MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017530	GCT	2	6	843209	843214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010357
15502	NC_017530	TTC	2	6	843279	843284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010357
15503	NC_017530	TGC	2	6	843301	843306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010357
15504	NC_017530	GC	3	6	843342	843347	0 %	0 %	50 %	50 %	386010357
15505	NC_017530	CCAC	2	8	843361	843368	25 %	0 %	0 %	75 %	386010357
15506	NC_017530	GT	3	6	843490	843495	0 %	50 %	50 %	0 %	386010357
15507	NC_017530	CCTGTT	2	12	843518	843529	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386010357
15508	NC_017530	GGC	2	6	843542	843547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010357
15509	NC_017530	CTT	2	6	843554	843559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010357
15510	NC_017530	GGC	2	6	843561	843566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010357
15511	NC_017530	GTG	2	6	843681	843686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010357
15512	NC_017530	TCT	2	6	843775	843780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010357
15513	NC_017530	GGC	2	6	843801	843806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010357
15514	NC_017530	GCGCT	2	10	843811	843820	0 %	20 %	40 %	40 %	386010357
15515	NC_017530	GTTC	2	8	843871	843878	0 %	50 %	25 %	25 %	386010357
15516	NC_017530	GTT	2	6	843893	843898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010357
15517	NC_017530	TGT	2	6	844282	844287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010358
15518	NC_017530	CAT	2	6	844382	844387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010358
15519	NC_017530	GCC	2	6	844401	844406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010358
15520	NC_017530	ATG	2	6	844410	844415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010358
15521	NC_017530	CTG	2	6	844439	844444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15522	NC_017530	CTAT	2	8	844465	844472	25 %	50 %	0 %	25 %	386010358
15523	NC_017530	CTG	2	6	844473	844478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15524	NC_017530	GCT	2	6	844538	844543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15525	NC_017530	TGC	2	6	844549	844554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15526	NC_017530	GCCTGG	2	12	844555	844566	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010358
15527	NC_017530	CAT	2	6	844586	844591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010358
15528	NC_017530	CCA	2	6	844660	844665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010358
15529	NC_017530	A	6	6	844822	844827	100 %	0 %	0 %	0 %	386010358
15530	NC_017530	TTC	2	6	844845	844850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010358
15531	NC_017530	TTC	2	6	844884	844889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010358
15532	NC_017530	TTC	2	6	844893	844898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010358
15533	NC_017530	GTG	2	6	844905	844910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010358
15534	NC_017530	GCT	2	6	844916	844921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15535	NC_017530	CCA	2	6	844933	844938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010358
15536	NC_017530	TGGCG	2	10	844955	844964	0 %	20 %	60 %	20 %	386010358
15537	NC_017530	GGT	2	6	844979	844984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010358
15538	NC_017530	GCTGG	2	10	845015	845024	0 %	20 %	60 %	20 %	386010358
15539	NC_017530	TGG	2	6	845071	845076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010358
15540	NC_017530	GCT	2	6	845105	845110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15541	NC_017530	GCT	2	6	845123	845128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15542	NC_017530	GCT	2	6	845135	845140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010358
15543	NC_017530	GGT	2	6	845141	845146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010358
15544	NC_017530	G	7	7	845162	845168	0 %	0 %	100 %	0 %	386010358
15545	NC_017530	GGC	2	6	845291	845296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010358
15546	NC_017530	CGC	2	6	845425	845430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010359
15547	NC_017530	AGCGC	2	10	845560	845569	20 %	0 %	40 %	40 %	386010359
15548	NC_017530	CGGT	2	8	845578	845585	0 %	25 %	50 %	25 %	386010359
15549	NC_017530	CTG	2	6	845623	845628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15550	NC_017530	TGC	2	6	845688	845693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15551	NC_017530	GCA	2	6	845724	845729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15552	NC_017530	CAC	2	6	845769	845774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010359
15553	NC_017530	CAG	3	9	845785	845793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15554	NC_017530	GCA	2	6	845811	845816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15555	NC_017530	GGT	2	6	845833	845838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010359
15556	NC_017530	GTT	2	6	845931	845936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010359
15557	NC_017530	GAC	2	6	845982	845987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15558	NC_017530	CAG	2	6	846043	846048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15559	NC_017530	CG	4	8	846069	846076	0 %	0 %	50 %	50 %	386010359
15560	NC_017530	GCCCA	2	10	846077	846086	20 %	0 %	20 %	60 %	386010359
15561	NC_017530	GCC	2	6	846091	846096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010359
15562	NC_017530	GGT	2	6	846123	846128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010359
15563	NC_017530	GGCT	2	8	846135	846142	0 %	25 %	50 %	25 %	386010359
15564	NC_017530	TCA	2	6	846203	846208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010359
15565	NC_017530	GCCAG	2	10	846228	846237	20 %	0 %	40 %	40 %	386010359
15566	NC_017530	TG	3	6	846243	846248	0 %	50 %	50 %	0 %	386010359
15567	NC_017530	TGGC	2	8	846251	846258	0 %	25 %	50 %	25 %	386010359
15568	NC_017530	CTG	2	6	846274	846279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010359
15569	NC_017530	CCAG	2	8	846318	846325	25 %	0 %	25 %	50 %	386010359
15570	NC_017530	CAG	2	6	846491	846496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010360
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15572	NC_017530	CTG	2	6	846524	846529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010360
15573	NC_017530	GAG	2	6	846560	846565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010360
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15575	NC_017530	ATC	2	6	846663	846668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010360
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15578	NC_017530	CAA	2	6	846734	846739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010360
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15590	NC_017530	CGG	2	6	847568	847573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010361
15591	NC_017530	GCG	2	6	847623	847628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010361
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15599	NC_017530	TGCG	2	8	848135	848142	0 %	25 %	50 %	25 %	386010362
15600	NC_017530	GGC	2	6	848152	848157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010362
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15606	NC_017530	GCCG	2	8	848565	848572	0 %	0 %	50 %	50 %	386010362
15607	NC_017530	GCGG	2	8	848628	848635	0 %	0 %	75 %	25 %	386010362
15608	NC_017530	GTG	2	6	848689	848694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010362
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15610	NC_017530	TGT	2	6	848896	848901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010363
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15614	NC_017530	CGA	2	6	849143	849148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010363
15615	NC_017530	CGGCC	2	10	849164	849173	0 %	0 %	40 %	60 %	386010363
15616	NC_017530	GCA	2	6	849200	849205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010363
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15623	NC_017530	GCG	2	6	849430	849435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010363
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15630	NC_017530	TCA	2	6	849754	849759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010363
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15742	NC_017530	GC	3	6	854422	854427	0 %	0 %	50 %	50 %	386010366
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