149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010382
16063	NC_017530	GTC	2	6	870160	870165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010382
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16065	NC_017530	GAT	2	6	870247	870252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010382
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16067	NC_017530	ACC	2	6	870301	870306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010382
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16082	NC_017530	A	6	6	871283	871288	100 %	0 %	0 %	0 %	386010383
16083	NC_017530	GACA	2	8	871302	871309	50 %	0 %	25 %	25 %	386010383
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16086	NC_017530	CCAGT	2	10	871461	871470	20 %	20 %	20 %	40 %	386010383
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16088	NC_017530	GGT	2	6	871497	871502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010383
16089	NC_017530	GCC	3	9	871518	871526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010383
16090	NC_017530	GTG	2	6	871579	871584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010383
16091	NC_017530	TGCG	2	8	871604	871611	0 %	25 %	50 %	25 %	386010383
16092	NC_017530	TCG	2	6	871702	871707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010383
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16100	NC_017530	GGGC	2	8	872025	872032	0 %	0 %	75 %	25 %	386010384
16101	NC_017530	CACC	2	8	872041	872048	25 %	0 %	0 %	75 %	386010384
16102	NC_017530	GTT	2	6	872082	872087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010384
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16109	NC_017530	TAA	2	6	872216	872221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386010384
16110	NC_017530	CG	3	6	872262	872267	0 %	0 %	50 %	50 %	386010384
16111	NC_017530	GCCA	2	8	872298	872305	25 %	0 %	25 %	50 %	386010384
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16117	NC_017530	AGGT	2	8	872631	872638	25 %	25 %	50 %	0 %	386010385
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16119	NC_017530	TGG	2	6	872718	872723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010385
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16471	NC_017530	AGC	2	6	893383	893388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010403
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16474	NC_017530	TGG	2	6	893588	893593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010403
16475	NC_017530	GGGC	2	8	893633	893640	0 %	0 %	75 %	25 %	386010403
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16477	NC_017530	GAC	2	6	893682	893687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010403
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