MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida BIRD-1 chromosome

Total Repeats: 107806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017530	CCCG	2	8	818202	818209	0 %	0 %	25 %	75 %	386010332
15002	NC_017530	CCA	2	6	818229	818234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010332
15003	NC_017530	CGC	2	6	818311	818316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010332
15004	NC_017530	ACC	2	6	818321	818326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010332
15005	NC_017530	CG	3	6	818342	818347	0 %	0 %	50 %	50 %	386010332
15006	NC_017530	GTT	2	6	818385	818390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010332
15007	NC_017530	CGG	2	6	818535	818540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010332
15008	NC_017530	TTC	2	6	818735	818740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010333
15009	NC_017530	GCATG	2	10	818749	818758	20 %	20 %	40 %	20 %	386010333
15010	NC_017530	CCA	2	6	818839	818844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386010333
15011	NC_017530	GGC	2	6	818860	818865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010333
15012	NC_017530	CTG	2	6	818868	818873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010333
15013	NC_017530	AGG	2	6	818903	818908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010333
15014	NC_017530	GTGG	2	8	818933	818940	0 %	25 %	75 %	0 %	386010333
15015	NC_017530	CAA	2	6	818957	818962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010333
15016	NC_017530	AGT	2	6	819214	819219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010334
15017	NC_017530	CTG	2	6	819323	819328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15018	NC_017530	GCCCA	2	10	819398	819407	20 %	0 %	20 %	60 %	386010334
15019	NC_017530	CAG	2	6	819416	819421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15020	NC_017530	AGCC	2	8	819433	819440	25 %	0 %	25 %	50 %	386010334
15021	NC_017530	GCC	2	6	819533	819538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010334
15022	NC_017530	GCC	2	6	819542	819547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010334
15023	NC_017530	TCA	2	6	819573	819578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010334
15024	NC_017530	C	6	6	819602	819607	0 %	0 %	0 %	100 %	386010334
15025	NC_017530	AGC	2	6	819633	819638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15026	NC_017530	TGG	2	6	819664	819669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010334
15027	NC_017530	GCG	3	9	819904	819912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010334
15028	NC_017530	GCA	2	6	819931	819936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15029	NC_017530	CAGC	2	8	820090	820097	25 %	0 %	25 %	50 %	386010334
15030	NC_017530	TCG	2	6	820110	820115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15031	NC_017530	GCA	2	6	820276	820281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15032	NC_017530	CAG	2	6	820286	820291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15033	NC_017530	TCG	2	6	820308	820313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15034	NC_017530	AAG	3	9	820314	820322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010334
15035	NC_017530	TTC	2	6	820376	820381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010334
15036	NC_017530	GCC	2	6	820484	820489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010334
15037	NC_017530	TGT	2	6	820519	820524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010334
15038	NC_017530	CAG	2	6	820565	820570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15039	NC_017530	GTG	2	6	820572	820577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010334
15040	NC_017530	TCG	2	6	820578	820583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15041	NC_017530	GCA	2	6	820609	820614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15042	NC_017530	CGA	2	6	820631	820636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010334
15043	NC_017530	TCGA	2	8	820686	820693	25 %	25 %	25 %	25 %	386010334
15044	NC_017530	CAGC	2	8	820760	820767	25 %	0 %	25 %	50 %	386010334
15045	NC_017530	GC	3	6	820772	820777	0 %	0 %	50 %	50 %	386010334
15046	NC_017530	CAGCG	2	10	820826	820835	20 %	0 %	40 %	40 %	386010334
15047	NC_017530	GC	3	6	820867	820872	0 %	0 %	50 %	50 %	386010334
15048	NC_017530	GAA	2	6	820886	820891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010334
15049	NC_017530	CAT	3	9	820894	820902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010334
15050	NC_017530	GCC	2	6	820919	820924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010334
15051	NC_017530	GGC	2	6	821009	821014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010334
15052	NC_017530	CA	3	6	821032	821037	50 %	0 %	0 %	50 %	386010334
15053	NC_017530	GCT	2	6	821227	821232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010335
15054	NC_017530	TGG	2	6	821252	821257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010335
15055	NC_017530	TCC	2	6	821282	821287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010335
15056	NC_017530	ACG	2	6	821303	821308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010335
15057	NC_017530	GGT	2	6	821314	821319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010335
15058	NC_017530	TCA	2	6	821364	821369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010335
15059	NC_017530	GCC	2	6	821395	821400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010335
15060	NC_017530	AGC	2	6	821424	821429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010335
15061	NC_017530	TGG	2	6	821478	821483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010335
15062	NC_017530	GCC	2	6	821554	821559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010335
15063	NC_017530	AGA	2	6	821609	821614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010335
15064	NC_017530	GC	3	6	821894	821899	0 %	0 %	50 %	50 %	386010336
15065	NC_017530	CGA	2	6	821965	821970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15066	NC_017530	TCGT	2	8	822095	822102	0 %	50 %	25 %	25 %	386010336
15067	NC_017530	CAG	2	6	822134	822139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15068	NC_017530	CGA	2	6	822172	822177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15069	NC_017530	GCC	2	6	822218	822223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010336
15070	NC_017530	TCA	2	6	822228	822233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010336
15071	NC_017530	CTG	2	6	822260	822265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15072	NC_017530	CGG	2	6	822276	822281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010336
15073	NC_017530	CAG	2	6	822302	822307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15074	NC_017530	AAG	2	6	822308	822313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010336
15075	NC_017530	GC	3	6	822370	822375	0 %	0 %	50 %	50 %	386010336
15076	NC_017530	GGA	2	6	822481	822486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010336
15077	NC_017530	GAG	2	6	822524	822529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010336
15078	NC_017530	AAC	2	6	822578	822583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010336
15079	NC_017530	GAA	2	6	822602	822607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010336
15080	NC_017530	GTT	2	6	822631	822636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386010336
15081	NC_017530	GCT	2	6	822769	822774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15082	NC_017530	CAT	2	6	822809	822814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010336
15083	NC_017530	GC	3	6	822825	822830	0 %	0 %	50 %	50 %	386010336
15084	NC_017530	GGT	2	6	822832	822837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010336
15085	NC_017530	CCT	2	6	822912	822917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386010336
15086	NC_017530	GC	3	6	822936	822941	0 %	0 %	50 %	50 %	386010336
15087	NC_017530	CGG	2	6	822955	822960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010336
15088	NC_017530	ATC	2	6	823133	823138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010336
15089	NC_017530	TAC	2	6	823154	823159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010336
15090	NC_017530	CGA	2	6	823237	823242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15091	NC_017530	CAAGGC	2	12	823477	823488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15092	NC_017530	GT	3	6	823503	823508	0 %	50 %	50 %	0 %	386010336
15093	NC_017530	GAC	2	6	823523	823528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15094	NC_017530	CAT	2	6	823540	823545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010336
15095	NC_017530	CG	3	6	823630	823635	0 %	0 %	50 %	50 %	386010336
15096	NC_017530	CGG	2	6	823657	823662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010336
15097	NC_017530	TGA	2	6	823725	823730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010336
15098	NC_017530	CGC	2	6	823881	823886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010336
15099	NC_017530	GGTG	2	8	823942	823949	0 %	25 %	75 %	0 %	386010336
15100	NC_017530	CTT	2	6	823972	823977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010336
15101	NC_017530	TGA	2	6	824119	824124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010336
15102	NC_017530	CTG	2	6	824135	824140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15103	NC_017530	GAG	2	6	824147	824152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386010336
15104	NC_017530	CGA	2	6	824164	824169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010336
15105	NC_017530	GTG	2	6	824207	824212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010336
15106	NC_017530	GAT	2	6	824236	824241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010336
15107	NC_017530	GAA	2	6	824282	824287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010336
15108	NC_017530	GCCTGG	2	12	824505	824516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386010337
15109	NC_017530	GCA	2	6	824532	824537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010337
15110	NC_017530	CTG	2	6	824573	824578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010337
15111	NC_017530	CGC	2	6	824581	824586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010337
15112	NC_017530	AAC	2	6	824601	824606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010337
15113	NC_017530	TGG	2	6	824646	824651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386010337
15114	NC_017530	TCG	2	6	824673	824678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010337
15115	NC_017530	CATG	2	8	824689	824696	25 %	25 %	25 %	25 %	386010337
15116	NC_017530	GCG	2	6	824752	824757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010337
15117	NC_017530	GAA	2	6	824814	824819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386010337
15118	NC_017530	GCTG	2	8	825042	825049	0 %	25 %	50 %	25 %	386010338
15119	NC_017530	CTG	2	6	825083	825088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010338
15120	NC_017530	TGGT	2	8	825198	825205	0 %	50 %	50 %	0 %	386010338
15121	NC_017530	CTG	2	6	825209	825214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010338
15122	NC_017530	GTGATG	2	12	825215	825226	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386010338
15123	NC_017530	CTGG	2	8	825289	825296	0 %	25 %	50 %	25 %	386010338
15124	NC_017530	TCG	2	6	825311	825316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010338
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15131	NC_017530	TGC	2	6	825888	825893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010339
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15143	NC_017530	TGA	2	6	826591	826596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010340
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15145	NC_017530	GCA	2	6	826660	826665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010340
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15156	NC_017530	ACGGTG	2	12	827232	827243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386010342
15157	NC_017530	CCGA	2	8	827265	827272	25 %	0 %	25 %	50 %	386010342
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15221	NC_017530	GCGCC	2	10	829996	830005	0 %	0 %	40 %	60 %	386010346
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15225	NC_017530	ACT	2	6	830161	830166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386010346
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15230	NC_017530	AGC	2	6	830344	830349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010346
15231	NC_017530	GCC	2	6	830359	830364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010346
15232	NC_017530	GCTG	2	8	830420	830427	0 %	25 %	50 %	25 %	386010346
15233	NC_017530	GAC	2	6	830455	830460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010346
15234	NC_017530	GATC	2	8	830487	830494	25 %	25 %	25 %	25 %	386010346
15235	NC_017530	GAC	2	6	830689	830694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010346
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15237	NC_017530	CGA	2	6	830742	830747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010346
15238	NC_017530	GAT	2	6	830761	830766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386010346
15239	NC_017530	GAC	2	6	830773	830778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010346
15240	NC_017530	CTG	2	6	830954	830959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010347
15241	NC_017530	CCG	2	6	830961	830966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010347
15242	NC_017530	AGGC	2	8	831030	831037	25 %	0 %	50 %	25 %	386010347
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15244	NC_017530	GCTGG	2	10	831088	831097	0 %	20 %	60 %	20 %	386010347
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15266	NC_017530	CAA	2	6	831787	831792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386010347
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15340	NC_017530	CAG	2	6	835071	835076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386010349
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15352	NC_017530	TTC	2	6	835655	835660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386010350
15353	NC_017530	CGGCAG	2	12	835679	835690	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386010350
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15355	NC_017530	CTG	2	6	835724	835729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010350
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15360	NC_017530	TGC	2	6	835924	835929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010350
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15471	NC_017530	GCAACT	2	12	841636	841647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386010356
15472	NC_017530	CGC	2	6	841702	841707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010356
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15474	NC_017530	GGC	2	6	841813	841818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386010356
15475	NC_017530	GT	3	6	841873	841878	0 %	50 %	50 %	0 %	386010356
15476	NC_017530	CCG	2	6	841900	841905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386010356
15477	NC_017530	GCT	2	6	841915	841920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010356
15478	NC_017530	C	6	6	841923	841928	0 %	0 %	0 %	100 %	386010356
15479	NC_017530	TCG	2	6	841965	841970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010356
15480	NC_017530	TGCG	2	8	842017	842024	0 %	25 %	50 %	25 %	386010356
15481	NC_017530	GC	3	6	842046	842051	0 %	0 %	50 %	50 %	386010356
15482	NC_017530	TGC	2	6	842179	842184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386010356
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